斑马鱼基因敲除是怎么做的

一、基因敲除的设计方案 1.1 基因的基本信息 确认斑马鱼基因的基本信息,包括名称ID号等,一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑,设计最佳的KO靶点。 1.4 分析并设计CRISPR,分析其效率及脱靶的情况 一般使用CCTOP,少数物种如没有可找其它专业网站。 二、CRISPR活性验证 2.1 分析并确认基因组序列 设计Genotyping引物,确认实际基因组序列与理论匹配情况,如CRISPR靶点验证与理论序列存在出入,需回到1.4重做。 该步骤还需要确认引物扩增条件,以备后用,如不能正常扩增需要重新设计,并且不能进行下一步操作。 2.2 合成sgRNA 使用Thermo转录试剂盒转录,完成后需测定浓度(不得低于400 ng/μl) 和OD......阅读全文

Science发表再生医学重要发现

  生物通报道:斑马鱼拥有惊人的再生能力,它们的脊髓在切断之后可以完全愈合。杜克大学的研究人员十一月四日在Science发表文章,揭示了斑马鱼修复脊髓的一个关键蛋白。这一发现为人类组织修复带来了新的启示。  斑马鱼再生脊髓的时候会形成一种“桥”。支持细胞伸出长长的突起,跨越数十倍于自身长度的距离,与

双光子显微镜活体单细胞成像揭示生物钟发育过程

  3月14日,PLOS Biology 期刊在线发表了题为《斑马鱼生物钟的活体单细胞成像》的研究论文。该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心(神经科学研究所)、上海脑科学与类脑研究中心、神经科学国家重点实验室严军研究组、何杰研究组与安徽医科大学附属第一医院教授李元海合作完成。该研究成功构建

双酚S(BPS)毒性对神经发育及其它方面的影响机制研究-2

图02为自由泳试验的结果。由图02可得知:不同浓度BPS情况下,斑马鱼幼鱼活动的总距离和运动速度呈下降趋势(随着BPS浓度的增加而减少/降低)。与控制组相比,0.3 mg/L和3.0 mg/L 剂量下有明显差异。与此同时,阳性对照组中斑马鱼幼鱼活动总距离和平均运动速度也有所下降。 这些结果表明:

基因敲除的不简单论p53基因的重要性

p53基因位于17号染色体p13,全长16-20kb,含有11个外显子,转录2.8kb的mRNA,编码一种分子量为43.7KDa的P53蛋白质,是一种核内磷酸化蛋白。因蛋白条带出现在Marker所示53KDa处,命名为P53。p53基因是人体一种肿瘤抑制基因(tumor suppressor gen

基因敲除的不简单论p53基因的重要性

  p53基因位于17号染色体p13,全长16-20kb,含有11个外显子,转录2.8kb的mRNA,编码一种分子量为43.7KDa的P53蛋白质,是一种核内磷酸化蛋白。因蛋白条带出现在Marker所示53KDa处,命名为P53。p53基因是人体一种肿瘤抑制基因(tumor suppressor g

甘露聚糖可增强斑马鱼对鲤春病毒血症的抵抗力

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/1/492799.shtm

COL22A1基因突变与药物因子介绍

该基因编码胶原家族成员,被认为有助于在收缩活动中稳定肌腱膜连接和加强骨骼肌附着。它属于胶原超家族中具有间断三螺旋(facit)亚群的纤维相关胶原,通过其c端胶原结构域与胶原纤维结合,并通过其n端非胶原结构域介导蛋白质-蛋白质相互作用。编码蛋白沉积在肌腱连接的基膜区,仅存在于肌肉、肌腱、心脏、关节软骨

COL22A1基因编码功能及结构描述

该基因编码胶原家族成员,被认为有助于在收缩活动中稳定肌腱膜连接和加强骨骼肌附着。它属于胶原超家族中具有间断三螺旋(facit)亚群的纤维相关胶原,通过其c端胶原结构域与胶原纤维结合,并通过其n端非胶原结构域介导蛋白质-蛋白质相互作用。编码蛋白沉积在肌腱连接的基膜区,仅存在于肌肉、肌腱、心脏、关节软骨

中科院动物所《PNAS》发表研究新成果

  来自中科院动物研究所的研究人员在斑马鱼中证实Foxn1通过mcm2维持胸腺上皮细胞,支持了T细胞发育。相关论文“Foxn1 maintains thymic epithelial cells to support T-cell development via mcm2 in zebraf

强大的基因组编辑工具Crisp/cas9(一)

关于Crisp/cas9,这个是目前研究的一个大热门,相关的文章和技术解析层出不穷,大家对什么是Crisp/cas9应该也有了一定的了解,今天就跟大家简单的介绍一下相关的产品吧。不过首先,我们还是再过一遍Crisp/cas9的相关概念吧。  一、 相关概念 (1)CRISPR/Cas是什么?CRIS

如何选择基因敲除动物模型制备技术?

动物模型是现代生命科学研究的重要工具,特别是基因工程小鼠和大鼠,在基因功能研究、人类生理病理机制研究及新药研发中起着不可替代的作用。近几年来,制 备动物模型的基因修饰技术层出不穷,这不仅包括传统ES打靶、TALEN、CRISPR/Cas9, 还有TetraOne基因敲除新技术。如此繁 多的技

CRISPR-技术进行细胞-TP53-基因敲除

实验原理 TP53 是重要的抑癌基因。在多种肿瘤中都能发现 TP53 基因突变及功能丧失。我们将针对 TP53 基因设计的靶点构建到 pCas9/gRNA1 载体,转染 293T 细胞,构建了 TP53 基因敲除 293T 细胞系。 1、本实验基因敲除原理:pCas9/gRNA1 载体表达

教你学会-CRISPR-Cas9-基因敲除技术

CRISPR/Cas 是进行基因编辑的强大工具,可以对基因进行定点的精确编辑。在向导 RNA(guide RNA, gRNA)和 Cas9 蛋白的参与下,待编辑的细胞基因组 DNA 将被看作病毒或外源 DNA,被精确剪切。一、寻找目的基因的靶标使用在线设计网站 CRISPR direct,如需直接复

双酚S可能与双酚A一样“毒”

  常见于婴儿奶瓶和包装的化学物质双酚A由于存在健康风险,正被双酚S替代。但美国《国家科学院学报》近日刊载一项新研究说,双酚S可能同样存在毒性,在动物实验中会影响大脑发育,导致多动。   当前市场上许多塑料制品都开始贴上“不含双酚A”的标志,宣称可放心安全使用,这些产品大多使用与双酚A化学

信噪比在高效液相中是怎么做的

【高效液相中的信噪比】在高效液相色谱仪中,定量限与检测限均由信噪比来确定,分别是S/N=10:1;S/N=3:1。因此在高效液相色谱仪分析方法中定量限与检测限的确定非常重要。1、按规定的方法与条件进行运行,当基线符合要求后,观察规定运行时间的最强噪音,记录其峰高或峰面积。2、按规定方法制定标准曲线,

水生所在鱼类先天性免疫基因的功能研究取得两项新进展

几年来,由于水产动物重大病害频频发生以及病急乱用药、滥用药引起的水产品食品安全等隐患,国际上已形成了进行鱼类等水产动物免疫学研究的交叉学科,且尤为重视先天性免疫机制研究。近年来,水生所淡水生态与生物技术国家重点实验室在国家基础研究计划973项目的支持下,已在渔业生物技术研究方向滋生出新的进行鱼类先天

The-scientist:2013年度最热基因组

  新的一年即将来临,The scientist杂志盘点了2013年度的高引基因组研究,让我们看看今年又有哪些新解码的基因组受到热捧。   斑马鱼基因组   种属:Zebrafish, Danio rerio   基因组大小:~1.41 billion base pairs   斑马鱼(Da

Nat.-Comm.:CRISPR基因编辑会导致可遗传的基因组结构突变

  CRISPR-Cas9是对微生物、动植物,以及人类基因组进行修饰的强有力工具。在医疗保健领域,CRISPR-Cas9基因编辑为治愈遗传病、癌症,乃至心脏病等重大疾病带来了前所未有的希望。但这一切的前提是DNA被正确的修饰,而没有产生意外的变化。  在进行CRISPR基因编辑时,脱靶性是一个重点关

高内涵在模式生物中的应用(一)

生命科学研究离不开各式各样的模式生物,模式生物由于其结构简单、生活周期短、培养简单、基因组小等特点,在生物医学等领域发挥重要作用。模式生物作为材料不仅能回答生命科学研究中最基本的生物学问题,对人类一些疾病的治疗也有借鉴意义。常见的模式生物有真菌中的酵母,低等无脊椎动物中的线虫,昆虫纲的果蝇,鱼纲的斑

高内涵在模式生物中的应用

生命科学研究离不开各式各样的模式生物,模式生物由于其结构简单、生活周期短、培养简单、基因组小等特点,在生物医学等领域发挥重要作用。模式生物作为材料不仅能回答生命科学研究中最基本的生物学问题,对人类一些疾病的治疗也有借鉴意义。常见的模式生物有真菌中的酵母,低等无脊椎动物中的线虫,昆虫纲的果蝇,鱼纲的斑

无创产前基因检测怎么做?

无创产前基因检测只需在怀孕期间抽取孕妇5毫升外周血即可。一般在孕12周-孕24周之间前往能够开展无创基因检测的机构即可进行检测。采血无需空腹。关于无创产前基因检测的最小与最大孕周限制出于不同的考虑。孕周过小的孕妇血液中胎儿游离DNA浓度不够,检测失败的概率会增加。目前的经验是在12周时胎儿浓度一般能

科学家创建“荧光鱼”研究基因功能

  可探究动物或人类癌症的早期发展   美国研究人员正在利用荧光鱼作为分子“灯塔”来研究动物的早期发育阶段。研究人员聚焦的Sp2基因可调节其他基因的表达,他们创建的荧光鱼也可为探究肿瘤发展成因提供线索。此项研究成果刊登在近期出版的《生物化学期刊》(The Journal of Biological

鱼类肠炎怎么治?中科院水生所找到新方法

《中国科学报》记者从中科院水生生物研究所(以下简称水生所)获悉,水生所科研团队在斑马鱼肠黏膜免疫细胞分析方法上取得新进展,相关成果发表于《免疫学前沿》杂志。科学家重点研究对象——斑马鱼。受访者供图   在水产养殖中,饲料引起肠黏膜慢性炎症的情况比较常见,同时肠黏膜免疫屏障也经常是水产病源(如

科学家首次实现对斑马鱼全脑十万级神经元实时监控

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519158.shtm记者15日从中国科学院自动化研究所获悉,来自该所和中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心的科研人员,开发了一套实感智能计算-控制平台。基于该平台,他们在国际上首次实现对斑马鱼全脑十万级

创建荧光鱼研究基因功能

研究人员正在利用作为分子“灯塔”来研究动物的早期发育阶段。研究人员聚焦的Sp2基因可调节其他的表达,他们创建的荧光鱼也可为探究发展成因提供线索。此项研究成果刊登在近期出版的《期刊》(The Journal of Biological Chemistry)上。 Sp2是Sp转录因子家庭的成员之一,

高内涵在模式生物中的应用

生命科学研究离不开各式各样的模式生物,模式生物由于其结构简单、生活周期短、培养简单、基因组小等特点,在生物医学等领域发挥重要作用。模式生物作为材料不仅能回答生命科学研究中最基本的生物学问题,对人类一些疾病的治疗也有借鉴意义。常见的模式生物有真菌中的酵母,低等无脊椎动物中的线虫,昆虫纲的果蝇,鱼纲的斑

高内涵在模式生物中的应用(一)

生命科学研究离不开各式各样的模式生物,模式生物由于其结构简单、生活周期短、培养简单、基因组小等特点,在生物医学等领域发挥重要作用。模式生物作为材料不仅能回答生命科学研究中最基本的生物学问题,对人类一些疾病的治疗也有借鉴意义。常见的模式生物有真菌中的酵母,低等无脊椎动物中的线虫,昆虫纲的果蝇,鱼纲的斑

科研人员揭示促进鱼类卵子发生和卵子质量新机制

配子质量特别是卵子质量(卵质)是决定鱼类成功繁育和养殖效率的先决条件。鱼类的卵质由卵子中储存的所有母源因子的集合共同决定。开展母源因子对卵子发生与早期胚胎发育的调控研究可指导鱼类卵质的评估,提升卵质,促进水产种业和养殖业的发展。在卵子发育和成熟的过程中,大量的母源mRNA被转录并囤积在卵子中,母源m

科学家通过基因敲除发现了听力损伤的关键基因

  最近,来自Harwell医学研究委员会(MRC Harwell)的科学家在对超过3000个小鼠基因进行试验后,发现了52个之前未被鉴定的对听力至关重要的基因。通过国际小鼠表型联盟(IMPC)领导了这一研究的科学家表示,这些新发现的基因将为人类听力损失的原因提供见解。   这项发表在Nature

双酚A及其替代品双酚S同样“有毒”

  双酚A,称为BPA,在世界各地大量生产用于消费性产品,包括家用塑料制品。制造塑料容器剩余的双酚A都大概渗入到所盛的液体中,然后进入人体。为回应消费者对于安全性的担忧,许多厂家用一种称为双酚S(BPS)的化学物质来代替双酚A,通常被标记为“不含双酚A”,并被认为是安全的。  2015年1月12日在