斑马鱼基因敲除是怎么做的
一、基因敲除的设计方案 1.1 基因的基本信息 确认斑马鱼基因的基本信息,包括名称ID号等,一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑,设计最佳的KO靶点。 1.4 分析并设计CRISPR,分析其效率及脱靶的情况 一般使用CCTOP,少数物种如没有可找其它专业网站。 二、CRISPR活性验证 2.1 分析并确认基因组序列 设计Genotyping引物,确认实际基因组序列与理论匹配情况,如CRISPR靶点验证与理论序列存在出入,需回到1.4重做。 该步骤还需要确认引物扩增条件,以备后用,如不能正常扩增需要重新设计,并且不能进行下一步操作。 2.2 合成sgRNA 使用Thermo转录试剂盒转录,完成后需测定浓度(不得低于400 ng/μl) 和OD......阅读全文
基因敲除技术
一.概述:基因敲除是自80年代末以来发展起来的一种新型分子生物学技术,是通过一定的途径使机体特定的基因失活或缺失的技术。通常意义上的基因敲除主要是应用DNA 同源重组原理,用设计的同源片段替代靶基因片段,从而达到基因敲除的目的。随着基因敲除技术的发展,除了同源重组外,新的原理和技术也逐渐被应用,比较
基因敲除技术
一.概述:基因敲除是自80年代末以来发展起来的一种新型分子生物学技术,是通过一定的途径使机体特定的基因失活或缺失的技术。通常意义上的基因敲除主要是应用DNA 同源重组原理,用设计的同源片段替代靶基因片段,从而达到基因敲除的目的。随着基因敲除技术的发展,除了同源重组外,新的原理和技术也逐渐被应用,比较
基因敲除简介
基因敲除是自80年代末以来发展起来的一种新型分子生物学技术,是通过一定的途径使机体特定的基因失活或缺失的技术。通常意义上的基因敲除主要是应用DNA同源重组原理,用设计的同源片段替代靶基因片段,从而达到基因敲除的目的。随着基因敲除技术的发展,除了同源重组外,新的原理和技术也逐渐被应用,比较成功的有基因
从斑马鱼身上竟然获得治疗帕金森的方法
与哺乳动物相比,成年斑马鱼会使大脑中的神经元再生,但这种能力的程度和变异性尚不清楚。来自Edinburgh大学脑神经科学研究中心的Thomas Becker及其研究团队探寻了各种多巴胺能神经元群体的丧失是否足以触发神经元的功能性再生。 他们的研究结果为未来治疗具有运动异常、震颤等症状的神经系统
国际首例-他们用光指挥斑马鱼的白细胞
未来,如果你生病了,除了吃药外,还有更多简单高效的治疗方式可选择,比如用光照一照身体就能远程遥控白细胞,从而主动调动身体的免疫能力。这并非科幻。我国科学家已实现了在活体上用光将白细胞变成“医学微机器人”,可自主控制白细胞的激活和运动,这在国际上是第一例。7月13日,暨南大学李宝军教授和郑先创教授研究
国际首例-他们用光指挥斑马鱼的白细胞
未来,如果你生病了,除了吃药外,还有更多简单高效的治疗方式可选择,比如用光照一照身体就能远程遥控白细胞,从而主动调动身体的免疫能力。这并非科幻。我国科学家已实现了在活体上用光将白细胞变成“医学微机器人”,可自主控制白细胞的激活和运动,这在国际上是第一例。7月13日,暨南大学李宝军教授和郑先创教授
诺奖得主Science解开斑马鱼条纹的秘密
斑马鱼,一种小的淡水鱼,得名于一种醒目的蓝黄色相间条纹图案。在幼鱼皮肤生长过程中,有三种主要的色素细胞类型——黑色细胞、反光银色细胞和黄色细胞出现,它们多层镶嵌,构成特征性的颜色图案。 众所周知,所有这三种细胞类型必须相互作用才能形成适当的条纹,但是,形成成鱼条纹的色素细胞的胚胎起源,直到现在
斑马鱼:一条游上“试药路”的小鱼
蓝色的世界、嗡嗡作响的机器、不时出现的人影……湖蓝色的塑料鱼缸里,七八条小鱼在水中自由游弋,不时停下来盯着外面的世界。看见人影走近,有的小鱼开始在鱼缸里打转,有的则依旧悠然地游来游去。 这些体长不过5厘米、带有墨蓝色斑纹的斑马鱼并不知道,它们从一出生就已同那些野外的同类们分道扬镳,成为人类医药
研究揭示斑马鱼肠脑调节关键机制
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517493.shtm
斑马鱼嗅觉作用主要是左鼻子
斑马鱼嗅觉作用主要是左鼻子 如同人有“左撇子”一样,鱼也有类似“左撇子”的鼻子。 日前,日本名古屋市立大学与国立遗传学研究所的一项新研究发现,斑马鱼发挥嗅觉作用的主要是左鼻子。相关研究论文在线刊登在了近期出版的《自然—神经科学》(Nature Neuroscience)杂志上。
-Nat-Commun:斑马鱼可用于癫痫药物筛选
化学药物Clemizole在“Dravet综合症”的一个斑马鱼模型中能有效防止癫痫类发作。在Nature Communications上发表的这一发现确认了一个新方法,后者有可能被用来识别癫痫病的另类疗法。 “Dravet综合症”是一种从婴儿时期开始的严重癫痫,以严重的、自发的和复发的
寄生虫感染或破坏斑马鱼实验
研究人员表示,一种感染实验室斑马鱼的常见寄生虫可能令多年的行为实验结果产生混淆。不过,批评者认为,这个案例仍有待证实。 和小鼠一样,斑马鱼被用在全球的实验室中,以研究从药物疗效到诸如精神分裂症和自闭症等遗传性疾病和障碍的所有事情。由于斑马鱼和人类都具有高度社会性,因此研究人员认为,和啮齿类动物
除了小鼠,斑马鱼也被盯上了-|-PNAS
植有人类肿瘤细胞(红色)的斑马鱼胚胎,这一模型有望帮助医生快速筛选癌症患者最佳的治疗方案(图片来源:Rita Fior团队) 最新一期《PNAS》在线发表了一篇题为“Single-cell functional and chemosensitive profiling of combinato
北大、加大等联手探索斑马鱼全基因组突变新技术
来自北京大学生命科学学院、美国国立人类基因组研究所和加州大学生物系的研究人员,最近在利用逆转录病毒插入法引发斑马鱼全基因组范围内基因突变的研究中取得重大进展。文章刊登于7月18日在线版《PNAS》。 研究人员采用其研制的一组技术,用假性逆转录病毒(pseudotyped retroviruses)
再生医学新进展-人类抗癌基因抑制斑马鱼组织再生
再生医学或许可以在未来某一天帮助医生进行先天性畸形的修复,帮助病人重新长出受伤的手指,甚至是进行心脏修复。但要实现这一切,就必须考虑如何攻破机体自身的抗癌保护系统。最近,来自美国UCSF的研究人员发现了一个人类基因可能是这一保护系统中一个重要部分,既能阻止癌症发展又会阻断健康组织的再生。 在这
从鱼缸到太空:“鱼航员”肩负科研使命
4月24日17时17分,神舟二十号载人飞船在酒泉卫星发射中心成功发射。此次发射不仅标志着中国航天事业的又一重要里程碑,更因6条来自华南理工大学医学院的斑马鱼“鱼航员”的加入而备受瞩目。 “这些斑马鱼将在太空站停留30天以上,执行失重性骨丢失及心肌重塑的蛋白稳态调控机制研究项目,这也是国际上首次
AJPCell:斑马鱼皮肤的排氨机制
斑马鱼是一种新型的模式脊椎动物,广泛应用于发育学、遗传学、行为学和分子生物学等研究领域。2008年,中国台湾的科学家林礼益教授应用“非损伤微测技术”(scanning ion-selective electrode technique,SIET)检测了斑马鱼幼体皮肤上特化细胞的H+ 和NH4+ 流,
Cell子刊:组织特异性的CRISPR载体
细菌一直在与病毒或入侵核酸(质粒)进行斗争,为此它们演化出了多种防御机制。CRISPR/Cas适应性免疫系统就是其中之一。在CRISPR和Cas的帮助下,细菌可以经由小RNA分子的引导,靶标和沉默入侵者遗传信息的关键部分。 现在,CRISPR与Cas9的组合已经成为了一个通用工具,被用来对真核
斑马鱼为何作为高内涵筛选HCS的模式动物?
有两种有效的筛选方法,广泛用于早期药物发现中的化合物分选。这些方法包括高通量筛选 (HTS) 和高内涵筛选 (HCS)。虽然前者从大量新药候选药物中快速有效地分选有用的化合物,但HCS使用基于成像的多参数分析来鉴定可能影响这些药物疗效的化合物。 在本文中,您将了解什么是HCS,使用的不同方法以及常见
北大近年来首篇NatureMethods文章
Nature Methods杂志是Nature出版社旗下的著名期刊之一,也是方法学领域的权威刊物,主要刊载具有创新性的技术进展,在去年之前,大陆学者在此刊物上发表的技术文章仅有3篇。近期来自北京大学生科院,加州大学洛杉矶分校的研究人员在这一著名期刊上发表了题为“TALEN-mediated
水生所揭示急性白血病基因MLL对斑马鱼血细胞发生的作用
急性白血病基因MLL编码一个组蛋白甲基化转移酶,能通过表观遗传机制调控Hox等基因的表达。它与70多种基因发生重排是导致急性淋巴细胞白血病(ALL)和急性骨髓性白血病(AML)发生的主要原因。由于小鼠mll基因敲除导致早期胚胎死亡,因此对于它在早期胚胎发育中的作用及其分子机制仍很不
RNAi引起的基因敲除
RNAi引起的基因敲除:由于少量的双链RNA就能阻断基因的表达,并且这种效应可以传递到子代细胞中,所以RNAi的反应过程也可以用于基因敲除。
基因敲除的技术路线
基因敲除的技术路线如下:(1)构建重组基因载体﹔(2)用电穿孔、显微注射等方法把重组DNA转入受体细胞核内﹔(3)用选择培养基筛选已击中的细胞﹔(4)将击中细胞转入胚胎使其生长成为转基因动物,对转基因动物进行形态观察及分子生物学检测。
基因敲除技术的分类
基因敲除分为完全基因敲除和条件型基因敲除(又称不完全基因敲除)两种。完全基因敲除是指通过同源重组法完全消除细胞或者动物个体中的靶基因活性,条件型基因敲除是指通过定位重组系统实现特定时间和空间的基因敲除。噬菌体的Cre/LoxP系统、Gin/Gix系统、酵母细胞的FLP/FRT系统和R/RS系统是现阶
条件基因敲除的定义
中文名称条件基因敲除英文名称conditional gene knockout定 义使靶基因在特定细胞类型或者特定发育阶段完全丧失功能的实验技术。应用学科遗传学(一级学科),发育遗传学(二级学科)
基因敲除的实验步骤
构建重组基因载体绝大多数的基因敲除策略都是基于同源重组的机制,其基因载体包括载体骨架、靶基因同源序列和突变序列及选择性标记基因等非同源序列,其中同源序列是影响同源重组效率的关键因素。用电穿孔显微注射方法把重组DNA转入受体细胞(一般是胚胎干细胞)核内。同源重组基因重组时以载体的同源序列取代染色体靶位
基因敲除的实验步骤
实验步骤构建重组基因载体绝大多数的基因敲除策略都是基于同源重组的机制,其基因载体包括载体骨架、靶基因同源序列和突变序列及选择性标记基因等非同源序列,其中同源序列是影响同源重组效率的关键因素。用电穿孔显微注射方法把重组DNA转入受体细胞(一般是胚胎干细胞)核内。同源重组基因重组时以载体的同源序列取代染
基因敲除的技术应用
基因敲除技术主要应用于动物模型的建立,而最成熟的实验动物是小鼠,对于大型哺乳动物的基因敲除模型还处于探索阶段。近年来,牛、羊、猪、猴等大型哺乳动物实现了基因敲除。但由于狗的生殖生理较为特殊,基因敲除狗的培育难度大为增加,狗基因组的定点修饰一直未获成功。针对这一问题,研究团队设计了一个自体移植的策略,
基因敲除的操作步骤
利用基因打靶技术产生转基因动物的程序一般为:获得干细胞基因敲除一般应用于鼠,而最常用的鼠的种系是129及其杂合体,因为这类小鼠具有自发突变形成畸胎瘤和畸胎肉瘤的倾向,是基因敲除的理想实验动物。而其他遗传背景的胚胎干细胞系逐渐被发展应用,来自于C57BL/6×CBN/JNCrjF1小鼠的胚胎干细胞系成
《自然》:发现斑马鱼造血干细胞生成机理
为医学界研究白血病疗法提供了新思路 法国科学家日前通过对斑马鱼胚胎进行即时监控,发现了其造血干细胞的生成机理。这一成果为医学界研究白血病疗法提供了新思路。 该研究由法国国家科研中心和巴斯德研究所共同完成。研究人员在最新一期英国《自然》杂志上报告说,他们采用即时成像技术对斑马鱼的胚胎进行了观察