北大、加大等联手探索斑马鱼全基因组突变新技术
来自北京大学生命科学学院、美国国立人类基因组研究所和加州大学生物系的研究人员，最近在利用逆转录病毒插入法引发斑马鱼全基因组范围内基因突变的研究中取得重大进展。文章刊登于7月18日在线版《PNAS》。 研究人员采用其研制的一组技术，用假性逆转录病毒（pseudotyped retroviruses）感染斑马鱼胚胎，并且绘制了F1代斑马鱼基因组中前病毒整合（retroviral integrations）的遗传位点。研究人员在F1斑马鱼中找到代表993个逆转录病毒整合的2045个序列。共599个整合位于现有的遗传集合 (Zv6)中，233个整合定位于基因内。 通过培育25个基因中携带前病毒整合的斑马鱼，研究人员证实，在接近一半的基因“点击率”中，mRNA转录水平下降了70％以上，整合出现在外显子或者第一个内含子中时突变的可能性最大。根据这些数据，将近1/5的整合会出现逆转录病毒的突变。另外，当鼠类白血病病毒特异整合到基因的第一个......阅读全文
北大、加大等联手探索斑马鱼全基因组突变新技术
来自北京大学生命科学学院、美国国立人类基因组研究所和加州大学生物系的研究人员，最近在利用逆转录病毒插入法引发斑马鱼全基因组范围内基因突变的研究中取得重大进展。文章刊登于7月18日在线版《PNAS》。 研究人员采用其研制的一组技术，用假性逆转录病毒（pseudotyped retroviruses）
除了小鼠，斑马鱼也被盯上了－|－PNAS
植有人类肿瘤细胞（红色）的斑马鱼胚胎，这一模型有望帮助医生快速筛选癌症患者最佳的治疗方案（图片来源：Rita Fior团队） 最新一期《PNAS》在线发表了一篇题为“Single-cell functional and chemosensitive profiling of combinato
斑马鱼
一、概述斑马鱼是生长在印度、巴基斯坦淡水河流中的一种硬骨鱼（鲤鱼），成年鱼全身仅长4－5厘米，因全身横向分布着一道一道褐色的斑马线而得名。斑马鱼很容易在实验室饲养，一般3个月就可以达到生殖成熟期，雌鱼每次产卵200枚左右，一生可产卵数千枚，斑马鱼所产之卵经24小时即可胚胎发育成熟，仔鱼期只有1个月。
Nature：系统解析斑马鱼参考基因组
斑马鱼(Zebrafish)是研究发育生物学的新兴模式动物。斑马鱼由于具有饲育容易、胚胎透明、体外受精、突变种多、遗传学工具成熟等诸多优点，近年来已成为研究脊椎动物发育与人类遗传疾病的新兴模式动物。 近日，英国桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)
平生医疗Micro－CT小动物成像在斑马鱼基因突变个体观察...
平生医疗Micro CT小动物成像在斑马鱼基因突变个体观察的应用前言 斑马鱼与哺乳动物基因组和蛋白调控机制有高度同源性，而且个体小、生殖周期短、繁殖能力强、易于饲养、体外受精、胚胎透明且发育迅速等诸多方面的优点，被广泛应用于药物筛选、毒性检测和发育研究等科学领域。由于硬骨鱼和人类在骨骼发育过程中的基
北大近年来首篇NatureMethods文章
Nature Methods杂志是Nature出版社旗下的著名期刊之一，也是方法学领域的权威刊物，主要刊载具有创新性的技术进展，在去年之前，大陆学者在此刊物上发表的技术文章仅有3篇。近期来自北京大学生科院，加州大学洛杉矶分校的研究人员在这一著名期刊上发表了题为“TALEN-mediated
斑马鱼出生就识数！
意大利科学家发现，斑马鱼幼鱼在孵化后96小时里可以识别不同数量的黑条，研究者表示这一发现表明数字能力可能在新生斑马鱼中是与生俱来的。相关研究3月24日发表于《通讯—生物学》。 过去的研究表明，人类新生儿和新孵化的孔雀鱼、小鸡（孵化时脑已经高度发育的物种）具有数学能力。但在此之前，人们对新生时处
斑马鱼基础研究
近期，我们收到了很多小伙伴提交的文献奖励申请，其中，有2篇成功吸引了小编的注意，这2篇文章的内容都是斑马鱼研究相关的。我们都知道，斑马鱼是一种常见的模式生物，但是市面上针对斑马鱼的抗体却非常少，我们不仅有一百多种斑马鱼抗体，而且还可以根据客户需求来进行定制生产。下面来看看这2篇文章吧。01标题：Sa
斑马鱼显微CT实验
斑马鱼作为传统的脊椎动物模型已经广泛应用于人类疾病和胚胎发育过程的研究，斑马鱼全基因已经完全清楚，与人类基因组有85%同源性，这意味着在斑马鱼身上进行的实验，其结果很多都适用于人类。斑马鱼与其他实验常用动物相比，具有较高的繁殖率和生长速率，并且其胚胎发育过程是在体外进行的，科研人员通过显微镜直接观察
深受科学家的热爱斑马鱼基因编辑技术介绍
斑马鱼又叫蓝条鱼，因为其体表有暗蓝色和银色的类似于斑马一样的条纹而命名。斑马鱼属于鲤科鱼类，同属鲤科的还有我们十分熟悉的鲤鱼、鲫鱼等。斑马鱼的体型较小，成鱼体长约4-6厘米，而且成鱼常年产卵且产卵量大，可达300-1000粒，还是体外受精并发育，因此十分适合进行实验室的大规模养殖与筛选。
斑马鱼基因编辑技术介绍
斑马鱼又叫蓝条鱼，因为其体表有暗蓝色和银色的类似于斑马一样的条纹而命名。斑马鱼属于鲤科鱼类，同属鲤科的还有我们十分熟悉的鲤鱼、鲫鱼等。斑马鱼的体型较小，成鱼体长约4-6厘米，而且成鱼常年产卵且产卵量大，可达300-1000粒，还是体外受精并发育，因此十分适合进行实验室的大规模养殖与筛选。斑马鱼这种原
深受科学家的热爱斑马鱼基因编辑技术介绍
斑马鱼又叫蓝条鱼，因为其体表有暗蓝色和银色的类似于斑马一样的条纹而命名。斑马鱼属于鲤科鱼类，同属鲤科的还有我们十分熟悉的鲤鱼、鲫鱼等。斑马鱼的体型较小，成鱼体长约4-6厘米，而且成鱼常年产卵且产卵量大，可达300-1000粒，还是体外受精并发育，因此十分适合进行实验室的大规模养殖与筛选。
关于肝损伤修复及其分子调控机制
利用 CRISPR/Cas9 技术，针对靶基因序列设计 sgRNA， 指导 Cas9 蛋白在特定基因位点引起 DNA 双链断裂，在非同源性末端接合修复断裂 DNA 的过程中，靶基因碱基突变或缺失被引入到斑马鱼基因组中，最终导致靶基因无法正常转录翻译，达到基因敲除的目的。目前我们利用 CRISPR
斑马鱼的基因敲除定制（Cas9KO）法介绍
利用 CRISPR/Cas9 技术，针对靶基因序列设计 sgRNA， 指导 Cas9 蛋白在特定基因位点引起 DNA 双链断裂，在非同源性末端接合修复断裂 DNA 的过程中，靶基因碱基突变或缺失被引入到斑马鱼基因组中，最终导致靶基因无法正常转录翻译，达到基因敲除的目的。目前我们利用 CRISPR
斑马鱼的基因敲除定制（Cas9KO）法介绍
利用 CRISPR/Cas9 技术，针对靶基因序列设计 sgRNA， 指导 Cas9 蛋白在特定基因位点引起 DNA 双链断裂，在非同源性末端接合修复断裂 DNA 的过程中，靶基因碱基突变或缺失被引入到斑马鱼基因组中，最终导致靶基因无法正常转录翻译，达到基因敲除的目的。目前我们利用 CRIS
基因组学突破性成果：斑马鱼序列解析
人类发育，生理功能及疾病发生的过程涉及到成千上万的基因和其变异体，但是大部分的基因和其变异体的功能依然是未知的。过去的20年里，斑马鱼逐渐成为研究人类基因功能的重要模式动物。在《自然》杂志网站发表的两篇文章里1,2，报道了斑马鱼参考基因组序列和完成超过10,000个蛋白编码基因的断裂性突变体的鉴
斑马鱼胚胎DNA的制备
材料和试剂1. 蛋白酶K（罗氏03115836001）2. 1M的Tris，pH值8.33. 氯化钾4. 吐温20（10％，EMD4 biosciences，655207）5. NP40（10％，Merck，492018）设备1.
斑马鱼胚胎细胞的培养
成纤维细胞饲养层 原代培养 细胞系 实验方法原理 通过用链酶蛋白酶除去绒毛膜、用添加成分的 FGF 培养液培养细胞和采用不同的胰蛋白酶消化
转基因斑马鱼的构建
实验概要本实验对斑马鱼导入含 EGFP的质粒，观察其在动物体内的表达情况，在斑马鱼体内，绿色荧光蛋白从原肠胚到出苗期均能在荧光显微镜下观察到绿色荧光。主要试剂EGFP、绿色荧光蛋白基因、pEGFP-N2载体、E.coli主要设备试管、试管架、可调式微量加样器、电泳仪、电泳槽、染色缸、42℃恒温水浴箱
水生所发布高质量AB品系斑马鱼参考基因组
斑马鱼是生命科学、健康科学和环境科学等研究领域的重要模式生物之一。常见的两种实验室斑马鱼品系分别是Tubingen品系和AB品系。其中，AB品系斑马鱼被国内外很多实验室作为研究对象。然而，却缺乏一个高质量的AB品系斑马鱼参考基因组。 由于不同品系斑马鱼来源不同，各品系之间存在着大量基因序列上的
水生生物所等公布斑马鱼1号染色体全基因敲除研究成果
斑马鱼是开展生命科学、健康科学、环境科学等研究的重要模式动物。在斑马鱼研究历史上，欧美学者发起过几次大规模的随机诱变突变体库，开展基于“从表型到基因型”的正向遗传学筛选，奠定了斑马鱼作为国际公认模式动物的重要基础。 随着斑马鱼全基因组测序的完成和CRISPR/Cas9等基因组编辑技术的成熟，规
水生所关于斑马鱼基因捕获与插入突变的研究取得突破
脊椎动物后基因组时代的主要任务是解读基因的功能，而基因捕获和插入突变是揭示基因功能的重要手段。斑马鱼具有易于饲养、繁育周期短、产卵量大、体外受精与发育等优点，已成为发育和遗传学研究的理想模式动物，但尚缺乏胚胎干细胞和基于胚胎干细胞的基因敲除技术。转座子介导的基因捕获和突变研究为大规模筛选斑马鱼突
Cell：新研究开启自闭症基因治疗时代
自闭症（别称“雨人”）是受基因和环境因素影响，由大脑神经系统失调导致的发育障碍，其病征表现为社交能力、沟通能力、兴趣和行为模式出现异常。从第一例自闭症患者——美国男孩唐纳德于1943年被确诊开始，人们就开始了针对自闭症的研究。然而，不管治疗方式怎样“更新换代”，自闭症的病因却一直是科学界无法达成
首个CRISPR/Cas9靶序列数据库
近期，来自美国国立卫生研究院和瑞典乌普萨拉大学的研究人员，在国际著名学术期刊《Nucleic Acids Research》上发表的一项研究中，首次提出了一个已在斑马鱼中经过实验验证的CRISPR/Cas9靶序列数据库。 CRISPR及CRISPR相关蛋白（Cas9），是在古细菌和细菌中发现的
基因组学研究成果让斑马鱼研究“快马加鞭”
基因组学研究成果让斑马鱼研究快马加鞭（Genomics: Zebrafish earns its stripes）作者：谢训卫人类发育，生理功能及疾病发生的过程涉及到成千上万的基因和其变异体，但是大部分的基因和其变异体的功能依然是未知的。过去的20年里，斑马鱼逐渐成为研究人类基因功能的重要模式动物。
斑马鱼人类疾病模型的构建
斑马鱼是唯一的经过大规模遗传筛选的脊椎动物物种。许多斑马鱼的哺乳动物同源基因已经被克隆，并且发现有相似的功能，证实了斑马鱼作为人类疾病模型的可行性。通过Tol2转座子技术、基因突变（插入诱变、ENU化学诱变）、基因敲除（TALEN,CRISPER）等技术，构建在特点靶点标记荧光蛋白的转基因品系及
斑马鱼色素细胞如何形成条带
一项研究发现，斑马鱼的特征条带反映了这种动物的皮肤上的色素细胞的运动和它们之间的相互作用。尽管科研人员长久以来就注意到了数学模型可以准确地重现动物界的许多特征条带和斑点，动物图案背后的生物过程在很大程度上尚未得到解释。为了更好地理解这些过程，Hiroaki Yamanaka 和Shigeru
Nat.－Comm.：CRISPR基因编辑会导致可遗传的基因组结构突变
CRISPR-Cas9是对微生物、动植物，以及人类基因组进行修饰的强有力工具。在医疗保健领域，CRISPR-Cas9基因编辑为治愈遗传病、癌症，乃至心脏病等重大疾病带来了前所未有的希望。但这一切的前提是DNA被正确的修饰，而没有产生意外的变化。 在进行CRISPR基因编辑时，脱靶性是一个重点关
利用斑马鱼模型首次揭示干扰素λ受体突变导致临床遗...
利用斑马鱼模型首次揭示干扰素λ受体突变导致临床遗传性耳聋2月16日（正月初一），国际医学遗传学期刊 Journal of Medical Genetics 在线发表了解放军总医院的科研成果“Mutation of IFNLR1, an interferon lambda receptor 1,
北京大学Cell－Res基因编辑研究新成果
来自北京大学的研究人员报告称，他们利用一种RNA导向的Cas9核酸酶在哺乳动物细胞和斑马鱼胚胎中有效实现了位点特异性基因编辑。相关论文“Genome editing with RNA-guided Cas9 nuclease in Zebrafish embryos”发表在3月26日的《细胞