开启2020年科研新热点的染色体外环状DNA（eccDNA）
近期，Nature与Cell相继发表文章讨论染色体外环状DNA（eccDNA），这位超级明星在各家媒体、宣传号上纷纷闪亮登场。一时间eccDNA走在了生物医学研究舞台的最中央，云序生物已经带您领略过eccDNA在这两篇重量级文章中的迷人风采（点击链接：颠覆性发现：癌基因竟不在染色体上---环状DNA连登Nature，Cell!），它极大的丰富了肿瘤异质性的研究内容，为液体活检、肿瘤耐药以及肿瘤微环境讨论指明了新的方向。eccDNA在肿瘤环境中可以借助多样的成环方式、开放的高级结构以及多个调控元件的辅助，强有力的推动原癌基因的转录，颠覆了科研人员对原癌基因在肿瘤发生发展当中的传统认知。染色质是动态的！eccDNA也是动态的！ 虽然eccDNA的讨论内容多数围绕肿瘤环境，那eccDNA是否是肿瘤学的专属明星分子？并非如此，非疾病状态下的细胞核同样拥有丰富的eccDNA。云序生物今天带来的文章将让大家感受到，eccDNA在正......阅读全文
肿瘤细胞中ecDNA新机制在斯坦福大学致癌基因研究应用1
文章导读eccDNA是染色体外的一种特殊的环状DNA，从它的出现至今已长达数年，但在起初的很长一段时间里并未得到人们的重视。随着高通量技术的发展，eccDNA(extrachromosomal circular DNAs，eccDNAs)作为染色体外的环状DNA的研究也进一步深入。在国际学术
肿瘤细胞中ecDNA新机制在斯坦福大学致癌基因研究应用2
（5）EcDNA hubs调控两个癌基因位点的分子互作上述研究证明ecDNA hubs可能促进分子间增强子-启动子相互作用。为了验证这些相互作用，作者对人类胃癌细胞系中两种类型的ecDNA进行了研究，一种ecDNA包含来自8号染色体的MYC扩增子，另一种包含来自10号染色体的FGFR2扩增子。用
再登Nature－GeneticsecDNA与致ai基因扩增及多种ai症不良...1
再登Nature Genetics-ecDNA与致ai基因扩增及多种ai症不良预后相关文章导读研究发现，许多扩增的原ai基因，并不只是位于染色体，而且还能变成游离的染色体外DNA（ecDNA），并出现大量拷贝，而且相当高比例的ecDNA是以环状DNA分子的形式存在，即eccDNA（染色体外环状DNA
染色体外DNA——导至癌症恶变的罪魁
北京时间11月21日，发表在《Nature》上的一篇新研究发现，在人类肿瘤细胞中发现大量如“甜甜圈”般的环状染色体外DNA(EcDNA)，改变了与癌症相关基因的表达方式，从而促进了癌细胞的侵袭性，并在肿瘤快速进化和抵御威胁的能力（如化疗、放疗和其他治疗）中发挥了关键作用。该研究由美国加州大学圣地亚哥
分子遗传学词汇染色体外DNA
中文名称：染色体外DNA英文名称：extrachromosomal DNA定 义：存在于染色体外的DNA。包括线粒体DNA、叶绿体DNA和质粒DNA等。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
新冠肺炎疫情－开启“云端”科研模式
美国威斯康星国家灵长类动物研究中心的戴夫·奥康纳清晨收到在伦敦的一名合作伙伴发来的论文预印本。这项研究在中国完成，两人通过企业协同云端办公软件Slack讨论了一上午。下午2点，奥康纳打开高清会议系统GoToMeeting，和多个机构的研究人员讨论改进研究计划，他们希望构建一个灵长类动物模型来研
环状DNA的结构特点
超螺旋，DNA双螺旋本身进一步盘绕称超螺旋，超螺旋有正超螺旋和负超螺旋两种。当盘旋方向与DNA双螺旋方向相同时，其超螺旋结构为正超螺旋，反之则为负超螺旋，负超螺旋的存在对于转录和复制都是必要的。
eccDNA新型生物标志物的多种应用
实验方法：eccDNA-seq 文章内容1. 血浆中eccDNA检测eccDNA高通量检测的关键步骤是要通过实验手段对其进行有效的富集。研究者通过线性DNA的去除、eccDNA的纯化、建库、测序，生物信息分析对反式剪切位点（junction site）的识别从而完成对eccDNA的鉴定。5例
环状DNA的类型和分布
环状DNA也有两种，环状单链DNA和环状双链，一般存在于病毒、细菌和真核生物的线粒体和叶绿体中， 环状DNA一般比线性DNA结合更紧密更稳定，储存的遗传信息更多（重复序列）。原核生物的拟核是大型环状DNA。
细胞化学词汇环状DNA
中文名称：环状DNA分 类：环状单链DNA和环状双链环状DNA也有两种，环状单链DNA和环状双链，一般存在于病毒、细菌和真核生物的线粒体和叶绿体中， 环状DNA一般比线性DNA结合更紧密更稳定，储存的遗传信息更多（重复序列）。原核生物的拟核是大型环状DNA。定 义：超螺旋，D
《Nature－Genetics》染色体外DNA会改变癌基因扩增水平
恶性胶质瘤（glioblastoma，GBM）是最常见且最具攻击性的脑癌，标准治疗反应很差，两年生存率仅为15%。最近，《Nature Genetics》的一篇文章发现了GBM肿瘤耐药的一个关键密码。 为了靶向遏制GBM的攻击性，杰克逊实验室（Jackson Laboratory，JAX）教授
Nature发表山中伸弥新成果，iPS校正环状染色体
科学家们通过细胞重编程技术(iPS)，使正常染色体成功替代环状染色体，校正了大规模的染色体缺陷。这样的新技术有望用来治疗，因染色体异常引起的先天畸形、智力障碍和生长迟缓。 这项研究于一月十二日发表在Nature杂志的网站上，文章的通讯作者包括iPS技术的创始人山中伸弥(Shinya Y
带切口环状DNA的结构特点
中文名称带切口环状DNA英文名称nicked circular DNA定 义双链环状DNA分子中一条单链上带有一个或多个裂口。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
染色体外基因的定义
染色体外基因：也叫细胞质基因，是细胞器和细胞质颗粒中的遗传物质统称。质粒、卡巴粒、叶绿体基因、线粒体基因等。
环状染色体的概念和特点
若断裂发生于染色体的二个末端，那么断裂下来的两个断片彼此可以粘合成无着丝粒碎片，而带着丝粒的部分可通过两断端的粘合形成环状染色体。不带着丝粒的碎片往往消失，而带着丝粒的部分能继续进行有丝分裂。如慢性粒细胞白血病患者向急性方向转化时，常可见到环状染色体。（1）真核类生物中的一种异常染色体，为没有末端的
2018国自然研究热点一：环状RNA研究深度剖析
1.环状RNA为什么火？它到底是何方神圣？ 2013年两篇Nature[1][2]文章的出世，彻底颠覆了我们对RNA的传统认知，同时也迅速引爆了整个生物医学界！经过严格统计汇总后，2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项，其中有两项杰出青年基金，一项优秀
Nature－Nanotechnology：DNA环状分子的自主复制
生物系统中存在很多的自主复制的例子。然而，人工制造这样的生物系统的自主复制系统却是相当困难，这是因为生物系统很复杂。在其他领域，人类可以创造某些自我复制系统，比如磁场系统以及模块化机器人等等。我们很少将这些人造的自我复制系统和生物系统中的自我复制系统进行比较。因而，如果能从理论上将人工的自主复制
今年哪些科研会成为热点
2016年到来之际，两大国际权威学术刊物《自然》和《科学》相继刊发文章，梳理今年全球科研热点。 中国科研受关注 《自然》杂志认为，中国“科学”系列卫星和500米口径球面射电望远镜（FAST）值得关注。 《自然》说，中国于去年12月成功发射了5颗“科学”系列卫星中的首发星——暗物质粒子探测卫
体外DNA重组技术4
（二）质粒的大量制备:1.将5ml转化菌种接种于500ml LB培养液(含用于筛选的抗生素)中，37℃以225rpm速度振荡培养12～16小时；2.10,000rpm，4℃离心15min收集菌体；3.将细菌悬浮于100ml预冷的STE（0.1M NaCl，10mM Tris.Cl，pH8.0，1mM
体外DNA重组技术6
六、重组质粒的转化【实验目的】学习和掌握感受态细胞的制备方法和转化实验的基本操作。【实验原理】将重组质粒转入大肠杆菌的过程称为转化。转化所用的大肠杆菌需要用物理或化学方法特殊处理，使重组DNA分子容易进入细胞内，被处理后易于接纳DNA分子的细胞称作感受态细胞。下面介绍感受态细胞的制备。【实验试剂与器
体外DNA重组技术2
【注意事项】基因组DNA分子量大，所有操作必须轻柔，酚/氯仿对皮肤有腐蚀作用，应该戴手套操作。二、RNA的制备【实验目的】1.理解生物细胞中RNA制备方法的原理。2.熟悉组织细胞中RNA制备的基本操作。（一）细胞总RNA的提取1.异硫氰酸胍法【实验原理】异硫氰酸胍法提取细胞总RNA是目前常用的提取方
体外DNA重组技术5
（三）DNA酶切片段的回收【实验方法与步骤】1.冻融法:（1）在UV灯下，用手术刀片将含DNA片段的琼脂糖凝胶切下，-70℃冷冻至少 15min，然后在65℃水浴中使胶融化；（2）加入等倍体积TE-饱和酚，剧烈振荡30秒钟，然后-70℃冷冻 15min；（3）室温融化后，12,000rpm离心5mi
体外DNA重组技术1
在体外将两个或多个来源相同或不相同的DNA片段连接成新的重组DNA分子，再转到特定宿主细胞中进行自主复制并表达。这是分子生物学中的基本技术。DNA重组技术的基本程序包括：（1）获得外源DNA：外源DNA是进行DNA重组的目的DNA片段，一般采用 DNA聚合酶链式反应(PCR)或逆转录-DNA聚合酶链
体外DNA重组技术3
【实验试剂与器材】（1）Oligo(dT)纤维素（2）层析柱装置（3）1×上样缓冲液：20mM Tris.Cl (pH7.6)，0.5M NaCl，1 mM EDTA.Na2 (pH8.0)，0.1%十二烷基肌氨酸钠(SLS)配制方法: 用Tris.HCl、NaCl和EDTA母液，加入各成分确切
细胞化学词汇带切口环状DNA
中文名称：带切口环状DNA英文名称：nicked circular DNA定 义：双链环状DNA分子中一条单链上带有一个或多个裂口。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
分子遗传学词汇环状DNA
中文名称：环状DNA分 类：环状单链DNA和环状双链定义：超螺旋，DNA双螺旋本身进一步盘绕称超螺旋，超螺旋有正超螺旋和负超螺旋两种。当盘旋方向与DNA双螺旋方向相同时，其超螺旋结构为正超螺旋，反之则为负超螺旋，负超螺旋的存在对于转录和复制都是必要的。
什么是染色体外基因？
染色体外基因：也叫细胞质基因，是细胞器和细胞质颗粒中的遗传物质统称。质粒、卡巴粒、叶绿体基因、线粒体基因等。
受益体外检测热点－爱康生物估值攀升
据统计，目前A股市场涉及体外诊断的概念股就已达66家。9月29日，成立已有20年的爱康生物科技股份有限公司（简称爱康生物）递交招股材料，开启上交所科创板上市冲刺。 根据其募投资料，2021年总资产5.26亿元，营收3.97亿元的爱康生物拟募资6亿元，分别布局爱康生物产业基地、研发中心等项目建设和补
共价闭和环状DNA的结构特点
中文名称共价闭和环状DNA英文名称covalently closed circular DNA;cccDNA定 义两条多核苷酸链是完全连续的环状双链DNA分子。由于链上没有裂隙可以释放内部张力，所以可以形成超螺旋结构。天然状态下某些病毒、细菌的染色体DNA，质粒、线粒体和叶绿体的DNA具有这种结构
关于共价闭合环状DNA（cccDNA）的简介
在乙肝病毒的复制过程中，病毒DNA进入宿主细胞核，在DNA聚合酶的作用下，两条链的缺口均被补齐，形成超螺旋的共价、闭合、环状DNA分子（covalently closed circularDNA，cccDNA）。细胞外乙型肝炎病毒DNA是一种松弛环状的双链DNA（relaxed circular