体外DNA重组技术6
六、重组质粒的转化【实验目的】学习和掌握感受态细胞的制备方法和转化实验的基本操作。【实验原理】将重组质粒转入大肠杆菌的过程称为转化。转化所用的大肠杆菌需要用物理或化学方法特殊处理，使重组DNA分子容易进入细胞内，被处理后易于接纳DNA分子的细胞称作感受态细胞。下面介绍感受态细胞的制备。【实验试剂与器材】大肠杆菌菌株，LB培养基，100mM CaCl2 ，DMSO或2-巯基乙醇，离心机，振荡器，冰浴【实验方法与步骤】（一）感受态细胞的制备1.将大肠杆菌菌株在LB琼脂培养基上画线，37℃培养12～16h；2.次日从琼脂平板上取一单菌落于2ml LB培养基中，37℃以200 rpm速度振荡培养12～16h；3.取1ml上述培养物接种于100ml LB培养基中，37℃以200 rpm的速度震荡培养直至A600值为0.5～0.6 (大约3h)；4.将菌液置冰浴10min，然后2,500×g，4℃离心20min收集菌液；5.弃上清，倒置离心......阅读全文
体外DNA重组技术4
（二）质粒的大量制备:1.将5ml转化菌种接种于500ml LB培养液(含用于筛选的抗生素)中，37℃以225rpm速度振荡培养12～16小时；2.10,000rpm，4℃离心15min收集菌体；3.将细菌悬浮于100ml预冷的STE（0.1M NaCl，10mM Tris.Cl，pH8.0，1mM
体外DNA重组技术6
六、重组质粒的转化【实验目的】学习和掌握感受态细胞的制备方法和转化实验的基本操作。【实验原理】将重组质粒转入大肠杆菌的过程称为转化。转化所用的大肠杆菌需要用物理或化学方法特殊处理，使重组DNA分子容易进入细胞内，被处理后易于接纳DNA分子的细胞称作感受态细胞。下面介绍感受态细胞的制备。【实验试剂与器
体外DNA重组技术2
【注意事项】基因组DNA分子量大，所有操作必须轻柔，酚/氯仿对皮肤有腐蚀作用，应该戴手套操作。二、RNA的制备【实验目的】1.理解生物细胞中RNA制备方法的原理。2.熟悉组织细胞中RNA制备的基本操作。（一）细胞总RNA的提取1.异硫氰酸胍法【实验原理】异硫氰酸胍法提取细胞总RNA是目前常用的提取方
体外DNA重组技术5
（三）DNA酶切片段的回收【实验方法与步骤】1.冻融法:（1）在UV灯下，用手术刀片将含DNA片段的琼脂糖凝胶切下，-70℃冷冻至少 15min，然后在65℃水浴中使胶融化；（2）加入等倍体积TE-饱和酚，剧烈振荡30秒钟，然后-70℃冷冻 15min；（3）室温融化后，12,000rpm离心5mi
体外DNA重组技术1
在体外将两个或多个来源相同或不相同的DNA片段连接成新的重组DNA分子，再转到特定宿主细胞中进行自主复制并表达。这是分子生物学中的基本技术。DNA重组技术的基本程序包括：（1）获得外源DNA：外源DNA是进行DNA重组的目的DNA片段，一般采用 DNA聚合酶链式反应(PCR)或逆转录-DNA聚合酶链
体外DNA重组技术3
【实验试剂与器材】（1）Oligo(dT)纤维素（2）层析柱装置（3）1×上样缓冲液：20mM Tris.Cl (pH7.6)，0.5M NaCl，1 mM EDTA.Na2 (pH8.0)，0.1%十二烷基肌氨酸钠(SLS)配制方法: 用Tris.HCl、NaCl和EDTA母液，加入各成分确切
染色体外DNA的定义
中文名称染色体外DNA英文名称extrachromosomal DNA定 义存在于染色体外的DNA。包括线粒体DNA、叶绿体DNA和质粒DNA等。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
染色体外DNA的定义
中文名称染色体外DNA英文名称extrachromosomal DNA定 义存在于染色体外的DNA。包括线粒体DNA、叶绿体DNA和质粒DNA等。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
细胞化学词汇染色体外DNA
中文名称：线粒体DNA外文名称：Mitochondrial DNA,mtDNA定 义：线粒体DNA是线粒体中的遗传物质，线粒体能为细胞产生能量（ATP），是在细胞线粒体内发现的脱氧核糖核酸特殊形态。线粒体是为细胞提供能量（ATP）的细胞器。一个线粒体中一般有多个DNA分子。
细胞化学词汇染色体外DNA
中文名称：染色体外DNA英文名称：extrachromosomal DNA定 义：存在于染色体外的DNA。包括线粒体DNA、叶绿体DNA和质粒DNA等。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
染色体外环状DNA（eccDNA）
1. eccDNA成环的整体统eccDNA测序结果充分体现了基因组水平成环的多样性。eccDNA来源十分丰富，同一个基因有可能会产生非常多的环状，同样一个环状也不仅仅只会包含一个外显子。TTN基因就是一个非常典型的例子。该基因长度达到了0.3Mb，而这样一个基因竟然能衍生得到130个eccDNA，是
染色体外DNA的基本信息
中文名称染色体外DNA英文名称extrachromosomal DNA定 义存在于染色体外的DNA。包括线粒体DNA、叶绿体DNA和质粒DNA等。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
体外连接DNA片段的方式有哪些？
第一种方法是，用DNA连接酶连接具有互补粘性末端的DNA片段;第二种方法是，用T4DNA连接酶直接将平末端的DNA片段连接起来，或是用末端脱氧核苷酸转移酶给具平末端的DNA片段加上poly(dA)-poly(dT)尾巴之后，再用DNA连接酶将它们连接起来;第三种方法是，先在DNA片段末端加上化学合成
体外连接DNA片段的具体方式介绍
平末端DNA片段的连接常用的平末端DNA片段连接法，主要有同聚物加尾法、衔接物连接法及接头连接法。同聚物加尾法这种方法的核心部分是，利用末端脱氧核苷酸转移酶转移核苷酸的特殊功能。末端脱氧核苷酸转移酶是从动物组织中分离出来的一种异常的DNA聚合酶，它能够将核苷酸(通过脱氧核苷三磷酸前体)加到DNA分子
体外连接DNA片段的具体方式介绍
平末端DNA片段的连接常用的平末端DNA片段连接法，主要有同聚物加尾法、衔接物连接法及接头连接法。同聚物加尾法这种方法的核心部分是，利用末端脱氧核苷酸转移酶转移核苷酸的特殊功能。末端脱氧核苷酸转移酶是从动物组织中分离出来的一种异常的DNA聚合酶，它能够将核苷酸(通过脱氧核苷三磷酸前体)加到DNA分子
DNA体外转染试剂_如何准备转染所需的质粒DNA
转染效率受到诸多因素的影响，除了细胞、培养基和载体等影响因素外，另外一项非常重要的因素便是DNA的质量。为了比较不同厂家的转染效率，我们分别从三家不同的供应商购买了质粒制备试剂盒来制备pEGFP-N3质粒DNA，并通过不同的方法将制备的pEGFP-N3质粒转运至NIH-3T3细胞。pEGFP-N3质
分析体内DNA复制和体外PCR扩增DNA有何异同点
一、相同点1、体内DNA复制和体外PCR扩增DNA都是DNA的复制过程。2、体内DNA复制和体外PCR扩增DNA都需要酶促合合成过程。二、不同点1、条件不同体内DNA复制：以DNA双链、细胞分裂环境为条件。体外PCR扩增DNA：以模板DNA、引物和4种脱氧核苷酸存在的条件。2、过程不同体内DNA复制
分析体内DNA复制和体外PCR扩增DNA有何异同点
相同点： 都是半保留复制，都会经历DNA双链的解开（变性），寡聚核酸与单链DNA的结合（退火），以及DNA聚合酶开始合成DNA（延伸）的三个过程。不同点：1、连续性不同体内DNA复制半不连续复制，体外PCR连续复制，不会产生冈崎片断。2、酶不同PCR技术形成DNA时用耐热DNA聚合酶，而DNA复制用
分子遗传学词汇染色体外DNA
中文名称：染色体外DNA英文名称：extrachromosomal DNA定 义：存在于染色体外的DNA。包括线粒体DNA、叶绿体DNA和质粒DNA等。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
染色体外DNA——导至癌症恶变的罪魁
北京时间11月21日，发表在《Nature》上的一篇新研究发现，在人类肿瘤细胞中发现大量如“甜甜圈”般的环状染色体外DNA(EcDNA)，改变了与癌症相关基因的表达方式，从而促进了癌细胞的侵袭性，并在肿瘤快速进化和抵御威胁的能力（如化疗、放疗和其他治疗）中发挥了关键作用。该研究由美国加州大学圣地亚哥
癌基因的关键——染色体外环状DNA（eccDNA）
实验方法：环状DNA-seq, RNA-seq（云序生物提供以上服务）1. ecDNA是环状结构为了了解ecDNA的结构，作者通过环状DNA-seq（云序生物提供以上服务）方法研究了三种人类癌细胞系和来自于TCGA的临床肿瘤样品。通过这种方法检测到了GBM39细胞中的圆形扩增子游离于染色体之外，并且
聚合酶链式反应体外扩增DNA：PCR
聚合酶链式反应体外扩增DNA1. 按以下次序，将各成分加在0.5 ml灭菌离心管、扩增管或灭菌滴定板的孔内混合：10×扩增缓冲液 5μl20 mmol/L 4种dNTP混合液（pH 8.0） 1μl20 μmol/
研究者首次发现孕妇染色体外环状DNA
人血浆中细胞游离的DNA（cfDNA）的片段化模式是引起人们广泛研究的领域。在怀孕期间，观察到胎儿血浆DNA（主要是胎盘来源）是线性DNA片段，比母体来源（主要是造血来源）DNA短。有研究报道了人和鼠血浆中存在染色体外环状DNA（eccDNA）。但是，尚无有关孕妇血浆中eccDNA的公开数据。
《Nature－Genetics》染色体外DNA会改变癌基因扩增水平
恶性胶质瘤（glioblastoma，GBM）是最常见且最具攻击性的脑癌，标准治疗反应很差，两年生存率仅为15%。最近，《Nature Genetics》的一篇文章发现了GBM肿瘤耐药的一个关键密码。 为了靶向遏制GBM的攻击性，杰克逊实验室（Jackson Laboratory，JAX）教授
我国团队在体外成功重构DNA双链断裂的形成
北京时间2月19日24点，国际学术期刊Nature 在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（原生物化学与细胞生物学研究所）童明汉课题组联合上海交通大学医学院附属新华医院黄旲团队的研究成果，题为“In vitro reconstitution of meiotic DNA double-st
以双链－DNA－为模板的体外诱变：用－DpnⅠ选择
实验材料 带 hsdR17 基因型的感受态大肠杆菌菌株 试剂、试剂盒 ATP 含有四种 dNTF 的混合溶液
帕金森体外模型帕金森体外模型
体外培养的中脑多巴胺能神经元MPTP损伤模型l实验操作：实验采用胚胎龄14一16天的大鼠，剖子宫取胎，取胎鼠中脑腹侧区。可将多个胚胎来源的组织收集在一起，置Fl2培养基（Gibco）至35mm的培养皿中，以细剪刀剪碎。将2ml含0.125％的胰酶的F12加入到组织中，该混合物于37oC孵育10分钟后
武汉大学：建立体外高效CRISPR/Cas9靶向DNA编辑系统
在我们的DNA深处潜伏着许多“寄生虫”，那就是被称为跳跃基因的转座子。这些尾巴很长的家伙如果插入健康的基因，就可能会引发疾病。不过迄今为止，人们还不清楚这种尾巴对于转座子的跳跃有何作用。 密西根大学医学院的研究团队在十一月十二日的Molecular Cell杂志上发表文章指出，没有尾巴的转座子
全局DNA甲基化重塑技术帮助检验体外实验模型是否有效
一些神经疾病的发病率正在攀升，特别是那些与衰老有关的疾病，如阿尔兹海默症和帕金森。为了更好地了解这些疾病，评估潜在新疗法，生物学家需要能在实验室进行研究的精确模型。 来自Salk和Stanford的研究人员，与Baylor医学院的合作者证明，用之前发表的方法诱导神经细胞，与大脑中自然发育的神经
科学家首次解析肿瘤染色体外DNA的环状结构与功能
早期研究认为肿瘤中大量扩增的原癌基因存在于染色体上。2017年，来自美国加州大学圣迭戈分校的Paul Mischel教授团队在Nature杂志上指出，它们是以染色体外DNA（extrachromosomal DNA，ecDNA）的形式存在的，但ecDNA的结构和功能一直缺乏直接的证据。 201