世界首篇非洲爪蟾环状RNA研究成果发表！
作为最新的明星分子，环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度？从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑：上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界首个小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究，整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上，云序客户此前更是先后发表了全世界第一篇斑马鱼环状RNA、第一篇小麦环状RNA和第一篇鸡环状RNA文章，如今首篇非洲爪蟾的环状RNA文章新鲜出炉了！这一成果今年年初发表在《Chemosphere》（影响因子4.2）上！ 研究背景： 利用高通量测序手段，研究者们在拟南芥、小鼠、果蝇和人体内都发现了环状RNA的高度表达，证明了环状RNA在不同物种中广泛存在。目前，已经进行过环状RNA研究的物种数量还非常有限，环状RNA数据库circBase中已收录的物种仅有7个。作为一种重要的模式生物，非洲爪蟾的环状RNA尚未见报道。本文通过云序生物提供的一站式环状RNA测......阅读全文
中科院，港中大PNAS基因编辑研究新成果
近日来自香港中文大学、中科院广州生物医药与健康研究院等机构的研究人员成功利用遗传工程转录激活因子样效应物核酸酶(TALENs)技术在爪蟾胚胎中获得了高效的靶向基因破坏。相关论文“Efficient targeted gene disruption in Xenopus embryos usi
《Science》发表中科院研究成果
来自中国科学院南京地理与湖泊研究所，美国北卡罗琳娜大学的研究人员在Science(317卷)发表了今年夏季太湖蓝藻水华大量暴发的现场报道。 原文检索：Science 31 August 2007:Vol. 317. no. 5842, p. 1166 DOI: 10.1126/science.3
当外泌体遇上环状RNA（二）
（4）circUHRF1通过miR-449c-5p相关途径来抑 制NK细胞功能作者利用生物信息学预测了14个miRNA，在NK-92细胞中进行circUHRF1-RIP以及qPCR，结果表明miR-449c-5p是NK-92细胞中一个与circUHRF1相互作用的miRNA。在NK-92细胞中进行抗
当外泌体遇上环状RNA（五）
（6）circSHKBP1直接HSP90相互作用并抑 制其降解在HGC27细胞中用circSHKBP1探针的RNA pull-down和蛋白质谱结果显示两个差异表达蛋白HSP90β和HSP90α（HSP90的异构体）在过表达circSHKBP1的GC细胞中富集。RIP实验显示，circSHKBP1能
环状RNA研究的方法及功能作用（一）
环状RNA—隐秘的未知RNA平行宇宙环状RNA，被喻是隐秘的未知RNA平行宇宙。最近，复旦大学的郑秋鹏博士（2016交流会嘉宾之一）以第一作者身份在Nature Communications上发布了他们关于circHIPK3的最新研究成果。现在就和小编一起来学习circRNA的研究思路，认识圆圈重塑
当外泌体遇上环状RNA（七）
（3）circPACRGL作为海绵分子结合miR-142-3p和miR-506-3p作者使用生物信息学数据库预测发现circPACRGL同时具有miR-142-3p和miR-506-3p的结合位点，双荧光素酶报告实验检测也证实miR-142-3p和miR-506-3p可与circPACRGL直接结合
Nat－Rev－Genetics－|－环状RNA的合成与功能
环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种新兴的内源性非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA)，是继microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非编码RNA家族中极具研究潜力的新成员。越来越多的研究表明，环状RNA具
当外泌体遇上环状RNA（四）
（3）GC来源的外泌体circSHKBP1在体外能促进GC细胞的增殖、迁移和侵袭为了探索circSHKBP1是否影响GC细胞的生物学过程，分析了circSHKBP1在4种人GC细胞系（BGC823、HGC27、AGS和MGC803）和正常胃上皮细胞系GES1中的表达水平。结果表明，circSHKBP
当外泌体遇上环状RNA（一）
文章导读外泌体是细胞分泌的大小为30-200nm的盘状囊泡，它在人体体液中分布广 泛。2013年，科学家通过研究外泌体细胞囊泡调控机制获得诺贝尔奖，这使外泌体开始被广 泛关注，随着研究的深入，人们发现外泌体可作为细胞间信息交流的桥梁，在细胞间往来穿梭进行信息传递。另外，外泌体与疾病的发生尤其
环状RNA研究的方法及功能作用（二）
RNA是怎样变成环状的呢？a. 在可变剪切过程中，外显子迁移，剪切形成套索结构，拉近剪切位点，促进序列成环b. 依赖邻近的反向互补序列配对，拉近剪切位点，使其相互攻击，促进序列成环c. 单个内含子直接成环d. RNA结合蛋白、反式作用因子参与成环研究功能，敲降看看据文献报道，环状RNA可以被小干扰R
当外泌体遇上环状RNA（三）
2. 外泌体circSHKBP1通过调控miR-582-3p/HUR/VEGF过程以及抑 制HSP90降解来促进胃ai发展发表期刊：Molecular Cancer影响因子：15.302发表时间：2020.6.29文章链接：Exosomal circSHKBP1 promotes gastric
当外泌体遇上环状RNA（六）
3. 外泌体circPACRGL通过miR-142-3p/miR-506-3p- TGF- cm1过程驱动大肠ai的恶化发表期刊：Molecular Cancer影响因子：15.302发表时间：2020.7.27文章链接：Exosomal circPACRGL promotes progressio
脑创伤外泌体环状RNA的鉴定功能及预测
近期，云序生物客户天津医科大学总医院张建宁教授带领的神经创伤团队针对大脑创伤的研究。该课题组集合了外泌体和环状RNA两大科研热点，应用云序生物提供的全转录组测序服务，仅通过大脑创伤外泌体中环状RNA表达谱研究就成功地于今年年初在《Journal of Neurotrauma》（影响因子5.19）
8篇论文，Science最新研究成果概览
1.Science：揭示哺乳动物卵母细胞中的非中心体纺锤体组装机制 doi:10.1126/science.aat9557 哺乳动物胚胎经常异常发育，从而导致流产和遗传性疾病，如唐氏综合症。胚胎发育异常的主要原因是卵子减数分裂过程中的染色体分离错误。与体细胞和雄性生殖细胞不同的是，卵子通过一
6篇论文，Science最新研究成果概览！
1.Science：靶向白细胞中的IRE1α–XBP1信号通路抑制前列腺素合成，改善疼痛治疗 doi:10.1126/science.aau6499； doi:10.1126/science.aay2721 组织损伤触发由免疫细胞协调的快速局部反应，这决定了炎症的维持和消退，因而也就决定了是
m6A－RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用（四）
1）m6A修饰PCR芯片 new！云序生物提供m6A修饰PCR芯片检测，高效一次性检测m6A相关的Writer，Eraser，Reader的表达情况，m6A PCR 芯片基因列表（34 个基因）-human如图： 2）RNA修饰PCR芯片 new！云序生物提供多种RNA修饰PCR芯片检测，高效一次
m6A－RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用（一）
导读最近小编检索了关于m6A修饰的文章发表情况，发现目前2020年发表的关于m6A修饰的文章已经达到309篇，已经追平2019年整年度发表篇数，可以预见m6A RNA修饰下半年年发表文章会呈现出爆炸式增长。 图1. 近6年m6A RNA修饰相关文章发表情况（ data from PubMed）那么您
m6A－RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用（二）
为了进一步说明Mettl3在CRC糖酵解过程中促进肿瘤发展的作用，作者通过RNA-seq(云序可提供此服务)分析比较Mettl3 KO和野生型的细胞（WT HCT116 CRC）基因表达情况。通过GO和KEGG分析，WT HCT116主要富集与葡萄糖代谢相关的信号通路，而Mettl3 K
m6A－RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用（三）
（5）酶METTL3作用分子机制研究已表明Mettl3是一种甲基化转移酶，可以调控靶分子的甲基化水平，那么是如何调节糖代谢过程呢？现有实验已表明Mettl3敲除或过表达不仅影响HK2和SLC2A1的甲基化水平，还调节HK2和SLC2A1的表达水平，这暗示着靶分子甲基化水平影响其表达，而双荧光素酶实验
脑创伤外泌体环状RNA的鉴定功能及预测
近期，云序生物客户天津医科大学总医院张建宁教授带领的神经创伤团队针对大脑创伤的研究。该课题组集合了外泌体和环状RNA两大科研热点，应用云序生物提供的全转录组测序服务，仅通过大脑创伤外泌体中环状RNA表达谱研究就成功地于今年年初在《Journal of Neurotrauma》（影响因子5.19）
施一公等登Science封面：AI与冷冻电镜揭示「原子级」NPC结构
6月10日，《Science》杂志以封面专题形式发表了 5 篇论文，其中 3 篇论文共同揭开了人类核孔复合体的近原子分辨率冷冻电镜结构，另外两项研究通过非洲爪蟾呈现了脊椎动物核孔复合体的单颗粒冷冻电镜图像。这篇封面文章将多项研究成果拼接在一起，形成的人类 NPC 图像接近原子级。这一研究成果建立在多
《细胞》同期发表四篇中国论文
近日，最新一期的国际顶级学术期刊《细胞》杂志同时在线发表了4篇以中国科研机构为第一单位和通讯单位的研究论文。 这四篇论文分别来自中科院上海药物所徐华强团队，浙江大学免疫所曹雪涛院士团队，上海交通大学医学院附属仁济医院房静远、陈萦晅、洪洁、陈豪燕与美国密歇根大学邹伟平合作团队，中科院生物物理所王
Nature在线发表4篇华人研究
对于华人学者在学术界做出的突破性研究,我们总是倍感亲切。今日,在顶尖学术期刊《自然》在线发表的多篇文章中,我们很高兴地看到,有4篇生物医药领域的研究来自于华人学者的课题组。在这篇文章里,我们也将为各位读者介绍这4篇论文。 Yueh-hsiu Chien课题组 A multi-cohort s
世界首次发表猛禽基因组成果
由英国卡迪夫大学、华大基因等联合完成的游隼、猎隼基因组研究成果，近日在《自然》杂志在线发表。该研究为科研工作者从全基因组水平探究游隼和猎隼的捕食性提供了一个全新的视角，对深入探究游隼、猎隼的起源、进化及其他生物学特性研究具有重要价值。这是世界上首次猛禽基因组成果被发表。 游隼和猎隼都属于猛
同济大学Nature发表最新研究成果
来自同济大学医学院、加州大学洛杉矶分校和南京医科大学大学的研究人员，采用单细胞RNA测序技术揭示了人类和小鼠早期胚胎的遗传程序，研究成果发表在7月28日的《自然》(Nature)杂志上。 同济大学医学院的薛志刚(Zhigang Xue)博士、南京医科大学的刘嘉茵(Jia-yin Liu)教
张锋参与发表CRISPR新研究成果
2016年7月29日，国际学术期刊《Journal of Biological Chemistry》在线发表了哈佛大学医学院、麻省理工学院-哈佛大学Broad研究所和山西眼科医院等处的一项最新研究成果，题为“The Clustered, Regularly Interspaced, Short
清华大学Nature发表最新研究成果
来自清华大学、香港科技大学和康奈尔的研究人员报告称，他们成功揭示出了分辨率达到3.8埃近原子水平的真核生物MCM复合物结构。这一重要的研究结果发布在7月29日的《自然》（Nature）杂志上。 清华大学生命科学学院的高宁（Ning Gao）研究员、香港科技大学的Yuanliang Zhai助理
浙江大学Nature发表最新研究成果
每年，在亚洲水稻都面对着来自一种芝麻籽大小的昆虫——褐飞虱(brown planthopper)的巨大威胁。现在由浙江大学领导的一项研究揭示出了，使得一些飞虱发育为短翅型，而另一些飞虱发育为长翅型的原因——这是决定它们入侵新水稻田能力的一个重要因素。研究结果发表在3月18日的《自然》（Natur
清华院士Cell－Research发表重要研究成果
Ca2+/钙调蛋白依赖的蛋白磷酸酶calcineurin（CN），是由一个催化亚基A和一个调控亚基B组成的异源二聚体。CN在多种细胞过程中起到了关键功能，比如心肌肥厚和T细胞激活。不过CNA调控区域的大部分结构还有待确定，CN活性的调控机制也存在相当大的争议。 清华大学的研究团队日前获得了全长
苏州大学研究成果在《Nature》发表
目前，能源短缺危机以及碳排放问题正让世界各国重新审视核电发展的重要性。然而，作为核能可持续发展的前提，如何安全高效处理处置核燃料循环所产生的强放射性核废料，仍是尚未解决的世界性难题。 近日，苏州大学放射医学与辐射防护国家重点实验室王殳凹教授团队联合清华大学、美国科罗拉多矿业大学、德国于利希研究