锐博生物:环状RNA研究的方法及功能作用介绍

锐博生物:环状RNA—隐秘的未知RNA平行宇宙 环状RNA,被喻是隐秘的未知RNA平行宇宙。最近,复旦大学的郑秋鹏博士(2016交流会嘉宾之一)以第一作者身份在Nature Communications上发布了他们关于circHIPK3的最新研究成果。现在就和小编一起来学习circRNA的研究思路,认识圆圈重塑的RNA世界吧。 环状RNA测序的样本选择、分析方法 RNA测序分析来自6个正常组织(脑、结肠、心脏、肝、肺、胃)和7个癌症组织(膀胱尿路上皮癌、乳癌、结直肠癌、肝癌、胃癌、肾透明细胞癌、前列腺癌)的去核糖体RNA后的总RNA,发现了67,358个潜在的环状RNA,其中27,296含有至少两个unique back-spliced reads。 研究者使用RefSeq database 24对这些环状RNA进行注释;环状RNA表达差异使用Wilcoxon rank-sum test计算,比较癌症......阅读全文

锐博生物:环状RNA研究的方法及功能作用介绍

  锐博生物:环状RNA—隐秘的未知RNA平行宇宙   环状RNA,被喻是隐秘的未知RNA平行宇宙。最近,复旦大学的郑秋鹏博士(2016交流会嘉宾之一)以第一作者身份在Nature Communications上发布了他们关于circHIPK3的最新研究成果。现在就和小编一起来学习circRNA的

锐博生物:环状RNA研究的方法及功能作用介绍

  锐博生物:环状RNA—隐秘的未知RNA平行宇宙   环状RNA,被喻是隐秘的未知RNA平行宇宙。最近,复旦大学的郑秋鹏博士(2016交流会嘉宾之一)以第一作者身份在Nature Communications上发布了他们关于circHIPK3的最新研究成果。现在就和小编一起来学习circRNA的

环状RNA研究的方法及功能作用(二)

RNA是怎样变成环状的呢?a. 在可变剪切过程中,外显子迁移,剪切形成套索结构,拉近剪切位点,促进序列成环b. 依赖邻近的反向互补序列配对,拉近剪切位点,使其相互攻击,促进序列成环c. 单个内含子直接成环d. RNA结合蛋白、反式作用因子参与成环研究功能,敲降看看据文献报道,环状RNA可以被小干扰R

环状RNA研究的方法及功能作用(一)

环状RNA—隐秘的未知RNA平行宇宙环状RNA,被喻是隐秘的未知RNA平行宇宙。最近,复旦大学的郑秋鹏博士(2016交流会嘉宾之一)以第一作者身份在Nature Communications上发布了他们关于circHIPK3的最新研究成果。现在就和小编一起来学习circRNA的研究思路,认识圆圈重塑

环状RNA研究方法(一)

至2015起云序生物已经完成10000+例环状RNA全转录组测序服务,涵盖了50+疾病,20+物种,帮助众多客户在环状RNA分子的研究中取得突破性进展。客户发表的环状RNA文章高达20篇以上。此外云序生物还提供环状RNA机制研究手段,rip&RNA pull down技术,帮助客户冲刺高分机制文章。

环状RNA研究方法(二)

在此基础上,哪些环状RNA分子发生了差异表达?在这里火山图、Venn图应有尽有。根据p=2的标准,一共发现42个环状发生上调,47个环状发生下调。 图3. 差异环状RNA的筛选2. 差异环状RNA分子的qPCR验证对于一篇做谱的文章,差异环状RNA的结果验证只需做到qPCR即可。对5个上调和5个下调

云序生物环状RNA研究文章汇总

  环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品,严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章,受到了广大客户的一致好评。迄今为止,云序已经积累了超过10000例环状RNA测序的经验,样本覆盖20多个物种以及50多种疾病,客户发表文章达

云序环状RNA研究策略在环状RNA研究的应用(一)

环状RNA作为新发现的RNA分子,从诞生之日起就是光环加身,屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期发表的《2019研究前沿》中,“环状RNA作为癌症新的生物标志物”成为生物科学领域6个新兴前沿之一。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇,较2018年增长约20%,其中大

云序环状RNA研究策略在环状RNA研究的应用(二)

4.对年龄相关性白内障circRNA的分析显示,circZNF292可以通过海绵机制调节miR-23b-3p功能发表期刊:Aging-us影响因子:4.831发表时间:2020.9.10研究方法:全转录组测序、qRT-PCR、RIP、RNA pull down、双荧光素酶实验等云序提供文章链接:Pr

环状RNA结合功能蛋白

环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转录前

环状RNA研究深度剖析

  1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?   2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀

环状RNA研究文章汇总(二)

4.世界首篇人胶质瘤环状RNA研究(影响因子:3.0)胶质瘤作为最常见的颅内恶性肿瘤占颅脑肿瘤的40%~50%,电磁辐射等其他环境致癌因素会导致胶质瘤的发生,尽管手术切除、术后放疗、药物化疗等方法可以作为主流的胶质瘤治疗手段,但是多形性胶质母细胞瘤(GBM)的强侵袭、增殖能力仍给病人的治疗造成很大的

环状RNA研究文章汇总(一)

环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品,严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章,受到了广大客户的一致好评。迄今为止,云序已经积累了超过10000例环状RNA测序的经验,样本覆盖20多个物种以及50多种疾病,客户发表文章达20

环状RNA研究深度剖析(一)

1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀青年基金,两

环状RNA研究深度剖析(二)

目标circRNA的机制研究 a RIP-qPCR:挑选功能最为明显的1个circRNA做RIP-qPCR实验,检测circRNA是否与AGO2蛋白结合。(AGO2是circRNA发挥海绵作用的指示蛋白) b RNA pull down:对上述circRNA进行RNA pull down实验,拉

锐博生物:外泌体在肝纤维化过程中发挥的作用研究

  过分!外泌体连肝纤维化也掺和!   关于IL-17 (白介素-17) 对肝脏疾病的作用,科学家们已经研究得很透彻了,但尚不知道IL-17的来源,特别是在非病原体引起的肝损伤和纤维化。今天我们来看看,来自韩国KAIST的研究者在Hepatology上叙述的一个关于外泌体与肝纤维化的故事。   

锐博生物:外泌体在肝纤维化过程中发挥的作用研究

  过分!外泌体连肝纤维化也掺和!   关于IL-17 (白介素-17) 对肝脏疾病的作用,科学家们已经研究得很透彻了,但尚不知道IL-17的来源,特别是在非病原体引起的肝损伤和纤维化。今天我们来看看,来自韩国KAIST的研究者在Hepatology上叙述的一个关于外泌体与肝纤维化的故事。   

环状RNA(circRNA)功能研究又一利器——过表达载体

circRNAs 环状 RNA(circular RNAs,circRNA)是一类具有闭合环状结构的 RNA 分子,早在 20 世纪八十年代即有研究报道,但由于其表达丰度低,文献报道较少,一直被认为是 RNA 转录剪切的罕见错误而被忽视。直到 2012 年开始有研究者开始大批量鉴定 circRN

非洲爪蟾环状RNA研究成果

作为最新的明星分子,环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度?从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑:上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界首个小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究,整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上,云序客户此前更是先后发表了全世界第

Nat-Rev-Genetics-|-环状RNA的合成与功能

  环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种新兴的内源性非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA),是继microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非编码RNA家族中极具研究潜力的新成员。越来越多的研究表明,环状RNA具

锐博生物:特定的tRNA基因的表达促进肿瘤转移

  Cell重大发现:tRNAs促进肿瘤转移   转运RNAs(tRNAs)最初被认为是基因表达的静态参与者,但是6月2号,洛克菲勒大学的H. Goodarzi研究团队在Cell上发表的文章证明,tRNA也是基因表达的动态调节器,可影响疾病进展。接下来让我们一起来看看他们的研究成果吧。   H.

锐博生物-LincRNAEPS如何通过转录制动来发挥抑制炎症作用

  麻省大学医学院的Katherine研究团队于6月16号在Cell上发表了lincRNA-EPS能够抑制免疫炎症反应的研究成果,进一步证明lincRNA在免疫系统中的重要性。   研究背景   基因间长链非编码RNA (Long intergenic noncoding RNAs, LincR

乳环状试验的方法作用

中文名称乳环状试验英文名称milk ring test定  义用于检测牛、羊是否感染布鲁菌的高灵敏试验。即制备苏木精染色的死布鲁菌悬液,与牛、羊乳汁进行环状试验,乳脂表层形成红色(或蓝色)环者为阳性。应用学科免疫学(一级学科),应用免疫(二级学科),免疫学检测和诊断(三级学科)

【锐赛小课堂】miRNA研究之RNA标记

  RNA标记是将标记物(如放射性同位素、荧光素或酶)共价地连接到RNA,通过检测标记物,进而实现对RNA鉴别和检测的目的。RNA标记在分子探针领域应用广泛,在疾病诊断方面也很有前景。   理想的RNA标记方法应符合以下要求:   1. 操作简单,灵敏度高   2. 不影响碱基配对的特异性

研究发现环状RNA限制皮肤癌的转移

  一项新的研究发现,一种神秘的遗传物质可以抑制皮肤癌细胞的扩散,但随着它们的成熟,这种物质往往会丢失。这项新研究近日发表在《Cancer Cell》上。通常,DNA被转化成RNA,然后转化成具有细胞功能的蛋白质。虽然大多数RNA是线性分子,但当它们的末端循环并附着时,有些会形成圆圈。  该研究的作

2018国自然研究热点一:环状RNA研究深度剖析

  1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?   2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀

反式作用RNA的功能

中文名称反式作用RNA英文名称trans-acting RNA定  义通过分子间反应机制起作用的RNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

RNA沉默的功能作用

植物可利用 PTGS 和 TGS 来抵抗病毒侵染, 病毒侵染植物后会产生大量病毒来源的小 RNA (virus-derived small interfering RNAs, vsiRNA), 介导对病毒 RNA 的降解或抑制病毒基因的转录;而在与植物长期共进化过程中, 病毒编码一个或多个RNA沉默

环状-RNA-测序案例分析

案例:以结肠癌,卵巢癌,特发性肺纤维化及正常的人组织为例探讨 circular RNAs 的富集与增殖的相关性 背景:最新研究表明,circular RNAs 大量存在,是构成生物体 RNA 网络的一部分,而且研究者们推测 circular RNAs 与 miRNAs 一样具有生物学功能。 目的

生物安全柜的作用及功能特点介绍

  生物安全柜的作用   生物安全柜主要是在操作原代培养物、菌毒株以及诊断性标本等具有感染性的实验材料时,用来保护操作者本人、实验室环境以及实验材料,使其避免暴露于上述操作过程中可能产生的感染性气溶胶和溅出物而设计的。  根据不同的生物研究和防疫要求,生物安全柜可分为一级、二级和三级三大类,其中一类