PLoSONE:鹌鹑PIWI基因的克隆及其结合小RNA的鉴定

PIWI 蛋白能通过与多种内源非编码小RNA结合在表观水平和转录后水平调控基因的表达。然而在家禽中,PIWI蛋白的生物学功能及其结合小RNA的作用机制尚不清楚。扬州大学动物科学与技术学院陈国宏教授课题组对该作用机理进行了研究*,研究成果发表在2012年12月刊的PLoS ONE上。 PIWI 基因最早在果蝇的生殖干细胞(Germline Stem Cells,GSCs)中被发现,因其编码的蛋白质能调节GSCs的数量与分化率而得到研究者的进一步研究。在果蝇中,PIWI亚家族包含三个成员:PIWI, AUB, AGOs。对于PIWI突变个体,雄性与雌性均表现不育。而在人类中,PIWI蛋白除了参与精子发生外,同时也与肿瘤的形成和发展相关。 在本研究中,研究者首先克隆得到PIWI基因,随后利用二代测序技术对鹌鹑的小RNA表达谱进行分析(由联川生物承担完成),并利用生物信息学方法预测了与其绑定的小RNA,再经......阅读全文

中国农大:测序解析miRNA调控害虫发育机制

  小菜蛾(Plutella xylostella)是全球范围内严重危害十字花科作物生长的鳞翅目害虫,据估计每年造成的损失和防治成本达到40-50亿美元。最近的转录组分析和基因组测序为了解小菜蛾适应环境胁迫的分子机制提供了一个极好的机会。尽管Etebari等1发现了在寄生胁迫下二龄幼

诱骗RNA结合蛋白不与癌细胞中的天然RNA分子结合

  科学家也开始变得“狡猾”,开始用欺骗来对抗癌症。希伯莱大学的研究人员发明了一种诱饵,可以阻止癌症用于转移的RNA结合蛋白。  近年来,RNA结合蛋白在肿瘤生长中起着重要作用已经成为不争的事实。这些蛋白在所有细胞中都很活跃,尤其是在癌细胞中,它们与RNA分子结合,加速癌细胞的生长。不幸的是,目前还

核仁小RNA的功能及其在癌症研究中的作用(一)

为什么研究snoRNAs?引言核仁小RNA(snoRNAs)是一类中等长度的非编码小RNA,它们的长度在60-300nt不等,能与核仁核糖核蛋白结合形成snoRNPs 复合物[1]。在脊椎动物中编码核仁小RNA的基因主要存在于蛋白编码基因或非蛋白编码基因的内含子区域,并且经过进一步的转录后加

核仁小RNA的功能及其在癌症研究中的作用(二)

snoRNAs在癌症中的作用snoRNAs参与的癌症的分子病理学研究snoRNAs在癌症中的作用起始于一项研究:在脑膜瘤中,与正常脑组织相比snoRNAs的表达大幅下调[20]。最近研究发现,在非小细胞肺癌中多种snoRNAs呈现出不同的表达状态[21]。其它的研究证明snoRNAs U50

可爱龙教授Cell评述重要结构生物学进展

  在所有的非编码RNA中, piRNA 数量最多, 主要存在于生殖系统,这种RNA在动物生殖组织中可以引导PIWI蛋白质沉默有害的转座子。其关键作用复合物:piRNA诱导沉默复合体piRISC的生物合成涉及多个步骤,至今科学家尚未清楚了解这个步骤的分子机制。  近期一组研究人员报道了PIWI-cl

PLOS ONE :抗击糖尿病、避免并发症的新工具

  根据PLOS ONE 5月1日发表的一项研究,Benjamin U. Nwosu医学博士已经开发了一种与1型糖尿病相关的有价值的新工具。  该工具使临床医生能够预测新近诊断的1型糖尿病患儿在治疗早期几个月内是否会出现暂时的,但有益的,部分临床缓解现象。那么不太可能进入所谓的“蜜月期”的患者可以被

《PLOS-ONE》:廉价、快速和详细的蛋白质分析新技术

  报道:蛋白质是几乎所有生命过程的重要参与者,包括细胞生长、修复和信号转导,化学反应催化和防御感染。因此,只要能够在临床上鉴定和评估它们,蛋白质就能够提供健康和疾病的重要标志。   对用于治疗和诊断目标的蛋白质进行准确定性,一直是医学界的一个巨大挑战。亚利桑那州立大学生物设计研究所生物

plos-one:减脂手术导致的口味偏好变化会影响体重

  根据来自伯明翰大学的研究人员做出的一项新研究,接受RYGB(一种减肥手术)之后,许多患者对甜味和脂肪类食物的口味偏好会有所降低,尽管这种影响可能只是暂时的。  肥胖症是世界范围内日益增长的流行病,并且是因心脏病和吸烟导致死亡的主要原因。减肥手术,特别是RYGB,是治疗肥胖最有效的方法。  作者认

克隆的筛选和快速鉴定

实验概要掌握快速细胞破碎法测定大小不等的众多的质粒DNA;和菌落PCR快速鉴定克隆。实验原理在这个实验方法中,只需配制一种细胞缓冲液(它可以在室温下保存,长期使用)。利用破碎细胞缓冲液中的阴离子去污剂---SDS在37℃溶解膜蛋白,使细胞破裂,并解聚核蛋白,SDS还能与蛋白质结合形成复合物,使得蛋白

转化克隆的筛选和鉴定

1.目的学会用酶切法或PCR法筛选重组质粒转化成功的克隆菌。2.原理利用转化后宿主菌所获得的抗菌素抗性性状筛选出获得质粒的菌落克隆。再从这些菌落中鉴定出质粒上带有外源基因插入片段的克隆菌落。3.器材旋涡混合器,小镊子,微量移液取样器,移液器吸头,1.5ml 微量离心管,双面微量离心管架,干式恒温气浴

转化克隆的筛选和鉴定

实验概要本实验介绍了转化克隆的筛选和鉴定方法,有助于学会用酶切法或PCR法筛选重组质粒转化成功的克隆菌。实验原理利用转化后宿主菌所获得的抗菌素抗性性状筛选出获得质粒的菌落克隆。再从这些菌落中鉴定出质粒上带有外源基因插入片段的克隆菌落。主要试剂1. LB培养基(加抗菌素)2. PCR用试剂3. 引物4

转化克隆的筛选和鉴定

1.目的学会用酶切法或PCR法筛选重组质粒转化成功的克隆菌。 2.原理利用转化后宿主菌所获得的抗菌素抗性性状筛选出获得质粒的菌落克隆。再从这些菌落中鉴定出质粒上带有外源基因插入片断的克隆菌落。 3.器材旋涡混合器,小镊子,微量移液取样器,移液器吸头,1.5ml 微量离心管,双面微量离心管架,干式恒温

PLoS-ONE:摄取大量叶酸可促进乳腺癌生长

  一项新研究发现,给予大鼠北美乳腺癌患者及幸存者消耗水平的叶酸补充剂,会促进大鼠体内已有乳腺癌的生长。   叶酸是B族维生素中的一种,常见于深绿色蔬菜,豆类、水果和动物肝脏中。叶酸在人类中充当辅酶的作用,参与氨基酸和核酸的代谢过程,并能通过多个途径维护DNA的正常。正常的DNA结构和功能对于维持

Plos-one:饮食中反式脂肪酸使人健忘

  近日,来自美国加州大学圣地亚哥分校的研究人员发现饮食中反式脂肪酸含量越多,越容易发生记忆功能减退,特别是对于45岁左右的男性来说。反式脂肪酸是一种在加工食品中常用的添加剂,主要用于提升口感,延长保存时间,保证食物不易变质。  研究人员对1018名男性和女性进行了分析,要求他们填写一份饮食调查并进

PLOS-ONE:精氨酸可改善口腔健康-预防牙周病发生

  近日,发表在国际杂志PLoS ONE上的一篇研究论文中,来自密歇根大学等处的研究人员通过研究发现,食物中一种常见的天然氨基酸—精氨酸或可分解牙菌斑,这或许就可以帮助数百万的个体避免蛀牙及牙周病了。L-精氨酸一般存在于红肉中、鱼肉、家禽及乳制品中,其同时也被用作牙齿敏感的牙科产品中用以阻断牙菌斑的

PLoS-ONE:胸腺是艾滋病病毒变异主要场所

近日,佛罗里达大学科研人员发现了艾滋病(HIV)病毒在人体内的进化历程,此项发现为确定早期HIV病毒形式,研究新型治疗措施,开发新型治疗药物找到了新方向。该项科研成果发表在美国《公共科学图书馆·综合》(PLoS ONE)期刊上。 研究人员跟踪观察了4个出生时感染HIV的儿童。他们一出生就被采了血液样

PLoS-ONE:铁沉积可能导致神经退化性疾病

科学家一直怀疑铁沉积会导致神经退化疾病,例如帕金森氏症等,但由于技术方面的缺陷,铁对于神经的影响从未被观察到过。而最近,来自法国Bordeaux大学CNRS、西班牙Sevilla大学、INSERM Grenoble神经科学研究所和ESRF的科学家研究了体外产生多巴胺的神经细胞中铁的分布。 多巴胺是哺

-PLoS-ONE:新型候选药物让“青春痘”不再烦

  记者12月13日从中科院昆明动物所获悉,该所赖仞课题组设计合成的名为LZ1的小肽,对与痤疮相关的微生物具有非常强烈的杀灭作用。相关成果发表在美国《公共科学图书馆-综合》上。   据了解,痤疮是发病于毛囊皮脂腺单位的一种慢性炎症性皮肤病,好发于青少年,临床表现为面部的粉刺、丘疹、脓疱、结节等多形

PLOS-ONE:为何男性寿命更短?-这要追溯到“娘胎”

  性别的不平等起始于子宫,但可能不是以你认为的方式进行。日前,PLOS ONE杂志上的一项研究对出生于1981年至2011年间的574000名澳大利亚婴儿进行分析,结果发现男孩更容易出现早产,且出生时的风险也更大。与生育女孩的女性相比,生育男孩的女性在妊娠后期患先兆子痫、高血压或糖尿病的可能性更大

Plos-One:-能量如何驱动乳腺癌扩增与恶化

  肿瘤细胞,尤其是更具侵略性的癌细胞-似乎具有通过改变自身,从而达到逃避治疗并成功扩散到全身的能力。  但是,癌细胞如何获得所需的能量呢?在最近的一项研究中,Merajver的实验室研究了癌细胞内部的糖原水平。糖原水平代表了储存的葡萄糖分子集合。  密歇根大学的内科和流行病学以及密歇根大学罗格尔癌

Plos-one:饮食中反式脂肪酸使人健忘

  近日,来自美国加州大学圣地亚哥分校的研究人员发现饮食中反式脂肪酸含量越多,越容易发生记忆功能减退,特别是对于45岁左右的男性来说。反式脂肪酸是一种在加工食品中常用的添加剂,主要用于提升口感,延长保存时间,保证食物不易变质。  研究人员对1018名男性和女性进行了分析,要求他们填写一份饮食调查并进

生化与细胞所等研究发现小鼠PIWI/piRNA代谢调控机制

  国际知名学术期刊Developmental Cell于1月13日发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所刘默芳组、王恩多组关于piRNA在精子发生后期触发小鼠PIWI(MIWI)蛋白经 APC/C-泛素途径降解的最新研究成果。该工作与李劲松研究员、上海计划生育研究所施惠娟研究员、美国路

核仁小RNA(snoRNAs)的功能及其在癌症研究中的作用介绍

  核仁小RNA(snoRNAs)是一类中等长度的非编码小RNA,它们的长度在60-300nt不等,能与核仁核糖核蛋白结合形成snoRNPs 复合物[1]。在脊椎动物中编码核仁小RNA的基因主要存在于蛋白编码基因或非蛋白编码基因的内含子区域,并且经过进一步的转录后加工处理形成成熟的核仁小RNA[2]

关于小干扰RNA的RNA激活介绍

  已经发现dsRNA还可以激活基因表达,这种机制被称为“小RNA诱导的基因激活”或RNAa。已经显示靶向基因启动子的dsRNA诱导相关基因的有效转录激活。使用合成的dsRNA在人细胞中证明RNAa,称为“小活化RNA”(saRNA)。尚不清楚RNAa是否在其他生物体中是保守的。

核小RNA的特点

①稳定,半寿期常与核糖体相近;②含量丰富,如U1分子在每个核中的含量可有10^6个;③普遍性,在动、植物细胞中均含有snRNA;④高度保守,如人和爪蟾的U1snRNA有90%的序列相同。通常snRNA不是游离存在,而是与蛋白质结合成复合物,成为小核核糖核蛋白颗粒(small nuclear ribo

核小RNA的特点

①稳定,半寿期常与核糖体相近;②含量丰富,如U1分子在每个核中的含量可有10^6个;③普遍性,在动、植物细胞中均含有snRNA;④高度保守,如人和爪蟾的U1snRNA有90%的序列相同。

时序小RNA的定义

中文名称时序小RNA英文名称small temporal RNA;stRNA定  义一类长度约为22核苷酸的非编码RNA,是微RNA大家族的成员。与生物发育时间顺序调控有关,如早期报道的线虫lin-4和let-7时序小RNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

核小RNA的用途

核小RNA是真核生物转录后加工过程中RNA剪接体(spliceosome)的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。

小分子RNA的简介

  MicroRNA (miRNA) 是一类内生的、长度约为20-24个核苷酸的小RNA,其在细胞内具有多种重要的调节作用。每个miRNA可以有多个靶基因,而几个miRNA也可以调节同一个基因。这种复杂的调节网络既可以通过一个miRNA来调控多个基因的表达,也可以通过几个miRNA的组合来精细调控某

EST技术及其在基因全长cDNA克隆上的应用策略

第二军医大学细胞生物学教研室;上海200433 何志颖;姚玉成(综述);胡以平(审校)关键词:EST技术;“电子”基因克隆;生物信息学;基因摘要: 随着人类基因组计划的顺利进行,EST技术被广泛应用于基因识别、绘制基因表达图谱、寻找新基因等研究领域。利用人类基因组研究不断产生的数据,从ESTs即cD