叶明亮：位点特异性糖型的蛋白质组分析方法研究
分析测试百科网讯 2020年9月14日，由中国质谱学会（中国物理学会质谱分会）主办，分析测试百科网和中国质谱学会网承办的2020年中国质谱学会质谱网络研讨会（2020 CMSS）正式开幕。本届质谱网络研讨会正值中国质谱学会成立40周年，按报告内容涉及领域包括生命科学与组学、药物药理毒理分析、元素分析与金属组学、离子化及成像技术、环境与食品、临床质谱等。本届大会第一天共有近3000人参与。分析测试百科网为您带来全程跟踪报道。中国科学院大连化学物理研究所 叶明亮研究员报告题目：位点特异性糖型的蛋白质组分析方法研究 由中国科学院大连化学物理研究所叶明亮研究员为大家介绍位点特异性糖型的蛋白质组分析方法研究。叶明亮表示，传统临床上使用的标志物基本都是检测蛋白质的浓度差异，或是糖链抗原的浓度差异。不同于传统方法，团队通过将糖基化蛋白质组和糖组学结合，形成糖基化蛋白质组的全景式分析，将去N的糖链用亲水色谱富集，最后用束状CID质谱分析，......阅读全文
田志新：位点和结构特异性定量N糖蛋白组学研究进展
分析测试百科网讯 2020年9月15日，2020年中国质谱学会质谱网络研讨会（2020CMSS）进行到第二天，由北京生命科学研究所董梦秋研究员、中国科学院生态环境研究中心汪海林研究员、同济大学田志新教授、中国医学科学院药物研究所张金兰研究员；吉林大学药物代谢研究中心顾景凯教授、军事医学科学院放射
Rosa2基因组中的安全位点
当我们提到“safe harbour”，你首先想到的什么呢？我们今天要讨论的不是船只安全停泊的港口，而是小鼠基因组中外源基因定点整合的安全位点。接下来就让我们一起探索小鼠基因组中的最经典的安全位点之一：Rosa26，作为基因组中的安全位点是种怎样的体验吧。 Rosa26：安全这块我拿捏的死死地！ 随
剪接位点
中文名称剪接位点英文名称splicing site;splice site定 义剪接体可识别的RNA前体中内含子和外显子连接边界的序列和接头位点。根据位置不同可以分为供体和接纳体剪接位点。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
识别位点
中文名称识别位点英文名称recognition site定 义限制性内切酶特异结合的核苷酸序列。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞遗传（二级学科）
蛋白质组再揭肿瘤新靶点
继两周前，nature上发表了利用蛋白质组学发现胰腺癌治疗靶点和诊断标志物的突破性成果后（添加该文链接）。5月2日，又一篇卵巢癌新靶点的文章在nature上重磅发表！！还是那个蛋白质组，却是肿瘤领域又一重要新发现！！！肿瘤转移一直是困扰癌症治疗的一大问题。5月2日，来自芝加哥大学的Ernst Len
精确修饰位点谱图库的建立与磷酸化蛋白质组的－DIA－解析3
结果显示，从 DIA 数据中提取、定量到 6401 条可信的磷酸化肽，占谱图库磷酸化肽总数（6505 条）的 98.4%（图 5）。磷酸化肽的丰度和离子化效率普遍较低，本实验如此高的解析成功率表明，基于 Orbitrap 的 DIA 数据具有极高的谱图质量和出色的灵敏度。 图5. DIA可
精确修饰位点谱图库的建立与磷酸化蛋白质组的－DIA－解析2
2. 磷酸化样本的 DDA 鉴定、可信度筛选和谱图库建立磷酸化样本信息和色谱质谱参数见实验条件部分。3 针 DDA 数据按磷酸化检索流程使用 Proteome Discoverer 2.0 软件搜库鉴定（S/T/Y+79.966 Da），并使用 ptmRS 模块对位点打分（图 2-1）。搜库完成
精确修饰位点谱图库的建立与磷酸化蛋白质组的－DIA－解析1
引言 数据非依赖采集（Data-Independent Acquisition, DIA）是当前最热门的质谱采集技术之一，它以非目标的方式将质量范围分为若干窗口，依次并循环采集窗口内所有母离子的二级碎片[1,2]。DIA 与 SRM 类似，也是基于子离子（transition）定量，相比
新技术找到人类蛋白质关键变构位点
根据6日发表在《自然》网站上的一项新研究，人类蛋白质表面的潜在治疗靶点的数量比之前认为的要多得多。西班牙巴塞罗那基因组调控中心（CRG）的研究人员开发出一项突破性新技术，揭示了许多控制蛋白质功能的“秘密大门”，从理论上讲，这些“门”可以显著改变痴呆症、癌症和传染病等各种疾病的进程。现在，他们已经绘制
关于位点专一重组的基本介绍
λ噬菌体感染大肠杆菌后，或是进入裂解生长，或是进入溶原生长。当噬菌体裂解宿主细胞的功能受到抑制，噬菌体DNA整合进宿主染色体并随宿主染色体而进行复制，或作为一个独立的郊犹?/SPAN>(如P22)。这称为溶原性(lysogeny)，这类噬菌体称为溶原性噬菌体(lysogenic phage)。当
tNAS（转录组新可变剪接位点的发现）
本公司采用自主研发与成熟开源软件相结合的方式构建了专业高效的生物信息分析流程，对您获得的海量RNA-seq序列的质量、特征等重要信息进行图形可视化；发现您样品中的新可变剪接事件，揭示出的重要科学问题进行中肯分析；让您快速“发现”所关注生物学问题，医学问题和农业问题的答案。 我们的流程：1. Pr
CRISPR新工具开辟更多可编辑基因组位点
据最新一期《科学进展》报道，美国麻省理工学院（MIT）研究人员发现了一种可靶向几乎一半基因组位点的Cas9酶，从而极大地扩展了基因编辑工具的适用范围。 尽管基因编辑工具近年来取得了相当大的成功，但CRISPR-Cas9在基因组上可访问的位点数量仍然有限。这是因为CRISPR需要在基因组靶向位点
概述位点专一重组的相关信息
溶原状态同裂解状态是可以转换的。当λ噬菌体DNA整合在宿主基因组中，则进入溶原状态；当噬菌体DNA从宿主基因组中切离下来，则转入裂解状态。这种整合和切离，都是通过DNA和细菌DNA特定的附着位点之间的重组来实现的。大肠杆菌DNA上的att(attach)位点记为attλ或attB，长度为23 b
叶明亮、聂勇战、董铭铭联合开发出新型糖蛋白组学定量分析软件工具
近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员叶明亮团队，联合大连理工大学副教授董铭铭、空军军医大学教授聂勇战等，开发了一款新型糖蛋白组学定量分析软件工具——GlyPep-Quant。该工具可显著降低大样本分析中糖肽定量的缺失值，提升位点特异性糖型的定量覆盖度，并应用于胃癌生物标志物的发现研究中。目前
最新抗衰老靶点：控制蛋白质组代谢
“蛋白质合成对细胞来说是一个极耗能的过程，当细胞投入宝贵资源生产蛋白时，其他重要功能很可能就会被忽视。我们的工作表明，正常和异常老化的一个驱动器会加速蛋白质周转（protein turnover），”文章通讯作者、Salk研究所首席科学官和副总裁Martin Hetzer说道。 注：Water
核糖体结合位点的蛋白质合成的介绍
真核细胞中，核糖体进行蛋白质合成时，既可以游离在细胞质中，称为游离核糖体（freeribosome）。也可以附着在内质网的表面，称为膜旁核糖体或附着核糖体。参与构成RER，称为固着核糖体或膜旁核糖体，是以大亚基圆锥形部与膜接着游离核糖体（freeribosome）。分布在线粒体中的核糖体，比一般
核糖体结合位点的蛋白质构成的介绍
核糖体是细胞内一种核糖核蛋白颗粒（ribonucleoproteinparticle），主要由rRNA和蛋白质构成，其唯一功能是按照mRNA的指令将氨基酸合成蛋白质多肽链，所以核糖体是细胞内蛋白质合成的分子机器。 构成核糖体的蛋白质。大肠杆菌核糖体蛋白的初级结构均被确定。大肠杆菌核糖体的30S
双深度PCA：找到人类蛋白质关键变构位点
根据6日发表在《自然》网站上的一项新研究，人类蛋白质表面的潜在治疗靶点的数量比之前认为的要多得多。西班牙巴塞罗那基因组调控中心（CRG）的研究人员开发出一项突破性新技术，揭示了许多控制蛋白质功能的“秘密大门”，从理论上讲，这些“门”可以显著改变痴呆症、癌症和传染病等各种疾病的进程。现在，他们已经
进入位点
中文名称进入位点英文名称entry site定 义特指氨酰tRNA进入核糖体的部位。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
加帽位点
中文名称加帽位点英文名称cap site定 义mRNA中加帽结构的部位，该位点在前体mRNA的5'端。应用学科遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
督查组两天发现241个环境问题点位
11月5日，28个督查组对照任务清单的469家企业（单位）的526个具体任务点位进行了现场核实，发现其中85家企业（单位）的102个点位存在环境问题。存在问题的点位中，重污染天气应急响应方面的33个，工业企业未落实无组织整治要求的29个，施工工地扬尘管理方面的12个，非工业污染问题的10个，未安
揭示了不同泌乳期的母乳糖蛋白位点特异性糖型变化
近日，中国科学院大连化学物理研究所能源研究技术平台研究员靳艳团队和生物分离分析新材料与新技术研究组研究员叶明亮团队合作，在母乳糖蛋白的鉴定研究中取得新进展，实现了母乳样品大规模位点特异性糖型的鉴定与定量，并揭示了在不同泌乳期的母乳糖蛋白位点特异性糖型变化。 母乳是新生儿理想的天然食物，蛋白质是
昆明动物所在预测蛋白质功能位点方面取得重要进展
随着蛋白质结构信息的不断积累，以及结构基因组学不断的发展，越来越多的功能未知但结构已知的蛋白质提交到了国际大分子数据库中(PDB数据库)，这些蛋白质的功能及其功能位点需要注释。而随着实验生物学的不断发展，以前一些已知功能的蛋白质的功能及其功能位点可能需要重新注释。因此，发展一种精
苏州纳米所在金纳米棒位点特异性表面功能化中取得进展
纳米材料相比传统材料有着很高的比表面积，因此纳米材料的表面功能性对其理化性质有着重要影响。传统的表面功能化方法均匀作用于纳米材料表面，材料通常表现出单一的表面功能性。近年来研究人员通过各种方法制备出拥有多重表面功能性的纳米材料。但是，这些各向异性的表面功能化方法仍然缺少足够的精度在纳米材料表面任
我所开发N糖肽质谱谱图解析新软件
近日，我所生物分离分析新材料与新技术研究组（1809组）叶明亮研究员团队开发了一款具有高灵敏度的N-糖肽质谱谱图解析新软件——Glyco-Decipher。该软件可实现在解析谱图的过程中不依赖糖库，利用不同糖肽的同一肽段骨架具有相似碎裂规律的特点，发展出基于“模式识别”的肽段序列鉴定新方法，实现
叶明亮团队开发N糖肽质谱谱图解析新软件－解析率提升31％
近日，大连化物所生物分离分析新材料与新技术研究组（1809组）叶明亮研究员团队开发了一款具有高灵敏度的N-糖肽质谱谱图解析新软件——Glyco-Decipher。该软件可实现在解析谱图的过程中不依赖糖库，利用不同糖肽的同一肽段骨架具有相似碎裂规律的特点，发展出基于“模式识别”的肽段序列鉴定新方法
人类基因组“primiRNA”剪切位点图谱绘制
人体的基因表达是一个复杂的过程，那么多的基因不可能都总是持续表达。指挥基因表达的功臣之中就包括几种RNA分子。MicroRNA（miRNA）是一类真核生物内源性的小分子单链RNA，它是一种古老的、生死攸关的基因调节因素，30-60%的哺乳动物蛋白质编码基因都受miRNA的调控（主要是基因沉默调控
盘点全基因组检测CRISPR脱靶位点的几种重要技术
在2013年，来自麻省总医院的研究人员发现使用CRISPR-Cas RNA引导性核酸酶的一个重要局限：会在预期靶点以外的位点上生成多余的DNA突变。此后陆续有研究直接说明了CRISPR/Cas9存在严重的脱靶性，即该技术可以发生非特异性切割，引起基因组非靶向位点的突变，这样会造成研究结果的不确定
nut－位点的定义
中文名称nut 位点英文名称nut site定 义噬菌体基因组中抗终止因子N蛋白的识别位点。N蛋白对nut位点的识别和随之发生的相互作用，使RNA聚合酶能忽略终止信号而持续通过终止子。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
什么是活性位点
者一般用在大分子化学中，活性位点指的是可以发生化学反应的集团。活性位点少，发生有效碰撞的机率就少，也就是说反应比较单一，容易被控制