美研制出高效基因组改编方法
中国科技网讯 据物理学家组织网、《自然》网站等媒体9月23日报道，一个由美国明尼苏达州罗彻斯特市梅奥诊所研究人员领导的国际研究小组，开发出一种高效的基因组改编方法，可对斑马鱼基因组进行精确定位的剪切替换，用于各种研究目的。该研究首次实现了对斑马鱼基因组分的自定义修改，帮生物医学家克服了鱼类不能作为人类疾病模型的障碍。相关论文发表在今天的《自然》杂志网站上。 在脊椎动物生物学和人类疾病研究中，斑马鱼是主要实验对象。它们透明、体外受精、生殖周期短、生长迅速，这些特点让人们能密切跟踪其活体胚胎发育，研究其基因表达和功能。但在定位基因修改方面，却效率不高。 研究人员用一种人工改良的酶TALENs(人工转录激活因子样感受器核酸酶)，瞄准一段基因序列的目标位置，切下该处DNA片断，用人工DNA来替换。在研究人员所插入的人工序列中，其中一段还有一个基因开关，能立刻打开或鱼成熟后才打开，以检验该......阅读全文
斑马鱼如何长出新的神经元
研究人员已经发现了使得斑马鱼的大脑能够在其受到创伤性损害之后再生的机制。与哺乳动物不同，这些在淡水中生长的小鲦鱼因为脑部损伤所致的炎症会伴有新神经元的产生。 如今，Nikos Kyritsis及其同事展示，在损伤反应中，斑马鱼脑部的炎症会激活特定的信号传导分子及神经胶质细胞，后者可促进
斑马鱼嗅觉作用主要是左鼻子
斑马鱼嗅觉作用主要是左鼻子 如同人有“左撇子”一样，鱼也有类似“左撇子”的鼻子。 日前，日本名古屋市立大学与国立遗传学研究所的一项新研究发现，斑马鱼发挥嗅觉作用的主要是左鼻子。相关研究论文在线刊登在了近期出版的《自然—神经科学》(Nature Neuroscience)杂志上。
Dev－Cell：转基因斑马鱼的彩色皮肤
美国杜克大学的研究人员，利用基因工程改造的方法，造成单个的皮肤细胞可以产生70种不同颜色的荧光。该研究发表在最近的《Developmental Cell》上。 该团队并非是为了好玩才做成这样五彩斑斓的斑马鱼，实际上，他们希望通过颜色标记来研究斑马鱼皮肤的愈合。利用颜色来标记细胞，可以让斑马鱼皮
除了小鼠，斑马鱼也被盯上了－|－PNAS
植有人类肿瘤细胞（红色）的斑马鱼胚胎，这一模型有望帮助医生快速筛选癌症患者最佳的治疗方案（图片来源：Rita Fior团队） 最新一期《PNAS》在线发表了一篇题为“Single-cell functional and chemosensitive profiling of combinato
寄生虫感染或破坏斑马鱼实验
研究人员表示，一种感染实验室斑马鱼的常见寄生虫可能令多年的行为实验结果产生混淆。不过，批评者认为，这个案例仍有待证实。 和小鼠一样，斑马鱼被用在全球的实验室中，以研究从药物疗效到诸如精神分裂症和自闭症等遗传性疾病和障碍的所有事情。由于斑马鱼和人类都具有高度社会性，因此研究人员认为，和啮齿类动物
斑马鱼胚胎细胞的培养——原代培养
实验方法原理收集胚胎，除去绒毛膜，用胰蛋白酶分散胚胎细胞，然后在胚胎成纤维细胞饲养层上培养从斑马鱼囊胚和原肠期胚获得的原代细胞。实验材料链酶蛋白酶E用D-PBSA配制1%胰蛋白酶和1mmol L EDTA胚胎成纤维细胞饲养层人重组白血病抑制因子试剂、试剂盒LDF基础培养液LDF原代培养液LDF维持培
－Nat－Commun：斑马鱼可用于癫痫药物筛选
化学药物Clemizole在“Dravet综合症”的一个斑马鱼模型中能有效防止癫痫类发作。在Nature Communications上发表的这一发现确认了一个新方法，后者有可能被用来识别癫痫病的另类疗法。 “Dravet综合症”是一种从婴儿时期开始的严重癫痫，以严重的、自发的和复发的
斑马鱼基因敲除是怎么做的
一、基因敲除的设计方案 1.1 基因的基本信息 确认斑马鱼基因的基本信息，包括名称ID号等，一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑，设计最佳的KO靶点。 1.4
斑马鱼胚胎细胞的培养——细胞系
实验材料链酶蛋白酶E用D-PBSA配制1%胰蛋白酶和1mmol L EDTAZEM-2细胞（或等同物）试剂、试剂盒LDF基础培养液LDF原代培养液LDF维持培养液D培养液Holtfreter缓冲液实验步骤鳟鱼胚胎提取物：(a)收集胚胎（受精后 28 天的 Shasta Rainbow 或其他鳟鱼种系
敲降斑马鱼基因的方法学比较
一、基因敲降的前期准备工作相同1.1 生物信息学分析目标基因在斑马鱼早期胚胎发送过程中是否有表达。1.2 收集斑马鱼早期发育胚胎（通常为48 hpf前的胚胎），提取总RNA，然后进行体外转录（RT）。1.3 设计检测目标基因表达的PCR引物，以1.2获得的cDNA为模板，进行PCR扩增，确认目标基因
斑马鱼的胚胎原位杂交试验实录
收集斑马鱼的胚胎，在Holfretor水中培养，到达所需要的发育时期时，用蛋白酶去除卵膜，用4%多聚甲醛固定，在4℃保存，二十四小时后用50%甲醇2%多聚甲醛溶液洗，然后换成甲醇，在-20C 保存，待用（两天和两天以上的胚胎需要用双氧水处理，去除色素。或者使用苯锍脲稀溶液培养，可阻断色素的形成）原位
敲降斑马鱼基因的方法学比较
一、基因敲降的前期准备工作相同 1.1 生物信息学分析目标基因在斑马鱼早期胚胎发送过程中是否有表达。 1.2 收集斑马鱼早期发育胚胎（通常为48 hpf前的胚胎），提取总RNA，然后进行体外转录（RT）。 1.3 设计检测目标基因表达的PCR引物，以1.2获得的cDNA为模板，
敲降斑马鱼基因的方法学比较
一、基因敲降的前期准备工作相同 1.1 生物信息学分析目标基因在斑马鱼早期胚胎发送过程中是否有表达。 1.2 收集斑马鱼早期发育胚胎（通常为48 hpf前的胚胎），提取总RNA，然后进行体外转录（RT）。 1.3 设计检测目标基因表达的PCR引物，以1.2获得的cDNA为模板，
斑马鱼基因敲除是怎么做的
一、基因敲除的设计方案 1.1 基因的基本信息 确认斑马鱼基因的基本信息，包括名称ID号等，一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑，设计最佳的KO靶点。 1.4
斑马鱼基因敲除是怎么做的？
一、基因敲除的设计方案1.1 基因的基本信息确认斑马鱼基因的基本信息，包括名称ID号等，一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域通过综合考虑，设计最佳的KO靶点。 1.4 分析并设计CRISPR，分析其效率及脱靶的情况一般使用C
研究揭示斑马鱼肠脑调节关键机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517493.shtm
两篇Cell文章发现精子的作用远不止DNA遗传
一般认为胚胎早期发育过程中，精子仅仅提供DNA遗传信息，其它方面主要由卵细胞决定，然而最新一期(5月10日)Cell杂志上接连公布了两项研究成果，指出精子的表观遗传学信息也会影响子代胚胎发育，这颠覆了传统上认为早期胚胎发育主要是由卵子决定的观念，也对于发育生物学和癌症生物学具有重要的意义。
The－scientist：2013年度最热基因组
新的一年即将来临，The scientist杂志盘点了2013年度的高引基因组研究，让我们看看今年又有哪些新解码的基因组受到热捧。 斑马鱼基因组 种属：Zebrafish, Danio rerio 基因组大小：~1.41 billion base pairs 斑马鱼(Da
北大近年来首篇NatureMethods文章
Nature Methods杂志是Nature出版社旗下的著名期刊之一，也是方法学领域的权威刊物，主要刊载具有创新性的技术进展，在去年之前，大陆学者在此刊物上发表的技术文章仅有3篇。近期来自北京大学生科院，加州大学洛杉矶分校的研究人员在这一著名期刊上发表了题为“TALEN-mediated
北京大学Cell－Res基因编辑研究新成果
来自北京大学的研究人员报告称，他们利用一种RNA导向的Cas9核酸酶在哺乳动物细胞和斑马鱼胚胎中有效实现了位点特异性基因编辑。相关论文“Genome editing with RNA-guided Cas9 nuclease in Zebrafish embryos”发表在3月26日的《细胞
再生医学新进展－人类抗癌基因抑制斑马鱼组织再生
再生医学或许可以在未来某一天帮助医生进行先天性畸形的修复，帮助病人重新长出受伤的手指，甚至是进行心脏修复。但要实现这一切，就必须考虑如何攻破机体自身的抗癌保护系统。最近，来自美国UCSF的研究人员发现了一个人类基因可能是这一保护系统中一个重要部分，既能阻止癌症发展又会阻断健康组织的再生。 在这
中科院动物所《PNAS》发表研究新成果
来自中科院动物研究所的研究人员在斑马鱼中证实Foxn1通过mcm2维持胸腺上皮细胞，支持了T细胞发育。相关论文“Foxn1 maintains thymic epithelial cells to support T-cell development via mcm2 in zebraf
首个CRISPR/Cas9靶序列数据库
近期，来自美国国立卫生研究院和瑞典乌普萨拉大学的研究人员，在国际著名学术期刊《Nucleic Acids Research》上发表的一项研究中，首次提出了一个已在斑马鱼中经过实验验证的CRISPR/Cas9靶序列数据库。 CRISPR及CRISPR相关蛋白（Cas9），是在古细菌和细菌中发现的
《自然》：发现斑马鱼造血干细胞生成机理
为医学界研究白血病疗法提供了新思路 法国科学家日前通过对斑马鱼胚胎进行即时监控，发现了其造血干细胞的生成机理。这一成果为医学界研究白血病疗法提供了新思路。 该研究由法国国家科研中心和巴斯德研究所共同完成。研究人员在最新一期英国《自然》杂志上报告说，他们采用即时成像技术对斑马鱼的胚胎进行了观察
斑马鱼：一条游上“试药路”的小鱼
蓝色的世界、嗡嗡作响的机器、不时出现的人影……湖蓝色的塑料鱼缸里，七八条小鱼在水中自由游弋，不时停下来盯着外面的世界。看见人影走近，有的小鱼开始在鱼缸里打转，有的则依旧悠然地游来游去。 这些体长不过５厘米、带有墨蓝色斑纹的斑马鱼并不知道，它们从一出生就已同那些野外的同类们分道扬镳，成为人类医药
孕酮信号可独立维护斑马鱼精巢正常发育
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/3/474828.shtm 近日，中国科学院水生生物研究所一项研究发现，揭示了孕酮/ NPGR信号对斑马鱼精巢发育的调控作用。研究发现，动物体内增强的孕酮/NPGR信号，可以发挥不依赖于雄激素信号通路，促进
《干细胞》：斑马鱼细胞可修复人视网膜
在最新一期的《干细胞》（Stem Cells）杂志上，来自英国的研究人员发现，斑马鱼眼睛中的一类叫做Muller胶质细胞的特殊细胞对对视网膜的再生至关重要，该细胞还有助于视力的恢复。研究人员预言，这种Muller胶质细胞可能用于恢复人类受损视网膜。 已经知道，视网膜损伤是造成失明的主要原因，引起视
从斑马鱼身上竟然获得治疗帕金森的方法
与哺乳动物相比，成年斑马鱼会使大脑中的神经元再生，但这种能力的程度和变异性尚不清楚。来自Edinburgh大学脑神经科学研究中心的Thomas Becker及其研究团队探寻了各种多巴胺能神经元群体的丧失是否足以触发神经元的功能性再生。 他们的研究结果为未来治疗具有运动异常、震颤等症状的神经系统
国际首例－他们用光指挥斑马鱼的白细胞
未来，如果你生病了，除了吃药外，还有更多简单高效的治疗方式可选择，比如用光照一照身体就能远程遥控白细胞，从而主动调动身体的免疫能力。这并非科幻。我国科学家已实现了在活体上用光将白细胞变成“医学微机器人”，可自主控制白细胞的激活和运动，这在国际上是第一例。7月13日，暨南大学李宝军教授和郑先创教授研究
诺奖得主Science解开斑马鱼条纹的秘密
斑马鱼，一种小的淡水鱼，得名于一种醒目的蓝黄色相间条纹图案。在幼鱼皮肤生长过程中，有三种主要的色素细胞类型——黑色细胞、反光银色细胞和黄色细胞出现，它们多层镶嵌，构成特征性的颜色图案。 众所周知，所有这三种细胞类型必须相互作用才能形成适当的条纹，但是，形成成鱼条纹的色素细胞的胚胎起源，直到现在