研究观测到染色质重塑中DNA的BZ构象转变

近年来,Z型DNA(Z-DNA)的研究引发关注,但是在细胞中对其进行观测还存在困难,主要原因是缺少一种简便可靠的手段对其进行直接观测。最近,中国科学院合肥物质科学研究院智能机械研究所研究员黄青课题组与郑州大学张凤秋课题组合作,利用红外光谱技术观测并研究染色质重塑中DNA的B-Z构象转变,相关研究成果发表在Analytical Chemistry上。 染色质重塑是表观遗传学的主要研究内容之一,一般包括组蛋白共价修饰型或ATP(一种高能磷酸化合物)依赖型两种类型。组蛋白共价修饰型通过影响组蛋白与DNA双链的亲和性,从而改变染色质的疏松或凝结状态;ATP依赖型的染色质重塑通过染色质重塑复合物改变组蛋白与DNA的结合状态,在靠近核心组蛋白的DNA表面建立特殊构象,从而使转录因子更易靠近DNA的过程。在染色质重塑过程中,组蛋白与DNA间的相互作用将发生变化,因此可能导致DNA构象的改变。其中,Z-DNA构象可能更利于破坏核小体的结构......阅读全文

ATRX基因的结构特点和作用

该基因编码的蛋白含有一个atpase/螺旋酶结构域,因此属于染色质重塑蛋白的swi/snf家族。这种蛋白被发现经历了细胞周期依赖性磷酸化,它调节其核基质和染色质的结合,并表明它参与有丝分裂的间期基因调节和染色体分离。该基因突变与X连锁精神发育迟滞(XLMR)综合征有关,通常伴有α-地中海贫血(ATR

​DNA损伤修复信号通路ATRX基因的临床解释

该基因编码的蛋白含有一个atpase/螺旋酶结构域,因此属于染色质重塑蛋白的swi/snf家族。这种蛋白被发现经历了细胞周期依赖性磷酸化,它调节其核基质和染色质的结合,并表明它参与有丝分裂的间期基因调节和染色体分离。该基因突变与X连锁精神发育迟滞(XLMR)综合征有关,通常伴有α-地中海贫血(ATR

癌症相关的基因突变类型及临床解释-ATRX

该基因编码的蛋白含有一个atpase/螺旋酶结构域,因此属于染色质重塑蛋白的swi/snf家族。这种蛋白被发现经历了细胞周期依赖性磷酸化,它调节其核基质和染色质的结合,并表明它参与有丝分裂的间期基因调节和染色体分离。该基因突变与X连锁精神发育迟滞(XLMR)综合征有关,通常伴有α-地中海贫血(ATR

关于地西他宾的不良反应和用途介绍

  1、不良反应  (1)中性白细胞减少(症)、血小板减少(症)、贫血、呕吐、疲劳、发热、咳嗽、恶心、便秘、腹泻、高血糖、热性的中性白细胞减少(症)。  (2)大剂量可引起神经毒性,表现为嗜睡、失语、偏瘫等,但停药后可恢复正常。  2、用途  是一种表观遗传修饰物,可抑制DNA转甲基酶活性,导致在D

清华大学陈柱成课题组Nature发表结构生物学重要研究成果

  生物通报道:染色质重塑蛋白ISWI与Snf2、Chd1、Ino80同属于SWI2/SNF2 家族。ISWI是一些染色质重塑复合体的催化亚基,这些复合物沿着基因组DNA移动核小体,协助复制前进、转录抑制、异染色质形成和其他细胞核过程。  ISWI的ATPase马达是一个自主的重塑机器,其C端HSS

CRISPR触发的内源Oct4或Sox2基因位点染色质重塑激...(一)

CRISPR触发的内源Oct4或Sox2基因位点染色质重塑激活细胞重编程题目:CRISPR-Based Chromatin Remodeling of the Endogenous Oct4 or Sox2 Locus EnablesReprogramming to Pluripotency期刊:C

CRISPR触发的内源Oct4或Sox2基因位点染色质重塑激活细胞

  题目:CRISPR-Based Chromatin Remodeling of the Endogenous Oct4 or Sox2 Locus Enables   Reprogramming to Pluripotency   期刊:Cell stem cell   影响因子:23.3

CRISPR触发的内源Oct4或Sox2基因位点染色质重塑激...(二)

3. CRISPR-dCas9-SunTag-VP64系统单独对Sox2基因进行内源激活,也能有效获得iPS研究者单独选取了能对Sox2进行激活的SgRNA进行iPS诱导,发现在有效激活内源Sox2基因表达的情况下,能成功得到诱导性多能干细胞,并能稳定增殖传代。得到iPS通过体内体外实验,如干细胞基

CRISPR触发的内源Oct4或Sox2基因位点染色质重塑激活细胞

  题目:CRISPR-Based Chromatin Remodeling of the Endogenous Oct4 or Sox2 Locus Enables   Reprogramming to Pluripotency   期刊:Cell stem cell   影响因子:23.3

清华大学生科院最新Nature子刊文章

  2016年7月11日,清华大学生命科学学院陈柱成课题组在《Nature Structural & Molecular Biology》在线发表题为《染色质重塑因子SWI/SNF基态的结构》(Structure of chromatin remodeler Swi2/Snf2 in the res

Caspase活化、核染色质固缩及DNA片段化

Life Technologies提供了用于细胞功能和健康检测的各种试剂。其中许多分析以荧光或比色法为基础,具有灵敏性、便利性和安全性。这些产品已经过多种仪器平台验证,包括显微镜、流式细胞仪、酶标仪和高内涵筛选,能够实现各种细胞功能的分析:细胞活性和细胞毒性细胞增殖和细胞周期细胞凋亡自噬氧化应激内吞

染色质的组成DNA的功能相关内容

  DNA是一种具有多种功能的分子。它能够通过复制过程产生自己,细胞每分裂一次DNA便复制一次。它通过转录过程制造三种RNA:信使 RNA(mRNA),转移RNA(tRNA)和核糖体RNA(rRNA)。这三种RNA在细胞质合成蛋白质的一系列过程中行使不同的功能。信使RNA由DNA模板产生,是按一定顺

全局DNA甲基化重塑技术帮助检验体外实验模型是否有效

  一些神经疾病的发病率正在攀升,特别是那些与衰老有关的疾病,如阿尔兹海默症和帕金森。为了更好地了解这些疾病,评估潜在新疗法,生物学家需要能在实验室进行研究的精确模型。  来自Salk和Stanford的研究人员,与Baylor医学院的合作者证明,用之前发表的方法诱导神经细胞,与大脑中自然发育的神经

美科学家发现-DNA-内“空间语法”-或重塑基因调控理解

  美国科学家发现了DNA内长期潜伏的“空间语法”,这是理解基因活动如何在人类基因组中编码的关键。这项研究或重塑科学家对基因调控的理解,更深入地揭示遗传变异如何影响发育或疾病中的基因表达。相关论文发表于《自然》杂志。  转录因子是一种蛋白质,控制人基因组中哪些基因被打开或关闭,在编码中起着至关重要作

什么是表观遗传学

是研究不涉及DNA序列改变的基因表达和调控的可遗传修饰,即探索从基因演绎为表型的过程和机制的一门新兴学科。遗传学是指基于基因序列改变所 致基因表达水平变化,如基因突变、基因杂合丢失和微卫星不稳定等。而表观遗传学则是指基于非基因序列改变所致基因表达水平变化,如DNA甲基化和染色质构象变化等;表观基因组

ATRX基因编码功能及结构描述

该基因编码的蛋白含有一个atpase/螺旋酶结构域,因此属于染色质重塑蛋白的swi/snf家族。这种蛋白被发现经历了细胞周期依赖性磷酸化,它调节其核基质和染色质的结合,并表明它参与有丝分裂的间期基因调节和染色体分离。该基因突变与X连锁精神发育迟滞(XLMR)综合征有关,通常伴有α-地中海贫血(ATR

DNA损伤修复信号通路相关因子ATRX

该基因编码的蛋白含有一个atpase/螺旋酶结构域,因此属于染色质重塑蛋白的swi/snf家族。这种蛋白被发现经历了细胞周期依赖性磷酸化,它调节其核基质和染色质的结合,并表明它参与有丝分裂的间期基因调节和染色体分离。该基因突变与X连锁精神发育迟滞(XLMR)综合征有关,通常伴有α-地中海贫血(ATR

实体肿瘤检测ATRX基因介绍

该基因编码的蛋白含有一个atpase/螺旋酶结构域,因此属于染色质重塑蛋白的swi/snf家族。这种蛋白被发现经历了细胞周期依赖性磷酸化,它调节其核基质和染色质的结合,并表明它参与有丝分裂的间期基因调节和染色体分离。该基因突变与X连锁精神发育迟滞(XLMR)综合征有关,通常伴有α-地中海贫血(ATR

ATRX基因突变与药物因子介绍

该基因编码的蛋白含有一个atpase/螺旋酶结构域,因此属于染色质重塑蛋白的swi/snf家族。这种蛋白被发现经历了细胞周期依赖性磷酸化,它调节其核基质和染色质的结合,并表明它参与有丝分裂的间期基因调节和染色体分离。该基因突变与X连锁精神发育迟滞(XLMR)综合征有关,通常伴有α-地中海贫血(ATR

精神分裂症的新发突变支持染色质重塑在精神性疾病中...

精神分裂症的新发突变支持染色质重塑在精神性疾病中的作用精神分裂症是一种严重且复杂的心理疾病,其致病机理尚未明确。最近的一项研究1,在一组精神分裂症病人中进行新发突变(de novo mutation)的扫描,并将结果与其他精神性疾病如孤独症、智力低下等的突变进行了比较,发现了这些疾病之间拥有相似的遗

浙江大学黄俊教授Cell子刊发表最新成果

  细胞基因组的完整性,持续受到多种内外因素的挑战,例如复制叉崩溃、氧化应激和电离辐射等等。并由此引发一系列细胞学反应。DNA的损伤类型很多,其中以DNA双链断裂(DSB)最为严重。DSB会随着年龄的增长不断累积。可以说我们的健康在很大程度上依赖于细胞发现和修复DNA损伤的能力。  DSB具有高度的

DNA的化学检测项目介绍羊水细胞性染色质检查

羊水细胞性染色质检查介绍:  羊水细胞性染色质检查可以用于预测胎儿性别,以及估计某些遗传性疾病的可能发生概率。羊水细胞性染色质检查正常值:  X染色质:>0.06为女性胎儿,0.05为男性胎儿,

植物转录起始调控机制研究获进展

在国家自然科学基金面上项目和青年项目的资助下,中国科学院华南植物园研究员陈琛团队联合广东省农业科学院研究员刘军、加拿大农业部伦敦研发中心研究员崔玉海在植物转录起始调控机制研究方面取得新进展。相关研究近日发表于《核酸研究》(Nucleic Acids Research)。  转录复合体将DNA转录

华南植物园关于植物转录起始调控机制的研究获进展

  转录复合体将DNA转录为RNA,是遗传信息由细胞核向细胞质转递的基础。由于核小体与基因组的紧密结合,转录复合体需克服核小体障碍进而确保功能基因的表达。染色质重塑复合体(Chromatin Remodeler)被认为在转录过程中发挥了重要作用。这类蛋白复合体能通过水解ATP来调控核小体的组成和分布

南方医科大颜光玗教授Nature揭示基因表达调控机制

  由来自法国巴黎-萨克雷大学、中国南方医科大学、美国宾夕法尼亚州立大学等机构的科学家组成的一个国际研究小组,揭示出了一些特殊的酶重塑细胞核中极其凝缩的遗传物质,由此控制哪些基因获得利用的机制。这一研究发现发布在1月27日的《自然》(Nature)杂志上。  中国南方医科大学的颜光玗(Kuangyu

SMARCE1基因的结构特点和作用

该基因编码的蛋白质是大的atp依赖性染色质重塑复合物swi/snf的一部分,它是染色质正常抑制的基因转录激活所必需的。编码的蛋白质,单独或当在SWI/SNF复合物中,可以结合到4位连接DNA,这被认为在进入或退出核小体时模仿DNA的拓扑结构。该蛋白含有一个dna结合的hmg结构域,但该结构域的破坏并

NatureCell两大顶级杂志获表观遗传研究突破

  来自美国宾州大学与西北大学的两个研究组,近期分别在Nature和Cell这两大顶级期刊上发表文章,分别取得了表观遗传学核小体研究方面的突破性进展,这两项的关键点都来自其重要的研究新技术――宾州大学的研究人员发展了超高分辨率ChIP-exo技术,而西北大学的研究人员则研发了一种基于改造后组蛋白的化

microRNA的肿瘤抑制因子角色

美国南加州大学的研究人员报道说,一种新的方法通过活化癌细胞基因组中保护性的microRNA的表达,从而使致癌基因的表达水平显著降低。这篇发表在6月的Cancer Cell杂志上的文章证明已知能调节基因表达的制剂还能够影响调节性的RNA。这种调节性的RNA即为microRNA,它能充当正常细胞中的肿瘤

首次绘制紫外辐射诱导的细胞应答遗传互作图谱

  美国加利福尼亚大学圣地亚哥医学院的研究人员,与荷兰和英国的合作者一起,首次绘制了紫外辐射诱导的细胞应答反应背后的详细的遗传互作图谱。这项研究成果将在12月26日的Cell Reports杂志上刊出。   加利福尼亚大学圣地亚哥医学院的研究人员,与荷兰、英国的合作者一起,首次绘制了紫外(UV

植物转录起始调控机制研究获进展

  在国家自然科学基金面上项目和青年项目的资助下,中国科学院华南植物园研究员陈琛团队联合广东省农业科学院研究员刘军、加拿大农业部伦敦研发中心研究员崔玉海在植物转录起始调控机制研究方面取得新进展。相关研究近日发表于《核酸研究》(Nucleic Acids Research)。  转录复合体将DNA转录