分子细胞中心等研发出系统性鉴定siRNA脱靶位点新方法

12月4日,Molecular Therapy–Nucleic Acids在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)吴立刚研究组,上海市计划生育科学研究所李卫华研究组与扬州大学赵雅研究组合作的研究成果Identifying Cleaved and Noncleaved Targets of Small Interfering RNAs and MicroRNAs in Mammalian Cells by SpyCLIP。该研究运用自主研发的SpyCLIP技术,对野生型和切割活性缺失的miRNA/siRNA效应器蛋白AGO2平行进行SpyCLIP建库测序,在全基因组层面准确、高效地鉴定出siRNA、miRNA的切割活性以及非切割活性作用位点,为降低siRNA药物的潜在脱靶风险,改进siRNA的设计规则提供了强有力的手段。 2018年8月,美国食品药品监督管理局批准了siRNA药物ONPATT......阅读全文

MCMV和SCMV复合侵染玉米引起玉米组织中siRNAs的积累

  RNA沉默是真核生物中调控基因表达的一种保守机制,它在植物生长发育和抗病毒中发挥着重要的作用。RNA病毒进入寄主植物细胞后,其复制中间复合体和单链基因组RNA的高级结构形成的双链RNA可以被寄主植物DCL蛋白识别,加工产生21-24-nt的初级来源于病毒的siRNA(vsiRNA)。初级vsiR

MCMV和SCMV复合侵染玉米引起玉米组织中siRNAs的积累

背景介绍RNA沉默是真核生物中调控基因表达的一种保守机制,它在植物生长发育和抗病毒中发挥着重要的作用。RNA病毒进入寄主植物细胞后,其复制中间复合体和单链基因组RNA的高级结构形成的双链RNA可以被寄主植物DCL蛋白识别,加工产生21-24-nt的初级来源于病毒的siRNA(vsiRNA)。初级vs

ncRNA-UICLM通过ceRNA机制调控结直肠癌的肝转移

中山大学附属肿瘤医院院长、主任医师徐瑞华教授长期从事消化道肿瘤个体化治疗领域及抗癌药物研究,在消化道肿瘤的转移与转归、化疗药物耐受及其机制和优化临床治疗方面具有国际领先的创新性成果。近期,该课题组应用Arraystar lncRNA芯片在肝转移的结直肠癌组织中分析了lncRNAs的表达情况。课题组筛

MCMV和SCMV复合侵染玉米引起玉米组织中siRNAs的积累

  背景介绍   RNA沉默是真核生物中调控基因表达的一种保守机制,它在植物生长发育和抗病毒中发挥着重要的作用。RNA病毒进入寄主植物细胞后,其复制中间复合体和单链基因组RNA的高级结构形成的双链RNA可以被寄主植物DCL蛋白识别,加工产生21-24-nt的初级来源于病毒的siRNA(vsiRNA

张辰宇教授权威期刊连发miRNA及RNAi研究新成果

  南京大学的张辰宇(Chen-Yu Zhang)主要从事microRNA、线粒体功能和人体及细胞能量代谢研究。近年来因发布了多项有关miRNA的惊人研究成果而广受关注。迄今已在包括Cell, Nature, Science及其子刊(~22篇)在内的国际学术期刊上发表论文约150余篇。  本月,张辰

SCI文章解析lncRNA-UICLM通过ceRNA机制调控结直肠癌的肝转移

   中山大学附属肿瘤医院院长、主任医师徐瑞华教授长期从事消化道肿瘤个体化治疗领域及抗癌药物研究,在消化道肿瘤的转移与转归、化疗药物耐受及其机制和优化临床治疗方面具有国际领先的创新性成果。近期,该课题组应用Arraystar lncRNA芯片在肝转移的结直肠癌组织中分析了lncRNAs的表达情况。课

从表达谱至海绵机制完美进阶-环状RNA测序加机制研究!

  禽白血病病毒J亚群(ALV-J)属于逆转录病毒属,慢病毒亚科的家族成员,可引起禽类多种肿瘤性疾病,如骨髓细胞瘤、肉瘤、血管瘤、肾肿瘤和成红细胞增多症,以及禽类骨髓白血病,导致受感染鸡的高死亡很率。该分散的ALV-J菌株分布广泛,既能水平传播又能垂直传播,往往造成禽类养殖领域的巨大经济损失。目前我

细胞外miRNAs:从生物标志物到生理和疾病的调节因子

miRNAs可在血清和其他体液中发现,并可作为疾病的生物标志物。更重要的是,分泌型miRNAs,尤其是胞外囊泡(EVs)如外泌体分泌的miRNAs,可能介导不同组织间的旁分泌和内分泌通讯,从而调节基因表达和远程调控细胞功能。分泌型miRNAs受影响时可能会导致组织功能障碍、衰老和疾病。 脂肪组织是循

云序客户8.0分成果揭秘还愁lncRNA功能机制如何研究吗?

  LncRNA是长度大于200nt的长链非编码RNA,在调控不同的分子过程中发挥着重要作用。其主要功能不仅可以与功能蛋白结合,并在转录或转录后水平调控基因表达,而且lncRNA也可以作为诱饵,吸附miRNA,调节miRNA调控的靶基因表达。但是,目前关于lncRNA在胃癌中的表达谱和生物学功能的了

2018年糖尿病专题盘点

  2018年即将过去,年末为大家献上生物谷本年度糖尿病专题盘点,希望读者朋友们能够喜欢。1. Nature:利用细胞替换疗法治疗1型糖尿病取得重大进展!胞外基质组分决定着胰腺祖细胞的命运DOI: 10.1038/s41586-018-0762-2  I型糖尿病是一种自身免疫性疾病,它会破坏胰腺中产

环状RNA结合功能蛋白

环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转录前

7月6日《Cell》精彩内容

Cell创刊于1976年,现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一,并陆续发行了十几种姊妹刊,在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。Cell以发表具有重要意义的原创性科研报告为主,许多生命科学领域最重要的发现都发表在Cell上。最新一期(7月6日)Cell杂志就公布了不少重要的研究成果:

Nature子刊m6A修饰携手miRNA揭示脱氧胆酸在胆囊癌中作...2

(4) MiR-92b-3p作用于PTEN降低PI3K/AKT信号为了探究潜在的miR-92b-3p靶基因,维恩图结果显示磷酸酶和紧张素同源基因(PTEN)可能是潜在的候选基因。为了进一步验证,作者使用含有miR-92b-3p 的PTEN 3’-UTR片段的载体进行了双荧光素酶实验。与对照组相比,m

云序客户8.0分成果揭秘:还愁lncRNA功能机制如何研究吗?

  文章导读   LncRNA是长度大于200nt的长链非编码RNA,在调控不同的分子过程中发挥着重要作用。其主要功能不仅可以与功能蛋白结合,并在转录或转录后水平调控基因表达,而且lncRNA也可以作为诱饵,吸附miRNA,调节miRNA调控的靶基因表达。但是,目前关于lncRNA在胃癌中的表达谱

环状RNA结合功能蛋白!找对方向20分文章水到渠成

  环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转

RIP测序解析RNA结合蛋白SORBS2在卵巢癌细胞转移中作用机制

  环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转

环状RNA结合功能蛋白!找对方向20分文章水到渠成

  环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转