首个韩国人基因组图谱绘制成功

据韩国联合通讯报道,韩国研究机构日前宣布,第一个完整的韩国人基因组图谱已经绘制成功。 报道指出,这是人类染色体碱基序列第四次被完整破译,这项成果是由韩国嘉泉医科大学和韩国生命工程研究院的两个研究团队通过共同研究取得的。研究人员宣布,分析测序中使用的基因物质来自于嘉泉医科大学教授金圣镇。 研究的目的是建立韩国人标准染色体数据库。研究人员期待,在染色体碱基序列图谱基础上进一步分析韩国人特有的遗传特性,有助于探明韩国人种发病率较高的遗传性疾病的病因,找到后基因时代的解决办法。 联合通讯社引用研究人员的观点说,对韩国人基因组图谱的初步解读从科学意义上证实了韩国人同中国人和日本人的差异性。染色体碱基序列分析发现,在非洲人、西方人及东方人中,韩国人的基因属于东方人类型,居中国人和日本人之间。以单核苷酸多态性位点(SNP)分析,金圣镇的染色体与美国沃森和中国杨焕明此前发表的染色体序列的差异度分别为0.05%和0.......阅读全文

鸟枪法如何测序

全基因组鸟枪法测序(Whole Genome Shotgun Sequencing)无需构建各类复杂的物理图谱和遗传图谱,采用最经济有效基因组鸟枪法测序/鸟枪法Shotgun测序(Whole Genome Shotgun Sequencing)无需构建各类复杂的物理图谱和遗传图谱,采用最经济有效的实

llumina高通量测序平台的应用

  Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收

llumina高通量测序平台的应用

  Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收

基因组错配扫描的功能

中文名称基因组错配扫描英文名称genome mismatch scanning;GMS定  义从遗传背景有较大差异、但具有相同性状的两个不同个体基因组中筛查高度一致的DNA片段的技术。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

Genome-Biol:开发出有望识别致癌病原体的新方法

  近日,一项刊登在国际杂志Genome Biology上的研究报告中,来自东英吉利亚大学等机构的科学家们通过研究开发了一种新方法来寻找与癌症相关的细菌和病毒。 图片来源:CC0 Public Domain   如今研究人员已经发现,某些感染与癌症发生直接相关,比如胃癌和宫颈癌等;这项研究

南京农业大学国家重点实验室联合发表《Genome-Biology》

  中国南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室、美国德州大学和德州A&M大学的科学家们分析了驯养的异源四倍体棉花和其4倍体和2倍体亲缘植物的1200万个差异甲基化胞嘧啶的综合表观基因和功能。  生物通报道:中国约有2000年的棉花种植历史,是世界三大产棉国之一。长绒棉(纤维柔长)是纺高支纱的关

Genome-Res:核糖体RNA基因拷贝数变异和表达调控新发现

  核糖体是细胞中最重要的细胞器之一,负责将细胞转录出来的信使RNA(messenger RNA,简称“mRNA”)翻译成蛋白质。真核生物的核糖体,主要由4种核糖体 RNA(rRNA)和80多种核糖体蛋白组成。其中,45S rRNA基因位点通过转录加工可以产生18S、5.8S和25S rRNA;而5

高通量测序发展史

人类基因组计划(human genome project, HGP)  在介绍高通量测序发展之前,需要先为大家介绍一个人类发展史上的一项重要创举——人类基因组计划(human genome project, HGP)。HGP的完成对测序技术的推动作用意义重大。  HGP是由美国科学家于1985年率先

细胞器基因组的概念

中文名称细胞器基因组英文名称organelle genome定  义真核细胞线粒体、叶绿体等细胞器所包含的全部DNA分子。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

表观基因组学研究指南(三)

  今年九月,对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份,因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在 Nature,Genome Biology,Genome Research等杂志上公布了三十多份论文,还有在Science,Cell,以及the Journal

《自然》社论关注人类基因组测序

  2月10日出版的《自然》杂志刊登社论——《最好的还未到来》(Best is yet to come),回顾了人类基因组测序工程过去10年的发展并展望其值得期盼的辉煌未来。以下为文章主要内容:  从比尔·克林顿(Bill Clinton)到托尼·布莱尔(Tony Blair),2001年

中国热科院牵头发布椰子高质量基因组

  近日,中国热科院椰子研究所作为第一完成单位,联合海南大学、广西大学、华北理工大学科研团队,在国际学术期刊 Genome Biology(影响因子:13.58;中科院一区)上发表题为“High-quality reference genome sequences of two coconut cu

近期最热门的基因组测序成果

  生物通报道:The scientist杂志对近期最热门的一些基因组测序成果进行了盘点,包括濒临灭绝的几维鸟和极其聪明的章鱼。  种属:甜瓜(Cucumis melo)  西班牙和意大利的研究团队在Molecular Biology and Evolution杂志上率先发布了七个甜瓜品种的基因组分

《自然》:重新认识人类基因组

“DNA元件百科全书”首批成果出炉,人类生物学再树里程碑     继“人类基因组计划”后最大的国际合作计划之一——“DNA元件百科全书”计划(Encyclopedia of DNA Elements,简称ENCODE)日前发表了一系列重要文章,挑战了关于人类基因组的传统理论,即人类基因蓝图不是由孤

谁在先?“鸡基因组”和“鸡蛋基因组”

是先有鸡还是先有鸡蛋?这个问题相当恼人,恐怕很难说清楚。现在,研究人员回答了与这个问题一样恼人的问题:是人类基因组中的成千上万的长重复DNA片段中,那个是第一个产生的?那些被复制了? 这个答案发表在10月7日的《自然·遗传学》杂志上。该研究给出了人类基因组中DNA重复片段复制的第一个进化证据,这种

武汉植物园发现蕨类植物叶绿体基因组进化的过渡形态

  目前已知的蕨类植物叶绿体基因组在组织结构上表现为两种基本类型:一是核心型,高等核心薄囊蕨类水龙骨目和树蕨目具此类型;另一是基部型,见于其他蕨类基部类群。与基部型相比,核心型叶绿体基因组的反向重复区和大单拷贝区的rpoB-psbZ区(BZ区)发生过复杂的基因组重排,同时它们还丢失了5个相同的tRN

盘点基因组测序的最新成果

  近日,the scientist杂志发表文章盘点了最近发布的几项基因组测序成果,一起来看看吧。   昏睡病传播者   种属:采采蝇(Glossina morsitans morsitans)   基因组:360 million bp   国际舌蝇基因组计划(International G

萝卜基因组组装与抽薹性状遗传调控机理解析研究新进展

  近日,南京农业大学作物遗传与种质创新利用全国重点实验室、园艺学院萝卜遗传育种团队在植物学领域权威期刊Plant Biotechnology Journal 在线发表了题为“A chromosome-level genome assembly of radish (Raphanus sativus

基因组所参加国际基因组ENCODE计划取得系列研究成果

    近日,国际科学界宣布“DNA元素百科全书”(简称ENCODE)计划获得了迄今最详细的人类基因组分析数据,并以30余篇论文的形式同时发表在Nature、Science、Genome Research、Genome Biology等一系列高水平的SCI学术期刊上。ENCODE被认为是继“人类基

细胞化学词汇镶嵌基因组

中文名称:镶嵌基因组英文名称:mosaic genome定  义:由不同生物基因组的DNA序列经过重新组合而形成的一套杂合的生物体基因。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

镶嵌基因组的定义

中文名称镶嵌基因组英文名称mosaic genome定  义由不同生物基因组的DNA序列经过重新组合而形成的一套杂合的生物体基因。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

九大测序平台对比(四)

5.Helicos企业: Helicos Biosciences推出时间: 2008年主流型号: HeliScope™ Single Molecule Sequencer(2008年推出)样品要求: 1-3 μg,起始DNA体积不超过100 μL.测序原理: 边合成边测序,可逆阻断测序待测DNA被随

我国科学家揭示竹子茎秆快速生长的机制

  竹子是一种独特的禾本科植物,它的茎秆生长迅速,如毛竹的幼嫩茎秆(笋)一天生长可达1米。这种特性使其能够与其他树木竞争,从而适应森林环境。以往对竹子木本茎快速生长特性的研究主要集中在形态学、解剖学和生理学方面。近期,我国科学家开展了竹子新基因功能演化的研究,揭示了其茎秆快速生长的遗传机制,相关研究

我国科学家揭示竹子茎秆快速生长的机制

  竹子是一种独特的禾本科植物,它的茎秆生长迅速,如毛竹的幼嫩茎秆(笋)一天生长可达1米。这种特性使其能够与其他树木竞争,从而适应森林环境。以往对竹子木本茎快速生长特性的研究主要集中在形态学、解剖学和生理学方面。近期,我国科学家开展了竹子新基因功能演化的研究,揭示了其茎秆快速生长的遗传机制,相关研究

2018年基因组测序盘点——各种新鲜的植物

  作为人类的主要食物,植物在我们的生活中扮演着重要角色。然而,由于植物基因组比较大,表现出多种倍性,还存在着大量的重复区域,故植物基因组的测序工作一直进展缓慢。  如今,得益于新型的测序技术,比如PacBio和Oxford Nanopore的长读长测序技术,许多植物在2018年收获了基因组,或者说

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析-6

应用WGS正在成为NGS中最广泛的应用。通过该技术并且结合生物学应用,研究人员可以获得基因组信息中最值得注意的信息73。举例来说,2012年,Ellis等报道了基因与乳腺癌患者芳香酶抑制剂(aromatase inhibitor)治疗法之间的关联。他们指出突变,后果与诊断之间的关联,同样还有

基因组重构的结构特征

中文名称基因组重构英文名称genome reorganization定  义由于进化中的选择压力所造成的物种间在基因组结构特征上的改变。可以通过染色体重排(如缺失、扩增、置换等)形成。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学词汇基因组重构

中文名称:基因组重构英文名称:genome reorganization定  义:由于进化中的选择压力所造成的物种间在基因组结构特征上的改变。可以通过染色体重排(如缺失、扩增、置换等)形成。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

中外科学家成功绘制并公开达尔文雀基因组图谱

  “万种脊椎动物基因组计划”(G10K)联盟和深圳华大基因研究院于8月16日联合宣布勇地雀(Geospizafortis)基因组图谱绘制完成。勇地雀是最早由达尔文记载的生活在加拉帕戈斯群岛上的13种达尔文雀之一。据悉,勇地雀是G10K 联盟最早计划进行测序的100种脊椎动物之一。   勇地雀

细胞化学词汇线性基因组

中文名称:线性基因组英文名称:linear genome定  义:构成生物体全部遗传信息的核酸分子的一种结构形式,具有这种结构形式的长链核酸分子的5′端和3′端都是游离的。具有线性基因组的生物包括真核生物、某些噬菌体和病毒,其基因组的完整复制依赖于各种有别于具有环状基因组的生物。应用学科:生物化学与