首个韩国人基因组图谱绘制成功
据韩国联合通讯报道,韩国研究机构日前宣布,第一个完整的韩国人基因组图谱已经绘制成功。 报道指出,这是人类染色体碱基序列第四次被完整破译,这项成果是由韩国嘉泉医科大学和韩国生命工程研究院的两个研究团队通过共同研究取得的。研究人员宣布,分析测序中使用的基因物质来自于嘉泉医科大学教授金圣镇。 研究的目的是建立韩国人标准染色体数据库。研究人员期待,在染色体碱基序列图谱基础上进一步分析韩国人特有的遗传特性,有助于探明韩国人种发病率较高的遗传性疾病的病因,找到后基因时代的解决办法。 联合通讯社引用研究人员的观点说,对韩国人基因组图谱的初步解读从科学意义上证实了韩国人同中国人和日本人的差异性。染色体碱基序列分析发现,在非洲人、西方人及东方人中,韩国人的基因属于东方人类型,居中国人和日本人之间。以单核苷酸多态性位点(SNP)分析,金圣镇的染色体与美国沃森和中国杨焕明此前发表的染色体序列的差异度分别为0.05%和0.......阅读全文
巨大的二倍体蚕豆基因组解开全球蛋白质作物的变异之谜
丹麦奥胡斯大学Stig Uggerhøj Andersen等研究人员的最新发现表明,巨大的二倍体蚕豆基因组解开全球蛋白质作物的变异之谜。2023年3月8日,《自然》杂志在线发表了这项成果。研究人员报告了一个高质量的染色体尺度的蚕豆基因组组装,并表明它已经通过扩增和消除逆转录基因和卫星重复的速度之间的
Nat.-Methods|新型显微镜实现纳米可及性基因组超分辨成像
美国霍华德休斯医学研究所Zhe Liu、加州大学伯克利分校Robert Tjian等研究人员合作,开发了用于可及性基因组超分辨成像的新型显微镜。 这一研究成果于2020年3月16日在线发表在《自然—方法学》上。 为了在纳米尺度上对可及性基因组进行原位成像,研究人员开发了转座酶可及性染色质光激
新型冠状病毒RNA不具备整合进宿主基因组的能力
SARS-CoV-2是一种具有高度传播性的单股正链RNA病毒,是COVID-19严重流行的病因。SARS-CoV-2具备高传染性特性,并通过侵犯多器官系统而引起严重临床症状。本研究聚焦新冠病毒RNA基因组是否整合到受其感染的宿主细胞基因组的可能性。 2021年8月2日,中国
Nature-Biotechnology定义病毒基因组标准:何谓高质量基因组
据说,地球上的微生物总量超过了银河系中的恒星数量,而且病毒总量也要比之前预计的多得多。 在最新的Nature Biotechnology杂志上,美国能源部(DOE)联合基因组研究所(JGI)构建了重要的病毒序列数据库,同时提出了病毒基因组标准,指出了三类基因组质量的分级。 目前虽然许多病毒未
Genome-Research丨lncRNA在精子发生过程中的关键作用
Genome Research丨lncRNA在精子发生过程中发挥重要作用 一直被很多科学家认为是真核生物基因组进化中“垃圾”信息的非编码RNA(ncRNA),既不编码蛋白质,又缺乏生物学功能的遗传学证据,近几年得到了“平反”,越来越多的研究表明ncRNA 在剂量补偿效应(Dosage co
Genome-research:不同RNA-m5C甲基化修饰存在巨大差异
近年来,RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,m5C RNA修饰的分子机理研究越来越清晰,也不断有学者探寻如何更全面的获得贴近真实的m5C修饰的原貌。近期,来自德国的Frank Lyko和Mark Helm团队在GENOME RESEARCH(
中科院学者Genome-Medicine报道肝细胞癌特异的诊断标志物
全球每年肝癌新发病例约75万人、死亡约70万人。肝细胞癌是肝癌的主要类型、约占肝癌的80%以上,全球每年半数以上的新发和死亡病例发生在中国,是危害我国人民生命健康的重大疾病。由于诊断方法的局限性,大多数肝细胞癌患者就诊时已属中晚期,失去了最佳治疗时机。因此,发现新的肝细胞癌诊断标志物特别是血清诊
Genome-research:不同RNA-m5C甲基化修饰存在巨大差异
导读 近年来,RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,m5C RNA修饰的分子机理研究越来越清晰,也不断有学者探寻如何更全面的获得贴近真实的m5C修饰的原貌。近期,来自德国的Frank Lyko和Mark Helm团队在GENOME RES
Genome-Biology:构建猪体细胞染色质三维结构图谱
猪不仅是重要的经济家畜,在生物医学领域也有重要应用。生猪的育种中广泛应用了辅助生殖技术,包括体外受精技术、孤雌和孤雄生殖技术等。但与体外受精胚胎相比,孤雌和孤雄胚胎的存活率级低。这一存活率差异产生的机制目前还不清楚。深入理解这一机制不仅有助于增加商业化猪育种的产仔数,也将有利于生物医学研究中转基
北京基因组所生命组学数据资源建设获进展
近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队题为The BIG Data Center: from deposition to integration to translation 的研究论文被国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表。该研究成
2年Science基因组学文章引用次数高达100
据The Scientist报道,一篇发表在Science杂志上的基因组学文章成为基因组学领域热门的文章,从2007年发表后,总的引用次数高达100次。 这篇文章即是:V. Nene et al., “Genome sequence of Aedes aegypti, a major ar
Pacific-Biosciences推出新的Sequel-II测序系统
Pacific Biosciences of California Inc.(纳斯达克股票代码:PACB)是基因组,转录组和表观基因组的高质量测序的领先供应商,于4月24号宣布Sequel®II系统的商业发布。该系统包括新的8M SMRT®Cell,以及配套试剂,仪器控制软件和SMRT Link
研究人员解析人类基因组计划的赢利奥秘
人类基因组计划(genome project)为美带来1万亿美元经济增长。 美国巴特尔纪念研究所6月12日发布的一份颇具争议的报告指出,解码人类基因组项目的经济收益持续增长。该项目结束10年后,目前其带来的收益已接近1万亿美元。 1988~2003 年进行的人类基因组计划(genom
基因组学研究成果让斑马鱼研究“快马加鞭”
基因组学研究成果让斑马鱼研究快马加鞭(Genomics: Zebrafish earns its stripes)作者:谢训卫人类发育,生理功能及疾病发生的过程涉及到成千上万的基因和其变异体,但是大部分的基因和其变异体的功能依然是未知的。过去的20年里,斑马鱼逐渐成为研究人类基因功能的重要模式动物。
Dharmacon文库在RNAi文库筛选的应用
1.什么是文库?――大幅提高研究效率的利器以往的实验室研究中,无论是寻找新基因的功能、探索已知基因致病的机制、解析复杂信号通路网络、探索疾病发生发展的机制,药物敏感性测试或者是寻找药物开发的新靶点,科研工作者们往往是围绕着潜在的单个目标基因进行改造,包括针对该基因的过表达、沉默、敲除、激活、修饰、突
研究发现人类合子基因组激活起始于父源基因组
表观遗传修饰包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质可及性和染色质高级结构等,在基因的表达调控中发挥重要作用。人类精子和卵细胞的染色质表观修饰状态存在较大差异。在受精后的早期胚胎里,来自精子的父源染色质和来自卵细胞的母源染色质会经历剧烈的表观遗传修饰重编程,最终达到两者类似的模式。人类胚胎的合子基因
盘点最新基因组测序成果
the scientist杂志发表文章盘点了几项最新的基因组测序成果以飨读者: 种属:非洲腔棘鱼(Latimeria chalumnae) 基因组:~2.86 billion bp 人们曾经认为腔棘鱼早在七千万年前就已灭绝,直到1938年一只腔棘鱼在南非海岸被渔民捕获。这种鱼看上去跟三亿年
基因组序列草图的概念
中文名称基因组序列草图英文名称draft genome sequence定 义已测定序列占到90%以上、测序精度在1%的基因组序列图。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
植生生态所在蛹虫草基因组研究方面取得进展
11月24日,Genome Biology期刊在线发表了中科院上海生命科学研究院植生生态所王成树课题组关于蛹虫草基因组的研究成果(Genome sequence of the insect pathogenic fungus Cordyceps militaris, a valued tradi
生物学术语基因组复杂度的概念
中文名称基因组复杂度英文名称genome complexity定 义衡量基因组所含信息量的参数,由单一序列的核苷酸数目表示。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
综述:全基因组时代基因连锁分析的原则、方法和应用
许多年来,连锁分析(linkage analysis)都是对孟德尔疾病和具有家族聚集倾向的复杂性状进行遗传作图(genetic mapping)的主要工具。而近几年来,随着研究焦点向常见变异(common variants)的转移,全基因组关联研究(genome-wide association
今夏最热门的基因组测序研究,中国学者再立新功
大千世界无奇不有,这都是进化的功劳。大航海时代,科学家们扬帆远航去探索大自然的神奇造化。如今,科学家们正在测序技术的帮助下进一步揭示生命的奥秘。The scientist杂志对近期最热门的一些基因组测序成果进行了盘点,我国学者参与的两项测序研究格外引人注目。 种属:虎鲸(Orcinus orc
天津工生所等神经退行性疾病遗传机制研究取得进展
阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease, AD)是一种复杂的中枢神经系统退行性疾病。目前,阿尔茨海默病发病机理尚不十分清楚。随着人类基因组计划(Human genome project, HGP)和高通量生物芯片技术的成功研发,人们广泛利用高通量全基因组生物芯片的技术手段,采用全基
2018年基因组测序盘点——各种有趣的动物
2018年,各国科学家继续卯足了劲,对本国的珍(qi)稀(pa)动物进行基因组测序。他们的目标是保护濒危动物(如考拉、金枪鱼),对付入侵物种(如小龙虾、海蟾蜍),抑或是从中发现长寿的秘密(如乌龟、鹦鹉)。 与之前采用单一技术的研究不同,如今的基因组测序研究大多结合Illumina短读长和Pac
双义基因组定义
中文名称双义基因组英文名称ambisense genome定 义双链DNA病毒中正义链和反义链同时含有可读框,其间被A-U富集区所分隔的一种基因组结构。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
双义基因组的概念
中文名称双义基因组英文名称ambisense genome定 义双链DNA病毒中正义链和反义链同时含有可读框,其间被A-U富集区所分隔的一种基因组结构。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
llumina高通量测序平台的应用
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收
llumina高通量测序平台的应用
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收
鸟枪法如何测序
全基因组鸟枪法测序(Whole Genome Shotgun Sequencing)无需构建各类复杂的物理图谱和遗传图谱,采用最经济有效基因组鸟枪法测序/鸟枪法Shotgun测序(Whole Genome Shotgun Sequencing)无需构建各类复杂的物理图谱和遗传图谱,采用最经济有效的实
细胞化学词汇基因组组构
中文名称:基因组组构英文名称:genome organization定 义:生物的基因组在诸如各基因的排列顺序、基因的结构、同源基因的序列差异等基因组结构上的特征。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)