中国学者9月参与发表多篇Nature文章

进入九月份,中国学者参与的多项研究在Nature杂志及其重要子刊上发表,其中主要包括的是太平洋牡蛎(Pacific oyster)基因组的测序、组装与分析,一种肠道细菌中的重要蛋白:Tir的作用,以及增强型绿色荧光蛋白的荧光会由于激光而被关闭等。 首先由中国科学院海洋研究所和深圳华大基因研究院领导的一个国际研究小组完成了对太平洋牡蛎(Pacific oyster)的测序、组装与分析,这是第一个测序的软体动物基因组,将有助于填补我们对于种类丰富而较少研究的软体动物家族的了解空白。 牡蛎是一种具有双开合贝壳的软体无脊椎动物,双开合贝壳是许多水生生态系统的重要组成部分。牡蛎呈全球分布,相比于所有其他的淡水或海洋生物多年来具有更高的年产量。除经济和生态重要性,牡蛎独特的生物学特性使得它成为了研究海洋适应的一个重要模型,引发了大量的生物学和基因组学研究。全面测序牡蛎基因组为了解如环境压力适应和贝壳形成等自然机制,更......阅读全文

什么是宿主细胞?

病毒侵入的细胞就叫宿主细胞。病毒一般没有成型的细胞核,一般被蛋白质所包裹在里面的是它的遗传物质,在病毒获得宿主后,利用宿主的蛋白质和其他物质制造自己的身体,然后将遗传物质注入到细胞内部感染细胞,有的使细胞死亡,有的会使细胞变异,也就是所谓的癌变。

关于宿主细胞的细胞介绍

  受体细胞也叫宿主细胞。受体细胞有原核受体细胞(最主要是大肠杆菌)、真核受体细胞(最主要是酵母菌)、动物细胞和昆虫细胞(其实也是真核受体细胞)。原核受体细胞中,最常用的宿主细胞是大肠杆菌。

宿主细胞的基本介绍

  病毒侵入的细胞就叫宿主细胞。病毒一般没有成型的细胞核,一般被蛋白质所包裹在里面的是它的遗传物质,在病毒获得宿主后,利用宿主的蛋白质和其他物质制造自己的身体,然后将遗传物质注入到细胞内部感染细胞,有的使细胞死亡,有的会使细胞变异,也就是所谓的癌变。  受体细胞也叫宿主细胞。受体细胞有原核受体细胞(

基因组DNA甲基化分析方法

早期的基因组DNA甲基化分析技术,如SssI甲基转移酶分析法、氯乙醛反应法、免疫学抗体技术等,已经不能满足现代表观遗传学研究的需求。今年来常用的基因组甲基化的方法有以下两种。1. 甲基化敏感扩增多态性实验甲基化敏感扩增多态性实验技术被用于检测双向型真菌的DNA甲基化,它是在扩增片段长度多态性技术的基

Nature-Genetics:单细胞全基因组DNA甲基化组新发现

  北京大学北京未来基因诊断高精尖创新中心,北大生命科学学院与第三医院等处的研究人员发表了题为“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimplantation Embryos”的文章,利用单细胞DNA甲基化组高通量测序方法,首次在单细胞分辨

甲基化的基因组直接测序法

  基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理,并以连接介导的PCR来放大信号强度,然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解,故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解

在基因组范围定位DNA甲基化

  DNA甲基化在哺乳动物基因表达中扮演了重要角色。尽管通过线粒体遗传且随时间稳定,但是细胞分化、疾病或环境影响都会改变DNA甲基化的模式。近年来,科学家们开发出多种新方法,试图在基因组范围定位DNA甲基化。   尽管从理论上来说,全基因组亚硫酸氢盐测序能让研究人员全面观察甲基化组,但它还是面临技

线虫基因组中存在DNA甲基化现象

  2012年10月18日,吉林大学和华大基因合作完成的旋毛形线虫不同发育阶段DNA甲基化差异分析的相关研究成果在国际著名期刊《基因组生物学》(Genome Biology)上发表。该研究首次证实了线虫基因组中存在DNA甲基化现象,改写了长期以来认为线虫中没有该表观遗传修饰的历史,同时也使以DN

家蚕基因组甲基化谱研究获突破

我国科学家利用新一代测序技术构建家蚕丝腺甲基化谱  由中国科学院昆明动物研究所、深圳华大基因研究院、西南大学、上海肿瘤所等合作的研究成果“家蚕基因组甲基化谱”,5月2日在国际著名学术杂志《自然—生物技术》(Nature Biotechnology)上发表,这是中国科学家

全基因组测序解读重要甲基化机制

  DNA看起来只是AGTC四种碱基的简单排列,可一旦它与组蛋白包装形成染色质,情况就复杂得多了。组蛋白主要有四种,分别是H2A、H2B、H3和H4。这些组蛋白要么令DNA盘绕起来保持沉默,要么将DNA解开允许基因表达。组蛋白上的化学修饰(如甲基化),能够影响它对基因的控制。   H3K4me3是

全基因组甲基化定量检测技术LUMA

  LUMA介绍   基因组DNA甲基化(Genomic DNA Methylation, GDM)的变化被认为是正常和病理细胞过程中的重要的事件,有助于正常发育和分化以及癌症和其他疾病。在此,我们介绍一种新的方法评估全基因组DNA甲基化,称为荧光甲基化检测(Luminometric Methyl

全基因组甲基化定量检测技术LUMA

LUMA介绍基因组DNA甲基化(Genomic DNA Methylation, GDM)的变化被认为是正常和病理细胞过程中的重要的事件,有助于正常发育和分化以及癌症和其他疾病。在此,我们介绍一种新的方法评估全基因组DNA甲基化,称为荧光甲基化检测(Luminometric Methylat

关于宿主细胞的感染过程介绍

  病毒通常由具有蛋白质外壳的遗传物质组成,它通过穿透细胞膜并向细胞释放大量的病毒遗传物质而感染细胞。利用宿主细胞上特定的膜上病毒输送蛋白,进入感染的宿主细胞,向细胞释放大量的病毒遗传物质而感染细胞。由于细胞为无性体,因此它们依赖复制蛋白质或宿主细胞的“机体”来复制自己的DNA物质。从而篡夺细胞功能

关于宿主细胞的感染过程介绍

  病毒通常由具有蛋白质外壳的遗传物质组成,它通过穿透细胞膜并向细胞释放大量的病毒遗传物质而感染细胞。利用宿主细胞上特定的膜上病毒输送蛋白,进入感染的宿主细胞,向细胞释放大量的病毒遗传物质而感染细胞。由于细胞为无性体,因此它们依赖复制蛋白质或宿主细胞的“机体”来复制自己的DNA物质。从而篡夺细胞功能

著名学者朱健康院士Cell-Research发表表观遗传学研究成果

  生物通报道:转座子通常是通过表观遗传学机制(包括DNA甲基化)保持沉默的。12月9日,在《Cell Research》杂志上发表的一项研究中,来自中科院上海生命科学研究院、美国普渡大学以及中科院遗传与发育生物学研究所的研究人员,在拟南芥中将一对Harbinger转座子衍生蛋白(HDPs)——HD

基因组直接测序法检测甲基化的介绍

  基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理,并以连接介导的PCR来放大信号强度,然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解,故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解

基因组直接测序法检测DNA的甲基化

基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理,并以连接介导的PCR来放大信号强度,然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解,故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解反应

细菌会像“粘扣”黏附宿主细胞

  一项国际研究发现,细菌性病原体已进化出了高效的生存策略,它们会像衣服上的尼龙“粘扣”那样,牢牢黏附到宿主细胞上。新发现将有助人们更好地应对细菌感染。  德国慕尼黑大学和美国伊利诺伊大学研究人员在新一期美国《科学》杂志上介绍说,表皮葡萄球菌会持久地黏附在宿主细胞上,为分析这种黏附机制,他们采用了“

关于宿主细胞的基本信息介绍

  病毒侵入的细胞就叫宿主细胞。病毒一般没有成型的细胞核,一般被蛋白质所包裹在里面的是它的遗传物质,在病毒获得宿主后,利用宿主的蛋白质和其他物质制造自己的身体,然后将遗传物质注入到细胞内部感染细胞,有的使细胞死亡,有的会使细胞变异,也就是所谓的癌变。

病毒能欺骗宿主细胞实现自我复制

美国宾西法尼亚大学医学院研究人员表示,他们发现Kaposi肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)能够欺骗受其感染的细胞完成病毒遗传物质复制。KSHV的这种复制手段能使其不被人体免疫系统察觉。过去,人们认为KSHV需要病毒蛋白质启动复制,新的研究结果显示病毒能够独立地从宿主细胞中获取蛋白质实现自我复制。  

细菌会像“粘扣”黏附宿主细胞

  一项国际研究发现,细菌性病原体已进化出了高效的生存策略,它们会像衣服上的尼龙“粘扣”那样,牢牢黏附到宿主细胞上。新发现将有助人们更好地应对细菌感染。  德国慕尼黑大学和美国伊利诺伊大学研究人员在新一期美国《科学》杂志上介绍说,表皮葡萄球菌会持久地黏附在宿主细胞上,为分析这种黏附机制,他们采用了“

细胞化学词汇DNA甲基化

中文名称:DNA甲基化外文名称:DNA methylation影    响:控制基因表达甲基酶分类:DNM T1、DNM T3a、DNM T3b作    用:修饰DNA序列

Cell-Research-肠道菌群调控宿主RNA甲基化和基因表达新机制

  肠道菌群微生物组学是近年来研究热点,肠道菌群在维持宿主生理平衡和健康中发挥着重要作用,在人和动物疾病治疗方面具有极大的应用前景。研究表明,肠道菌群及其代谢产物可调节宿主基因表达。随着研究的深入, 肠道菌群和宿主之间的相互作用机理也越来越多被发现,特别是通过表观遗传影响宿主的基因表达。如最新研究发

揭示全基因组DNA甲基化、半甲基化与遗传突变的新方法

  5月31日,中国科学院北京生命科学研究院研究员孙中生团队与北京大学肿瘤医院合作,在Briefings in Bioinformatics上,发表了题为A new approach to decode DNA methylome and genomic variants simultaneousl

中国学者9月参与发表多篇Nature文章

  进入九月份,中国学者参与的多项研究在Nature杂志及其重要子刊上发表,其中主要包括的是太平洋牡蛎(Pacific oyster)基因组的测序、组装与分析,一种肠道细菌中的重要蛋白:Tir的作用,以及增强型绿色荧光蛋白的荧光会由于激光而被关闭等。   首先由中国科学院海洋研究所和深圳华大基

人类基因组DNA甲基化数据分析

  近期来自电子科技大学,清华大学等处的研究人员从CpG岛等基本定义出发,阐述了高通量DNA甲基化的检测技术以及针对芯片技术与下一代测序技术的低水平数据处理方法,并重点对比了基于机器学习理论对CpG位点及CpG岛甲基化水平的预测算法,以及所利用的特征对预测效果的影响与发展趋势。  DNA甲基化是表观

进行全基因组甲基化检测需要多少钱

建库是5000块钱一个库,测序就是1500每G,看您要测多少G的数据量,信息分析大概要5000块钱左右吧。。。

北京基因组所发表RNA甲基化新发现

  在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA最后流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以在不改变DNA序列的基础上调控基因的表达,并由此决定细胞的分化和发育情况。实际上,mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。  N6-methyladenosine(m

科学家揭秘病毒如何感染宿主细胞

  据美国物理学家组织网报道,研究人员发现,在酸度出现变化的环境下,蛋白分子的结构将在原子水平上发生改变,引发病毒入侵并与宿主细胞发生融合。   美国普渡大学和巴斯德研究所的研究小组分别研究了酸性环境和中性环境中的蛋白结构。结合两个小组的研究成果,能够说明病毒在进入宿主细胞并准

PLOS-Pathogens:HIV如何侵入宿主细胞核?

  最近,芝加哥洛约拉大学的科学家们解决了长期以来困扰HIV研究人员的一个谜团:HIV如何设法进入免疫系统细胞的细胞核?  这一研究结果发表在国际著名病原学期刊《PLOS Pathogens》,可能为HIV/AIDS治疗带来有效的新药物。本文通讯作者是芝加哥洛约拉大学特里奇医学院微生物和免疫学系副教