circRNA在胃癌海绵调控机制的应用(一)
环状RNA (circRNA)作为新型非编码RNA,具有比线性RNA更加稳定的环状结构,可通过多种机制调控靶基因。近年来,circRNA被发现在多种肿瘤组织和细胞中异常表达,作为肿瘤的诊断生物标志物或治疗靶点,具有巨大的价值,受到广泛的关注。癌症新的证据表明,circRNAs在癌症的发生发展中起着重要的调控作用。云序用户山东大学刘志方课题组近期在Molecular Cancer杂志上发表的文章,通过全转录组测序、分子实验和细胞动物表型实验探讨了hsa_circ_0004872在胃癌(GC)中的作用及其调控机制。 发表杂志:Molecular Cancer影响因子:15.302发表时间:2020.11.10技术方法:全转录组测序、RIP-qPCR、pull down、双荧光素酶实验、ChIP文章链接:Circular RNA hsa_circ_0004872 inhibits gastric can......阅读全文
circRNA在胃癌海绵调控机制的应用(一)
环状RNA (circRNA)作为新型非编码RNA,具有比线性RNA更加稳定的环状结构,可通过多种机制调控靶基因。近年来,circRNA被发现在多种肿瘤组织和细胞中异常表达,作为肿瘤的诊断生物标志物或治疗靶点,具有巨大的价值,受到广泛的关注。癌症新的证据表明,circRNAs在癌症的发生发展中起
circRNA在胃癌海绵调控机制的应用(三)
6. 体内实验验证hsa_circ_0004872抑制肿瘤发生和转移通过皮下注射过表达hsa_circ_0004872的BGC-823细胞和对照组BGC-823细胞发现,过表达hsa_circ_0004872组生成的肿瘤明显小于对照组,并且肿瘤中Smad4和p21表达升高。尾静脉注射实验也发现过表达
circRNA在胃癌海绵调控机制的应用(二)
3. hsa_circ_0004872作为分子海绵吸附miR-224作者首先通过FISH实验观测到hsa_circ_0004872主要分布在细胞质。然后通过RIP-qPCR验证到hsa_circ_0004872与AGO2蛋白结合,pull down实验显示hsa_circ_0004872与miR-2
全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制(一)
2月7日,加拿大多伦多大学的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授团队对144例前列腺癌样本进行全转录组测序,结合后续的功能机制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的调控机制!该研究成果以题为“Widespread and Functional RNA Circ
circRNA机制研究汇总(一)
文章导读超强子调控circRNA-Nfix缺失诱导成年小鼠心肌梗死后再生circRNAs正在成为心脏发育和疾病强有力的调节因子,但其在心脏再生中的作用仍然未知。鉴于此,作者与他的团队探究了与超增强子(SEs)相关的circRNA-Nfix在小鼠心肌梗死后再生过程中的功能,并探究了其调节心脏重塑的分子
circRNA_104075在促进肝癌发生和进展的机制研究(一)
文章导读:在全球范围内原发性肝癌是造成癌症相关死亡的三大原因之一。肝细胞癌(HCC)是最常见的原发性肝脏癌症。由于缺乏高特异性和敏感性的早期诊断生物标志物,HCC患者往往得不到及时有效的治疗。相比于长链非编码RNA和miRNA,circRNA作为一种新型环状RNA,具有共价闭合环状结构,在组织和血液
circRNA在膀胱癌中的作用机制
研究背景膀胱癌(Bladder cancer)是一种常见的泌尿系统肿瘤,由于易转移,死亡率高,5年生存率只有8.1%。因此,研究膀胱癌的发病机制,有助于对膀胱癌的诊断和治疗。circRNA是一类具有闭合环形结构的非编码RNA,是现阶段转录组学研究的新星。本研究从circRNA的角度出发,深入阐述
全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制(二)
3. 环状RNA的差异表达与前列腺癌的进展有关研究者对144个前列腺癌进行了聚类分析,与线性RNA相比,环状RNA最强模式与它们在每个样本中的总体丰度相一致。另外,极端circRNA分布的患者的预后明显较circRNA分布稳定的患者差,同时极端circRNA index组也与更高的转移发生率
《Cell》重磅!全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制
2月7日,加拿大多伦多大学的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授团队对144例前列腺癌样本进行全转录组测序,结合后续的功能机制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的调控机制!该研究成果以题为“Widespread and Functional RNA Ci
Cell》重磅!全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制!
2月7日,加拿大多伦多大学的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授团队对144例前列腺癌样本进行全转录组测序,结合后续的功能机制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的调控机制!该研究成果以题为“Widespread and Functional RNA Ci
circRNA再发IF=18.88高分文章circRNA机制研究汇总
超强子调控circRNA-Nfix缺失诱导成年小鼠心肌梗死后再生 circRNAs正在成为心脏发育和疾病强有力的调节因子,但其在心脏再生中的作用仍然未知。鉴于此,作者与他的团队探究了与超增强子(SEs)相关的circRNA-Nfix在小鼠心肌梗死后再生过程中的功能,并探究了其调节心脏重塑的分子机制
circRNA再发IF=18.88高分文章circRNA机制研究汇总
超强子调控circRNA-Nfix缺失诱导成年小鼠心肌梗死后再生 circRNAs正在成为心脏发育和疾病强有力的调节因子,但其在心脏再生中的作用仍然未知。鉴于此,作者与他的团队探究了与超增强子(SEs)相关的circRNA-Nfix在小鼠心肌梗死后再生过程中的功能,并探究了其调节心脏重塑的
胃癌侵袭转移调控机制的新研究成果
近日,兰州大学第一医院普外科团队在胃癌侵袭转移调控机制方面研究取得新的成果,该研究阐明了BAG4在胃癌细胞侵袭转移中的作用和分子机制,有望成为胃癌潜在的预后标志物和治疗靶点。 胃癌是全球最常见的恶性肿瘤之一,流行病学调查结果显示:中国胃癌发病人数占全球发病总数的 46.8%,死亡人数占全球总数
circRNA机制研究汇总(二)
结合蛋白:(2)CircNfix与Ybx1结合并促进其降解:circNfix和对照组的蛋白质谱分析(A)。采用Ybx1、Nedd4l或阴性IgG抗体进行RIP实验(云序生物提供该服务)(B)。P0 CMs中过表达circNfix后Ybx1蛋白表达水平(C-D)。qRT-PCR检测P0 CMs中Y
circRNA_104075在促进肝癌发生和进展的机制研究
在全球范围内原发性肝癌是造成癌症相关死亡的三大原因之一。肝细胞癌(HCC)是最常见的原发性肝脏癌症。由于缺乏高特异性和敏感性的早期诊断生物标志物,HCC患者往往得不到及时有效的治疗。相比于长链非编码RNA和miRNA,circRNA作为一种新型环状RNA,具有共价闭合环状结构,在组织和血液中具有
CircRNAmiRNAmRNA相互作用网络在糖尿病及其相关并发症
大多数非蛋白质编码的RNA被鉴定为具有参与细胞内稳态的多种功能。环状RNA(CircRNAs)是一种非编码转录本,在许多生理和病理状态的发生和发展中起着关键作用。高通量RNA测序和生物信息学工具的进步帮助我们确定了几条CircRNA调控途径,其中之一就是microRNA(MiRNA)介导的调控。
CircEIF4G3或可成为判断胃癌预后的生物标志物和治疗靶点
胃癌是全球第五大常见癌症,也是癌症相关死亡的第三大原因。尽管有了很大的改善,但胃癌的早期诊断率、根治性切除率和五年生存率仍不尽如人意。因此,迫切需要寻找更有效的生物标志物和治疗靶点用于GC的诊断和治疗。 越来越多的研究表明,环状RNA(CircRNAs)是癌症发生和发展的关键调节因子。然而,C
IGF2BP3的蛋白诱饵,调控MYC和SNAIL的表达,抑制胃癌的转移
胃癌(Gastric cancer, GC)仍是我国最常见的胃肠道恶性肿瘤,肿瘤转移是预后不良的主要原因。环状rna (circrna)是一种具有重要调控作用的有趣的非编码rna。然而,circrna在胃癌转移中的作用尚未完全阐明。在这里,作者报道了与匹配的非癌组织相比,在103对GC组织中ci
新蛋白AXIN1295aa激活Wnt/βcatenin信号通路促进胃癌进展
环状RNA(CircRNAs)是一类具有共价闭环结构的转录本。它们没有5‘到3’的极性或Polya尾巴。大多数CircRNA是由外显子的后向剪接产生的,这是一种非规范的剪接过程。CircRNA以组织特异性、发育阶段特异性和疾病特异性的方式表达。它们被认为是微RNA海绵、转录调节剂和介导蛋白质相互
新蛋白AXIN1295aa激活Wnt/βcatenin信号通路促进胃癌进展
环状RNA(CircRNAs)是一类具有共价闭环结构的转录本。它们没有5‘到3’的极性或Polya尾巴。大多数CircRNA是由外显子的后向剪接产生的,这是一种非规范的剪接过程。CircRNA以组织特异性、发育阶段特异性和疾病特异性的方式表达。它们被认为是微RNA海绵、转录调节剂和介导蛋白质相互
circRNA_104075在促进肝癌发生和进展的机制研究(二)
5. circ_104075可以结合miR-582-3p作者首先想到circRNA通过海绵作用吸附miRNA,直接调控靶蛋白的表达,作者利用miRanda数据库预测了circ_104075最有可能结合的5个miRNA,接着通过RNA pull down技术(云序生物提供此项实验)捕获复合物后RT-q
《EMBO-reports》上阐述circRNA在膀胱癌中的作用机制
研究背景 膀胱癌(Bladder cancer)是一种常见的泌尿系统肿瘤,由于易转移,死亡率高,5年生存率只有8.1%。因此,研究膀胱癌的发病机制,有助于对膀胱癌的诊断和治疗。circRNA是一类具有闭合环形结构的非编码RNA,是现阶段转录组学研究的新星。本研究从circRNA的角度出发,
2018国自然研究热点一:环状RNA研究深度剖析
1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣? 2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀
环状RNA研究深度剖析
1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣? 2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀
环状RNA研究深度剖析(二)
目标circRNA的机制研究 a RIP-qPCR:挑选功能最为明显的1个circRNA做RIP-qPCR实验,检测circRNA是否与AGO2蛋白结合。(AGO2是circRNA发挥海绵作用的指示蛋白) b RNA pull down:对上述circRNA进行RNA pull down实验,拉
中国科学院动物所团队综述环形RNA药物设计
环形 RNA(circular RNA,circRNA)是一类广泛存在于真核细胞中的内源性非编码 RNA 分子,在生物体发育过程中发挥着重要作用。其独特的环状结构使其免受外切酶降解,因此比线性 RNA 更加稳定。自 2010 年代初以来,circRNA 在 RNA 适配体、 guide RNA 等领
Arraystar-CircRNA芯片应用于肝癌研究
第二军医大学免疫所所长、中国医学科学院院长曹雪涛院士课题组主要从事天然免疫与免疫调节基础研究、免疫治疗应用研究。近期其实验室用Arraystar CircRNA芯片研究发现circMTO1可以作为microRNA的吸附海绵结合癌基因miR-9从而上调p21的表达从而抑制肝细胞癌(hepatocell
环状RNA研究深度剖析(一)
1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀青年基金,两
伯豪客户《EMBO-reports》上阐述circRNA在膀胱癌中的作用机制
研究背景 膀胱癌(Bladder cancer)是一种常见的泌尿系统肿瘤,由于易转移,死亡率高,5年生存率只有8.1%。因此,研究膀胱癌的发病机制,有助于对膀胱癌的诊断和治疗。circRNA是一类具有闭合环形结构的非编码RNA,是现阶段转录组学研究的新星。本研究从circRNA的角度出发,
外泌体circRNA-PDE8A促进胰腺导管癌细胞侵袭
第三军医大学西南医院李晓武教授团队长期从事肝胆外科研究,近期,其实验室对利用Arraystar circRNA芯片研究发现了在胰腺导管癌细胞中高表达的circ-PDE8A可以通过miR-338调控MACC/MET/ERK通路,促进癌细胞侵袭。进一步研究发现,病人血浆外泌体中circ-PDE8A