m6A修饰的YTHDF1与介导EIF3C对卵巢癌进展的影响(二)
为了全面探索YTHDF1及其靶基因之间的直接相互作用,作者对过表YTHDF1的A2780细胞,进行了eCLIP-seq,并鉴定了2,343个目标转录物,这些转录物大多数是mRNA。将eCLIP seq的结果2,343个基因和上面三组数据交集确定的647个基因取交集,产生175个基因,将其确定为YTHDF1的直接结合靶基因。接下来,作者分析了175个基因上,m6A峰和YTHDF1结合mRNA上的eCLIP峰的分布。作者发现这些转录本中的大多数YTHDF1结合位点(包括EIF3C)都与m6A位点非常吻合。GO分析表明,结合YTHDF1的转录本与翻译调控最密切相关。EIF3C是真核转录起始因子EIF3的亚基之一,其翻译控制有助于肿瘤发生。此外,EIF3C与多种癌症(包括肝细胞癌,结肠癌和乳腺癌)的恶性行为相关。CLIP-qPCR还显示YTHDF1最显著富集EIF3C mRNA。这些数据表明EIF3C是YTHDF1在卵巢癌细......阅读全文
云序超微量MeRIP测序技术在m6A甲基化文章发表的应用2
3) m6A修饰与基因表达联合分析通过m6A-MeRIP-seq和RNA-seq联合分析,文章展示了m6A修饰水平与基因表达水平间的关系,统计发现表达高的基因分组中,受m6A修饰的基因比例也更高。4)甲基化相关酶的表达通过qPCR检测了两组样品中6个甲基化相关酶的表达,发现在高度近视白内障患者中甲基
中山大学团队研究发现诱发癌症发展新机制
中山大学肿瘤防治中心教授林东昕、研究员郑健团队研究发现,心理压力应激可通过激活交感神经系统释放去甲肾上腺素,作用于肿瘤细胞ADRB2受体,介导肿瘤RNA m6A去甲基化酶ALKBH5表达降低,引发肿瘤细胞表观转录组紊乱和微环境神经重塑的正反馈促癌环路。5月26日,相关成果发表于《自然-细胞生物学》(
全套病毒RNA-m6A甲基化修饰研究工具的使用(二)
那么,病毒RNA修饰的研究工作流程有哪些呢? 首先,提取病毒RNA 无论您是从细胞,组织还是病毒等样品开始实验,高效而快速的RNA提取通常都是成功进行实验的第一步。工作流程的这一部分至关重要,因为足够的纯度和产量都是确保下游应用程序平稳准确运行的基本要求。
Nature发表表观遗传学重要发现-决定性别的RNA甲基化
N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA和长非编码RNA上最普遍的一种RNA修饰,介导了超过80%的RNA碱基甲基化。人们已经陆续鉴定了m6A所需的“读”、“写”和“擦除”蛋白,但对其生物学功能还知之甚少。 伯明翰大学的科学家们在Nature杂志上发表文章,揭示了m6A
解析检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(上)
云序生物解析如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平(上) RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测
同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平
RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测序研究,首发推出了超微量RNA甲基化测序技术,首发推出RNA甲基化研究一站式系统性解决方案,云
揭示肠道细菌调控表观转录组修饰促进结直肠癌转移机制
结直肠癌是常见恶性肿瘤之一,是全世界发病人数第三、死亡人数第二的恶性肿瘤。结直肠癌在我国同样不容乐观。尽管结直肠癌的治疗手段不断发展,但晚期转移性结直肠癌患者的预后生存仍然不理想,我们需要对结直肠癌的转移机制有更深刻的认识。 近年来,随着宏基因组测序等研究手段的不断进展,人们发现肠道菌群能广泛
植物RNA修饰将成为新一代作物改良靶标
近日,上海交通大学生命科学技术学院副教授姜博晨课题组在《生物技术通报(英文)》(aBIOTECH)发表了综述论文。文章系统梳理了植物m6A调控的最新研究进展以及利用m6A修饰进行作物改良的潜在应用策略。 RNA表观修饰是指发生在RNA分子上的化学修饰,广泛存在于动物、植物、真菌等真核生物。N6
植物RNA修饰将成为新一代作物改良靶标
近日,上海交通大学生命科学技术学院副教授姜博晨课题组在《生物技术通报(英文)》(aBIOTECH)发表了综述论文。文章系统梳理了植物m6A调控的最新研究进展以及利用m6A修饰进行作物改良的潜在应用策略。RNA表观修饰是指发生在RNA分子上的化学修饰,广泛存在于动物、植物、真菌等真核生物。N6-甲基腺
带你解析肿瘤预后模型研究套路
研究背景 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)是全球人类第六大最常见的恶性肿瘤,超过50%的HNSCC确诊患者处于晚期。免疫系统的失衡在以免疫抑制性疾病为特征的HNSCC的发展中起着至关重要的作用。因此,应进一步探索肿瘤免疫微环境(TIME)的调节机制,以确定可精确预测预后及优化免疫疗法的有效生
我国学者在痕量样品m6A修饰定量检测方面取得进展
图 GLORI 2.0和3.0实现痕量样本全转录检测m6A修饰 在国家自然科学基金项目(批准号:22425071)等资助下,北京大学伊成器团队联合中科院遗传与发育生物研究所王秀杰团队,于2025年5月5日在《自然・方法》 (Nature Methods)期刊上发表了题为“Mild and ultr
揭示了m6A-RNA修饰的新的进化意义
无义介导的RNA降解(Nonsense-mediated decay, NMD)是真核生物一种重要的mRNA质量控制方式,细胞通过检验终止密码子与最后一个剪接接头的距离是否超过55nt来判断该终止密码子是否为提前终止密码子(Premature Termination Codon, PTC)从而决
一文了解甲基化研究领域新进展!
本文中,小编整理了多篇重要研究成果,共同解读科学家们在甲基化研究领域取得的新进展,分享给大家!图片来源:Vossman/ Wikipedia 【1】Nature:母体维生素C调节DNA甲基化重编程和生殖细胞产生 doi:10.1038/s41586-019-1536-1 发育通常被认为是在
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
Nature发表表观遗传学重要发现决定性别的RNA甲基化
N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA和长非编码RNA上最普遍的一种RNA修饰,介导了超过80%的RNA碱基甲基化。人们已经陆续鉴定了m6A所需的“读”、“写”和“擦除”蛋白,但对其生物学功能还知之甚少。伯明翰大学的科学家们在Nature杂志上发表文章,揭示了m6A在Sxl
陈建军/杨建华/何川/黄刚-揭示RNA-m6A由组蛋白修饰决定
近年来,RNA表观遗传学的研究发现RNA甲基化修饰,特别是m6A甲基化修饰,在哺乳动物的转录组中广泛存在,并且在多种生理和病理过程中发挥着重要的生物学功能,引领了RNA以及表观遗传学领域的又一个热潮。高通量测序揭示在人和小鼠的转录组中有1/3-1/2的mRNA转录本具有m6A修饰【1,2】。理论
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
我国研究院揭示m6A修饰对AtoI-类RNA编辑的调控作用
A-to-I类型的RNA编辑是一种基本的生物学现象,广泛存在于哺乳动物中,目前被认为是一种能够产生分子多样性的转录后修饰机制,通过重新编码来调节蛋白质翻译,大大丰富了遗传信息。A-to-I类型的RNA编辑不仅对基因表达调控具有重要影响,而且还与很多疾病的发生发展过程密切相关。m6A 修饰对 A-
m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RNA在
m6A修饰在头颈鳞癌免疫微环境调控中的作用机制
N6-甲基腺苷(m6A)修饰是RNA上丰度最高的修饰方式,属于转录后调控的重要机制,在各种生理和病理条件下发挥着关键作用,也给疾病治疗提供了崭新的靶点。然而,m6A在头颈鳞癌中的修饰状态以及作用模式尚不清楚。2022年4月,张志愿院士/何悦教授团队在肿瘤学权威期刊《分子癌症》(IF=41)在线发表题
premRNA中存在的修饰及其对剪接影响
2018年10月7日 讯 /生物谷BIOON/--日前,作为“诺贝尔奖风向标”的拉斯克奖——拉斯克·科什兰医学特殊成就奖颁给了Joan Argetsinger Steitz教授(致敬Joan Steitz!2018年拉斯克特别成就奖获得者),以表彰她在生物医学领域,尤其是RNA生物学领域中所发挥
何川教授eLife最新表观遗传学成果
7月2日,国际著名学术期刊《eLife》在线刊登了芝加哥大学何川教授(Chuan He)和俄亥俄州立大学Li Wu带领的一项研究成果,题为“N6-methyladenosine of HIV-1 RNA regulates viral infection and HIV-1 Gag protei
巨噬细胞M1极化助力银屑病发病机制获揭示
南方医科大学皮肤病医院教授荣知立/杨斌团队首次阐明RNA表观修饰通过“SLC15A3-TASL-IRF5”信号轴驱动巨噬细胞M1极化,参与银屑病发病的新机制。这一发现为炎症性皮肤病的治疗提供了全新的干预靶点。相关成果近日发表于《先进科学》(Advanced Science)。银屑病是一种常见的慢性复
人类组织中m6A修饰的动态变化和进化
文章导读 m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucle
人类组织中m6A修饰的动态变化和进化
文章导读 m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucle
Hepatology:m6A-RNA甲基化酶METTL3促肝癌发展新玄机
近年来,m6A RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,m6A RNA修饰的催化、去除以及识别的分子机理研究越来越清晰,而人们更关心的似乎是m6A RNA修饰与重大疾病例如肿瘤之间的相关性。表观遗传的改变极大得促进了人类癌症的发展,近期Hepat
RNA甲基化位点分析新方法
继上次QB期刊给大家推荐了WendyV. Gilbert教授的《关于pre-mRNA存在的修饰形式及其对剪接的影响》综述后,小编看到读者们的热情度特别高。借此机会,再给大家推荐一篇来自德克萨斯大学西南医学中心,QBRC、BICF中心主任谢阳教授实验室在QB期刊上发表的最新关于分析MeRIP-Se
低氧适应新基因在实体瘤中有重要潜在功能
从中科院昆明动物研究所获悉,该所研究人员新近揭示了在低氧适应和非小细胞肺癌发生发展中,一种扩增出的蛋白的重要功能和分子调控机理。国际权威期刊《自然·通讯》期刊在线发表了这一最新研究成果。 昆明动物研究所从事肿瘤信号转导研究的陈勇彬学科组,与从事灵长类进化遗传与发育研究的吴东东学科组合作,利用进
低氧适应新基因在实体瘤中有重要潜在功能
从中科院昆明动物研究所获悉,该所研究人员新近揭示了在低氧适应和非小细胞肺癌发生发展中,一种扩增出的蛋白的重要功能和分子调控机理。国际权威期刊《自然·通讯》期刊在线发表了这一最新研究成果。 昆明动物研究所从事肿瘤信号转导研究的陈勇彬学科组,与从事灵长类进化遗传与发育研究的吴东东学科组合作,利用进
低氧适应新基因在实体瘤中有重要潜在功能
记者11月3日从中科院昆明动物研究所获悉,该所研究人员新近揭示了在低氧适应和非小细胞肺癌发生发展中,一种扩增出的蛋白的重要功能和分子调控机理。国际权威期刊《自然·通讯》期刊在线发表了这一最新研究成果。 昆明动物研究所从事肿瘤信号转导研究的陈勇彬学科组,与从事灵长类进化遗传与发育研究的吴东东学