肿瘤免疫火得飞起,更新后的TIMER2.0数据库真心好用!

肿瘤微环境中免疫细胞的组成和丰度是影响肿瘤进展和免疫治疗效果的重要因素。由于直接测量方法的局限性,计算算法通常用于从肿瘤转录组图谱推断免疫细胞组成。这些估计的肿瘤免疫浸润人群与肿瘤的基因组和转录组学变化相关,提供了对肿瘤免疫相互作用的见解。今天我们就一起来看这个肿瘤免疫分析的又一神器——TIMER 2.0数据库。 TIMER 2.0数据库(http://timer.comp-genomics.org/)的开发者来自哈佛大学和四川大学,数据库相关文章(PMID: 32442275)于2020年7月发表在Nucleic Acids Research杂志(2019IF=11.501)上。截至2021-04-15该数据库相关文章已引用74次(数据来源:PubMed)。 开发者在之前版本的基础上进行了改进,TIMER 2.0使用六种最先进的算法,为癌症基因组图谱(TCGA)或用户提供的肿瘤概况提供更可靠的免疫浸润水平估计。TIME......阅读全文

肿瘤免疫火得飞起,更新后的TIMER-2.0数据库真心好用!

  肿瘤微环境中免疫细胞的组成和丰度是影响肿瘤进展和免疫治疗效果的重要因素。由于直接测量方法的局限性,计算算法通常用于从肿瘤转录组图谱推断免疫细胞组成。这些估计的肿瘤免疫浸润人群与肿瘤的基因组和转录组学变化相关,提供了对肿瘤免疫相互作用的见解。今天我们就一起来看这个肿瘤免疫分析的又一神器——TIME

肿瘤的免疫学检测

      肿瘤的免疫学检测的主要目的是对肿瘤进行免疫学诊断和评估宿主的免疫功能状态。  一、肿瘤的免疫学诊断  (一)检测肿瘤抗原  这是目前最常用的肿瘤免疫学诊断法,如AFP的检测对原发性肝细胞性肝癌有诊断价值,CFA的检测有助于诊断直肠癌、胰腺癌等。但对于人类肿瘤特异性抗原的检测进展不大。  

肿瘤免疫学令医药界狂热

  免疫肿瘤学(IO)高达210亿英镑的潜在市场给大小制药公司带来了希望。  一些人竟然大胆地将它称为治愈癌症的有效方法。而保守人士则提到这种治疗方法在显著延长患者生存期方面出现早期迹象。不过,无论你问谁,IO无疑是抗癌领域多年来最激动人心的开发成果。  前所未有的数据  在这个曾经是癌症研究的边缘

中国完成首个人类肿瘤放疗增敏数据库

  近日中科院合肥物质科学研究院技术生物与农业工程研究所研究员赵国平课题组、吴李君课题组与安徽大学夏俊峰教授合作,在前期工作基础上开发建立了人类肿瘤放疗增敏数据库dbCRSR。该成果是国际上首个关于人类肿瘤放疗相关基因的多组学整合数据库。研究成果发表在《数据库:生物数据库与管理》。图片来源于网络  

免疫学实验免肿瘤坏死因子α介绍

肿瘤坏死因子α介绍:  肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)可分为TNF α和TNFβ两种,前者来自单核巨噬细胞,后者由活化T细胞产生,是具有重要生物活性的细胞因子。存在于细胞上的TNF 受体主要有两种:TNFRⅠ和TNFRⅡ,血清中存在的是可溶性的TNFR(s TNF

福建医大陈列平获国际肿瘤免疫学界顶级大奖

  由于在发现免疫耐受型癌症的发病机理方面作出的杰出贡献,近日,福建医科大学免疫治疗研究所所长陈列平教授与其他三位科学家一起,共同分享了今年肿瘤免疫学界顶级大奖——威廉·科利奖(William B. Coley Award)。  陈列平为福建医科大学校友,同时也是美国耶鲁大学肿瘤免疫学部主任、教授。

免疫学实验肿瘤特异性生长因子介绍

肿瘤特异性生长因子介绍:  肿瘤特异性生长因子(lumor specific growth factor, TSGF)是恶性肿瘤形成和生长过程中,促使肿瘤及周边毛细血管大量增殖并释放到外周血液中的因子,是恶性肿瘤及周边毛细血管大量扩增的结果。肿瘤特异性生长因子正常值:  正常值是0-64U/ml肿瘤

300多种肿瘤-晚期癌症患者测序突变数据库发表的启示

  5月8日,Nature Medicine杂志发表一篇重量级文章,纪念斯隆-凯特琳癌症研究中心(MSKCC) 的科学家采用MSK-IMPACT方法,开展了一个大规模、前瞻性的临床测序研究。他们对上万名晚期癌症患者,接近300多种肿瘤进行了基因测序,同时收集了这些肿瘤病人的临床注释、病理等方面的信息

《自然—免疫学》:老药为肿瘤免疫治疗“提质增效”

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516557.shtm

中科院物质院完成首个人类肿瘤放疗增敏数据库

记者从中科院合肥物质科学研究院了解到,技术生物与农业工程研究所研究员赵国平课题组、吴李君课题组与安徽大学夏俊峰教授合作,在前期工作基础上开发建立了人类肿瘤放疗增敏数据库dbCRSR。该成果是国际上首个关于人类肿瘤放疗相关基因的多组学整合数据库。研究成果发表在《数据库:生物数据库与管理》。 放射治

贝瑞和康建成全球最大妇科肿瘤基因组数据库

  基因组大数据的重大意义开始凸显,贝瑞和康与阿里云合作开展的“神州基因组数据云”项目取得的阶段性成果,便已经收效显著。  9月23日,在第十九届全国临床肿瘤学大会暨CSCO学术年会上,北京贝瑞和康生物技术股份有限公司(以下简称“贝瑞和康”)公布了在生物信息分析领域和大数据建设方面做出的重要成果。 

《自然免疫学》:老药为肿瘤免疫治疗“提质增效”

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516553.shtm

《自然免疫学》:老药为肿瘤免疫治疗“提质增效”

  1月23日,《自然免疫学》杂志在线发表中国医学科学院基础医学研究所、华中科技大学基础医学院黄波教授团队一项最新研究论文。该研究找到了肿瘤免疫治疗杀器―碳酸锂,其能引导肿瘤部位的乳酸进入T细胞后,被快速转运至线粒体进行燃烧,进而给进入肿瘤组织的T细胞供能,全能复活CD8+T细胞对肿瘤细胞的杀伤,为

免疫学词汇免疫学检测

免疫学检测是机体识别“自身”与“非己”抗原,对自身抗体形成天然免疫耐受,对“非己”抗原产生排斥作用的一种生理功能的检测。正常情况下,这种生理功能对机体有益,可产生抗感染、抗肿瘤等维持机体生理平衡和稳定的免疫保护作用。在一定条件下,当免疫功能失调时,也会对机体产生有害的反应和结果,如引发超敏反应、自身

免疫学实验免疫学检测介绍

免疫学检测介绍:  免疫学检测是机体识别“自身”与“非己”抗原,对自身抗体形成天然免疫耐受,对“非己”抗原产生排斥作用的一种生理功能的检测。正常情况下,这种生理功能对机体有益,可产生抗感染、抗肿瘤等维持机体生理平衡和稳定的免疫保护作用。在一定条件下,当免疫功能失调时,也会对机体产生有害的反应和结果,

浆膜腔穿刺液免疫学检查应用于肿瘤标志物检查

肿瘤标志物 (1)癌胚抗原(CEA):CEA是一种分子量较大的糖蛋白,当积液中CEA>20μg/L,积液CEA/血清CEA比值>1时,应高度怀疑为癌性积液。有时强调胸水CEA/血清CEA比值>4.3是恶性病变的一个指标。(2)甲胎蛋白(AFP):血清AFP作为原发性肝癌的村志物现已肯定。同样腹水中A

期刊数据库更新

图片来源:B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评,认为其扭曲了学术出版。近日,美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告(JCR)数据库的更新版本,并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数,除以其两年间发表

期刊数据库更新

图片来源:B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评,认为其扭曲了学术出版。近日,美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告(JCR)数据库的更新版本,并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数,除以其两年间发表的文章数量,

中国本土科学家首获肿瘤免疫学界顶级大奖——威廉·科利奖

  2022年9月27日,美国纽约癌症研究所(Cancer Research Institute)将2022年度威廉·科利奖(William B. Coley Award)授予北京生命科学研究所邵峰院士(炎明生物联合创始人),哈佛医学院Judy Lieberman和Hao Wu,基因泰克Vishva

免疫学基础

  第一章 抗原  抗原(antigen,Ag)是指能刺激机体免疫系统诱导免疫应答并能与应答产生如抗体或致敏淋巴细胞发生特异反应的物质。一个完整的抗原应包括两方面的免疫性能:①免疫原性(immunogenicity)指诱导宿主产生免疫应答的能力,具有这种能力的物质称为免疫原(immunogen);②

核酸数据库的概念

中文名称核酸数据库英文名称nucleic acid data bank定  义DNA、RNA序列的资料库,主要包括已知序列名称、DNA或RNA全序列及其特性,如启动区、起始和终止密码的位置、编码区、限制酶切位点以及推导的翻译产物蛋白质序列等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级

GenBank数据库概述(一)

1. GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织,包括EMBL和DDBJ。是NIH遗传序列数据库,一个所有可以公开获得的DNA序列的注释过的收集。GenBank同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。唯一人类基因序列集合(UniGene),人类基因组基因图

GenBank数据库概述(四)

NCBI站点地图---其他基因组数据介绍:1、 小鼠基因组 1) 小鼠基因组资源向导 :把从各个中心来的各种小鼠相关的资源整合在一起,包括序列,图谱,和克隆信息以及指向小鼠种系和突变资源的指针。 2) 小鼠基因组测序:小鼠基因组计划的测序进展,HTG序列contigs(可以用大小和染色体号来浏览)由

GenBank数据库概述(三)

结构: 1、 结构主页 — 关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划,另外也可以访问分子模型数据库(MMDB)和用来搜索和显示结构的相关工具。 2、 MMDB:分子模型数据库 — 一个关于三维生物分子结构的数据库,结构来自于X-ray晶体衍射和NMR色谱分析。MMDB是来源于Brook

GenBank数据库概述(二)

FTP GenBank and Daily Updates:1. GenBank普通文件格式 — 参见GenBank记录样本和在GenBank公布通知中的详细描述,下载大多数最近的完全公告和日常积累或非积累更新数据。 2. ASN.1格式 — 摘要句法记号1,国际标准组织(ISO)数据表示格式,下载

免疫学词汇免疫学检测的临床意义

异常结果:在临床上常表现为各种免疫疾病:免疫缺陷病,自身免疫疾病,细菌入侵,病毒感染和肿瘤等。需要检查的人群:有免疫缺陷和免疫力低下的人群。

其它免疫学检测

其它免疫学检测是临床医学检验技士/技师/主管技师考试复习需要了解的检验基础知识,医学|教育网搜集整理了相关内容与考生分享,希望给予大家帮助! (一)淋巴细胞检测 虽然自身免疫病多与自身抗体有关,但仍有部分疾病不存在相关的自身抗体,而与致敏淋巴细胞有关,还可能与免疫调节异常或其他因素有关。这些相关

免疫学实验比较

免疫学三大工具,免疫组化、Western、ELISA,分别用于定位,定性和定量。 IHC(免疫组化Immunohistochemistry)是融合了免疫学原理(抗原抗体特异性结合)和组织学技术(组织的取材、固定、包埋、切片、脱蜡、水化等),通过化学反应使标记抗体的显色剂 (荧光素、酶、金属离子、

什么是免疫学

免疫学是研究生物体对抗原物质免疫应答性及其方法的生物-医学科学.免疫学的发展经历了四个时期即经验免疫学时期、经典免疫学时期、近代免疫学时期和现代免疫学时期.免疫学作为一门自然科学,只有100年左右的历史,最早只是细菌学的一部分,随后又作为微生物学的一部分来看待.它是以研究抗微生物感染而发展起来的一门

免疫学的定义

是机体识别“自身”与“非己”抗原,对自身抗原形成天然免疫耐受,对“非己”抗原产生排斥作用的一种生理功能。正常情况下,这种生理功能对机体有益,可产生抗感染、抗肿瘤等维持机体生理平衡和稳定的免疫保护作用。在一定条件下,当免疫功能失调时,也会对机体产生有害的反应和结果,如引发超敏反应、自身免疫病和肿瘤等。