中国完成首个人类肿瘤放疗增敏数据库
近日中科院合肥物质科学研究院技术生物与农业工程研究所研究员赵国平课题组、吴李君课题组与安徽大学夏俊峰教授合作,在前期工作基础上开发建立了人类肿瘤放疗增敏数据库dbCRSR。该成果是国际上首个关于人类肿瘤放疗相关基因的多组学整合数据库。研究成果发表在《数据库:生物数据库与管理》。图片来源于网络 放射治疗是治疗恶性肿瘤的重要手段之一。在分子生物学指导下提高肿瘤对射线的敏感性以及改善放射抗拒肿瘤的放射效果是放疗发展新趋势,放疗正从“物理精确”走向“生物精准”。 研究人员表示,调控放疗增敏可提高临床放疗的“生物精准”。dbCRSR目前已收录了多种类型具有调控放疗增敏作用的调控因子,包含395个编码基因、119个非编码RNA以及306个化合物。用户可根据需求,通过数据库获取影响特定癌症放疗敏感的基因、药物、调控方式,以及具有潜在放疗增敏调控作用的药物和miRNAs等多种注释信息。 此外,用户还可对数据库中的信息进行深度挖掘,如结......阅读全文
中科院物质院完成首个人类肿瘤放疗增敏数据库
记者从中科院合肥物质科学研究院了解到,技术生物与农业工程研究所研究员赵国平课题组、吴李君课题组与安徽大学夏俊峰教授合作,在前期工作基础上开发建立了人类肿瘤放疗增敏数据库dbCRSR。该成果是国际上首个关于人类肿瘤放疗相关基因的多组学整合数据库。研究成果发表在《数据库:生物数据库与管理》。 放射治
中国完成首个人类肿瘤放疗增敏数据库
近日中科院合肥物质科学研究院技术生物与农业工程研究所研究员赵国平课题组、吴李君课题组与安徽大学夏俊峰教授合作,在前期工作基础上开发建立了人类肿瘤放疗增敏数据库dbCRSR。该成果是国际上首个关于人类肿瘤放疗相关基因的多组学整合数据库。研究成果发表在《数据库:生物数据库与管理》。图片来源于网络
300多种肿瘤-晚期癌症患者测序突变数据库发表的启示
5月8日,Nature Medicine杂志发表一篇重量级文章,纪念斯隆-凯特琳癌症研究中心(MSKCC) 的科学家采用MSK-IMPACT方法,开展了一个大规模、前瞻性的临床测序研究。他们对上万名晚期癌症患者,接近300多种肿瘤进行了基因测序,同时收集了这些肿瘤病人的临床注释、病理等方面的信息
肿瘤免疫火得飞起,更新后的TIMER-2.0数据库真心好用!
肿瘤微环境中免疫细胞的组成和丰度是影响肿瘤进展和免疫治疗效果的重要因素。由于直接测量方法的局限性,计算算法通常用于从肿瘤转录组图谱推断免疫细胞组成。这些估计的肿瘤免疫浸润人群与肿瘤的基因组和转录组学变化相关,提供了对肿瘤免疫相互作用的见解。今天我们就一起来看这个肿瘤免疫分析的又一神器——TIME
贝瑞和康建成全球最大妇科肿瘤基因组数据库
基因组大数据的重大意义开始凸显,贝瑞和康与阿里云合作开展的“神州基因组数据云”项目取得的阶段性成果,便已经收效显著。 9月23日,在第十九届全国临床肿瘤学大会暨CSCO学术年会上,北京贝瑞和康生物技术股份有限公司(以下简称“贝瑞和康”)公布了在生物信息分析领域和大数据建设方面做出的重要成果。
期刊数据库更新
图片来源:B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评,认为其扭曲了学术出版。近日,美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告(JCR)数据库的更新版本,并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数,除以其两年间发表的文章数量,
期刊数据库更新
图片来源:B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评,认为其扭曲了学术出版。近日,美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告(JCR)数据库的更新版本,并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数,除以其两年间发表
核酸数据库的概念
中文名称核酸数据库英文名称nucleic acid data bank定 义DNA、RNA序列的资料库,主要包括已知序列名称、DNA或RNA全序列及其特性,如启动区、起始和终止密码的位置、编码区、限制酶切位点以及推导的翻译产物蛋白质序列等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级
GenBank数据库概述(一)
1. GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织,包括EMBL和DDBJ。是NIH遗传序列数据库,一个所有可以公开获得的DNA序列的注释过的收集。GenBank同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。唯一人类基因序列集合(UniGene),人类基因组基因图
GenBank数据库概述(三)
结构: 1、 结构主页 — 关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划,另外也可以访问分子模型数据库(MMDB)和用来搜索和显示结构的相关工具。 2、 MMDB:分子模型数据库 — 一个关于三维生物分子结构的数据库,结构来自于X-ray晶体衍射和NMR色谱分析。MMDB是来源于Brook
GenBank数据库概述(二)
FTP GenBank and Daily Updates:1. GenBank普通文件格式 — 参见GenBank记录样本和在GenBank公布通知中的详细描述,下载大多数最近的完全公告和日常积累或非积累更新数据。 2. ASN.1格式 — 摘要句法记号1,国际标准组织(ISO)数据表示格式,下载
GenBank数据库概述(四)
NCBI站点地图---其他基因组数据介绍:1、 小鼠基因组 1) 小鼠基因组资源向导 :把从各个中心来的各种小鼠相关的资源整合在一起,包括序列,图谱,和克隆信息以及指向小鼠种系和突变资源的指针。 2) 小鼠基因组测序:小鼠基因组计划的测序进展,HTG序列contigs(可以用大小和染色体号来浏览)由
QP2010农药数据库
Shimadzu气质联用的多种农药库 QP2010农药数据库
生命科学常用数据库
The NationalCenter for Biotechnology Information. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/National Center for GenomeResources.http://www.ncgr.org/ncgr/ncgr.html T
全球危险病毒数据库上线
一个供研究人员共享危险病毒基因组的新数据库,有望解决许多阻碍现有方法的问题。但前提是,必须说服研究人员使用它。据《自然》报道,这一名为Pathoplexus的数据库于上个月启动,数据库背后的科学家团队希望有更多研究人员分享已知和新出现的对公共卫生具有重要意义的基因序列。澳大利亚悉尼大学病毒学家Edw
汉语语言产生数据库发表
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517976.shtm
美国更新食品掺假数据库
9月5日食品安全新闻网消息,美国药典委员会(USP)更新了食品掺假数据库(FFD2.0)。食品掺假数据库主要为行业、监管部门以及消费者预防和应对食品掺假事件发生提供技术支持。最新的FFD2.0涵盖了科研文献、媒体信息、食品监管记录、司法裁决记录中涉及食品掺假事件的各种信息。新版食品掺假数据库将于
拉曼光谱免费数据库
拉曼数据库在物质鉴定和化学分析方面具有重要的作用。关于拉曼数据,我们一般会关注两个峰的位置,分别是D峰和G峰。D峰和G-峰均是C原子晶体的 Raman特征峰,分别在1350cm-1和 1580 cm-1附近,D峰反应的是晶格的碳缺陷,G峰反应的是材料的碳化程度。I(D) / I(G) 是 D峰和G峰
北京正在建罕见病数据库
今日,2014第三届中国罕见病高峰论坛在京举办。北京医学会罕见病分会副主任王琳在论坛中透露,北京正在建立罕见病病例登记系统和病人数据库,尝试单病种追踪调研和罕见病诊治地图的设置。 王琳介绍,中国目前所应用的罕见病相关数据都是基于欧盟、美国等地所提供的资料。“而国内到现在也没有对本国进行过罕见病
英国启动细胞产品试验数据库
英国细胞治疗产品行业现在拥有了一个数据库,该数据库囊括了该国所有正在进行之中的临床试验项目。建立这个数据库的目的是要扩大研究合作,将更多的早期试验推进到后期开发阶段。 囊括21个研究项目 这个数据库包括21个细胞治疗研究项目,由英国细胞疗法中心(CTC)发起,并得到了英国技术战略委员
“敦煌遗书数据库”建成投用
3月10日,在十四届全国人大二次会议甘肃代表团开放团组活动上,敦煌研究院党委委员、保护研究部副部长汪万福代表介绍,该院“流失海外敦煌文物数字化复原项目”迈出实质步伐,“敦煌遗书数据库”业已建成投用。 汪万福说,敦煌研究院还组建了甘肃省敦煌文物保护研究中心,建成国内首座文物保护领域多场耦合实验室
国内首个向量数据库标准发布
11月15日,中国信通院联合腾讯云计算(北京)有限责任公司、中移(苏州)软件技术有限公司等多家企业共同编制的、国内首个向量数据库标准正式发布,将为我国向量数据库研发、测试及选型提供重要参考,推动我国人工智能产业高质量发展。 向量数据能够从多个维度记录事物特征,是人工智能时代的基础数据形式。人工
盐湖资源环境信息数据库建成
日前,中国科学院青海盐湖研究所在科技部基础专项、中科院“百人计划”等项目的支持下,立足柴达木盆地盐湖资源优势,历时6年建成的盐湖资源与环境科学基础数据共享数据库正式通过科技部验收。这标志着目前我国数据量最大的盐湖资源与环境科学基础数据共享系统正式建成,并对基于科学数据的盐湖资源合理利用、长远决策
生命科学国外重要数据库
EMBL数据库结构EMBL数据库的基本单位也是序列条目,包括核甘酸碱基排列顺序和注释两部分。序列条目由字段组成,每个字段由标识字起始,后面为该字段的具体说明。有些字段又分若干次子字段,以次标识字或特性表说明符开始,最后以双斜杠“//”作本序列条目结束标记。条目的关键字包括ID(序列名称),DE(序列
siRNA数据库与设计工具
siRNA DatabaseSearchable database of Silencer ™ Validated and Pre-designed siRNAs to >34,000 human, mouse, and rat targets. All siRNAs in the database
植物生物学研究数据库
实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant
美国CDC将建炭疽杆菌公共数据库
日前,美国疾病预防控制中心(CDC)表示,将在亚特兰大建立一个有关炭疽杆菌的公共数据库。CDC称,已经在寻找可以建立这一公共数据库的承包商。 这一举动源于6月份在亚特兰大实验室发生的炭疽杆菌事件。由于实验室部分研究人员,在让炭疽杆菌失去活性时未遵守适当程序,便将可能含有活菌样本转移到安
英特尔将建帕金森患者数据库
帕金森症的患者通常都会被要求尽可能细致地做好自己的病情记录,以便于医生判断病情的进展。但不少患者都抱怨,我虽然正视自己的病情,但帕金森病并不是我生活的全部啊,按医生要求那样的忠实完整记录自己的病情?说起来容易做起来难! 好消息是,现在的病情监测可以很容易了。拜可穿戴技术所赐,帕金森病患者运
天津建成食品污染物数据库
日前从天津市卫生计生委、市卫生监督所获悉,为了扩大食品污染物及有害因素监测覆盖面,实现对食源性疾病的主动监测,该市食品安全风险监测区域已覆盖全市16个区县,食源性疾病监测哨点医院已由18家增加到33家,并已形成了市食品污染物数据库。 根据目前在食品安全领域担负的职责,该市卫生计生部门规划建立了
Nature:癌症数据库ClinVar打破Myriad垄断
去年,美国最高法院判定Myriad Genetics持有的BRCA1和BRCA2 DNA序列测试ZL无效,美国最高法院判定也意味着未来美国国内的癌症检查价格将变得更加便宜、普遍。 BRCA1基因的发现和致病相关性是Mary-Claire King博士在1990年发现,尽管当时她的研