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中国完成首个人类肿瘤放疗增敏数据库

近日中科院合肥物质科学研究院技术生物与农业工程研究所研究员赵国平课题组、吴李君课题组与安徽大学夏俊峰教授合作,在前期工作基础上开发建立了人类肿瘤放疗增敏数据库dbCRSR。该成果是国际上首个关于人类肿瘤放疗相关基因的多组学整合数据库。研究成果发表在《数据库:生物数据库与管理》。图片来源于网络 放射治疗是治疗恶性肿瘤的重要手段之一。在分子生物学指导下提高肿瘤对射线的敏感性以及改善放射抗拒肿瘤的放射效果是放疗发展新趋势,放疗正从“物理精确”走向“生物精准”。 研究人员表示,调控放疗增敏可提高临床放疗的“生物精准”。dbCRSR目前已收录了多种类型具有调控放疗增敏作用的调控因子,包含395个编码基因、119个非编码RNA以及306个化合物。用户可根据需求,通过数据库获取影响特定癌症放疗敏感的基因、药物、调控方式,以及具有潜在放疗增敏调控作用的药物和miRNAs等多种注释信息。 此外,用户还可对数据库中的信息进行深度挖掘,如结......阅读全文

中科院物质院完成首个人类肿瘤放疗增敏数据库

记者从中科院合肥物质科学研究院了解到,技术生物与农业工程研究所研究员赵国平课题组、吴李君课题组与安徽大学夏俊峰教授合作,在前期工作基础上开发建立了人类肿瘤放疗增敏数据库dbCRSR。该成果是国际上首个关于人类肿瘤放疗相关基因的多组学整合数据库。研究成果发表在《数据库:生物数据库与管理》。 放射治

中国完成首个人类肿瘤放疗增敏数据库

  近日中科院合肥物质科学研究院技术生物与农业工程研究所研究员赵国平课题组、吴李君课题组与安徽大学夏俊峰教授合作,在前期工作基础上开发建立了人类肿瘤放疗增敏数据库dbCRSR。该成果是国际上首个关于人类肿瘤放疗相关基因的多组学整合数据库。研究成果发表在《数据库:生物数据库与管理》。图片来源于网络  

肿瘤免疫火得飞起,更新后的TIMER 2.0数据库真心好用!

  肿瘤微环境中免疫细胞的组成和丰度是影响肿瘤进展和免疫治疗效果的重要因素。由于直接测量方法的局限性,计算算法通常用于从肿瘤转录组图谱推断免疫细胞组成。这些估计的肿瘤免疫浸润人群与肿瘤的基因组和转录组学变化相关,提供了对肿瘤免疫相互作用的见解。今天我们就一起来看这个肿瘤免疫分析的又一神器——TIME

300多种肿瘤 晚期癌症患者测序突变数据库发表的启示

  5月8日,Nature Medicine杂志发表一篇重量级文章,纪念斯隆-凯特琳癌症研究中心(MSKCC) 的科学家采用MSK-IMPACT方法,开展了一个大规模、前瞻性的临床测序研究。他们对上万名晚期癌症患者,接近300多种肿瘤进行了基因测序,同时收集了这些肿瘤病人的临床注释、病理等方面的信息

贝瑞和康建成全球最大妇科肿瘤基因组数据库

  基因组大数据的重大意义开始凸显,贝瑞和康与阿里云合作开展的“神州基因组数据云”项目取得的阶段性成果,便已经收效显著。  9月23日,在第十九届全国临床肿瘤学大会暨CSCO学术年会上,北京贝瑞和康生物技术股份有限公司(以下简称“贝瑞和康”)公布了在生物信息分析领域和大数据建设方面做出的重要成果。 

期刊数据库更新

图片来源:B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评,认为其扭曲了学术出版。近日,美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告(JCR)数据库的更新版本,并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数,除以其两

期刊数据库更新

图片来源:B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评,认为其扭曲了学术出版。近日,美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告(JCR)数据库的更新版本,并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数,除以其两年间发表

核酸数据库的概念

中文名称核酸数据库英文名称nucleic acid data bank定  义DNA、RNA序列的资料库,主要包括已知序列名称、DNA或RNA全序列及其特性,如启动区、起始和终止密码的位置、编码区、限制酶切位点以及推导的翻译产物蛋白质序列等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级

GenBank数据库概述(三)

结构: 1、 结构主页 — 关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划,另外也可以访问分子模型数据库(MMDB)和用来搜索和显示结构的相关工具。 2、 MMDB:分子模型数据库 — 一个关于三维生物分子结构的数据库,结构来自于X-ray晶体衍射和NMR色谱分析。MMDB是来源于Brook

GenBank数据库概述(二)

FTP GenBank and Daily Updates:1. GenBank普通文件格式 — 参见GenBank记录样本和在GenBank公布通知中的详细描述,下载大多数最近的完全公告和日常积累或非积累更新数据。 2. ASN.1格式 — 摘要句法记号1,国际标准组织(ISO)数据表示格式,下载