杨朝勇综述:肠道共生菌群和致病菌化学/生物学成像

肠道菌群作为一个新发现的“器官”,在影响宿主的生理病理活动中起着广泛而重要的作用。自本世纪初以来,肠道菌群的研究呈爆发式增长,但整个领域的研究过于依赖于DNA测序手段。成像技术因其独特的内在优势,在肠道菌群研究中具有重要的应用价值。利用成像技术,可观察肠道共生菌/致病菌在体原位的空间分布,也能够可视化研究细菌的微生物生长代谢活动以及细菌-宿主的免疫相互作用。然而,由于目前许多肠道细菌仍无法体外单独培养,极大限制了遗传操作工具在肠道菌群研究中的应用。近年来,国内外多个研究团队致力于开发适用于肠道细菌的化学/生物学成像工具,来破译这些高度复杂的肠道“暗物质”。近年来,上海交通大学医学院杨朝勇/王炜团队在肠道菌群研究新兴领域,取得系列的重要进展:(1)开发了基于抗生素的荧光探针,实现对复杂微生物群落中的革兰氏阴性/阳性菌的选择性荧光标记,并表现出临床应用的潜力;(2)利用荧光D型氨基酸(FDAA)代谢标记探针,建立了首个可用于研究粪菌......阅读全文

杨朝勇综述:肠道共生菌群和致病菌化学/生物学成像

肠道菌群作为一个新发现的“器官”,在影响宿主的生理病理活动中起着广泛而重要的作用。自本世纪初以来,肠道菌群的研究呈爆发式增长,但整个领域的研究过于依赖于DNA测序手段。成像技术因其独特的内在优势,在肠道菌群研究中具有重要的应用价值。利用成像技术,可观察肠道共生菌/致病菌在体原位的空间分布,也能够可视

化学发光荧光成像系统

  化学发光荧光成像系统是一种用于生物学、基础医学、临床医学、药学领域的分析仪器,于2017年6月27日启用。  技术指标  1.检测模式:荧光成像、数字化和化学发光成像; 2.激光波长:LD488、SHG532、LD635; 3.成像面积:40×46cm; 4.像素:10、25、50、100、20

从肠道菌群到肠道病毒群

  肠道菌群早以已经成为热点科技新闻概念,其核心要点是肠道内细菌是维持健康的重要因素。其实肠道菌群自己身体内也有另外一种生命,就是细菌病毒,又称为噬菌体。最近有研究发现,肠道内细菌感染的噬菌体对人体健康也具有重要价值,这些病毒无法裸露生活,都必须隐藏在细菌体内寄生。这里形成一个非常有趣的现象,人的肠

植物荧光成像仪——荧光成像简介

  荧光是自然界常见的一种发光现象。荧光是光子与分子的相互作用产生的,这种相互过程可以通过雅布隆斯基(Jablonslc)分子能级图描述:大多数分子在常态下,是处于基态的最低振动能级So,当受到能量(光能、电能、化学能等等)激发后,原子核周围的电子从基态能级So跃迁到能量较高的激发态(第一或第二激发

植物荧光成像仪——荧光成像原理

  荧光是自然界常见的一种发光现象。荧光是光子与分子的相互作用产生的,这种相互过程可以通过雅布隆斯基(Jablonslc)分子能级图描述:大多数分子在常态下,是处于基态的最低振动能级So,当受到能量(光能、电能、化学能等等)激发后,原子核周围的电子从基态能级So跃迁到能量较高的激发态(第一或第二激发

荧光成像与高光成像区别

荧光成像与高光成像区别如下:1、原理:荧光成像是利用荧光标记的分子在激发后发出特定波长的光来成像,而高光成像是基于样本的反射或透射光强度的差异来成像。2、样本处理:荧光成像需要在样本中引入荧光标记物,通常是通过染色或基因工程技术来实现,而高光成像则不需要对样本进行特殊处理,直接观察样本的自然反射或透

荧光成像系统

对完全校准好的荧光成像系统,当用不同的滤色镜组时,样品上一个点在检测器上精确成像为一个点,也就是像素对像素。然而,不同颜色的通道 merge 时,物镜的色差校正不够、滤镜光路没有完全对准都会使得荧光信号之间的记录有差错。对具有复杂图案的图像或明暗信号相混的图像,这个可能就检测不到。会得出这样的结论:

荧光成像系统

用荧光显微镜进行3D球状体荧光成像时,需要进行仪器设置优化和使用高级功能才能得到更好的成像结果。对球状体进行Z轴层扫时,需要选择合适的物镜并进行合适地聚焦才能拍出更清晰的图片。EVOS细胞成像系统和配套的CellesteTM成像分析软件可以完美地对球状体的大小、结构和蛋白表达水平进行定性和定量分析。

肠道菌群的基本介绍

  肠道菌群,人体肠道的正常微生物,如双歧杆菌,乳酸杆菌等能合成多种人体生长发育必须的维生素,如B族维生素(维生素B1、B2、B6、B12),维生素K,烟酸、泛酸等,还能利用蛋白质残渣合成必需氨基酸,如天门冬氨酸、苯丙氨酸、缬氨酸和苏氨酸等,并参与糖类和蛋白质的代谢,同时还能促进铁、镁、锌等矿物元素

肠道菌群“大有作为”

最近肠道菌群研究大热,肠道菌群并不安分在消化系统中,人们发现其在越来越多的领域发挥作用,今天,小鱼就跟大家盘点一下近期大牛杂志里关于肠道菌群的研究,看看肠道菌群都干了些啥?    1.Cell:小小肠道菌“调教”大大免疫细胞    最新一期Cell杂志,刊登了两篇文章,皆是讲述肠道细菌对免疫

肠道菌群随季节改变

  对现存为数不多的其中一个狩猎—采集者群体开展的研究表明,生活在人类肠道中的微生物随着季节发生变化。相关成果日前发表于《科学》杂志。  来自“人类食物工程”的Jeff Leach及其团队用一年多时间收集了生活在坦桑尼亚的350名哈扎人的粪便样本。“人类食物工程”是一个非营利性机构,旨在研究微生物组

肠道菌群的影响因素

  影响肠道菌群的主要因素有4个方面:人体自身的因素(肠道的酸碱性,胆汁及消化酶的分泌,肠道的蠕动,肠道黏液的分泌,肠道表皮的脱离等)以及人所处的环境因素(压力,出差等);人体摄入的饮食(可消化的食物与不可消化的纤维、药物等);细菌自身因素(细菌的黏附能力,繁殖能力,营养需求量,抗消化酶能力等);细

肠道菌群的分类介绍

  根据可培养细菌的数量分类在肠道菌群中,可以培养到的细菌有400余种,依据其数量多少可以分为主要(优势)菌群(predominant microflora)和次要菌群(sub—dominant microflora)。  ①主要(优势)菌群:指肠道菌群中数量大或种群密集度大的细菌,一般在10~10

肠道菌群诱发机体衰老

  多年以来,科学家们一直在研究栖息于人类机体肠道中的不同细菌群落是如何对机体功能产生显著影响的,包括机体免疫系统等;肠道菌群有时被称为“共生菌”,其存在于所有生活在一定功能平衡下的动物机体中,当这种平衡被打破后就会诱发宿主机体出现共生失调(commensal dysbiosis)的表现,比如疾病或

杨朝勇团队:外周血中循环肿瘤细胞分析检测的新方法

  探索发展肿瘤诊断、治疗的新技术、新方法已经成为我国亟待解决的关键科学问题之一。组织活检作为肿瘤诊断的金标准可为病例提供组织学结构判断,然而存在侵入性强、易产生并发症、采样偏差性大、取样难及滞后性等局限。而液体活检具有损伤小、代表全、易取样、快速等优点,可在肿瘤初期诊断、预测复发、监测治疗效果等方

有益肠道菌群如何有效适应宿主肠道

  有益菌菌群的生理功能:   如果肠内有益菌菌群占优,肠内黏膜呈现粉红色,表示肠内环境相当良好。   1、吸收水分,粪便较软,较易排泄   在胃部分解消化的食物,经由小肠吸收营养后,成为粘稠状物体送至大肠。然后再经过18小时将水分及矿物质吸收,就变成容易排泄的粪便。肠道内环境良好时,粪便的软

活体成像中荧光染料的选择与成像

Cy5.5(Ex/Em:678/701 nm)和Cy7(Ex/Em:749/776 nm)是对分子标记的最优选择之一;DiD(Ex/Em:644/663 nm)、DiR(Ex/Em:748/780)染料则常用于活体成像实验中对细胞进行标记。  一、Cy5.5 、Cy7 Cy5.5 、Cy7避开了可见

FluorCam多光谱荧光成像技术应用案例—多光谱荧光成像...

FluorCam多光谱荧光成像技术应用案例—多光谱荧光成像是什么1. 多光谱荧光的发现及特性二十世纪八九十年代,植物生理学家对植物活体荧光——主要是叶绿素荧光研究不断深入。激发叶绿素荧光主要是使用红光、蓝光或绿光等可见光。当科学家使用UV紫外光对植物叶片进行激发,发现植物产生了具备4个特征性波峰的荧

肠道菌群决定宿主吃什么

  数十年来,科学家已经知道人们吃什么会改变消化道内的微生物平衡。中午选择吃培根、生菜、番茄三明治还是酸奶果冻会增加肠道内特定的菌群数量并减少另外一些菌群。随着相对数量的变化,它们会分泌不同的物质,激活不同的基因并产生不同的影响。植物乳杆菌彩色扫描电子显微成像  这样的食物选择就像是一条双行道。肠道

-肠道菌群:法医破案新线索

通过肠道微生物侦查凶手,图片来自斯考特斯溪谷社区学院  在我们的肠道中,大约有10万亿个细菌——这是一件好事。这些菌群帮助我们的身体消化食物、支持免疫系统、保证胃肠道健康,同时它们也因此获得稳定的食物供应。  但是当人去世后,这些友好的肠道菌群迅速变成肠道敌人。没有了食物,这些微生物通过循环系统逃离

肠道菌群紊乱怎么办

问题一:如何治疗肠道菌群失调? 菌群失调症病因复杂,临床上伴有菌群失调症的疾病很多,一切机体内病理生理过程的变化,均不可避免的会影响到肠道正常菌群的变化,严重时会引起菌群失调症的发生。反之,菌群失调易导致肠道发生一系列病理生理改变,并互为因果。菌群失调症主要包括:质的失调、量的失调和定位转移。治疗原

肠道菌群数量可能被夸大

  肠道菌群和疾病的关系密切,已经受到医学领域的重视,但关于肠道菌群有一个最基本的数据可能是错误的,就是正常人体细菌的数量。许多论文都说人体细菌数量是人体细胞数量的10倍,但是以色列和加拿大的科学家提出,这一数字只是个传说,人体细菌数量并没有那么多。   加拿大多伦多儿童医院Shai Fuchs和

母亲基因影响孩子肠道菌群

  最近,加州大学(UC)戴维斯分校的研究人员发现一个基因——该基因在一些母亲当中是不活跃的,可产生母乳糖影响其婴儿肠道菌群的发展。产生的这种糖,被称为“secretors”不能被婴儿消化,而是滋养出生后不久婴儿肠道中定植的特定细菌。延伸阅读:基因和饮食哪个对肠道菌群影响更大?  称为“non-se

植物激素影响人类肠道菌群

  一碗沙拉里不仅含有维生素和矿物质,还有植物激素。近日,科学家发现人类肠道微生物和细胞可能会对这些植物激素产生反应,甚至产生相似的分子。在发表于《植物科学趋势》杂志的文章中,法国研究人员探讨了植物激素对人类健康的影响。  “我们知道肠道微生物群与人类疾病息息相关,这些生物可以合成植物激素影响人类,

肠道菌群的检测与筛选

最近,在Nature上有一篇题为“The gutmicrobiota is associated with immune cell dynamics in humans”的研究报告中,科学家们通过研究揭示了机体微生物菌群与免疫系统之间的关联,研究人员首次发现,血液中不同类型免疫细胞浓度的改变

概述肠道菌群的分布状况

  健康人的胃肠道内寄居着种类繁多的微生物,这些微生物称为肠道菌群。在人类胃肠道内的细菌可构成一个巨大而复杂的生态系统,一个人结肠内就有400个以上的菌种。 [3]  从口腔进入胃的细菌绝大多数被胃酸杀灭,剩下的主要是革兰氏阳性需氧菌。胃内细菌浓度

凝胶/化学发光成像系统凝胶成像种类

(1)普通凝胶成像分析系统:可以对蛋白电泳凝胶,DNA凝胶样品进行图象采集并进行定性和定量分析,样品包括:EB、SYBR Green、SYBR Gold、Texas Red、GelStar、Fluoroscecin、 Radiant Red等染色的核酸监测;以及Coomassie Blue、SYPR

美国-PHOTOMETRICS-活体化学发光和荧光成像系统

  美国 PHOTOMETRICS 活体化学发光和荧光成像系统   随着分子生物学、分子诊断学、基因治疗等学科的发展,“综合形态分析”的概念和应用被逐渐突显出来。研究人员迫切希望,能有一种研究方法和工具,使得他们能够直接捕捉整体动物、植物或微生物的形态变化:对动物、植物或微生物的目的细胞、目的组

美国-PHOTOMETRICS-活体化学发光和荧光成像系统

  美国 PHOTOMETRICS 活体化学发光和荧光成像系统   随着分子生物学、分子诊断学、基因治疗等学科的发展,“综合形态分析”的概念和应用被逐渐突显出来。研究人员迫切希望,能有一种研究方法和工具,使得他们能够直接捕捉整体动物、植物或微生物的形态变化:对动物、植物或微生物的目的细胞、目的组织

AI助力,“捞出”肠道菌群中耐药菌“杀手”

  在人体的“宇宙”中,居住着数百万种微生物。它们相生相克、相互制衡,维持着人体健康的微生态平衡。  很多常见耐药菌,如金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、大肠杆菌等都是人体共生的“原住民”。而人体中同样存在着克制它们的微生物及其代谢产物。找到这些耐药菌的“克星”作为药物是当前生命科学领域的前沿问题。  如