多样化CtoT植物碱基编辑器被开发

近日,电子科技大学张勇教授、马里兰大学YiPing Qi博士、扬州大学张韬教授课题组合作于《Plant Biotechnology Journal》发表了题名《Improved plant cytosine base editors with high editing activity, purity, and specificity》的研究论文。该研究针对7种胞嘧啶脱氨酶、4种不同的碱基编辑策略构建了21个不同的碱基编辑系统,对这21种胞嘧啶碱基编辑系统的编辑效率、编辑范围、编辑纯度及特异性等编辑特性进行了细致比较,并将胞嘧啶碱基编辑器应用于miRNA调控相关基因、籽粒相关基因、除草剂抗性基因编辑,为碱基编辑器在植物功能基因组研究及分子育种实践中的有效应用提供了多样化分子工具及应用实例。 碱基编辑系统将脱氨酶与失去双链剪切活性的Cas蛋白(dCas9或者nCas9)融合作用于单链DNA(ssDNA),以实现靶位点的碱基替......阅读全文

新型腺嘌呤碱基编辑器可让细胞RNA编辑最小化

  在一项新的研究中,来自美国布罗德研究所和哈佛大学的研究人员发现有证据表明使用碱基编辑器会导致细胞中出现意想不到的RNA编辑。相关研究结果发表在2019年5月8日的Science Advances期刊上,论文标题为“Analysis and minimization of cellular RNA

王猛郑平王钰等开发基于碱基编辑的多基因表达调控技术

  Nat Commun   同时对微生物细胞的多个基因进行组合表达调控,是研究微生物复杂代谢调控,重构代谢路径的重要技术。目前常用技术是基于DNA克隆,在体外构建表达调控元件(启动子或RBS)与目的基因的质粒文库,然后转化进入细胞进行表型筛选。受限于克隆效率和DNA转化效率,该方法仅适用于单个或少

基因编辑技术可以编辑所有基因吗

即便当前不能,以后会能的。基因编辑技术指能够让人类对目标基因进行“编辑”,实现对特定DNA片段的敲除、加入等。在过去几年中, 以ZFN (zinc-finger nucleases)和TALEN (transcription activator-like effector nucleases)为代表

构建双重检查碱基编辑系统提高ABE在大肠杆菌中编辑效率

  近年来,CRISPR/Cas9的新型碱基编辑技术迅速发展。David Liu实验室通过将催化失活的Cas9蛋白与胞嘧啶脱氨酶融合在一起,利用具有序列特异性的gRNA引导复合物靶向目标基因,实现了由C到T的单碱基转换;随后该实验室又建立了腺嘌呤碱基编辑器(ABE),实现了由A到G的精确转换。但是可

新型“碱基编辑器”有助治疗遗传疾病

  一个美国团队25日在英国《自然》杂志发表报告说,它在基因编辑技术方面取得新进展,可通过一种新型“碱基编辑器”在基因中替换碱基,有助科学家增强对遗传疾病的理解和开发新疗法。  基因是脱氧核糖核酸(DNA)上的片段,而DNA双链螺旋结构由4种化学碱基组成,即腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和

天津工生所实现单窗口碱基编辑

  碱基编辑器主要有3种类型:胞嘧啶碱基编辑器(cytosine base editor, CBE)、腺嘌呤碱基编辑器(adenine base editor, ABE)和糖基化酶碱基编辑器(Glycosylase base editor,GBE),它们在不需要DNA双链断裂和编辑模板的情况下可分别

单碱基编辑首次应用于非人灵长类模型

   5月20日美国遗传学家团队近日首次在非人灵长类模型中,实现了对一种名为PCSK9基因剪接位点的高效精准编辑。这一成功意味着,只需单次注射,便可持久抑制肝脏中PCSK9基因的表达,其为心血管疾病的预防提供了全新的思路,并极大地推动了单碱基编辑技术的临床转化应用。研究报告19日公开于英国《自然》杂

新进展!构建新型双碱基编辑器

  碱基编辑器是基于CRISPR/Cas9发展的新一代基因组编辑技术,可诱导单个碱基的突变,而鲜有关于特异性介导A-to-G和C-to-G双突变的碱基编辑工具的研究。此外,关于碱基编辑系统与染色质环境之间的联系也少见报道。  近日,中国科学院天津工业生物技术研究所研究员毕昌昊带领的合成生物学技术研究

基因突变碱基变化

  基因突变可分为碱基置换突变和移码突变两大类。  碱基置换突变——也称为点突变,指DNA分子中一个碱基对被另一个不同的碱基对取代所引起的突变。点突变分转换和颠换两种形式。如果一种嘌呤被另一种嘌呤取代或一种嘧啶被另一种嘧啶取代则称为转换嘌呤取代嘧啶或嘧啶取代嘌呤的突变则称为颠换(transversi

高效双碱基编辑器研发成功并在水稻中实现基因定向进化

  近日,中国农业科学院作物科学研究所作物精准育种技术创新团队成功开发了一种高效、编辑范围更广的胞嘧啶和腺嘌呤双碱基编辑融合系统,利用该系统对水稻内源基因编码区进行改造,获得了高抗草甘膦的水稻新型基因资源。相关研究成果在线发表在《植物学报(Journal of Integrative Plant B

Cell子刊:利用碱基编辑修复人胚胎中的致病性基因突变

  在一项新的研究中,来自中国广州医科大学附属第三医院、中科院生物化学与细胞生物学研究所和上海科技大学的研究人员利用一种改进形式的CRISPR基因编辑技术来修复活的人胚胎中的遗传缺陷。在近期发表Molecular Therapy期刊上的标题为“Correction of the Marfan Syn

新方法对人类基因组进行有效地单碱基编辑

  近日,来自格莱斯顿研究院的研究团队开发了一项新技术,可以对人类基因组进行单碱基编辑。这不仅增强了目前在干细胞中模拟疾病的能力,也为基因治疗新途径提供了基础。   相关研究论文发表在《自然方法学》(Nature Methods)上。其中提出如何有效并且精确地捕获罕见致病突变,以及如何修

新研究开发出靶向能力和编辑效率得到改善的碱基编辑器

  在一项新的研究中,来自美国布罗德研究所、哈佛大学和波士顿儿童医院的研究人员利用一种称为“噬菌体辅助的碱基编辑器连续进化(phage assisted continuous evolution of base editors, BE-PACE)”的系统开发出一种改进碱基编辑器的编辑效率的新方法。相

新型碱基编辑器助力工业底盘菌株创制

近年来,生物制造产业发展迅速,已成为推动我国经济社会可持续发展的重要引擎。工业菌株是生物制造的“灵魂”,性能优良的工业微生物就像一个个高效的“细胞工厂”,只需要摄取简单的营养甚至废料,便可合成我们日常所需的各种产品,如蛋白质、生物药品、化妆护肤成分、生物染料等。传统的微生物基因改造需要经过一系列的繁

碱基编辑将为镰状细胞病的治疗提供新策略

  由麻省理工学院(MIT)、哈佛大学(Harvard)布罗德研究所(Broad Institute of MIT)和圣犹大儿童研究医院领导的一个团队展示了一种基因编辑方法,可以有效纠正患者血液干细胞和小鼠体内SCD的突变。   镰状细胞病(SCD)是最常见的致命遗传疾病,每年影响全球超过30万新生

能预测碱基编辑效果的新模型开发成功

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519847.shtm

实验性碱基编辑技术“治愈”白血病女童

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/12/491107.shtm 科技日报北京12月13日电 (记者刘霞)一名罹患白血病的13岁女童艾莉莎成为全球首例接受一种新型CRISPR疗法的人。据英国《新科学家》网站11日报道,英国伦敦大学学院大奥蒙德

上海生科院发现DNA碱基编辑的新方法

  10月10日,国际学术期刊《自然-方法》(Nature Methods)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所常兴研究组题为Targeted AID -mediated mutagenesis (TAM) enablesefficient genomic div

首次人体碱基编辑试验可有效降低坏胆固醇

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512271.shtm

DNA碱基编辑器或能诱导大量脱靶RNA突变!

  DNA碱基编辑方法能够直接在基因组DNA中进行点突变的校正,同时并不会产生任何双链的断裂(DSBs,double-strand breaks),但潜在的脱靶效应常常限制了这些方法的应用,腺相关病毒(AAV)是DNA编辑基因疗法中最常用的传递系统,由于这些病毒能够在体内持续维持基因表达的功能,因此

科学家开发新型RNA单碱基编辑工具AMBER

中国科学院上海药物研究所研究员郝沛团队和中国科学院分子植物科学卓越创新中心研究员李轩团队合作,开发了一种新型RNA单碱基(C>U)编辑工具AMBER,并在细胞和小鼠动物模型体内实现对多个靶标基因RNA转录本的精准编辑,为基于RNA编辑的遗传病治疗策略开拓了新技术路径,同时进一步丰富了RNA编辑工具库

实验性碱基编辑技术“治愈”白血病女童

  一名罹患白血病的13岁女童艾莉莎成为全球首例接受一种新型CRISPR疗法的人。据英国《新科学家》网站11日报道,英国伦敦大学学院大奥蒙德街儿童医院发布声明称,这名女孩之前对其他疗法已无反应,但在今年5月接受了碱基编辑技术治疗后,现在身上已经检测不到癌细胞。不过医生们也表示,她未来是否不再出现相关

能预测碱基编辑效果的新模型开发成功

近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)动物表观基因组学创新团队研发出一种预测碱基编辑效果的新模型,该模型大幅提升了预测碱基编辑器在基因组内源靶位点编辑效果的准确性。相关研究成果发表在《细胞发现》(Cell Discovery)上。碱基编辑技术是一

碱基编辑器的效能差异并构建可编辑致病突变数据库

  近日,中国科学院上海营养与健康研究所杨力研究组与上海科技大学生命科学与技术学院陈佳研究组通过合作,系统揭示了一系列具有代表性的基因组碱基编辑器(baseeditor)的效能差异,并进一步构建了可利用20种已报道碱基编辑器进行编辑的人类疾病相关单碱基突变位点的数据库(BEable-GPS, Bas

广州生物院开发出新型双碱基编辑器

近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院赖良学课题组在新型碱基编辑器开发方面取得重要进展,获得了可同时兼具当前多种单碱基编辑器及CRISPR/Cas9基因编辑功能的多功能碱基编辑器,可广泛地诱导产生多种模式的突变,对于饱和突变文库构建、基因突变功能研究等方面具有促进作用。相关研究成果以AGBE: a

AI辅助创新蛋白聚类方法开发新型碱基编辑工具

  中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞研究组开创性地运用AI辅助结构预测,建立起基于三级结构的蛋白聚类方法,并扩展为全新的脱氨酶挖掘体系,开发了一系列具有中国自主知识产权的新型碱基编辑工具。该工作为蛋白功能分析、新功能元件挖掘提供了全新策略。新研发的碱基编辑系统具有我国自主知识产权的精准基因编辑

张峰团队边裁员边融资-碱基编辑行不通了?

  近日,由明星科学家张峰、刘如谦联合创立的 Beam Therapeutics 宣布将裁掉100名也就是20%的员工,暂停部分研究,并在一些药物项目开发上寻找合作伙伴。  作为CGT领域的明星公司、引人瞩目的平台型公司,以及第一家上市的碱基编辑公司,Beam的股价一度高达130美元,成立三年管线多

多样化C-to-T植物碱基编辑器被开发

  近日,电子科技大学张勇教授、马里兰大学YiPing Qi博士、扬州大学张韬教授课题组合作于《Plant Biotechnology Journal》发表了题名《Improved plant cytosine base editors with high editing activity, pur

碱基编辑研究获进展,为工业菌株改造提供新思路

  链霉菌是许多重要天然产物的生产者,其基因组蕴含着大量未被开发的次级代谢生物合成基因簇。传统的基于双链断裂的CRISPR/Cas9技术虽然已应用于链霉菌的基因组编辑,但需提供外源修复模板,且在多位点同时编辑的应用上仍有局限性。近年来,单碱基编辑技术已应用于天蓝色链霉菌等一些模式菌株中,相较于传统C

Nature-Biotechnology:新研究拓宽碱基编辑器的靶向范围

  基因组编辑技术CRISPR/Cas9被《科学》杂志列为2013年年度十大科技进展之一,受到人们的高度重视。CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列的简称,Cas是CRISPR相关蛋白的简称。CRISPR/Cas9是由一种原始的细菌免疫系统改编而成的,它的作用方式是首先在基因组的一个靶位点上切割