一种可以详细描绘人体细胞蛋白质图谱的新工具

共同第一作者Christopher Go使用192种已知存在于特定细胞器中的蛋白质标记物对人类细胞景观进行了调查,这些细胞器可以“标记”同一隔间中相邻的蛋白质。 西奈卫生研究院的研究人员发表了一项研究,对人类活细胞的组织进行了超详细的研究,提供了一种新的工具,可以帮助世界各地的科学家更好地了解疾病期间发生的情况。 发表在《Nature》杂志上的这项新研究是由多伦多大学分子遗传学系教授、Lunenfeld-Tanenbaum研究所(LTRI)高级研究员Anne-Claude Gingras博士的实验室进行的。 共同第一作者Christopher Go和James Knight博士使用192种已知存在于特定细胞器中的蛋白质标记物对人类细胞景观进行了研究,这些细胞器可以“标记”同一隔间中相邻的蛋白质。 Go说:“人类细胞图谱能够预测活细胞中所有隔间中的4000种蛋白质的定位。我们对人类细胞的所有主要细胞器进行采样,并使用创......阅读全文

首张肿瘤细胞蛋白质图谱绘就

日前绘制的首张癌症蛋白质相互作用图谱涵盖了以前被忽视的突变,而这些突变可能成为治疗的目标。 美国加州大学圣地亚哥分校的Trey Ideker和同事完成的这幅图谱,研究了几十种常见癌症蛋白质在乳腺癌和头颈癌中的相互作用。“癌症基因并不是单独起作用的。”Ideker说,“就像任何机器的部件一样,它们

《自然》发布重要单细胞RNA图谱:首张小肠细胞图谱

  我们肠道上皮是人体内多样性最高,最具活力的组织之一, 作为机体与外界的主要界面之一,组成了一个细胞的生态系统。为了更好地理解这些复杂的组织及其功能,还有影响它的疾病,麻省理工学院、哈佛大学和麻省总医院研究人员领导的一个研究团队通过分析从小鼠肠道或肠道类器官中取样的5.3万多个单独的细胞,完成了一

一种可以详细描绘人体细胞蛋白质图谱的新工具

  共同第一作者Christopher Go使用192种已知存在于特定细胞器中的蛋白质标记物对人类细胞景观进行了调查,这些细胞器可以“标记”同一隔间中相邻的蛋白质。  西奈卫生研究院的研究人员发表了一项研究,对人类活细胞的组织进行了超详细的研究,提供了一种新的工具,可以帮助世界各地的科学家更好地了解

人体细胞图谱问世

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505110.shtm

肠道细胞综合图谱面世

  肠道是人体重要的消化器官,肠道由不同的解剖区域组成,这些区域发育速度不同,在消化、营养吸收、代谢和免疫调节中也发挥着不同的作用。正确认识肠道细胞的分化过程对于肠道疾病的研究至关重要。  近期,英国桑格研究所的研究团队发布了人体肠道细胞综合图谱。相关研究在《Nature》发表,题为:Cells o

蛋白质组学牛人利用新技术分析蛋白质图谱

  蛋白质组(proteomics)分析是针对不同条件下细胞中蛋白的功能和特性进行研究的统称,这一领域的研究一直以来都落后于基因组研究,后者在技术创新方面取得了不少成果,一些令人眼花缭乱的快速基因组图谱绘制技术,还有无需借助核心实验室设备就能完成实验的技术,都令我们印象深刻。   但是与基因组研究

中国人肾透明细胞癌蛋白质基因图谱绘制成功

中国是肾癌大国,其中40%的肾癌患者在初诊或随访过程中出现转移,从而导致治疗效果不佳。其中,遗传异质性高、缺乏精准有效治疗靶点是肾癌治疗效果差的主要原因。复旦大学附属肿瘤医院教授叶定伟团队携手复旦表型研究院教授丁琛团队和上海交通大学医学院附属新华医院教授赵健元团队,成功绘制出中国人肾透明细胞癌蛋白质

-科学家绘制世界最大蛋白质图谱

  科学家已经发现了上万种新的蛋白联结,约占蛋白联结总量的四分之一。为了揭示蛋白质是如何构建细胞与机体,来自多个国家的科学家组成的研究团队筛选了不同生物的细胞,这些细胞从变形虫到蠕虫到老鼠到人类,来源十分广泛。  这项蛋白质科学的壮举,是来自七个国家的三个研究小组合作的结果,由多伦多大学唐纳利中心的

首个水稻全景定量蛋白质组图谱发布

  中国农业科学院生物技术研究所近日联合国内多家单位,共同绘制了水稻全景定量蛋白质组图谱,为水稻的基因功能研究提供了重要的蛋白质表达量资源,也为基因组学、蛋白质组学等多组学数据支撑作物智能设计育种提供了新思路。相关研究成果发表在国际期刊《自然植物》上。  植物的所有组织、器官中都富含蛋白质,它是构成

首个水稻全景定量蛋白质组图谱发布

中国农业科学院生物技术研究所近日联合国内多家单位,共同绘制了水稻全景定量蛋白质组图谱,为水稻的基因功能研究提供了重要的蛋白质表达量资源,也为基因组学、蛋白质组学等多组学数据支撑作物智能设计育种提供了新思路。相关研究成果发表在国际期刊《自然植物》上。植物的所有组织、器官中都富含蛋白质,它是构成细胞和生

Cell重要成果:绘制凋亡蛋白质组图谱

  斯克里普斯研究所的科学家们同时绘制出了细胞中两种最重要的蛋白质修饰类型的图谱,揭示了在凋亡这一重要细胞过程中它们之间广泛的协同作用。相关论文发表在7月20日的《细胞》(Cell)杂志上。   磷酸化(Phosphorylation)和蛋白质水解(proteolysis)几乎总是被独立开展研究。

《细胞》:单细胞测序助力基因重组图谱

  来自斯坦福大学医学院等处的研究人员发表了题为“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章,首次公布了来自一个成人男子91个

Science绘制细胞药物反应图谱

  为什么对于同一种药物人们会有不同的反应?研究人员第一次解开了与药物反应相关的遗传和环境因素,使得我们朝着预测出药物将会对我们造成的影响又近了一步。   来自英属哥伦比亚大学的研究人员将6,000种酵母菌株暴露于3,000种药物之中。他们对酵母菌株进行了改造使得能够测量这些酵母的反应。研究人员发

首个肺癌全息细胞图谱问世

  肺癌是发病率和死亡率增长最快、对人群健康和生命威胁最大的恶性肿瘤之一。近年来,肺癌患者有更加年轻化的趋势,治愈较为困难。虽然目前科学家在肺癌治疗方面已取得了巨大进展,但对其细胞层面上的科学认识仍难尽如人意。近日,著名学术期刊《自然—医学》推出史上最完整的肺癌细胞图谱,这将是科学家们在细胞层面深入

首个果蝇细胞衰老图谱公布

  了解身体如何衰老是一个重要的研究领域。美国贝勒医学院、斯坦福大学等机构研究人员在《科学》杂志上发表了首个果蝇细胞衰老图谱(AFCA),详细描述了果蝇中163种不同细胞类型的衰老过程。  分析表明,体内不同细胞的年龄不同,每种细胞类型的衰老过程都遵循特定的模式。AFCA为衰老研究提供了宝贵的资源,

PNAS:单细胞测序绘制大脑的细胞图谱

  斯坦福大学的著名学者Stephen Quake及其同事本周在《美国科学院院刊》(PNAS)上发表文章,介绍了人类脑细胞的单细胞转录组测序研究成果。  研究小组对近500个成人或胎儿脑细胞进行了单细胞RNA测序。利用这种方法,他们能够鉴定出大脑中所有主要的细胞类型,并确定神经元的亚型。他们还观察了

Nature:科学家再构建蛋白质-“遗传图谱”

  6月6日,《自然》杂志发表了一项由剑桥大学和默沙东的科学家领导完成的重要成果:他们成功创建出人类蛋白质的第一个详细遗传图谱。这一突破性研究有望增进我们对各种疾病的了解,并有助于新药的开发。   DOI: 10.1038/s41586-018-0175-2   这项研究描述了人类血浆“蛋

首个大豆全景定量蛋白质组图谱发布

近日,中国农业科学院生物技术研究所联合多家单位,绘制出大豆全景定量蛋白质组图谱,揭示了RNA甲基化在调控大豆蛋白表达量中的作用,并利用蛋白质组数据挖掘出调控大豆发育的新表观因子MTBa。相关研究成果发表在《细胞—基因组学》(Cell Genomics)上大豆基因组数据尽管可以提供大量信息,但不足以阐

Nature:科学家再构建蛋白质-“遗传图谱”

  《自然》杂志发表了一项由剑桥大学和默沙东的科学家领导完成的重要成果:他们成功创建出人类蛋白质的第一个详细遗传图谱。这一突破性研究有望增进我们对各种疾病的了解,并有助于新药的开发。   DOI: 10.1038/s41586-018-0175-2   这项研究描述了人类血浆“蛋白质组”(pro

图谱研究揭示蛋白质间交互作用链

图谱揭示上万种蛋白质之间存在相互作用   一国际研究团队通过大规模蛋白图谱研究发现,有机生物细胞内的不同蛋白质间具有较深联系,正是它们间的相互作用促进了细胞和生物体的构建。而蛋白图谱的绘制,或可帮助科学家探寻导致人类错综复杂的各种疾病的根源。   这项研究由加拿大多伦多大学的安德鲁·艾米莉教授和美国

Nature:科学家再构建蛋白质-“遗传图谱”

  6月6日,《自然》杂志发表了一项由剑桥大学和默沙东的科学家领导完成的重要成果:他们成功创建出人类蛋白质的第一个详细遗传图谱。这一突破性研究有望增进我们对各种疾病的了解,并有助于新药的开发。   DOI: 10.1038/s41586-018-0175-2   这项研究描述了人类血浆“蛋白质组

多学科交互,深度绘制细胞图谱

  大多数人类疾病实质上是细胞故障的产物。但要了解细胞的哪些部分出错会导致疾病,科学家首先需要对细胞有完整的了解。美国加州大学圣地亚哥分校医学院的研究人员及其合作者在24日发表于《自然》杂志上的论文中,介绍了尺度集成细胞(MuSIC)技术,这是一种结合了显微镜、生物化学和人工智能的技术,揭示了以前未

首个千万级免疫细胞图谱发布

免疫细胞是人体免疫系统不可或缺的重要组成部分,在发育、器官形成、疾病发生发展等方面发挥着关键作用。然而,由于技术和成本的限制,长期以来科学家们虽然知道免疫细胞种类繁多,却难以看清每个细胞的具体特征和它们之间的调控关系。北京时间1月9日,由中国科学家组成的研究团队,在《科学》杂志上发布首个了千万级高分

脑脊液细胞学分类及图谱

1.免疫活性细胞:均由淋巴细胞(图1)衍生而来,包括小淋巴细胞:为正常人脑脊液中的主要细胞,无特殊的病理意义,占细胞总数75%。①转化型淋巴细胞(图2)和淋巴样细胞:提示局部的体液或细胞介导的免疫反应。临床意义:提示病毒性脑炎、结核性脑膜炎、脑脓肿、多发性硬化等。②浆细胞(图3):亦名抗体细胞,它

单细胞水平肺癌T细胞免疫图谱绘就

  今天,《自然—医学》在线发表中国科学家的一项成果,研究通过国际领先的单细胞转录组测序技术和生物信息学分析方法,完整刻画了与非小细胞肺癌相关的T淋巴细胞图谱,揭示了肺癌T细胞的亚群分类、组织分布特征、肿瘤内群体异质性及药物靶基因表达情况,鉴定了跨组织分布的T细胞类群及亚群间潜在的状态转换关系,为肺

单细胞水平肺癌T细胞免疫图谱绘就

  今天,《自然—医学》在线发表中国科学家的一项成果,研究通过国际领先的单细胞转录组测序技术和生物信息学分析方法,完整刻画了与非小细胞肺癌相关的T淋巴细胞图谱,揭示了肺癌T细胞的亚群分类、组织分布特征、肿瘤内群体异质性及药物靶基因表达情况,鉴定了跨组织分布的T细胞类群及亚群间潜在的状态转换关系,为肺

泛癌症T细胞单细胞图谱-相关成果发表

  北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)、生命科学学院、北京未来基因诊断高精尖创新中心(ICG)张泽民课题组联合北京大学肿瘤医院季加孚、步召德课题组以及北京大学第三医院,在国际期刊Science上发表了题为“Pan-Cancer Single Cell Landscape of Tumor-

单细胞水平肺癌T细胞免疫图谱绘就

  今天,《自然—医学》在线发表中国科学家的一项成果,研究通过国际领先的单细胞转录组测序技术和生物信息学分析方法,完整刻画了与非小细胞肺癌相关的T淋巴细胞图谱,揭示了肺癌T细胞的亚群分类、组织分布特征、肿瘤内群体异质性及药物靶基因表达情况,鉴定了跨组织分布的T细胞类群及亚群间潜在的状态转换关系,为肺

水生所完成模式硅藻的蛋白质组精细图谱

  硅藻是一类重要的单细胞光合真核生物,分布广泛,提供了地球上约20%的初级生产力,对整个地球生物圈意义重大。三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)是海洋硅藻的模式生物,其基因组序列于2008年公布,但目前基因组的注释仍很不完善。蛋白基因组学(Proteogenomics)

Cell重磅:人类病毒蛋白质相互作用图谱面世

图片来源:《寄生虫》海报  近日,一部豆瓣评分9.2的韩国电影《寄生虫》广受大家的好评。故事也正如片名一样,讲述了一个贫困家庭“寄生”于富人家庭的故事。说到寄生,其实人体内的寄生事件更是数不胜数,最常见的便是病毒的感染。  病毒是一种比真菌和细菌小得多的感染性微生物,要想生存,它就必须找到合适的活体