LACEseq——一种RNA结合蛋白靶标研究的新方法
在真核细胞中，RNA可以“形单影只”，也可以与蛋白质“珠联璧合”。后者被称为RNA结合蛋白，它拥有着强大的基因调节能力。 RNA究竟与那些蛋白结合？将怎样作用于人类的发育、疾病？这都是悬而未解的难题。 6月10日，中国科学院生物物理研究所研究员薛愿超团队与合作者开发了可在微量细胞中鉴定RNA结合蛋白作用靶点的新技术LACE-seq，首次实现了在单碱基分辨率和单细胞层面精准鉴定RNA结合蛋白的结合位点，为研究RNA结合蛋白在胚胎发育和生殖疾病中的功能机制打开了大门。相关研究成果发表在《自然-细胞生物》。 寻觅工具 人类基因组共编码了约1500个RNA结合蛋白，它们往往通过结合RNA分子上的特定基序或结构元件而调控细胞内各种RNA分子的加工、定位、翻译和稳定性等。 研究表明，RNA结合蛋白在早期生殖、个体发育、细胞分化、增殖和凋亡等几乎所有的生理过程中都发挥了关键的调控作用。同时，RNA结合蛋白的突变会导致多种遗传性疾......阅读全文
对抗肥胖和糖尿病的新靶标
在最近召开的内分泌学会年度会议上，来自牛津大学的研究人员报告了他们的一项最新研究进展，他们发现移除一种酶就能够帮助雌鼠控制胆汁酸和激素水平，防止体重增加，这项研究为肥胖治疗提供了新的靶向目标。 类固醇激素和胆汁酸在调节食欲，机体活动以及能量使用和储存方面发挥多种功能。之前有研究表明雌激素能够降
Cell综述：遗传疾病mRNA靶标位点
脆性X综合症是世界范围内最常见的遗传性智力缺陷之一，仅次于唐氏综合症，这种疾病是由脆性X智障蛋白（Fragile X mental retardation protein，FMRP）功能缺陷导致。 这种关键蛋白具有三个RNA结合区域，其突变也是在这些区域发生了变化，最新一期（9月12日）Cel
重要癌症靶标三维结构获解析
上海科技大学iHuman研究所徐菲课题组与复旦大学、美国南加州大学和斯克瑞普斯研究所等单位合作，解析了重要癌症靶标人源Smoothened受体的多结构域晶体结构，分辨率达到2.9埃（1埃=10-10米），相关成果日前在线发表于《自然—通讯》。 Smoothened受体是Hedgehog信号通路
Plos－Biology：骨质疏松症治疗新靶标
近日，国际学术期刊 Plos Biology 在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所邹卫国研究组的最新研究成果“H3K36 trimethylation mediated by SETD2 regulates the fate of bone marrow mesenchymal ste
在小鼠中发现可能的男性避孕靶标
科研人员报告说，破坏雄性小鼠的两种蛋白质能在射精期间阻断精子运输并且导致完全不育，但是不会影响这些动物的精子的长期生育能力或者性行为。寻找男性避孕靶标主要把重点放在了激素靶标或者让精子机能障碍的机制上，但是这类策略有无法忍受的副作用，诸如改变的性活动或者生育力的不可逆的变化。 Sabatin
Science医学：击中艾滋病毒易变靶标
来自斯克里普斯研究所（TSRI）的科学家们在一项研究中发现，HIV病毒表面蛋白上的一个位点向人类免疫系统呈送了多样的靶标，而用一种疫苗或其他的治疗来瞄准这一位点理论上可以中和几乎所有的HIV病毒株，这一研究发现将有可能影响未来的HIV疫苗及抗体疗法设计。研究论文发表在5月15日的《科学转化医学》
Blood：治疗特定血液癌症的新靶标
约克大学科学家已经确定血液癌症新的治疗靶点，这可能导致针对特定血液癌症即骨髓增殖性肿瘤（MPNS）的新疗法的发展。 骨髓增殖性肿瘤是以一系或多系髓系细胞增殖为主要特征的克隆性造血干细胞肿瘤。多系髓系细胞(包括红系、粒系和巨核系) 增殖为主要特征的克隆性造血干细胞肿瘤，其特点是骨髓有核细胞增多，
精准打击－新型绿色农药的靶标找到了
想象一下，害虫失去表皮会怎样？自然是活不长了。 科学家认为，找到害虫表皮中特有的成分和机制，就能找到新型绿色农药的靶标，实现“精准打击”。 为此，中国农业科学院深圳农业基因组研究所研究员杨青团队已经努力了数十年。 12月24日，《细胞》在线发表了杨青团队的最新研究成果。他们揭示了ABCH转
研究发现预防和治疗肠癌的新靶标
澳大利亚奥莉维亚纽·顿-约翰癌症研究所科学家在6日出版的《科学免疫学》杂志上发表论文称，他们发现了预防和治疗肠癌的新靶标：TCF-1分子。研究表明，删除免疫细胞内的TCF-1时，会导致肠癌肿瘤显著减少。这是迄今首个此类研究，为开发靶向联合免疫疗法以更有效地治疗肠癌奠定了基础。健康人结肠的显微切片
Nature子刊：高效靶标肿瘤的新型载体
布莱根妇女医院（Brigham and Women's Hospital）的研究人员开发了一种有效递送基因疗法的新载体。他们将这一技术用于三阴乳腺癌的临床前模型，使肿瘤缩小了近90%。这项研究发表在十二月七日的Nature Materials杂志上。 乳腺癌是女性中最常见、也最严重的恶性肿瘤之
微信学术交流群之靶标预测
靶标预测 A:有什么简单的方法可以通过化合物的结构式预测该化合物可能的药理毒理作用么，比如抗肿瘤，抗炎，抗神经等等。 B:反向找靶。 A:那就复杂咯，想简单点，然后去做细胞实验验证。想着是不是可以通过计算机来预测哈子。 C:反向对接。 D:直接做激酶谱不就行了。
Cancer－Res：治疗神经母细胞瘤新靶标
利物浦大学科学研究人员发现可能用于治疗神经母细胞瘤的新靶点。 神经母细胞瘤是最致命的儿童癌症之一，占所有儿童癌症死亡人数的15％。多数患者无法得到完全治愈，往往在确诊时癌症已经扩散至全身。 在过去的20年中，儿童接受的治疗通常伴有非常大的副作用，不仅杀死肿瘤细胞，也杀伤正常细胞。相较于其他大
研究发现炎症疾病的新治疗性靶标
来自美国拉霍亚过敏和免疫学研究所（La Jolla Institute for Allergy & Immunology, La Jolla, CA），中科院上海生化与细胞研究所的研究人员利用一种体内敲除技术，分析了蛋白Neddylation在调控T细胞功能上的作用，为炎症疾病治疗提供了一
生物中的靶标和靶点是什么
生物靶点：能够与药物分子结合并产生药理效应的生物大分子现通称为药物作用的生物靶点。这些靶点的种类主要有受体、酶、离子通道和核酸，存在于机体靶器官细胞膜上或细胞浆内。 靶标生物的生物学特性及为害规律是选择适合药剂、施药方法及施药适期的基础。
上海药物所靶标发现技术取得突破
中科院上海药物所蒋华良研究员与大连理工大学力学系王希诚教授合作，针对寻找药物作用新靶标的需求，带领博士后李洪林和高振霆等，发展了以活性小分子为探针、搜寻潜在结合蛋白质的“反向分子对接”方法，相关结果发表在Nucl. Acids Res. (2006, 34, W219-224)，并建立了相应的公共网
RNA提取心得（组织RNA提取和培养细胞的RNA提取）
一.组织RNA提取 1.最好新鲜组织，这样RNA提取的效果比较好，这是肯定的。 2. 如果不是新鲜的（最好在半年之内，-80℃或者液氮中冻存的）组织，注意不要反复冻融，从冰冻状态拿到0-4℃，注意不要拿到常温，待组织解冻后，用 DEPC泡过的剪刀剪一小块组织，称重后，放到预冷的匀浆器中，然后
RNA干扰相关知识RNARITS）
RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing（RITS）：是一种组织染色质变型的复合物。RITS复合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白质，通过结合到异染色质的基因池上来促使异染色质上基因的沉默。
RNA分离与分析实验_分离RNA
实验材料标记细胞试剂、试剂盒乙酸缓冲液仪器、耗材漩涡器实验步骤1. 收获标记细胞。2. 小心处置上清液，用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸缓冲液悬浮细胞沉淀，每 1 ml 压积细胞用 10 ml 缓冲液。3. 于室温用漩涡器振荡裂解细胞。4. 加等体积的水饱和酚，充分混匀，于 60
RNA干扰相关知识RNARISC
RNA-induced silencing complex（RISC）：一种RNA-蛋白质复合物，通过与目标mRNA完全或者部分的互补配对来实施切割或者翻译抑制功能。SiRNA组装siRISC，miRNA组装miRISC。RISCs（无论siRISC还是miRISC）包括两种类型：切割型和不切割型。
反义技术——RNA干扰（RNA－interference，RNAi）
最近由于RNA干扰（RNA interference，RNAi）的发现使反义领域的研究增多。这种自然发生的现象最早是在秀丽线虫中发现的（1），是序列特异性地使转录后的基因沉默的有力机制。由于最近两年在RNAi领域取得的进步，已经有许多这方面的综述发表（2-4）。RNA干扰是由长的双链 RNA
RNA标记
RNA labeling (Amersham Pharmacia)For the generation of radiolabelled, single stranded RNA for use as hybridization probes 32P-pCp 3' End-labeling
RNA提取
RNA提取（主要内容如下）Tips for Handing RNA Total RNA IsolationmRNA IsolationrRNA IsolationOthersQ & A posted in the Method Forum Basic Procedures for Handing
RNA－电泳
①电泳RNA 所用器械如制胶的模具、梳子、电泳槽等用肥皂粉洗干净后用双蒸水冲洗二遍后在室温晾干备用。②用新的1XTBE 配制1. 2 %琼脂糖凝胶,倒胶时溴化乙锭(E直接加入凝胶中。③制备好的琼脂糖凝胶板放入电泳槽后再加入经高压灭菌过的1XTBE ,液面只能刚好同胶面平齐,缓冲液不要淹过胶面。④点样
指导RNA
中文名称指导RNA英文名称guide RNA;gRNA定 义一种小分子RNA，约含60～80个核苷酸，在RNA编辑中起模板作用。其功能是提供核苷酸插入或删除的信息。由小环DNA及大环DNA编码的指导RNA均带有编辑区的序列信息，可介导编辑过程。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调
Quantitating－RNA
RNA quantitation is an important and necessary step prior to most RNA analysis methods. Here we discuss three common methods used to quantitate RNA an
RNA电泳
RNA Gel (Crawford Lab)Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis.Northern Gel and TransferUsing glyoxal
RNA电泳
· RNA Gel (Crawford Lab)· Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis. · Northern
RNA标记
RNA标记是将标记物（如放射性同位素、荧光素或酶）共价地连接到RNA，通过检测标记物，进而实现对RNA鉴别和检测的目的。RNA标记在分子探针领域应用广泛，在疾病诊断方面也很有前景。 理想的RNA标记方法应符合以下要求： 1. 操作简单，灵敏度高 2. 不影响碱基配对的特异性 3. 不影响RN
RNA降解
新鲜细胞：如果试剂没有问题，且外源性污染也可以排除，那么降解几乎都来自裂解液的用量不足。如 果将裂解液直接加入培养皿中裂解细胞，一定要使裂解液能覆盖住细胞。 2. 新鲜组织：某些富含内源核酸酶的样品(如肝脏，胸腺等)，即使使用电动匀浆器匀浆也不能避免RNA的降解。更可靠的方法是：在液氮条件下将组织
RNA－剪接
中文名称RNA 剪接英文名称RNA splicing定 义在真核细胞核中从RNA初始转录物切除内含子，连接外显子形成成熟的mRNA的过程。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞遗传（二级学科）