LACEseq——一种RNA结合蛋白靶标研究的新方法

在真核细胞中,RNA可以“形单影只”,也可以与蛋白质“珠联璧合”。后者被称为RNA结合蛋白,它拥有着强大的基因调节能力。 RNA究竟与那些蛋白结合?将怎样作用于人类的发育、疾病?这都是悬而未解的难题。 6月10日,中国科学院生物物理研究所研究员薛愿超团队与合作者开发了可在微量细胞中鉴定RNA结合蛋白作用靶点的新技术LACE-seq,首次实现了在单碱基分辨率和单细胞层面精准鉴定RNA结合蛋白的结合位点,为研究RNA结合蛋白在胚胎发育和生殖疾病中的功能机制打开了大门。相关研究成果发表在《自然-细胞生物》。 寻觅工具 人类基因组共编码了约1500个RNA结合蛋白,它们往往通过结合RNA分子上的特定基序或结构元件而调控细胞内各种RNA分子的加工、定位、翻译和稳定性等。 研究表明,RNA结合蛋白在早期生殖、个体发育、细胞分化、增殖和凋亡等几乎所有的生理过程中都发挥了关键的调控作用。同时,RNA结合蛋白的突变会导致多种遗传性疾......阅读全文

RNA-Electrophoresis

Electrophoresis through agarose or polyacrylamide gels is the standard way to separate, identify and purify nucleic acid fragments. The location of th

RNA-剪接

中文名称RNA 剪接英文名称RNA splicing定  义在真核细胞核中从RNA初始转录物切除内含子,连接外显子形成成熟的mRNA的过程。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

RNA-电泳

①电泳RNA 所用器械如制胶的模具、梳子、电泳槽等用肥皂粉洗干净后用双蒸水冲洗二遍后在室温晾干备用。②用新的1XTBE 配制1. 2 %琼脂糖凝胶,倒胶时溴化乙锭(E直接加入凝胶中。③制备好的琼脂糖凝胶板放入电泳槽后再加入经高压灭菌过的1XTBE ,液面只能刚好同胶面平齐,缓冲液不要淹过胶面。④点样

Science:治疗癌症和糖尿病的靶标蛋白

  近日,昆士兰大学科学家们发现,一种调节你长多高的蛋白可用于治疗疾病,包括癌症和糖尿病。生长激素通过其受体作用,决定是否你正在努力达到身高最高。  来自昆士兰大学分子生物科学研究所Mike Waters教授的研究,现在已经发现生长激素受体也是癌症和糖尿病药物靶标。  没有生长激素受体的人从不罹患癌

瑞金医院宁光团队发现肥胖治疗新靶标

  记者从上海交大医学院附属瑞金医院获悉,该院内分泌科宁光研究团队日前发现了一个肥胖发生与治疗的新靶标——LGR4基因。研究显示,上述基因的缺失可促进白色脂肪转化为棕色脂肪,增加机体能量消耗,减轻体重。相关研究成果发表于《自然—细胞生物学》。   “肥胖是由人体内白色脂肪组织过度堆积所致

CRISPR如何寻找靶标?Jennifer-Doudna在线发表Science文章

  最近,人们利用Cas蛋白将一段动态图像插入了细菌基因组中(遗传学大牛Nature头条文章:CRISPR的另类用途),依托于CRISPR DNA的独特灵活性,细菌能识别一些允许病毒DNA插入的位点,确保有关病毒感染的“记忆”被正确储存。  7月20日《Science》在线报道了CRISPR“女神”

Neuro-Oncol:治疗恶性胶质瘤的新靶标

  靶向治疗是癌症治疗日益和突破性手段,其中药物或其他物质被设计成能干扰那些控制癌细胞生长和存活的基因或分子。现在,弗吉尼亚联邦大学梅西癌症中心和分子医学研究所VCU(VIMM)科学家们已经确定了microRNA和一种基因之间的相互作用,有助开发出治疗恶性胶质瘤的新药物。  相关研究最近发表在Neu

新的抗癌药物靶标——脂质化学信使

  一半以上的人类癌症都具有脂质代谢化学信号异常上调,但这些信号在肿瘤形成过程中是如何被调控的仍没有得到充分的理解。  近日,宾夕法尼亚大学Youhai Chen博士等人发现:TIPE3(一种新近被新发现的致癌蛋白),通过靶向这些脂质信号途径促进癌症。  第二信使--脂质在细胞膜外信号到细胞内部的传

Nature:两诺奖得主携手解析重要靶标分子

   由杜克大学医学院、密歇根大学和斯坦福大学的科学家们组成的一个研究小组,确定了与机体响应光和疼痛等刺激相关的一种细胞信号复合物的基本结构。这一由一种人类细胞表面受体及其调控蛋白构成的复合物,揭示出了人们从前猜测却未直接证实的一个两步骤机制。发表在6月22日《自然》(Nature)的新研

JCI:三阴性乳腺癌治疗的新靶标

  新加坡A * STAR基因组研究所(GIS)科学家与当地临床医生和美国同事合作,确定了一种与三阴性乳腺癌(TNBC)相关的生物标志物。新发现的生物标记物称为RASAL2基因,RASAL2基因或是治疗这种致命疾病的新靶标。  三阴乳腺癌是致命,因为其不同于其他类型的乳腺癌如雌激素受体(ER)阳性乳

追随诺奖脚步,Science解析重要靶标分子研究

  来自斯克里普斯研究所(TSRI)和范德堡大学的研究人员,生成了一个重要膜蛋白的最详细3-D图像。这一蛋白与学习、记忆、焦虑、疼痛及诸如精神分裂症、帕金森病、阿尔茨海默氏症和自闭症等脑疾病相关。   范德堡神经科学药物发现中心主任、药理学教授P. Jeffrey Conn博士,和斯克里普斯研究所

华人学者《Cancer-Cell》解析癌症药物新靶标

  目前,美国北卡罗莱纳大学(UNC)医学院的研究人员发现,蛋白质RBM4——对基因剪接过程至关重要的一个分子,在多种形式的人类癌症中急剧下降,包括肺癌和乳腺癌。相关研究结果发表在2014年9月8日的《Cancer Cell》杂志,为开发某种治疗方法,来阻止使癌细胞增殖和扩散的遗传通路变化,提供了一

Molecular-Cancer:发现治疗乳腺癌的新靶标

  一项由路易斯安那州立大学健康科学中心(LSU Health)新奥尔良医学院生物化学和分子生物学教授Suresh Alahari博士领导的研究首次发现一小段RNA会使细胞能量代谢失调,而这是癌症的一大特点。这些发现为乳腺癌的治疗性干预找到了一个新靶标,相关研究成果于近日发表在《Molecular

甲基化——肿瘤检测治疗的又一靶标?

前言在测序和相关技术不断进步的今天,研究人员不仅能够获得DNA、RNA的碱基序列,更能够获得碱基修饰的复杂信息。目前已经证明DNA甲基化能够导至的肿瘤产生,而Ribomed、基准医疗和鹍远基因等公司作为该领域的先行者,已经开发出相关产品。RNA作为中心法则的下游分子,也有多种多样的修饰,特别是m6A

曹雪涛院士JBC解析癌症治疗新靶标

  来自第二军医大学、浙江大学医学院等处的研究人员,在2014年3月13日的《Journal of Biological Chemistry》期刊发表了题为“Blockade of Fas signaling in breast cancer cells suppresses tumor g

叶明亮:发展高效药物靶标鉴定新方法

  近日,大连化物所生物分离分析新材料与技术研究组(1809组)叶明亮研究员团队和吉林大学胡良海教授团队、我所分子模拟与设计研究组(1106组)李国辉研究员团队合作,利用蛋白质结合药物以后对变性引起的沉淀具有更高的耐受性原理,发展了一种新型的药物靶标蛋白质鉴定方法。  靶标蛋白的发现对药物作用机制的

研究人员发现新的抗衰老靶标基因

  2月27日,《自然》期刊在线发表了题为《两个保守的表观遗传调控因子妨碍健康衰老》的研究论文,该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心(神经科学研究所)、上海脑科学与类脑研究中心、神经科学国家重点实验室蔡时青研究组与中国科学院上海巴斯德研究所江陆斌研究组合作完成。  衰老是生物体随时间推移各

数字微流控设备实现多靶标免疫分析

近日,中科院大连化学物理研究所研究员陆瑶、副研究员刘显明与复旦大学口腔医学院刘婷姣教授团队合作,在数字微流控多靶标免疫分析技术研究中取得新进展。相关研究成果发表在《生物传感器与生物电子》上。基于抗体—抗原特异性识别的免疫检测技术是生物医学研究、临床诊断及药物开发等领域中应用最广泛的靶向、高灵敏蛋白检

我所发展高效药物靶标鉴定新方法

原文地址:http://www.dicp.cas.cn/xwdt/kyjz/202210/t20221024_6538609.html  近日,我所生物分离分析新材料与技术研究组(1809组)叶明亮研究员团队和吉林大学胡良海教授团队、我所分子模拟与设计研究组(1106组)李国辉研究员团队合作,利用蛋

研究发现三阴性乳腺癌治疗新靶标

  中科院上海生命科学研究院(营养与健康院)詹丽杏研究组分析了三阴性乳腺癌(TNBC)患者的转录组特征,发现并确认了乳腺癌中JAK2/STAT3信号的新抑制子Wwox蛋白,阐明Wwox的异常减弱和JAK2/STAT3的异常激活这样的负相关关系是高度恶性TNBC发生转移的重要原因。研究成果近日在线发表

利用“数据+知识+AI”实现新靶标药物虚拟筛选

  6月6日,中国科学院上海药物研究所郑明月课题组在《自然-机器智能》(Nature Machine Intelligence)上发表了题为Generic protein–ligand interaction scoring by integrating physical prior knowled

深入揭示NAFLD发病机制,寻找潜在的干预靶标

  随着经济的高速发展,生活方式的转变,包括高热量食物和高糖饮料摄入、缺乏运动和体力活动等,非酒精性脂肪性肝病(Nonalcoholic fatty liver disease, NAFLD)已成为当代社会的重大慢性疾病。然而截止目前,NAFLD病理生理机制尚未完全阐明,临床上仍缺乏有效而特异的治疗

Cell:发现治疗糖尿病的潜在新靶标!

  来自卡罗林斯卡医学院的研究人员发表在国际期刊Cell Reports的一篇文章发现,胰岛β细胞的钙通道中的一个模块对调节我们的血糖有重要作用。针对这一模块的治疗将可能成为抗击2型糖尿病的新方法。  胰腺中的β细胞负责会产生在我们身体里调节血糖的胰岛素。在糖尿病中,β细胞失去了部分或全部的功能。钙

嗅觉受体竟然是膀胱癌治疗靶标

嗅觉受体(Olfactory receptors ,ORs)是一类主要存在于嗅觉器官上皮的G蛋白偶联受体。但是很多ORs也在其他组织表达,涉及包括癌症在内的多种疾病。近日来自德国波鸿鲁尔大学等机构的科学家们就发现其中一个叫做OR10H1的OR在膀胱癌组织中高表达,导致膀胱癌组织中相应的mRNA和蛋白

RNA干扰相关知识Small-interfering-RNA(siRNA)

Small interfering RNA(siRNA):是一种小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成员,激发与之互补的目标mRNA的沉默。

关于小干扰RNA的RNA激活介绍

  已经发现dsRNA还可以激活基因表达,这种机制被称为“小RNA诱导的基因激活”或RNAa。已经显示靶向基因启动子的dsRNA诱导相关基因的有效转录激活。使用合成的dsRNA在人细胞中证明RNAa,称为“小活化RNA”(saRNA)。尚不清楚RNAa是否在其他生物体中是保守的。

RNA沉默的分类

植物中的RNA沉默根据作用靶标可以分为两类:以RNA为靶标, 使其降解或抑制蛋白翻译, 称为转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing, PTGS);以染色质为靶标, 使其基因启动子或组蛋白甲基化从而抑制 RNA 转录的起始, 称为转录基因沉默(trans

植物中的RNA沉默的分类

植物中的RNA沉默根据作用靶标可以分为两类: 以RNA为靶标, 使其降解或抑制蛋白翻译, 称为转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing, PTGS); 以染色质为靶标, 使其基因启动子或组蛋白甲基化从而抑制 RNA 转录的起始, 称为转录基因沉默(tra

植物中的RNA沉默额定分类

植物中的RNA沉默根据作用靶标可以分为两类: 以RNA为靶标, 使其降解或抑制蛋白翻译, 称为转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing, PTGS); 以染色质为靶标, 使其基因启动子或组蛋白甲基化从而抑制 RNA 转录的起始, 称为转录基因沉默(tra

关于RNA沉默的分类介绍

  植物中的RNA沉默根据作用靶标可以分为两类: 以RNA为靶标, 使其降解或抑制蛋白翻译, 称为转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing, PTGS); 以染色质为靶标, 使其基因启动子或组蛋白甲基化从而抑制 RNA 转录的起始, 称为转录基因沉默(t