5000bp!单分子测序读长再次升级

PacBio RS单分子测序在发布时就以其超长的读长引起研究者的极大兴趣。在不到一年的时间里,随着年初C2试剂的升级,Pacbio RS的平均读长达到了3000bp,并迅速在测序的各个领域,特别是De novo中发挥了巨大的读长优势。Pacific Biosciences公司在11月6日正式发布新的超长测序试剂:XL系列。该试剂将主要针对De novo应用,平均读长将达到5000bp,其中5%的读长将超过13000bp,最长超过20000bp。美国冷泉港实验室前期试用于水稻基因组的组装,得到9倍覆盖率的长片段读序中50%在4800bp以上,大大提高了其通过NGS mate-pair拼接的程度。相信随着该新试剂的正式全面投入使用,将会对现有基因组的完善带来更大的突破。 对于研究者所关心的一些问题,我们也联系了Pacific Biosciences公司的技术支持,并一一做了解答。 问:XL试剂有哪些更......阅读全文

第三代基因编辑技术指的是

自2016年5月2日韩春雨作为通讯作者的“基因编辑技术NgAgo”论文发表引起关注、5月底质疑的声音开始出现,韩春雨实验的可重复争议,不仅科学界议论纷纷,在社会层面也引发了相关讨论。那么,基因编辑技术到底是一项怎么样的技术呢?为什么它这样备受瞩目?今天我们就一起去扒一扒基因编辑技术的“真面目”!(图

第三代基因测序仪定义

  基因测序仪(即DNA测序仪),是一台能自动灌胶、自动进样、自动数据收集分析等全自动电脑控制的测定基因片段的高档精密仪器。2009年12月3日,中科院北京基因组所与浪潮成立“中科院北京基因组研究所—浪潮基因组科学联合实验室”将研发国产第三代基因测序仪。该基因测序仪几十分钟就可完成一个人的完整基因组

第三代基因测序仪应用

  该仪器可广泛用于基因测定,癌细胞的表达普测定、亲子鉴定、个体识别、基因档案、父系鉴定、母系鉴定、种族鉴定、种属鉴定、传染病毒的测定及胎儿遗传缺陷的分析,比如癌细胞有起固有的表达方式,通过测定可得知人体癌细胞的发生和变化情况。另外,国产第三代基因测序仪的研发将极大地拓宽生命科学、生物化学、生物医药

第三代基因测序仪特点

  据介绍,使用该国产第三代基因测序仪,完成一个人的基因组测序的测试时间,将由6周缩短为10—15分钟;测试成本将由10万—30万美元降到5000—8000元人民币。  此外,国产第三代基因测序仪,与第二代测序仪在原理和效能上有本质区别,通过对单分子的操作而减少繁杂的生物学反应,同时结合对海量数据的

第三代基因测序仪特点

据介绍,使用该国产第三代基因测序仪,完成一个人的基因组测序的测试时间,将由目前(2009年)的6周缩短为10—15分钟;测试成本将由10万—30万美元降到5000—8000元人民币。此外,国产第三代基因测序仪,与第二代测序仪在原理和效能上有本质区别,通过对单分子的操作而减少繁杂的生物学反应,同时结合

第三代基因测序仪意义

  具有国际先进水平的国产第三代基因测序仪的研制,将使中国在该领域建立先发优势,在未来的国际竞争中占据有利位置。这不仅将填补中国在基因测序基础装备领域的空白、提升装备自主化水平,同时也将使国内生命科学研究机构能获得低成本、高效率的测序工具,更有效地开发和利用中国丰富的基因资源,加速中国基因战略的发展

第三代基因测序仪应用

该仪器可广泛用于基因测定,癌细胞的表达普测定、亲子鉴定、个体识别、基因档案、父系鉴定、母系鉴定、种族鉴定、种属鉴定、传染病毒的测定及胎儿遗传缺陷的分析,比如癌细胞有起固有的表达方式,通过测定可得知人体癌细胞的发生和变化情况。另外,国产第三代基因测序仪的研发将极大地拓宽生命科学、生物化学、生物医药等领

Science特刊:疼痛

痛觉是有机体受到伤害性刺激所产生的感觉,具有重要的生物学意义,这也是有机体内部的警戒系统,能引起防御性反应,具有保护作用。但是强烈的疼痛会引起机体生理功能的紊乱,甚至休克。11月3日Science杂志围绕这个主题,深入探讨了我们大脑中这一复杂的神经环路,虽然疼痛的分子机制已经困扰我们许多年,但是近年

首个!国内第三代基因测序仪研发成功

  三重优势,第三代测序技术正在兴起  测序技术从一代发展至三代,经历了Sanger、Roache、Illumina、Ion Torrent、PacBio及Nanopore等几种平台。目前全球应用最成熟且最广泛的是二代基因测序技术,但是却面临读长短以及无法解决高度杂合的基因组、高度重复序列、高GC区

第三代基因测序仪研发背景

  基因测序仪的研发是系统工程,涉及生物、半导体、计算机、化学、光学等多个领域,需要不同学科顶尖力量的合作。(指2009年)国际上对第三代基因测序仪的争夺十分激烈,美国宣称要在2012年推出成熟的第三代基因测序仪,日本和欧洲也有相关的研发计划。  中科院北京基因组研究所是国内权威的基因组学研究机构,

我国第三代核电技术基本成熟

  中国核工业集团公司自主研发、具备完整自主知识产权的先进压水堆核电站ACP1000(A代表先进、C代表中国、P代表堆型为压水堆,“1000”代表机组容量为百万千瓦级)的初步设计,日前在北京通过了中国核能行业协会、国家核安全局、国家能源局、国防科工局、中国机械工业联合会、环保部核与辐射安全

第三代多肽合成仪的发展

  第三代多肽合成仪诞生在上世纪九十年代  代表产品是美国Applied Biosystems公司的ABI 433 peptide synthesizer 与C S Bio公司的CS336无死角多肽合成仪。ABI433的设计原理是反应器上方相对固定,而下方作圆周360度快速旋转,带动反应器里的固液两

第三代新药何时惠及中国患者

  世界卫生组织今年2月发布的《全球癌症报告2014》显示,2012年全球癌症患者和死亡病例都在增加,新增癌症病例有近一半出现在亚洲,中国新增癌症病例高居首位,肺癌仍是最普遍和最致命的癌症,每年新发病大概在60万人左右。女性、40岁以下年轻人群的发病呈现出比较明显的上升趋势。最主要的致病诱因包括吸烟

第三代湿度分析仪问世

    对于烟草加工者和制造商来说,寻求实验室样品最终再现性和重复性仍是一个难以达到的目标。自从20世纪80年代中期以来,已经开发了两代湿度、尼古丁和糖分分析仪。现在NDC推出了Infralab 710,整批再现性和重复性方面的准确性比以前更接近了。     较差的再现性,即在不同实验室对同样样品

第三代基因测序仪技术原理

在分子生物学研究中,基因的序列分析是进一步研究和改造目的基因的基础。目前(2009年)用于测序的技术主要有Sanger等。发明的双脱氧链末端终止法。Sanger法是根据核苷酸在某一固定的点开始,随机在某一个特定的碱基处终止,产生A,T,C,G四组不同长度的一系列核苷酸,然后在尿素变性的PAGE胶上电

第三代基因测序仪技术原理

  在分子生物学研究中,基因的序列分析是进一步研究和改造目的基因的基础。用于测序的技术主要有Sanger等。发明的双脱氧链末端终止法。Sanger法是根据核苷酸在某一固定的点开始,随机在某一个特定的碱基处终止,产生A,T,C,G四组不同长度的一系列核苷酸,然后在尿素变性的PAGE胶上电泳进行检测,从

什么是第三代基因测序技术

第三代基因测序技术即基于纳米孔的单分子读取技术 在纳米孔测序技术中,DNA分子依靠核酸外切酶以一次一个碱基的速度通过小孔。这个酶能清楚地区分出4个DNA碱基编码:A、C、G、T,也可以检测出该碱基是否被甲基化,一个单孔能在大约70天左右测定一个完整的基因序列。 纳米孔技术不需要荧光标记物并且很可能不

第三代基因测序仪研发背景

基因测序仪的研发是系统工程,涉及生物、半导体、计算机、化学、光学等多个领域,需要不同学科顶尖力量的合作。目前(指2009年)国际上对第三代基因测序仪的争夺十分激烈,美国宣称要在2012年推出成熟的第三代基因测序仪,日本和欧洲也有相关的研发计划。中科院北京基因组研究所是国内权威的基因组学研究机构,而浪

基因测序技术进化史

  DNA上承载了关于我们的太多信息:发展史、祖先、特征、疾病易感性、甚至性格和命运。因此很多人迫不及待地想将DNA看得一清二楚。解码人类基因组的第一次郑重尝试是始于1990年的人类基因组计划。尽管合作和艰苦工作无疑扮演了重要角色,但一系列工程上的突破推动了这个项目,以前所未有的速率收集并核对数据。

分析比产生更快?中国“智”造全基因组组装算法

  10年前,Illumina基因组测序技术进入市场时,前所未有的庞大数据量淘汰了较早开发的测序分析工具。  历史总是重演。如今,第三代测序技术已经达到低成本群体测序规模的临界点。  12月10日,《自然—方法学》在线发表了第一个能够跟上基因组测序产生速度的组装算法。  论文作者、中国农业科学院农业

《自然—方法学》发表媲美基因组测序速度的组装算法。

  10年前,Illumina基因组测序技术进入市场时,前所未有的庞大数据量淘汰了较早开发的测序分析工具。  历史总是重演。如今,第三代测序技术已经达到低成本群体测序规模的临界点。  12月10日,《自然—方法学》在线发表了第一个能够跟上基因组测序产生速度的组装算法。  论文作者、中国农业科学院农业

第三代皮肤测试仪的简介

  计算机的出现大大推进了社会的发展,也使皮肤测试仪进入了智能的时代,使更多的人可以方便的掌握皮肤诊察的应用。这一代技术的出现,大大改写了皮肤测试的历史,产品也越来越丰富,涵盖了小型数字化的测试仪,USB接口的便携式智能测试仪,台式专用电脑皮肤测试仪etude综合咨询指导系统,NAUplus智能化测

第三代基因测序仪研发成功

  在国家重点研发计划“蛋白质机器与生命过程调控”重点专项以及深圳市孔雀团队的支持下,南方科技大学贺建奎教授的团队经过刻苦攻关,成功研发出具有完全自主知识产权的亚洲第一台第三代基因测序仪GenoCare并批量投产。  基因测序仪是基因行业上游的核心。我国的基因测序仪基本依靠进口,每年向欧洲、美国支付

第三代测序首次成功诊断罕见病

  目前临床上主要利用短读长测序(SRS)来进行基因组学分析,比如二代测序。SRS的主要特点是通量高、准确基数高以及成本低,但它无法解决高度杂合的基因组、高度重复序列、高GC区域、拷贝数变异、大的结构变异等问题。相比而言,长度长测序(LRS)有着与之互补的优势,在临床上可以检测到SRS遗漏的遗传变异

我国将研发第三代气象卫星

  12月5日至7日,中国气象局和中国航天科技集团公司在京联合召开我国风云卫星发展研讨会,通过征集用户需求,了解卫星及载荷预期发展目标,初步形成了我国第三代气象卫星的发展框架与思路。   我国风云系列气象卫星历经40年发展,共成功发射11颗气象卫星,现有6颗卫星在轨稳定运行,实现了业务化、系列化的

美国海军研发第三代生物燃料

   据美国海军网站报道,在近期的“替代燃料概况”简报会上,美国海军宣布将进一步研发第三代生物燃料,并计划在2016年举行的“环太平洋-2016”军事演习中为50%的舰艇和飞机配备使用,这一计划将标志着美海军替代生物燃料应用的新开端。  生物燃料的研制是美国海军“绿色大舰队(Great Green

我国将研发第三代基因测序仪

  几十分钟将可完成一个人的完整基因组测序,测试成本仅为当前的1%   为加速我国基因科学研究的进程,12月3日,中科院北京基因组所与浪潮成立“中科院北京基因组研究所—浪潮基因组科学联合实验室”仪式在京举行。该实验室将研发国产第三代基因测序仪,第一台样机预计2013年问世。这不仅将填补我国在基因测

英研发出第三代基因测序技术

  巧用纳米孔单分子读取法   基于纳米孔的单分子读取技术,英国牛津纳米孔公司成功研发出第三代基因测序技术。该测序技术读取数据更快、有望大大降低测序成本,改变个人医疗的前景。   当前,基因测序工作费时且昂贵,测序时,分子必须进行多次复制(这一步被称为扩增),同时进行荧光示踪标记,这一过程会带来

第三代杂交水稻育种技术通过验收

  中国工程院院士袁隆平团队最新研发的第三代杂交水稻育种技术,28日通过“身份验证”。湖南省农学会组织的验收专家一致认为,这是理想的杂种优势利用方式,它的应用推广,有利于水稻杂种优势利用的进一步普及,有望为全球水稻种植带来新“福利”。  当下,我国杂交水稻育种“主流”为国家杂交水稻工程技术研究中心袁

第三代半导体产研院成立

   本报南京10月19日电 (记者王伟健)如何让半导体器件更小、耐受更高电压、具备更低导通电阻和更快的开关速度?以氮化镓(GaN)为主的第三代半导体将成为发展方向。日前,江苏华功第三代半导体产业技术研究院成立,致力于第三代半导体技术的产业化。   硅半导体材料和器件在材料质量、器件设计、工艺优化等