Antpedia LOGO WIKI资讯

蛋白质磷酸化位点怎么确定

鉴定了磷酸化肽后,还要进一步确定磷酸化肽中修饰了磷酸化位点的哪个残基.用于确定磷酸化肽中磷酸化位点的质谱方法基于两种不同原理,第一种方法取决于磷酸酯键的化学稳定性,如在ESI质谱仪的碰撞室或离子源中,或在MALDI-MS的PSD过程中.磷酸化肽可通过磷酸酯键断裂产生的碎片离子鉴定.第二种方法基于肽段增加的磷酸酯基团的质量数.假如蛋白是已知的,可通过质量数来确定肽段.在某些情况下,肽段只含有一个丝氨酸、苏氨酸或酪氨酸残基,则很轻易找到磷酸化位点,但在大多数情况下肽段含有很多个丝氨酸、苏氨酸或酪氨酸残基,则确定磷酸化位点发生困难.......阅读全文

磷酸化位点分析实验-磷酸肽的分离

            实验方法原理 磷酸化分析的原理研究的最常见的磷酸化类型是丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸的磷酸酯化。已知发生的磷酸化还有精氨酸、组氨酸和赖氨酸的亚酰胺化,以及天冬氨酸和谷氨酸的酰化。这些修饰中

磷酸化位点分析实验-磷酸肽的分离

实验方法原理磷酸化分析的原理研究的最常见的磷酸化类型是丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸的磷酸酯化。已知发生的磷酸化还有精氨酸、组氨酸和赖氨酸的亚酰胺化,以及天冬氨酸和谷氨酸的酰化。这些修饰中的其中一些是化学不稳定的,通常观察不到,除非采取特殊的保护措施防止他们在蛋内质分离过程中消失。举例来说,组氨酸磷酸化是一

生物质谱技术在蛋白质组学中的应用

  一、 前言[1,2]   基因工程已令人难以置信的扩展了我们关于有机体DNA序列的认识。但是仍有许多新识别的基因的功能还不知道,也不知道基因产物是如何相互作用从而产生活的有机体的。功能基因组试图通过大规模实验方法来回答这些问题。但由于仅从DNA序列尚不能回答某基因的表达时间、表达量

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验

翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验             实验步骤

综述 |AD的蛋白质组学格局--发病机制和生物标志物新见解

  导 读  基于质谱的蛋白质组学使得对阿尔茨海默症(AD)的蛋白质组和蛋白质翻译后修饰(PTM)的深入剖析成为可能。在这里,我们回顾了AD蛋白质组学研究的历史和近期的进展以及局限。作为遗传图谱的补充,蛋白质组学研究不仅验证了典型的淀粉样蛋白和tau通路,而且还发现了蛋白质网络中的新组成部分,如RN

磷酸化位点分析实验-磷酸肽的质谱分析

实验方法原理用于确定磷酸肽中磷酸化位点的压谱方法有两种不同的基本原理。第一种方法依赖于在质谱仪条件下,如在 ESI 质谱仪的碰撞室或离子源中,或MALDI-MS 的 PSD 过程中,磷酸酯键的化学稳定性。因此,磷酸肽可通过磷酸酯键断裂产生的诊断离子鉴定。第二种方式依靠检测磷酸酯基团使肽段增加的质量数

磷酸化位点分析实验-磷酸化位点的确定

实验方法原理 磷酸化位点的确定也使用一些通用方法;磷酸化蛋白质被纯化,如果可能蛋白质要均一;磷蛋白被特异性的化学或酶反应切断、产生肽混合物,其中含有一到两个磷酸肽不同之处在干其分离磷酸肽的策略是为了确定氨基酸序列,定位肽段内磷酸化的残基。上面所述的分离方法, 2D-PP 作图、 HPLC 或 l

磷酸化多肽及其修饰方法

  蛋白质磷酸化是生物界最普遍,也是最重要的一种蛋白质翻译后修饰,20世纪50年代以来一直被生物学家看作是一种动态的生物调节过程。在细胞中,大概有1/3的的蛋白质被认为是通过磷酸化修饰的。蛋白质的磷酸化修饰与多种生物学过程密切相关,如DNA损伤修复、转录调节、信号传导、细胞凋亡的调节等。磷酸化蛋白质

磷酸化多肽及其修饰方法

  蛋白质磷酸化是生物界最普遍,也是最重要的一种蛋白质翻译后修饰,20世纪50年代以来一直被生物学家看作是一种动态的生物调节过程。在细胞中,大概有1/3的的蛋白质被认为是通过磷酸化修饰的。蛋白质的磷酸化修饰与多种生物学过程密切相关,如DNA损伤修复、转录调节、信号传导、细胞凋亡的调节等。磷酸化蛋白质

磷酸化位点分析实验-磷酸化位点的确定

磷酸肽的化学测序 磷酸肽的质谱分析 源后衰变 用酶和化学方法去磷酸化             实

磷酸化位点分析实验_磷酸肽的化学测序

实验方法原理磷酸化位点的确定也使用一些通用方法;磷酸化蛋白质被纯化,如果可能蛋白质要均一;磷蛋白被特异性的化学或酶反应切断、产生肽混合物,其中含有一到两个磷酸肽不同之处在干其分离磷酸肽的策略是为了确定氨基酸序列,定位肽段内磷酸化的残基。上面所述的分离方法, 2D-PP 作图、 HPLC 或 lMAC

磷酸化位点分析实验_磷酸肽的化学测序

实验方法原理磷酸化位点的确定也使用一些通用方法;磷酸化蛋白质被纯化,如果可能蛋白质要均一;磷蛋白被特异性的化学或酶反应切断、产生肽混合物,其中含有一到两个磷酸肽不同之处在干其分离磷酸肽的策略是为了确定氨基酸序列,定位肽段内磷酸化的残基。上面所述的分离方法, 2D-PP 作图、 HPLC 或 lMAC

多肽磷酸化修饰及检测方法

磷酸化影响着细胞生命的方方面面。在细胞中,大概有1/3的的蛋白质被认为是通过磷酸化修饰的。蛋白质的磷酸化修饰与多种生物学过程密切相关,如DNA损伤修复、转录调节、信号传导、细胞凋亡的调节等。磷酸化蛋白质及多肽的研究可以帮助人们阐述上述过程的机理,进一步认识生命活动的本质。肽谷生物依据自身原料优势和技

Cell重要成果:绘制凋亡蛋白质组图谱

  斯克里普斯研究所的科学家们同时绘制出了细胞中两种最重要的蛋白质修饰类型的图谱,揭示了在凋亡这一重要细胞过程中它们之间广泛的协同作用。相关论文发表在7月20日的《细胞》(Cell)杂志上。   磷酸化(Phosphorylation)和蛋白质水解(proteolysis)几乎总是被独立开展研究。

磷酸化多肽及其修饰方法

蛋白质磷酸化是生物界最普遍,也是最重要的一种蛋白质翻译后修饰,20世纪50年代以来一直被生物学家看作是一种动态的生物调节过程。在细胞中,大概有1/3的的蛋白质被认为是通过磷酸化修饰的。蛋白质的磷酸化修饰与多种生物学过程密切相关,如DNA损伤修复、转录调节、信号传导、细胞凋亡的调节等。磷酸化蛋白质及多

Cell子刊 蛋白质组标杆大牛揭示糖尿病新机制还得从这类

  关键词:磷酸化蛋白质组、蛋白质组、II型糖尿病、胰岛β细胞   原文:   Phosphoproteomics Reveals the GSK3-PDX1 Axis as a Key Pathogenic Signaling Node in Diabetic Islets   原文链接:

蛋白质组标杆大牛揭示糖尿病新机制还得从这类修饰入手

  原文:   Phosphoproteomics Reveals the GSK3-PDX1 Axis as a Key Pathogenic Signaling Node in Diabetic Islets   原文链接:   https://doi.org/10.1016/j.cmet

2011年北京质谱年会隆重召开

  2012年3月30-31日,北京理化分析测试技术学会北京质谱学会举办的“2011年度北京质谱年会”在北京外研社国际会议中心隆重召开。来自科研院所、检测机构、仪器厂商等五百余位质谱界专家学者、实验室人员、技术工程师等参加了本次年会,共同探讨了质谱技

多磷酸化肽标记技术

蛋白质磷酸化是生物界最普遍,也是最重要的一种蛋白质翻译后修饰,20世纪50年代以来一直被生物学家看作是一种动态的生物调节过程。在细胞中,大概有1/3的的蛋白质被认为是通过磷酸化修饰的。蛋白质的磷酸化修饰与多种生物学过程密切相关,如DNA损伤修复、转录调节、信号传导、细胞凋亡的调节等。磷酸化蛋白质及多

2014全国有机质谱学术会议举办 新技术、新应用精彩纷呈

  2014年10月29日-11月2日全国有机质谱学术会议在江西景德镇市召开,本届会议由国家大型科学仪器中心主办、北京化工研究院分析研究室承办,会议坚持历届有机质谱学术会议注重学术交流,致力于促进我国有机质谱学科发展的方针。来自生物、食品、环境、石油化工及相关

磷酸化蛋白鉴定实验

实验材料测序级膜蛋白酶                                        

磷酸化蛋白鉴定实验

实验材料 测序级膜蛋白酶试剂、试剂盒 二硫苏糖醇碘代乙酰胺乙酸溶液甲酸乙酰氯仪器、耗材 螯合琼脂糖凝胶层析介质实验步骤 这里所述的方法概括为下列几个步骤:胰蛋白酶水解消化膜和可溶性组分中的蛋白质(见 24. 3.1 );固相金属螯合亲和层析(IMAC) 富集磷酸肽(见 24. 3. 2 );用串

磷酸化蛋白鉴定实验

实验材料测序级膜蛋白酶试剂、试剂盒二硫苏糖醇碘代乙酰胺乙酸溶液甲酸乙酰氯仪器、耗材螯合琼脂糖凝胶层析介质实验步骤这里所述的方法概括为下列几个步骤:胰蛋白酶水解消化膜和可溶性组分中的蛋白质(见 24. 3.1 );固相金属螯合亲和层析(IMAC) 富集磷酸肽(见 24. 3. 2 );用串联质谱对磷酸

第十二届全国分析化学年会大会报告集锦(一)

  2015年5月8日-11日,第十二届全国分析化学年会在美丽的武汉洪山大礼堂举办,本次会议由中国化学会和国家自然科学基金委主办、华中师范大学承办,会议每三年一次,旨在交流与探讨分析化学学科的新成就、新进展和新技术。本次会议吸引到分析化学领域的院士、专家、学者2000余人。  5

Nature最新揭秘:人为何会“想睡觉”?

  长时间的清醒会导致认知障碍,而睡眠能够通过分子生物化学的改变来“刷新”大脑,这些变化影响着神经元的可塑性和大脑的功能。然而,多年来,“想睡觉”背后的分子基础一直没有被很好地理解。  目前关于睡眠-觉醒周期(sleep-wake cycle)的理论表明,觉醒编码记忆,而睡眠则巩固记忆并修复突触内稳

磷酸化位点分析实验-确定磷酸化氨基酸类型

            实验方法原理 实验材料 蛋白样品 实验步骤

磷酸化位点分析实验-确定磷酸化氨基酸类型

了解肽或蛋白质中磷酸化氨基酸的类型,可以限定可能的磷酸化位点,并因此简化(对多肽链中磷酸化残基的确认。磷酸化残基类型通常由磷酸氨基酸分析或磷酸氨基酸特异性免疫检测确定。磷酸氨基酸分析是对肽键进行气相或液相水解,此水解条件下要至少保留一段磷酸酯键完整。 32p标记的磷酸蛋白质或磷酸肽的水解产

磷酸化位点分析实验-确定磷酸化氨基酸类型

实验材料蛋白样品实验步骤了解肽或蛋白质中磷酸化氨基酸的类型,可以限定可能的磷酸化位点,并因此简化(对多肽链中磷酸化残基的确认。磷酸化残基类型通常由磷酸氨基酸分析或磷酸氨基酸特异性免疫检测确定。磷酸氨基酸分析是对肽键进行气相或液相水解,此水解条件下要至少保留一段磷酸酯键完整。 32p标记的磷

研究人员利用“机器学习”帮助鉴定磷酸化位点

  EMBL的欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)的研究人员创建了迄今为止最大的参考磷酸化蛋白质组,将近120000个人类磷酸化位点。为了识别最重要的成员,他们使用了一种机器学习方法,能够根据功能重要性对其进行排名。  蛋白质是细胞的核心分子机器,可以通过类似于分子开关的蛋白质修饰来调节。磷酸化

蛋白磷酸化检测的注意事项

1、样本准备过程中防止蛋白质降解和保留翻译后修饰     样本准备过程中,细胞会释放蛋白酶和/或去磷酸化酶,为了减少这些酶的活性,处理样本的过程应在冰上进行,并预先冷却所有缓冲液,并且建议用含蛋白酶和磷酸酶抑制剂的裂解缓冲液。2、磷酸化特异性抗体的选择  &n