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菌落pcr步骤

一、引言常规的PCR扩增需要进行细菌培养、质粒制备等多步操作后才能进行基因扩增,操作繁琐耗时较长,同时在反复的操作中DNA量损失也较大,产率较低。在1989年 Gussow Clackson3建立了菌落PCR( colony PCR)法,菌落PR与我们通常的普通DNA的PCR的不同在于,直接以单个菌作为模板。是一种可以快速鉴定菌落是否为含目的质粒的阳性菌落,操作简单,快速,在转化鉴定中较常用。二、原理常规的PCR需要专门制备DNA模板,面菌落PCR可直接以单个菌落作为模板,用无菌牙挑取单个菌落到TE级冲液中,煮沸10mn,涡旋振荡后短暂离心,用1-2pl裂解液作为DNA模板,省去抽提模板DNA这一步,通过特异性引物或通用引物对目的基因进行快速扩增大大节约了时间和成本三、材料1.固体平板培养基上培养出的单菌落②10XPCR缓冲液(100mmol/ L. Tris-HCL, pH8.3,500 mmol/L KCL;0.1%明胶;1......阅读全文

菌落PCR实验

菌落PCR标签: 菌落 PCR菌落PCR(Colony PCR)可不必提取基因组DNA,不必酶切鉴定,而是直接以菌体热解后暴露的DNA为模板进行PCR扩增,省时少力。建议使用载体上的通用引物。通常利用此方法进行重组体的筛选或者DNA测序分析。最后的PCR产物大小是载体通用引物之间的插入片断大小。

菌落pcr会出现假阳性结果吗

最近做酶切连接转化,最后做鉴定时,以菌落为模板进行PCR时可以见到有目的条带;当把菌落接种到LB液扩菌后,以菌液为模板进行PCR时却什么东东都没有?请问会是什么原因啊?多多指教啊!建议重新以菌落为模板进行PCR检测,再重新以菌液为模板进行PCR检测,因为菌落或者菌液PCR假阳性的几率还是比较高的。但

阳性重组克隆的构建和筛选

实验概要构建并筛选含有目的基因的候选阳性重组克隆。有助于理解目的基因与克隆载体的连接、转化和筛选原理及流程。实验原理1. 连接反应:利用经过限制性内切酶消化的线形载体与目的基因两端暴露出的平末端或相同的粘性末端,使用T4 DNA 聚合酶将二者连接起来形成重组载体。2. 转化过程:感受态细胞通过温度敏

利用PCR分析酵母菌落

利用PCR分析酵母菌落             实验方法原理 用 PCR 分析酵母菌落时,无需纯化 DNA。本方案以单个酵

利用PCR分析酵母菌落

利用PCR分析酵母菌落主要用于确定酵母中是否携带目的DNA序列。实验方法原理用 PCR 分析酵母菌落时,无需纯化 DNA。本方案以单个酵母菌落的粗裂解液作为 PCR 扩增的模板,来确定酵母中是否携带目的 DNA 序列。 实验材料Taq DNA 聚合酶寡核苷酸引物DNA 标准参照物YAC 重

分子克隆-蛋白表达实验指南(五)

8. TA质粒转化菌落的验证  与表达载体的验证不同,转化TA质粒时不用双酶切验证。只需用目的基因引物和TA载体引物PCR验证即可。TA载体引物PCR片段比插入片段大约长150bp。  目的基因退火温度与之前胶回收时温度相同,TA退火温度60C即可,但可在55~70之间变动,不会

什么是菌落pcr假阳性

利用菌落作为模板进行PCR扩增,验证该菌落里是否带有目标片段。但是由于PCR是一个级联放大的过程,所以即使菌落中不含有目标片段,而是菌落表面沾有一部分之前连接,转化中用的目标DNA,也会导致PCR获得扩增条带,从而误认为这个菌落已经带有了目标片段,称之为假阳性。可以通过提质粒酶切,或者测序验证,排除

菌落PCR

菌落PCR可用于:(1)重组体的筛选;(2)重组体DNA测序分析。实验方法原理直接挑取菌落进行PCR,PCR的95℃加热可以破胞,释放基因组DNA或质粒,成为PCR体系的模板,然后进行链式扩增。实验材料菌落样品试剂、试剂盒dNTPPCR混合液仪器、耗材PCR仪实验步骤1.  PCR混合液的

关于PCR你了解多少?

  实验原理  PCR是体外人工选择性扩增DNA的一种方法,它类似于生物体内DNA的复制。在生物体内DNA复制需要模板、引物、DNA聚合酶、DNA解旋酶、 dNTPs;而体外PCR反应同样需要类似的成分,有模板、引物、PCR Buffer、Taq酶、dNTPs。其中引物是人工设计的特定序列,实现对特

菌落PCR

            实验方法原理 直接挑取菌落进行PCR,PCR的95℃加热可以破胞,释放基因组DNA或质粒,成为PCR体系的模板,然后进行链式扩增。

利用PCR分析酵母菌落

实验方法原理 用 PCR 分析酵母菌落时,无需纯化 DNA。本方案以单个酵母菌落的粗裂解液作为 PCR 扩增的模板,来确定 YAC 中是否携带目的 DNA 序列。实验材料 Taq DNA 聚合酶寡核苷酸引物DNA 标准参照物YAC 重组子的酵母菌株试剂、试剂盒 PCR 缓冲液dNTP 溶液仪器、耗材

菌落PCR

实验方法原理 直接挑取菌落进行PCR,PCR的95℃加热可以破胞,释放基因组DNA或质粒,成为PCR体系的模板,然后进行链式扩增。实验材料 基因样品试剂、试剂盒 dNTPPCR混合液仪器、耗材 PCR仪实验步骤 1.  PCR混合液的制备(1)Taq buffer(10×) 180 ul(

BioXp™3200基因打印机系统在抗击COVID-19新冠的运用

鉴于COVID-2019造成的全球医疗紧急情况,加快创新步伐和开发工具来应对COVID-19的传播至关重要。科学界正在发挥其最大的创造力,以识别和推进预防,检测和治疗的解决方案。BioXp™3200系统是使全球研究人员能够快速合成SARS-CoV-2基因组部分的理想平台,使它们易于用于开发疫苗,诊断

菌液PCR的经验

此方法可能很多师兄师姐们都在用,只是当时的确没有找到相关的详细说明,学弟再次把自己摸索出来的一点心得写出来,高手就多多指正,没做过的就相互学习下,见笑)由于课题组所需,我需要构建数量可观的真核表达载体和融合载体起初我也查到相关菌落PCR 的文献 ,和导师商量,导师一口回绝了他的理由和我所搜

载体构建实验常见问题大解析

大家是否在实验中经常遇到载体构建的各种问题,浪费大量的时间和精力,各种各样的问题让人头疼,海创科业小编作为科研老司机特意为各位科研君整理了载体构建实验常见问题及解决方法,希望能够帮助到大家。1.       PCR载体构建大部分时候都要通过PCR的方法获取目的片段,扩增

cDNA文库组标准流程-7

2.检测:(PCR方法)取适量PCR薄壁管,置于冰上,按以下体系依次加入:各试剂均加好后,离心机上甩一下,使之沉底,置于PCR仪上待 PCR反应进入4℃后,取下PCR薄壁管,取7ulPCR产物加入3ul溴芬兰跑电泳,同时上1Kb DNA ladder半小时后照相,观察胶图:insert、vector

基因置换实验——构建融合蛋白

实验材料菌株BY4741质粒PDB118试剂、试剂盒磷酸盐缓冲液仪器、耗材YPD 平板YPD 液体培养基血球计数板SC-his平板实验步骤YPD 平板 第 1 天将菌株 7-3 在 YPD 平板上划单克隆,30°C 下培养两天。第 3 天挑取单克隆,在 5 mlYPD 液体培养基中培养,30°C 过

菌落 PCR 分析克隆的重组体实验

            实验方法原理 菌落PCR(Colony PCR)可不必提取基因组DNA,不必酶切鉴定,而是直接以菌体热解后暴露的DNA为模板进行PCR扩增,省时少力。使用载体上的通用引物,进行重

TA克隆常见问题分析

现象可能原因解决方案 转化后无菌落生长 感受态细胞已经失效用pUC18质粒进行转化,确认细胞的感受态效率。1ng pUC18质粒至少应得到1000个以上的转化子。如有问题,重新制备感受态细胞。 平板所用抗性不对pBS-T载体为amp抗性,工作浓度 100 ug/ml 连接中使用了不恰当的vector

克隆在原核载体的DNA片段的快速鉴定

已转化的重组载体的细菌细胞或 λ 噬菌体颗粒可通过直接从培养皿上挑取菌落或噬菌斑获得,然后直接加入到 PCR 混合液中,这时 PCR 混合液中含有除了未加热稳定 DNA 聚合酶外的所有试剂,其中引物与所要鉴定的已克隆 DNA 片段的侧翼序列互补。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方

克隆的筛选和快速鉴定

实验概要掌握快速细胞破碎法测定大小不等的众多的质粒DNA;和菌落PCR快速鉴定克隆。实验原理在这个实验方法中,只需配制一种细胞缓冲液(它可以在室温下保存,长期使用)。利用破碎细胞缓冲液中的阴离子去污剂---SDS在37℃溶解膜蛋白,使细胞破裂,并解聚核蛋白,SDS还能与蛋白质结合形成复合物,使得蛋白

Northern 印迹分析实验

            试剂、试剂盒 琼脂糖凝胶 菌落裂解缓冲液 蒸馏水 甲醛 甲酰胺预杂交 杂交液 Ho

Northern 印迹分析实验

试剂、试剂盒 琼脂糖凝胶菌落裂解缓冲液蒸馏水甲醛甲酰胺预杂交 杂交液HotPrime cDNA Labeling Kit矿物油MOPS 缓冲液MOPS乙酸钠EDTAPCR 缓冲液SSCNaClSDSNaClNaH2PO4[a-32P]dATPLgh Rgh 引物鲑鱼精 DNATaq DNA

Northern 印迹分析实验

为了确认所选择 cDNA 确实是差异表达的,建议使用 Northern 印迹分析,而不要用其他的确认技术,比如反向 Northern 杂交(Zhangetal.1996) 或定量 RT-PCR。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒琼脂糖凝胶菌落裂解缓冲液蒸馏水甲

利用血清筛选噬菌体文库PCR扩增的模板

  [器材和试剂]    ●MicroAmp反应管(PerkinElmer)    ●洗脱缓冲液(20mmol/LTris—ClpH8.5,2mmol/LEDTA,1%TritonX—100)    ●GeneAmp9600PCR仪(PerkinElmer)    ●正向引物:5’—AGAGATTA

酵母菌落PCR方法

问:很郁闷,zui近在做电转毕赤酵母,但是转化完了没有合适的筛选方法,如果提基因组的话费时费钱,而且由于我这个电转的几率十分低,也就有1%-10%,所以想用菌落PCR方法筛选,但酵母菌破壁很困难,如果处理不好的话基因组释放不出来,就没有阳性结果了。查了一些资料说用反复冻融法,是不是直接挑单菌落就行了

毕赤酵母表达(pichia pastoris expression )实验手册(5)

3.5 Pichia酵母表达直接PCR鉴定重组子的方法3.5.1 模板的处理:1. 平板上的菌落长到肉眼可见时(约12小时);2. 将除了模板之外的其它PCR反应液的组分准备好,并分装。引物最好使用Kit中已有的检测专用的引物,或者或者一条使用载体上的引物,一条使用基因的特异性引物(这样做可以鉴定非

克隆在原核载体的DNA片段的快速鉴定

            实验方法原理 已转化的重组载体的细菌细胞或 λ 噬菌体颗粒可通过直接从培养皿上挑取菌落或噬菌斑获得,然后直接加入到 PCR 混合液中,这时 PCR 混合液中含有除了未加热稳定 D

小鼠β-actin基因的克隆表达(2)

实验步骤:   (1)目的基因与表达载体的连接反应: ①表达载体和目的片段的酶切   管号 ① ② pGEX 4T-1

克隆在原核载体的DNA片段的快速鉴定

实验方法原理 已转化的重组载体的细菌细胞或 λ 噬菌体颗粒可通过直接从培养皿上挑取菌落或噬菌斑获得,然后直接加入到 PCR 混合液中,这时 PCR 混合液中含有除了未加热稳定 DNA 聚合酶外的所有试剂,其中引物与所要鉴定的已克隆 DNA 片段的侧翼序列互补。实验材料 热稳定 DNA 聚合酶正义和反