生物信息中心组学原始数据归档库数据汇交量突破10PB！
9月28日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心（CNCB-NGDC）组学原始数据归档库（Genome Sequence Archive，简称GSA）的用户汇交数据量突破10 PB（1 PB=1024 TB）。 为存好、管好、用好我国生命组学大数据，解决国内重要数据资源流失和生命组学数据孤岛等问题，提高数据共享率和利用率，北京基因组所于2015年10月建立了国内首个组学原始数据汇交、存储、管理与共享系统GSA，为国家重点研发计划、国家自然科学基金、中科院战略先导专项等国家重大、重点研究计划及任务的科学数据安全管理和归档共享提供了重要支撑。 GSA自上线以来，持续为全球生命科学研究人员提供数据汇交和共享服务，尤其为我国科研人员提供了极大便利。截止2021年9月28日，GSA数据库体系已接收国内外437家研究机构1829名用户的数据递交，支撑科研人员在250种期刊发表研究论文760余篇，为全球......阅读全文
Transformation－of－E.－coli－by－Electroporation
实验概要 Electrocompetent bacteria are prepared by growing cultures to mid-log phase, washing the bacteria extensively at low temperature, and
基因组构的定义
中文名称基因组构英文名称gene organization定 义(1)单个基因的组成结构。一般包含启动子、增强子、非翻译序列、编码序列等。真核生物和原核生物的一个显著区别是前者具有内含子。(2)广义指一个完整的生物个体内基因的组织排列方式。原核和真核生物的一个显著区别是原核生物的结构基因成串分布，
基因组文库法
基因组文库法一）基因组DNA分离、纯化和加工[Mbo I酶检测]1．准备1.5ml小试管4个；每管内含有：基因组DNA（在TE或水中） 10.0μg10×Mbo I缓冲液 2.5μlH2O
基因组印记
这是根据我写的一个PPT摘录的，希望能有朋友讨论这方面的问题。并拓宽这个领域，讨论epigenetics更广泛的问题。毕竟epigenetics是现在动物功能基因组研究的主流和一个重要方向。1. 印迹基因的概念及重要意义概念:基因组印迹是特指来源于亲本的等位基因进行不对称后成修饰后而导致的单等位基因
基因组构的定义
中文名称基因组构英文名称gene organization定 义(1)单个基因的组成结构。一般包含启动子、增强子、非翻译序列、编码序列等。真核生物和原核生物的一个显著区别是前者具有内含子。(2)广义指一个完整的生物个体内基因的组织排列方式。原核和真核生物的一个显著区别是原核生物的结构基因成串分布,
烟草基因组计划
生物技术和生命科学将成为21世纪引发新科技革命的重要推动力量。实施基因组计划可以获得一批具有自主知识产权的烟草重要性状功能基因，全面揭示种质资源的遗传背景，确立我国在烟草基因组研究上的核心优势，对提升烟草育种工作整体水平、实现烟草品种的根本性突破、培育烟草新兴产业、更好地发挥烟草模式作物的基础研究作
基因组的定义
在分子生物学和遗传学领域，基因组是指生物体所有遗传物质的总和。这些遗传物质包括DNA或RNA（病毒RNA）。基因组包括编码DNA和非编码DNA、线粒体DNA和叶绿体DNA。研究基因组的科学称为基因组学。
基因组的分类
病毒基因组病毒基因组可以由RNA或DNA组成。 RNA病毒的基因组包含单链或双链RNA，也包含一种或多种单独的RNA分子。 DNA病毒基因组可以是单链或双链DNA。大多数DNA病毒基因组由单个线性DNA分子组成，但有些由DNA病毒基因组由环状DNA分子组成 。原核基因组原核生物和真核生物基因组由D
任意波形发生器Keysight－M8195A共享应用
仪器名称：任意波形发生器-Keysight M8195A仪器编号：22025212产地：马来西亚生产厂家：Keysight Technologies型号：M8195A出厂日期：购置日期：2022-11-17所属单位：集成电路学院>微纳加工平台>高精尖放置地点：荷清大厦A座一层实验室固定电话：010-
大量培养物中分离－BAC－DNA
BAC 重组子的精细分析，包括详细的限制酶切图谱、DNA 测序或亚克隆，所需 DNA 量都超过小量制备所能提供的量。本方案的制备流程适用于重组 BAC 的大规模培养物。500 ml BAC 转化菌的平均产量为 20~25 μg BAC DNA。还可用柱层析对 DNA 产物进一步纯化。本实验来源「分子
移动基因组增加弧菌基因组可塑性的机制
移动基因组增加微生物物种多样性的示意图。研究团队 供图 6月27日，中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室研究员王晓雪团队通过研究珊瑚体内具有生态竞争的假交替单胞菌和弧菌之间的互作，揭示了一种移动基因组增加弧菌基因组可塑性，驱动弧菌遗传和表型多样化的机制。相关研究在线发表
基因组所人类基因组突变研究获进展
序列变异的周期性和与TCR相关联的突变 基因突变会导致人类疾病的产生，因此研究遗传变异的产生过程和那些能够引起疾病的突变对生命科学基础研究以及人类健康是十分关键和重要的。 近日，中国科学院北京基因组研究所于军研究员带领其研究团队，在有关人类基因组中以转录为中心的突变研究方面取得新进展
OPGEN全基因组图谱应用系列——鞭虫全基因组测序
鞭虫是一种常见的土壤传播寄生虫，地理分布广，感染率高，寄生于人体盲肠，导致人体慢性感染，对人类危害巨大。鞭虫的全基因组测序研究由著名的桑格研究院（Wellcome Trust Sanger Institute）完成，发表在世界顶级期刊《Nature Genetics》上。该研究通过对2种不同
最大动物基因组图谱——南极磷虾基因组图谱破译
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495141.shtm ? Cell官网截图。黄海水产研究所供图 日前，由中国水产科学研究院黄海水产研究所联合青岛华大基因研究院、德国阿尔弗雷德?魏格纳研究所、澳大利亚联邦科学
将基因组存进银行－迎接真正的基因组时代
你知道在你身上什么东西比钱更有价值，并且还是唯一的吗？答案是：你的基因组。就像你的钱一样，你的基因组也应该被尽可能安全的存储起来。而那些负责存储你基因组的机构应该对如何存储、使用以及分享它进行监管。 随着医学科学的进步，人们能够控制和管理他们的个人基因组将变得越来越重要。为
从大规模裂解物中制备λ噬菌体颗粒实验
实验方法原理 从大规模培养物中制备的 λ 噬菌体，可在高盐存在下用聚乙二酵 ( PEG ) 沉淀的办法从裂解物中回收得到。残余的细胞碎片和 PEG 可用氯仿抽提。在进一步纯化之前，建议测定噬菌体制备物的得率。实验材料 大肠杆菌培养物试剂、试剂盒 氯仿NaCl聚乙二醇SM胰 DNaseⅠ仪器、耗材 S
从大规模裂解物中制备λ噬菌体颗粒实验
实验方法原理 从大规模培养物中制备的 λ 噬菌体，可在高盐存在下用聚乙二酵 ( PEG ) 沉淀的办法从裂解物中回收得到。残余的细胞碎片和 PEG 可用氯仿抽提。在进一步纯化之前，建议测定噬菌体制备物的得率。
“拼命三郎”鲍一明和他的“最美”团队
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510198.shtm在中国科学院北京基因组研究所（以下简称北京基因组所）一楼的机房里，伴随着大型计算机运转的嗡鸣声，各种大大小小的红绿色指示灯不停地闪烁着。这里承载着两块沉甸甸的“国字头”招牌——国家生
关于脯氨酸的体内代谢介绍
在谷氨酰激酶(γ -GK)的作用下谷氨酸生成谷氨酰磷酸(γ-GP)，而后在谷氨酸一半醛脱氢酶(GSADH)的作用下生成谷氨酸一半醛(GSA)，GSA自发环化为吡咯琳-5-羧酸(P5C)，在吡咯琳-5-羧酸还原酶(P5CR)的作用下还原为脯氨酸。 脯氨酸在植物体内的降解基本上是合成过程的逆过程，
脯氨酸的代谢过程
在谷氨酰激酶(γ- GK)的作用下谷氨酸生成谷氨酰磷酸(γ-GP)，而后在谷氨酸一半醛脱氢酶(GSADH)的作用下生成谷氨酸一半醛(GSA)，GSA自发环化为吡咯琳-5-羧酸(P5C)，在吡咯琳-5-羧酸还原酶(P5CR)的作用下还原为脯氨酸。脯氨酸在植物体内的降解基本上是合成过程的逆过程，这一过程
脯氨酸的体内代谢介绍
在谷氨酰激酶(γ- GK)的作用下谷氨酸生成谷氨酰磷酸(γ-GP)，而后在谷氨酸一半醛脱氢酶(GSADH)的作用下生成谷氨酸一半醛(GSA)，GSA自发环化为吡咯琳-5-羧酸(P5C)，在吡咯琳-5-羧酸还原酶(P5CR)的作用下还原为脯氨酸。脯氨酸在植物体内的降解基本上是合成过程的逆过程，这一过程
脯氨酸体内代谢的基本介绍
在谷氨酰激酶(γ -GK)的作用下谷氨酸生成谷氨酰磷酸(γ-GP)，而后在谷氨酸一半醛脱氢酶(GSADH)的作用下生成谷氨酸一半醛(GSA)，GSA自发环化为吡咯琳-5-羧酸(P5C)，在吡咯琳-5-羧酸还原酶(P5CR)的作用下还原为脯氨酸。 脯氨酸在植物体内的降解基本上是合成过程的逆过程，
脯氨酸的体内代谢途径
在谷氨酰激酶(γ- GK)的作用下谷氨酸生成谷氨酰磷酸(γ-GP)，而后在谷氨酸一半醛脱氢酶(GSADH)的作用下生成谷氨酸一半醛(GSA)，GSA自发环化为吡咯琳-5-羧酸(P5C)，在吡咯琳-5-羧酸还原酶(P5CR)的作用下还原为脯氨酸。脯氨酸在植物体内的降解基本上是合成过程的逆过程，这一过程
中国BIGD跻身国际生物组学数据库
测序技术的发展将生命科学领域带入组学时代，海量的数据产出成为常态。组学是将基因、蛋白及代谢物等生物分子以整体为单位进行系统性的研究，基因组学、蛋白质组学和代谢物组学等相应产生。相较于此前以个体为单位的研究，组学最主要的特征就是大数据。随着组学数据的产出，搭建组学数据库，实现海量信息的存储、整合及
制备肌动蛋白实验——从肌肉制备丙酮粉用于纯化肌动蛋白
实验材料肌球蛋白试剂、试剂盒肌球蛋白抽提溶液仪器、耗材离心机实验步骤1. 抽提肌球蛋白时得到的沉淀物用 3 倍于沉淀物体积的肌球蛋白抽提溶液抽提 10 分钟。肌球蛋白抽提溶液：0.5 mol/L KCl0.1 mol/L K2HPO42. 抽提物离心（GSA 转头，13000 r/min，17310
制备肌动蛋白实验
实验材料 肌球蛋白试剂、试剂盒 肌球蛋白抽提溶液仪器、耗材 离心机实验步骤 1. 抽提肌球蛋白时得到的沉淀物用 3 倍于沉淀物体积的肌球蛋白抽提溶液抽提 10 分钟。肌球蛋白抽提溶液：0.5 mol/L KCl0.1 mol/L K2HPO42. 抽提物离心（GSA 转头，13000 r/min，1
“拼命三郎”鲍一明和他的“最美”团队
在中国科学院北京基因组研究所（以下简称北京基因组所）一楼的机房里，伴随着大型计算机运转的嗡鸣声，各种大大小小的红绿色指示灯不停地闪烁着。 这里承载着两块沉甸甸的“国字头”招牌——国家生物信息中心和国家基因组科学数据中心（NGDC）。 建成国际一流生物信息中心，曾是我国几代生命科学研究者30年
宏基因组学技术测序木乃伊的肺结核基因组
来自华威大学的研究者使用宏基因组学技术发现215年之久的木乃伊的肺结核基因组。 由Mark Pallen带领的研究团队试图用技术来发现组织学标本中的肺结核的DNA。 宏基因组学是一种从样本中检测DNA序列的技术，并且样本不需要培养或扩增。这种方法避免了与细菌培养或DNA扩增
北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank－3.0
中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0，并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题，在线发表在Nucleic Acids Rese
基因组所肝癌全基因组合作研究取得新进展
近日，由中国科学院北京基因组研究所所长吴仲义及其科学团队与国立台湾大学医学院陈定信院士、陈培哲院士共同合作开展的“肝癌癌症基因组合作研究”计划获最新进展，相关学术论文在在最新出版的PNAS杂志上发表。 “肝癌癌症基因组合作研究”计划于2009启动，作为基因组所一项长期的癌症基因