首张肿瘤细胞蛋白质图谱绘就

日前绘制的首张癌症蛋白质相互作用图谱涵盖了以前被忽视的突变,而这些突变可能成为治疗的目标。 美国加州大学圣地亚哥分校的Trey Ideker和同事完成的这幅图谱,研究了几十种常见癌症蛋白质在乳腺癌和头颈癌中的相互作用。“癌症基因并不是单独起作用的。”Ideker说,“就像任何机器的部件一样,它们相互影响。” 该图谱对生物系统中蛋白质相互作用的所有不同方式进行了分类。在这种情况下,研究小组选择了两种癌症中61种常见的突变蛋白质,并确定了它们如何相互作用,及其与癌症肿瘤中数百种其他蛋白质的相互作用。 “我们正在寻找在癌症发生过程中面临变异压力的蛋白质群体。”Ideker说。 对于头颈部癌,研究小组发现了771种蛋白质相互作用,涉及大约650种蛋白质,其中84%的相互作用以前从未被报道过。如果这些相互作用对肿瘤生长至关重要,那么未来靶向和破坏它们的肿瘤药物可能会减缓癌症生长。 与此同时,从整体数据看,该团队发现了之......阅读全文

肿瘤标志物特殊蛋白质类标志

大多数实体瘤是由上皮细胞衍生而来,当肿瘤细胞快速分化、增值时,一些在正常组织中不表现的细胞类型或组分大量出现,如作为细胞支架的角蛋白,成为肿瘤标志。一、角蛋白(一)生物化学特性细胞角蛋白(Cytokeratin.CK)是细胞体间的中间丝,在正常及恶性的上皮细胞中起支架作用,支撑细胞及细胞核。肿瘤细胞

蛋白质组再揭肿瘤新靶点

继两周前,nature上发表了利用蛋白质组学发现胰腺癌治疗靶点和诊断标志物的突破性成果后(添加该文链接)。5月2日,又一篇卵巢癌新靶点的文章在nature上重磅发表!!还是那个蛋白质组,却是肿瘤领域又一重要新发现!!!肿瘤转移一直是困扰癌症治疗的一大问题。5月2日,来自芝加哥大学的Ernst Len

肿瘤标志物特殊蛋白质类标志

       大多数实体瘤是由上皮细胞衍生而来,当肿瘤细胞快速分化、增值时,一些在正常组织中不表现的细胞类型或组分大量出现,如作为细胞支架的角蛋白,成为肿瘤标志。       一、角蛋白       (一)生物化学特性       细胞角蛋白(Cytokeratin.CK)是细胞体间的中间丝,在正常

肽质量指纹图谱—MALDITOF-法鉴定蛋白质实验(二)

1. 目标样本沉积 1 ) 经典干燥液滴法( 1 ) 半饱和氰基-4-羟基肉桂酸(约 5 mg/ml) 的配制:将 α-氰基-4-羟基苯甲酸溶解在 300 μl 1 : 1 乙腈/ TFA 溶 液(超声 10 min) 。离心几秒钟得到上清液。取 200 μl 上清液加到微量离心管中,并加入相同

肽质量指纹图谱—MALDITOF-法鉴定蛋白质实验(一)

实验材料 测序级猪胰蛋白酶试剂、试剂盒 碳酸氢铵碳酸氢铵缓冲液乙腈 碳酸氢铵缓冲液消化缓冲液仪器、耗材 真空离心机烤箱实验步骤 许多凝胶染色方法适用于后续的 MALDI-TOF 肽质量指纹图谱(PMF ) 分析。在第 14 章已经比较讨论了一些染色方法的性能和兼容性。3.1 胶内消化凝胶消化方法改编

转录图谱的转录图谱的意义

在于它能有效地反应在正常或受控条件中表达的全基因的时空图。通过这张图可以了解某一基因在不同时间不同组织、不同水平的表达;也可以了解一种组织中不同时间、不同基因中不同水平的表达,还可以了解某一特定时间、不同组织中的不同基因不同水平的表达。人类基因组是一个国际合作项目:表征人类基因组,选择的模式生物的D

蛋白质芯片技术在肿瘤检测中的应用

【关键词】  蛋白质芯片;卵巢癌;前列腺癌;肿瘤;临床检验 蛋白质芯片技术在肿瘤研究领域中进展最快。随着肿瘤细胞的发生,肿瘤患者体内某些蛋白质会发生上调或下调,或产生新的与肿瘤关联的异常蛋白,而蛋白质芯片技术可以描绘出患者体液中所有蛋白质表达情况。根据正常与异常的蛋白质表达谱的差异,从而建立肿瘤的指

Cell:-中国学者首次发布大规模肿瘤单细胞水平免疫图谱

  2017 年 6 月 15 日,北京大学生命科学学院 BIOPIC 中心、北京未来基因诊断高精尖创新中心、北大  -清华生命科学联合中心张泽民研究组,首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大学第九临床医学院肝胆胰外科彭吉润研究组,及美国 AMGEN 公司的欧阳文君研究组在《Cell》杂志发表了题为

cell-张泽民团队首次发布大规模肿瘤单细胞水平免疫图谱

  2017年6月15日,北京大学生命科学学院 BIOPIC 中心、北京未来基因诊断高精尖创新中心、北大  -清华生命科学联合中心张泽民研究组,首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大学第九临床医学院肝胆胰外科彭吉润研究组,及美国 AMGEN 公司的欧阳文君研究组在《Cell》杂志发表了题为“Land

从三种检测对象,看液态活检助力反映肿瘤基因图谱

  约翰霍普金斯大学医学院的科研人员1月18日在《Science》上发表了一篇文章,报道了一种名叫“CancerSEEK”的癌症早期筛查新方法,只需要从检测对象体内抽取一管血,便可检测出8种癌症。  这一消息迅速“刷屏”,包括新浪医药在内的广大媒体纷纷转发。  首先得说,“CancerSEEK”作为

量子点多色成像显示临床组织样品的肿瘤异质性分子图谱

肿瘤异质性(Tumor heterogeneity)是肿瘤发生发展机制研究及肿瘤细胞根除治疗方法探寻所面临的巨大挑战。肿瘤异质性广泛存在于各种肿瘤(尤其是乳腺癌和前列腺癌具有高度异质性),但是检测和评估方法尚欠缺。目前的技术如RT-PCR, gene chips, protein chi

人类血浆蛋白质组遗传图谱公开-有助鉴定新的治疗靶点

  英国《自然》杂志6月6日发表了一项遗传学最新成果:剑桥大学研究团队量化了人体血浆中的3000多种蛋白质,成功绘制出人类血浆蛋白质组遗传图谱,其中89%前所未知。该研究发现的遗传变异与个体蛋白水平之间的联系,或意味着可以借此鉴定出新的治疗靶点,并将现有药物用于治疗新的疾病。  血浆蛋白是指血浆中的

十年大型项目,绘制人类蛋白质组图谱

  由瑞典皇家理工学院的Mathias Uhlén领导的一项长达十年之久的研究项目——人类蛋白质图集(Human Protein Atlas,HPA)项目,在本周发布了1300万张全身人类蛋白质“图像”。通过制备出荧光标记抗体,将其应用于保存组织的薄切片,观察组织的颜色以及附着在组织上的抗体,研究人

一种可以详细描绘人体细胞蛋白质图谱的新工具

  共同第一作者Christopher Go使用192种已知存在于特定细胞器中的蛋白质标记物对人类细胞景观进行了调查,这些细胞器可以“标记”同一隔间中相邻的蛋白质。  西奈卫生研究院的研究人员发表了一项研究,对人类活细胞的组织进行了超详细的研究,提供了一种新的工具,可以帮助世界各地的科学家更好地了解

高绍荣Cell-Reports:小鼠植入前胚胎蛋白质组动态图谱

  近日,同济大学高绍荣课题组与华东师范大学廖鲁剑课题组合作在Cell子刊《Cell Reports》杂志在线发表题为“Protein Expression Landscape of Mouse Embryos during Pre-implantation Development”的文章。首次报道

一管血检测8种癌症-液态活检助力反映肿瘤基因图谱

  约翰霍普金斯大学医学院的科研人员1月18日在《Science》上发表了一篇文章,报道了一种名叫“CancerSEEK”的癌症早期筛查新方法,只需要从检测对象体内抽取一管血,便可检测出8种癌症。这一消息迅速“刷屏”,包括新浪医药在内的广大媒体纷纷转发。  首先得说,“CancerSEEK”作为液体

肿瘤患者如何补充蛋白质,检验科有话说

我们知道蛋白质对身体非常重要,蛋白质是生命活动的最主要载体,更是功能的执行者。 肿瘤患者在围手术期间(手术前后)需要适量增加蛋白质。及时补充蛋白质能够有助于伤口愈合,减少术后并发症。蛋白质能够帮助构建健康组织,加速康复。在放化疗期间需要适量增加蛋白质,能够减轻副作用,提高耐受性,促进细胞修复。在康复

蛋白质胰蛋白酶磷酸肽图谱制定实验_从纤维平板上

验材料烧结的聚乙烯片TLC 平板(已分离过磷酸肽并经过放射自显影的)试剂、试剂盒电泳缓冲液仪器、耗材玻璃棒1000 μl(蓝色)移液器吸头单边剃刀刀片实验步骤实验材料、试剂、仪器耗材详见「其他」。1. 用锋利的刀片小心地切去蓝色吸头领圈的部分,细的吸口端也裁去约 3 mm。2. 用玻璃棒将一烧结的聚

蛋白质胰蛋白酶磷酸肽图谱制定实验——固相蛋白消化

试剂、试剂盒甲醇PVP-360(溶于乙酸)50 mmol L 碳酸氢铵pH 8.0仪器、耗材PVDF 膜/硝酸纤维素膜保鲜膜/聚酯薄膜实验步骤1. 用 SDS-PAGE 凝胶电泳分离 32P 标记的样品,用标准的湿式或半干式蛋白质转移方法将蛋白质转移到 PVDF 或硝酸纤维素膜上。2. 将膜晾干并用

钟声团队开发快速揭示蛋白质互作图谱的新技术PROPERseq

  近年来,大量新技术的开发与应用使我们对人类基因组及其产物的互作图谱有了更全面的了解。然而,对人类蛋白质互作图谱的揭示仍旧有限。现阶段,主流的大规模揭示蛋白质自身互作图谱的技术可分为单对单以及单对多两大类。单对单类技术例如酵母双杂交系统 (Yeast two-hybrid) 可以测试成对的蛋白质互

中国人肾透明细胞癌蛋白质基因图谱绘制成功

中国是肾癌大国,其中40%的肾癌患者在初诊或随访过程中出现转移,从而导致治疗效果不佳。其中,遗传异质性高、缺乏精准有效治疗靶点是肾癌治疗效果差的主要原因。复旦大学附属肿瘤医院教授叶定伟团队携手复旦表型研究院教授丁琛团队和上海交通大学医学院附属新华医院教授赵健元团队,成功绘制出中国人肾透明细胞癌蛋白质

阅读质粒图谱

载体主要有病毒和非病毒两大类,其中质粒DNA是一种新的非病毒转基因载体。一、一个合格质粒的组成要素  复制起始位点Ori 即控制复制起始的位点。原核生物DNA分子中只有一个复制起始点。而真核生物DNA分子有多个复制起始位点。  抗生素抗性基因 可以便于加以检测,如Amp+ ,Kan+  多克隆

红外图谱口诀

   红外识谱图看似复杂,其实也有规律可循,试试这个口诀,说不定 也是一种方法。   红外可分远中近,中红特征指纹区,   1300来分界,注意横轴划分异。   看图要知红外仪,弄清物态液固气。   样品来源制样法,物化性能多联系。   识图先学饱和烃,三千以下看峰形。   2960、2870是甲基

XPS图谱解释

(1)谱线识别X射线入射在样品上,样品原子中各轨道电子被激发出来成为光电子。光电子的能量统计分布(X射线光电子能谱)代表了原子的能级分布情况。不同元素原子的能级分布不同,X射线光电子能谱就不同,能谱的特征峰不同,从而可以鉴别不同的元素。电子能量用E = Enlj 表示。光电子则用被激发前原来所处的能

最全癌症基因图谱公布-有望提前数十年识别出肿瘤突变

  癌症是一种基因病,由体细胞癌基因突变引起。早在2001年对首个人类基因组进行测序后,肿瘤的全面基因组表征就成为癌症研究人员的一个主要目标。从那时起,测序技术和分析工具取得的进展使得这个研究领域蓬勃发展。  2月5日,Nature杂志及其子刊同期发表了20余篇关于癌症研究的文章,由来自37个国家、

关于蛋白质类肿瘤标志物检测的基本介绍

  大多数实体瘤是由上皮细胞衍生而来,当肿瘤细胞快速分化、增值时,一些在正常组织中不表现的细胞类型或组分大量出现,如作为细胞支架的角蛋白,成为肿瘤标志。化学本质属于蛋白质类的肿瘤标志包括:  ①酶;  ②蛋白类或肽类激素;  ③不属于前两者的其他蛋白质。

Nat-Rev-Cancer综述:肿瘤蛋白质基因组学

导 读       肿瘤蛋白质基因组学(Cancer proteogenomics)是将基于质谱(MS)的蛋白质丰度和翻译后修饰(PTM)信息与临床前肿瘤模型和肿瘤样本的基因组、表观基因组和转录组数据相结合的组学技术。基因组学和表观基因组学为解释可能发生的生物过程提供了基础知识,蛋白质组学是对已经发

简述蛋白质类肿瘤标志物检测的临床意义

  异常结果:发生大肠癌,肺癌,胰腺癌,胃癌和乳腺癌以及一些其他肿瘤时,血清中的癌胚抗原升高,肝细胞癌、卵黄囊和胚胎性恶性肿瘤以及一部分肝外肿瘤可重新合成胎儿期的甲胎蛋白(AFP)而使血清AFP浓度上升,故AFP是一种癌胚蛋白,并成为上述肿瘤的血清学标志。酸性铁蛋白对肝癌的辅助诊断尚有一定价值,对造

关于蛋白质类肿瘤标志物检测的注意事项

  不合宜人群:无特殊要求。一般是作肿瘤治疗依据或体检预防依据。  检查前禁忌:血清检测,一般是早晨空腹抽血检测,因此宜空腹。  检查时要求:注意血清不被污染和及时送检。

临床化学检查方法介绍蛋白质类肿瘤标志物检测

蛋白质类肿瘤标志物检测介绍:  大多数实体瘤是由上皮细胞衍生而来,当肿瘤细胞快速分化、增值时,一些在正常组织中不表现的细胞类型或组分大量出现,如作为细胞支架的角蛋白,成为肿瘤标志。化学本质属于蛋白质类的肿瘤标志包括:①酶;②蛋白类或肽类激素;③不属于前两者的其他蛋白质。蛋白质类肿瘤标志物检测正常值: