最全癌症基因图谱公布有望提前数十年识别出肿瘤突变
癌症是一种基因病,由体细胞癌基因突变引起。早在2001年对首个人类基因组进行测序后,肿瘤的全面基因组表征就成为癌症研究人员的一个主要目标。从那时起,测序技术和分析工具取得的进展使得这个研究领域蓬勃发展。 2月5日,Nature杂志及其子刊同期发表了20余篇关于癌症研究的文章,由来自37个国家、1300多名科学家和临床医生组成的国际团队完成了迄今为止最全面的癌症基因组研究,显著提高了我们对癌症的基本认识,并为癌症的诊断和治疗指明了新的方向。图片来源:Nature 主导该研究的是ICGC/TCGA全基因组泛癌分析(PCAWG)项目,简称泛癌项目。该项目分析了38种不同肿瘤类型的2600多个基因组,创造了巨大的原发癌基因组资源。 2006年,美国国家癌症研究所和国家人类基因组研究所开启了癌症基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas Program,TCGA)。该计划涵盖了33种癌症类型,包括超过2万个癌......阅读全文
美基因图谱研究将癌症重新“归类”
美国国家卫生研究院资助的科学家团队完成大规模癌症基因组图谱绘制,他们根据基因变异和表达的相似性,提出可以按照分子类型给癌症“归类”。研究人员认为,这将为癌症诊断和治疗提供新思路。5日发表在美国《细胞》杂志上的研究,对33种癌症、1万多个肿瘤病例的基因、表观遗传和蛋白质组学变化进行分析,确认约30
美基因图谱研究将癌症重新“归类”
美国国家卫生研究院资助的科学家团队完成大规模癌症基因组图谱绘制,他们根据基因变异和表达的相似性,提出可以按照分子类型给癌症“归类”。研究人员认为,这将为癌症诊断和治疗提供新思路。 5日发表在美国《细胞》杂志上的研究,对33种癌症、1万多个肿瘤病例的基因、表观遗传和蛋白质组学变化进行分析,确认约
透过大规模基因组分析推出-泛癌症图谱-开启癌症治疗
【Technews科技新报】美国国立卫生研究院(NIH)资助的研究团队已经完成了一份详细的基因组分析,这个被称为泛癌症图谱(PanCancer Atlas)的研究结果收录了 27 篇论文,并包含了 33 种癌症、1 万多个种不同肿瘤分子和临床讯息的数据资料。 泛癌症图谱主要是针对癌症基因组
全球癌症基因组图谱计划又一研究突破
最近,发表在国际杂志the New England Journal of Medicine上的一篇研究论文中,来自从事癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas)研究计划的科学家通过进行研究,对第二种常见类型的肾癌的两种类型进行了分子特性的分析,并且对这种常见类型的肾癌进行了
多国科学家将绘制人类癌症基因图谱
图谱如果绘制成功,可望开辟癌症个性化治疗新时代 国际癌症基因组协会将开展一项与人类基因组计划具有同等重要意义的癌症研究计划,集世界各国和地区的科学家之力,绘制完整的人类癌症基因图谱。 该协会4月29日在英国伦敦正式成立,目前有英国、中国、美国、法国、印度、日本、新加坡、澳大利亚、加拿大和欧盟1
《Cell》:如何根据癌症基因组图谱分析肿瘤
时至今日,这一计划已经取得了许多成果,最新Cell杂志公布了泛癌症图谱(Pan-Cancer Atlas),这也是癌症基因组图谱(TCGA)的收官项目,同期Cell杂志介绍了根据癌症基因组图谱分类的肿瘤类型列表,以及相关的一些主要发现(每种肿瘤类型的标记论文)。 生物通报道:2005年美国国立
利用DNA图谱诊断癌症
作为无创产前诊断等相关领域技术的首创者,来自香港中文大学的卢煜明(DennisLo)教授最早就曾发现孕妇外周血中存在“漂流”的胎儿DNA,也就是说,假设每毫升母亲样品相当于1000个基因组,则总共含有1900条母亲的21号染色体,100条整倍体胎儿的21号染色体或150条21三体胎儿的21号染色
Cell:首个图谱!1篇论文揭秘769个癌症“关键”基因
7月27日,发表在Cell杂志上题为“Defining a Cancer Dependency Map”的研究成果中,来自Broad研究所和Dana-Farber癌症研究所的科学家们建立了癌细胞遗传弱点的综合目录。具体来说,研究人员鉴定出了超过760个癌细胞生长和生存强烈依赖的基因。其中,许多依
全球首份癌症病例图谱发布
日前,《科学》杂志刊登了瑞典科学家的重磅成果——全球首份癌症病例图谱“Atlas”,将数千种特定癌症相关基因与患者生存情况联系起来,发掘出32种不以癌症类型分类、但与80%人类癌症相关的“公共”基因,可作为潜在新药研发的精准靶点。新图谱被认为是肿瘤临床实践革命性改进的重要推手。 据《麻省理工技
NIH-340万美元资助癌症基因组图谱研究计划
美国国立卫生研究院于当地时间7月2日宣布,决定对八个单位(或个人)进行为期两年、总值340万美元的资助,以支持癌症基因组图谱研究计划(Cancer Genome Atlas pilot program)。 癌症基因组图谱计划是美国国立癌症研究所和美国国家人类基因组研究的合作项目,于2005年晚期,
-多项研究发现:癌症特征决定于基因图谱而非发病器官
以往我们对癌症的称谓都是依据其所在身体器官,如乳腺癌、前列腺癌、肺癌等。现在这点上发生了很大的转变,研究者越来越确信肿瘤的划分应该基于基因信息而不是发生的位置。这一新的理念将肿瘤治疗的焦点从器官转移到肿瘤发生相关的基因突变上来。其结果可能是,不同部位的肿瘤因为包含有相同的基因突变信息而使用同一种
Nature子刊:非编码RNA癌症药物基因组图谱新突破
近日,匹兹堡大学药物遗传研究中心的杨达和张敏课题组借力于一种名为弹性网络回归(Elastic Net regression)的机器学习模型,从1,001个肿瘤细胞系的高通量长非编码RNA表达谱(long noncoding RNAs, lncRNAs)与265种抗癌药物敏感性数据中,挖掘出了27
最全癌症基因图谱公布-有望提前数十年识别出肿瘤突变
癌症是一种基因病,由体细胞癌基因突变引起。早在2001年对首个人类基因组进行测序后,肿瘤的全面基因组表征就成为癌症研究人员的一个主要目标。从那时起,测序技术和分析工具取得的进展使得这个研究领域蓬勃发展。 2月5日,Nature杂志及其子刊同期发表了20余篇关于癌症研究的文章,由来自37个国家、
美国癌症研究所拨款550万美元资助生物标志物实验室
美国国家癌症研究所(NCI)在2016年财政年度拨款550万美元资助建立多家实验室以便加快研究生物标志物和开发生物标志物测定方法用于检测乳腺癌、前列腺癌、肺癌、泌尿生殖器官癌以及发病率快速上升的癌症。 正如已被指定的名字,生物标志物开发实验室(Biomarker Developmental L
濒危“抗癌奇木”有望发酵罐中“新生”
三尖杉酯类生物碱具有广谱抗癌作用,在临床上主要用于急性白血病的治疗。然而,能天然产生这类生物碱的植物几乎都已濒临灭绝。科学家试图找到人工合成三尖杉酯类生物碱的方法。 2022年12月29日,《美国国家科学院院刊》(PNAS) 在线发表中国热带农业科学院(以下简称热科院)热带作物品种资源研究所研
北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM
近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human cance
北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM
近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human can
Science:基因图谱展示生物钟调节胰岛素
最近,美国西北大学的研究人员发表了一项最新研究进展,他们发现了机体生物钟用以调节胰腺beta细胞合成分泌胰岛素,控制血糖水平的全新基因图谱,这项发现将促进糖尿病新治疗方法的开发。 机体生物钟能够根据地球上的24小时昼夜循环对进食和睡眠等行为进行协调,同时还会调节机体的生理活动,如代谢。在脑内有
细胞信号通路与癌症治疗
2月16日的SCIENCESIGNALING为细胞信号通路与癌症治疗的专辑,发表了编者案“当细胞生物学遇到癌症治疗”,介绍本期和往期该杂志发表的关于细胞信号通路领域相关癌症治疗方面的内容,在这方面做了一个很好的概括。 生长和分化的细胞,包括癌细胞对代谢要求很高,因为它们必须建立新的蛋白质、膜和
新方法可更精确测定木制文物年代
据日本媒体近日报道,日本科学家开发的一种新方法能精确测定遗址或文物所使用木材的年龄。这种方法不分树种,只需少量木材样本,就能精确到以年为单位,测定耗时短,成本低廉。 新检测法利用了木材纤维素中的氧同位素比率受当年降水量影响的现象。自然界的氧有三种稳定的同位素——氧16、氧17和氧18,其中
基于八大基因组学数据库-构建迄今最完整的癌症eRNA图谱
增强子RNA(eRNA)是一种从增强子转录的非编码RNA。目前,科学家已经在人类细胞中鉴定出数以万计的eRNA,其中许多都在RNA转录过程中发挥重要作用,以介导靶基因的激活。在人类癌症中,癌基因或致癌信号通路的激活通常引起增强子的激活和eRNA的产生。例如,ESR1的激活可以整体上增加乳腺癌中e
癌症eRNA表达图谱并揭示其在癌症临床中的应用
2019年10月8日,德克萨斯大学休斯敦健康研究中心的韩冷、李文博课题组合作在Nature Communications上在线发表题为“Transcriptionallandscape and clinical utility of enhancer RNAs for eRNA-targeted
如何阅读基因载体图谱?
基因载体是基因工程的核心,也是基因治疗中强有力的生物工具,我们先来认识和阅读载体图谱吧。 载体分类及载体组成元件 载体分类 1、按属性分类:病毒载体和非病毒载体 病毒载体是一种常见的分子生物学工具,可将遗传物质带入细胞,原理是利用病毒具有传送其基因组进入目的细胞,进行感染的分子机制。
如何阅读基因载体图谱
基因载体是基因工程的核心,也是基因治疗中强有力的生物工具,我们先来认识和阅读载体图谱吧。 一、载体分类及载体组成元件 载体分类 1、按属性分类:病毒载体和非病毒载体 病毒载体是一种常见的分子生物学工具,可将遗传物质带入细胞,原理是利用病毒具有传送其基因组进入目的细
如何阅读基因载体图谱
基因载体是基因工程的核心,也是基因治疗中强有力的生物工具,我们先来认识和阅读载体图谱吧。 一、载体分类及载体组成元件 载体分类 1、按属性分类:病毒载体和非病毒载体 病毒载体是一种常见的分子生物学工具,可将遗传物质带入细胞,原理是利用病毒具有传送其基因组进入目
基因图谱是什么
人类基因图谱名称: 人类基因图谱主题词或关键词: 生命科学内容人类基因组图谱今天将宣布完成。专家说,这是医学上一场革命的开始,但这场革命的成功将需要更长的时间。中国科学家承担了这个工程1%的工作量。人类的基因决定了人的生老病死,它存在于人体每一个细胞内的脱氧核糖核酸分子即DNA分子。DNA分子在细胞
什么是基因图谱?
基因图谱指综合各种方法绘制成的基因在染色体上的线性排列图。生物的性状千差万别,决定这些性状的基因成千上万。这些基因成群地存在于遗传物质的载体——染色体上。基因定位就是要确定基因所在的染色体,并测定基因在特定染色体上线性排列的顺序和相对距离。通过测定重组率得到的基因线性排列图称为遗传图谱,将遗传重组值
Nat-Genet:新研究绘制出关键癌症基因VHL所有潜在变异的影响图谱
在一项新的研究中,来自弗朗西斯-克里克研究所等研究机构的研究人员绘制出了一个名为VHL的肿瘤抑制基因发生变化后可能产生的所有结果,这是为揭示与癌症有关的基因中数以万计的基因变异的结果而开展的一项巨大研究工作的第一步。这份VHL图谱可能帮助临床医生确定哪些病人有患肾癌的风险,或可能对某些药物产生反
全球首份癌症病例图谱发布发掘出32种新选靶点基因
《科学》杂志日前刊登了瑞典科学家的重磅成果——全球首份癌症病例图谱“Atlas”,它将数千种特定癌症相关基因与患者生存情况联系起来,发掘出32种不以癌症类型分类、但与80%人类癌症相关的“公共”基因,可作为潜在新药研发的精准靶点。 瑞典皇家理工学院教授马瑟尔斯·阿合雷是欧洲生物技术联合会主席,
一管血检测8种癌症-液态活检助力反映肿瘤基因图谱
约翰霍普金斯大学医学院的科研人员1月18日在《Science》上发表了一篇文章,报道了一种名叫“CancerSEEK”的癌症早期筛查新方法,只需要从检测对象体内抽取一管血,便可检测出8种癌症。这一消息迅速“刷屏”,包括新浪医药在内的广大媒体纷纷转发。 首先得说,“CancerSEEK”作为液体