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科学家开发高性能大片段插入删除变异鉴定工具

10月13日,华中农业大学生物信息团队杨庆勇课题组联合新加坡国立大学Sung Wing-Kin(宋永健)课题组在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表论文,开发出高性能的大片段插入删除变异(InDel)鉴定工具IndelEnsembler,使大片段InDel鉴定准确性由45%提高到84%。 鉴定准确性提高 遗传变异是指一个群体中个体之间DNA序列的差异,主要包括点突变(SNP/单核苷酸多态性)、小片段InDel和结构变异(包括大片段InDel、染色体倒位、易位和拷贝数变异)。基因组上的遗传变异是人类遗传病产生的根源,也是动植物形态、表型多样性的遗传基础。因此,SNP被广泛应用于群体遗传学研究和疾病相关基因的研究。但越来越多的研究表明,SNP并不能解释所有的表型差异,在人类中有超过1000种疾病由结构变异导致,其中不乏人们常常耳闻的渐冻症、精神分裂症以及自闭症等。近年来,随着二代测序技术的蓬勃......阅读全文

科学家开发高性能大片段插入删除变异鉴定工具

  10月13日,华中农业大学生物信息团队杨庆勇课题组联合新加坡国立大学Sung Wing-Kin(宋永健)课题组在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表论文,开发出高性能的大片段插入删除变异(InDel)鉴定工具IndelEnsembler,使大片段InDel鉴定准确

遗传变异的医学应用

变异是生物的一般特性。甚至在人类尚未发现病毒以前,就已开始运用变异现象 制造疫苗。例如1884年,巴斯德利用兔脑内连续传代的方法,将狂犬病的街毒(强毒) 转变为固定毒。这种固定毒保留了原有的免疫原性,但毒力发生了变异——非脑内接 种时,对人和犬等的毒力明显降低,因而成功地用作狂犬病的预防制剂。此后,

遗传变异的分子基础

遗传从现象来看是亲子代之间的相似的现象,即俗语所说的“种瓜得瓜,种豆得豆”。它的实质是生物按照亲代的发育途径和方式,从环境中获取物质,产生和亲代相似的复本。遗传是相对稳定的,生物不轻易改变从亲代继承的发育途径和方式。因此,亲代的外貌、以及优良性状很有可能在子代重现,甚至酷似亲代。而亲代的缺陷和遗传病

遗传变异的基本概念

生物的亲代能产生与自己相似的后代的现象叫做遗传。遗传物质的基础是脱氧核糖核酸(DNA),亲代将自己的遗传物质DNA传递给子代,而且遗传的性状和物种保持相对的稳定性。生命之所以能够一代一代地延续的原因,主要是由于遗传物质在生物进程之中得以代代相承,从而使后代具有与前代相近的性状。只是,亲代与子代之间、

天津大学连发三篇Nature子刊 发表原创性基因组重排技术

  来自天津大学的元英进教授带领的合成生物学研究团队开发了一系列原创的基因组重排技术和策略,在化学再造酵母应用领域取得重大突破。  这些成果分别以“Precise control of SCRaMbLE in synthetic haploid and diploid yeast”(精准控制合成型单

植物所等在玉米抗旱基因克隆和功能研究方面取得进展

  在全球范围内,干旱等自然灾害严重威胁玉米生产,严重时会造成大幅减产甚至绝收。因此,克隆玉米抗旱基因、改良玉米抗旱性是农业生产的迫切需求。   中国科学院植物研究所秦峰研究组利用全球不同地区的玉米自交系组成的自然变异群体,通过全基因组关联分析发现,83个遗传变异位点(解析至42个候选基因)与玉米苗

我国学者在合成型基因组重排领域取得重大突破

           图1.精确控制合成型单倍体和二倍体酵母基因组重排图2.体外DNA重排图3.杂合二倍体与跨物种基因组重排  在国家自然科学基金项目(项目编号:21750001,21621004)等资助下,天津大学元英进教授带领的合成生物学研究团队开发了一系列原创的基因组重排技术和策略,

JBC:揭秘“吃不胖”人群表观遗传变异

  有没有想过为什么有些人可以想吃多少就吃多少,并且从来不会因此而变胖?仅仅是因为遗传变异?最近一个研究小组指出了另一个重要的因素。相关研究结果发表在最近的《Journal of Biological Chemistry》杂志。  我们都知道:有些人不用为减肥苦恼,而其他一些人似乎一直都在跟赘肉做斗

分子生态学词汇--遗传变异

中文名称:遗传变异外文名称:genetic variation定      义:遗传变异是指生命是在遗传的基础上,同一基因库中不同个体之间在DNA水平上的差异,也称“分子变异(molecular variation)”,也是对同一物种个体之间遗传差别的定性或定量描述。遗传与变异,是生物界不断地普遍发

中美大豆品种存在大量遗传变异

美国种植的大豆品种同中国种植的大豆品种有何不同?依据新近完成的中国大豆基因组测序,科学家发现,中美大豆品种在基因组上存在着大量的遗传变异。中国大豆基因组测序的完成,为优良大豆品种的培育奠定了基础。相关研究以封面文章形式在线发表于最新一期的《中国科学—生命科学》(英文版)上。作为重要的经济作物,大豆起