我国科学家解析小RNA的生物合成机制

小RNA是真核生物中重要的基因调控分子,在生长发育、基因沉默、抵御病毒等动植物的各类生理过程中起着至关重要的作用。小RNA的生物合成中,Dicer家族核酸内切酶选择性识别小RNA前体,切割RNA至特定长度,并选择性地将一条链递呈给下游AGO蛋白从而介导下游基因沉默。Dicer如何起到“分子尺”和“分子刀”的功能,切割小RNA前体生成特定长度的小RNA这一机制尚不清晰。 国家“十三五”科技计划“蛋白质机器与生命过程调控”重点专项“植物非编码RNA介导基因沉默过程中重要蛋白质机器的结构功能研究(2016YFA0503200)”项目取得重要进展。项目团队以植物中特异性生成24-nt小RNA的Dicer Like 3 (DCL3)为对象开展了研究,利用合成的DCL3天然底物模拟物和冷冻电镜技术,解析了DCL3和天然底物模拟物的复合物结构,并从中观测到Dicer家族蛋白同时对前体小RNA的5’和3’端同时产生特异性识别的机制。项目团......阅读全文

RNA-大量转录合成

实验材料 模板 DNA 或质粒试剂、试剂盒 TE TE 饱和酚 氯仿异内醇 3mol LNaAc 无水乙醇 5X 转录缓冲液 lOOmmoL LDTT RNasin rATPrGTPrUTPrCTP SF6T3 或 T7RNA 聚合酶 异戊醇 DNase 7.5mol L 乙酸铵 无水乙醇 乙醇实验

RNA-大量转录合成

            实验材料 模板 DNA 或质粒 试剂、试剂盒 TE   TE 饱和酚   氯仿

Cell|重大进展,清华北大联合中心王宏伟首次揭示人类Dicer

Cell|重大进展,清华-北大联合中心王宏伟首次揭示人类Dicer及其与Pre-miRNA底物复合物的冷冻电镜结构   iNature:2018年4月26日,清华北大联合生命科学研究中心王宏伟课题组等人在Cell 上在线发表了题为“Cryo-EM Structure of Human Dicer a

Dicer酶结构及作用原理

1、Dicer酶在RNA干扰研究中会用到Dicer酶,Dicer酶是RNaseIII型家族中的蛋白酶,可特异识别dsRNA,它可以切割以各种方式进入到细胞内的dsRNA,将其切割成19-21bp大小的短RNAs。Dicer是来自果蝇RNA干扰必须的RNaseIII型蛋白。Dicer酶是RNase I

关于小干扰RNA的RNA激活介绍

  已经发现dsRNA还可以激活基因表达,这种机制被称为“小RNA诱导的基因激活”或RNAa。已经显示靶向基因启动子的dsRNA诱导相关基因的有效转录激活。使用合成的dsRNA在人细胞中证明RNAa,称为“小活化RNA”(saRNA)。尚不清楚RNAa是否在其他生物体中是保守的。

RNAi常见问题及问答(FAQs)

有关Stealth™ RNAi的问题什么是Stealth™ RNAi?Stealth™ RNAi是RNAi化学的新一代产品。Stealth™ RNAi分子是经过ZL化学修饰的、钝末端、双链25聚体(25mer)。这些化学修饰专门用来消除诱导的细胞应激反应。它也使Stealth™ RNAi比标准的si

蛋白质与生物小分子结合

生物大分子,首先先说一下什么是生物大疯子,生物大分子指的是作为生物体内主要活性成分的各种分子量达到上万或更多的有机分子.高相对分子量的生物有机化合物(生物大分子)主要是指蛋白质、核酸以及高相对分子量的碳氢化合物.常见的生物大分子包括蛋白质、核酸、多糖.但是,这只是相对的说法,这个定义只是概念性的,与

戚益军教授Cell子刊发布小RNA研究新发现

  来自中国医学科学院、清华大学的研究人员在新研究中证实,在拟南芥中cma33 / XCT通过调节Dicer-Like(DCL)基因的转录调控了小RNA(sRNA)的生成。这一研究发现发表在8月刊的《分子植物》(Molecular Plant)杂志上。  现任职于中国医学科学院及清华大学的戚益军(Y

戚益军教授Cell子刊发布小RNA研究新发现

来自中国医学科学院、清华大学的研究人员在新研究中证实,在拟南芥中cma33 / XCT通过调节Dicer-Like(DCL)基因的转录调控了小RNA(sRNA)的生成。这一研究发现发表在8月刊的《分子植物》(Molecular Plant)杂志上。   现任职于中国医学科学院及

小分子RNA(miRNA)简介

一、什么是小分子RNA( MicroRNA)?    MicroRNA (miRNA) 是一类长度约为20-24个核苷酸长度的具有调控功能的非编码RNA。 miRNA 主要参与基因转录后水平的调控。这些miRNA基因首先在细胞核内转录成原始miRNA转录本(primary transcrip

小分子RNA的简介

  MicroRNA (miRNA) 是一类内生的、长度约为20-24个核苷酸的小RNA,其在细胞内具有多种重要的调节作用。每个miRNA可以有多个靶基因,而几个miRNA也可以调节同一个基因。这种复杂的调节网络既可以通过一个miRNA来调控多个基因的表达,也可以通过几个miRNA的组合来精细调控某

核小RNA的用途

核小RNA是真核生物转录后加工过程中RNA剪接体(spliceosome)的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。

核小RNA的特点

①稳定,半寿期常与核糖体相近;②含量丰富,如U1分子在每个核中的含量可有10^6个;③普遍性,在动、植物细胞中均含有snRNA;④高度保守,如人和爪蟾的U1snRNA有90%的序列相同。通常snRNA不是游离存在,而是与蛋白质结合成复合物,成为小核核糖核蛋白颗粒(small nuclear ribo

核小RNA的特点

①稳定,半寿期常与核糖体相近;②含量丰富,如U1分子在每个核中的含量可有10^6个;③普遍性,在动、植物细胞中均含有snRNA;④高度保守,如人和爪蟾的U1snRNA有90%的序列相同。

什么是小分子RNA?

  MicroRNA (miRNA) 是一类由内源基因编码的长度约为22 个核苷酸的非编码单链RNA分子,它们在动植物中参与转录后基因表达调控。在动植物以及病毒中已经发现有28645个miRNA 分子(Release 21: June 2014) 。大多数miRNA 基因以单拷贝、多拷贝或基因簇(c

时序小RNA的定义

中文名称时序小RNA英文名称small temporal RNA;stRNA定  义一类长度约为22核苷酸的非编码RNA,是微RNA大家族的成员。与生物发育时间顺序调控有关,如早期报道的线虫lin-4和let-7时序小RNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

研究揭示正单链RNA病毒编码小蛋白新策略

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510524.shtm

RNAi干扰技术及应用进展研究(一)

RNAi是Napoli CD等在试图向紫色矮牵牛花转导色素合成基因,用以增加其花色时发现的。结果出乎预料,转基因的植株不仅没有新基因的表达,反而自身的色素合成也减弱了,一些转基因的花出现了全白色或部分白色。他们把这种导入的基因未表达和植物本身合成色素基因的失活现象命名为共抑制(cosuppressi

黄连助力解析小檗碱型生物碱生物合成机制

  黄连是一种珍贵的中药材,其药用价值在神农本草经和本草纲目中均有记载。研究表明,黄连中的药用活性物质主要是小檗碱、黄连碱、药根碱、等原小檗碱类生物碱,并且这类物质被报道在心血管、糖尿病和癌症等的防治中具有重要作用。然而,由于基因组资源的限制,目前关于黄连地下根茎中丰富的原小檗碱型生物碱形成的进化机

中山大学等开发RNA编辑新工具

  CRISPR-Cas9系统使用一段引导RNA(其与Cas9蛋白结合起来才能发挥作用)来靶定一段DNA,并裂解双链DNA。这一现象提出了一个问题:由一个Dicer结合RNA元件和一段反义RNA组成的一种人造小RNA(asRNA,是否也能用来诱导Dicer处理和降解一段特定的RNA呢?  为此,5月

上海生科院发明一种高效安全的新型RNAi载体

  10月12日,国际学术期刊Nature Communications 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心(上海)吴立刚研究组的最新研究成果:Ribozyme-enhanced single-stranded Ago2-processed inter

蛋白聚糖的生物合成的介绍

  包括肽链的合成及糖链的合成。核心蛋白质肽链的合成是蛋白聚糖合成的限速步骤,在粗面内质网进行,其过程与一般蛋白质相同。肽链的糖基化在内质网起始,在戈尔吉氏体完成。氨基聚糖糖链的合成过程与糖蛋白者类似。亦由一系列糖基转移酶催化逐个将活化单糖的糖基转移到肽链及未完成的糖链,使之不断延长。糖基的硫酸化是

蛋白质生物合成过程的介绍

  1.氨基酸的活化与搬运:氨基酸的活化以及活化氨基酸与tRNA的结合,均由氨基酰tRNA合成酶催化完成。反应完成后,特异的tRNA3’端CCA上的2’或3’位自由羟基与相应的活化氨基酸以酯键相连接,形成氨基酰tRNA。  2.活化氨基酸的缩合——核蛋白体循环:活化氨基酸在核蛋白体上反复翻译mRNA

RNA干涉实验——采用RNaseⅢ制备siRNA分子实验

实验方法原理首先在体外以长为 200~1000 bp 的 cDNA 为模板转录合成正义与反义的单链 RNA 分子,然后通过退火形成长的 dsRNA 分子,再用Diccr 核酸酶进行切割得到 siRNA 分子的混合物,通过纯化去除没有被切割的双链 RNA 分子和 DNA 模板以后,siRNA 分子就可

RNAi实验原理与方法选择(一)

一、RNAi的分子机制通过生化和遗传学研究表明,RNA干扰包括起始阶段和效应阶段(inititation and effector steps)。在起始阶段,加入的小分子RNA被切割为21-23核苷酸长的小分子干扰RNA片段(small interfering RNAs, siRNAs)。证

什么是Dicer(DCR)?

Dicer(DCR):是RNAase Ⅲ家族中的一员,主要切割dsRNA或者茎环结构的RNA前体成为小RNAs分子。对应地,我们将这种小RNAs分子命名为siRNAs和miRNA。Dicer有着较多的结构域,最先在果蝇中发现,并且在不同的生物体上表现出很高的保守性

朱健康院士Cell-Research发布表观遗传新发现

  来自中国科学院上海植物逆境生物学研究中心、美国普渡大学的研究人员,在拟南芥中揭示出了Dicer非依赖性的RNA介导的DNA甲基化机制(RdDM)。这一重要的研究发现发布在12月8日的《细胞研究》(Cell Research)杂志上。  中国科学院上海植物逆境生物学研究中心主任朱健康(Jian-K

3.1.2-RNA-大量转录合成

RNA 标准转录体系的一般回收率为 lugRNA/ug 质粒 DNA, 使用下面的方法,可以提高回收率至 5〜l0ug RNA/ug 质粒 DNA。大量制备 RNA 可以用于体外翻译。实验材料模板 DNA 或质粒试剂、试剂盒TETE 饱和酚氯仿异内醇3mol LNaAc无水乙醇5X 转录缓冲液lOO

RNA病毒怎么合成mRNA

和DNA和成mRNA一样的,RNA聚合酶可以完成这一过程,只不过特殊的单股RNA病毒分为正链mRNA(即mRNA和原RNA一样)和负链mRNA(和原RNA互补)。

RNAi的研究进展(一)

RNA干扰(RNA interference ,RNAi) 现象是一种进化上保守的抵御转基因或外来病毒侵犯的防御机制。将与靶基因的转录产物mRNA 存在同源互补序列的双链RNA(double strand RNA ,dsRNA) 导入细胞后,能特异性地降解该mRNA ,从而产生相应的功能表型缺失