生物物理所女娲基因组资源研究取得进展

遗传变异图谱是研究人群演化史、医学遗传学、基因型-表型关联的基础。此前,大多数全基因组测序相关研究主要集中在欧洲血统人群。已有研究表明,罕见和低频的变异往往特定于人群或样本,尤其是与疾病相关的变异。针对特定人群的基因组数据可以为全基因组关联研究、区域适应性研究、用药指导等提供更准确的参考。 单倍型参考面板可基于大型人群队列中已知的单倍型信息,对来源于相对稀疏的基因变异芯片或低覆盖率测序样本中缺失的基因型进行推演,是促进全基因组关联研究 (genome-wide association study, GWAS) 有意义且具有成本效益的方法。此前缺乏中国人群特异的参考面板,其他参考面板对中国人群特异的变异推演效果较差,从而导致GWAS中遗漏潜在的表型相关变异。 中国人群全基因组测序资源和单倍型参考面板的缺乏阻碍了世界上最大人群的遗传学与精准医学研究。为此,中国科学院院士、中科院生物物理研究所研究员徐涛团队,研究员何顺民团队合......阅读全文

新研究构建出小麦属全基因组遗传变异图谱

  小麦是人类历史上最成功的作物之一,它起源于新月沃地一个狭小的核心区域,一万年间,从地区性的野生植物迅速转变成为全球种植面积最广的作物之一,在多种多样的环境下为人类提供大量的碳水化合物和蛋白质。然而,小麦对自然环境和人类粮食需求两方面同时适应的遗传机制尚不清楚,理解小麦适应性进化对气候变化条件下小

超级泛基因组助水稻种质资源遗传变异挖掘利用

 水稻泛NLRs家族基因的共线性位点(左);基于全基因组SNPs的水稻系统发生树(右)。中国农科院供图 近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所与国内多家高校、科研单位合作,组装了251份高质量的水稻基因组,构建了目前植物中群体规模最大、基因组充分注释、稻属中最为系统的超级泛基因组。该图谱

我国完成桑蚕大规模基因组重测序和遗传变异图谱构建

  北京时间8月28日凌晨2时,由深圳华大基因研究院与西南大学合作的研究成果“40个基因组的重测序揭示了蚕的驯化事件及驯化相关基因”在国际权威学术刊物《科学》上发表,这是科学家继2003年在家蚕基因组研究领域取得进展后的又一重要成果。   据悉,科学家共获得了40个家蚕突变品系和中国野桑蚕的全基因

Lancet子刊最新全基因组分析-额颞叶变性与遗传变异有关

  FTLD患者皆存在TAR-DNA结合蛋白43(TDP-43,一种调节转录的核蛋白)的异常磷酸化,GRN基因突变是FTLD的常见遗传因素,但不同患者发病年龄和临床表现存在差异,因此,近日有研究人员通过全基因组关联分析对FTLD患者GRN突变外的的遗传因子进行了考察。  研究人员发现TMEM106B

遗传变异的医学应用

变异是生物的一般特性。甚至在人类尚未发现病毒以前,就已开始运用变异现象 制造疫苗。例如1884年,巴斯德利用兔脑内连续传代的方法,将狂犬病的街毒(强毒) 转变为固定毒。这种固定毒保留了原有的免疫原性,但毒力发生了变异——非脑内接 种时,对人和犬等的毒力明显降低,因而成功地用作狂犬病的预防制剂。此后,

遗传变异的分子基础

遗传从现象来看是亲子代之间的相似的现象,即俗语所说的“种瓜得瓜,种豆得豆”。它的实质是生物按照亲代的发育途径和方式,从环境中获取物质,产生和亲代相似的复本。遗传是相对稳定的,生物不轻易改变从亲代继承的发育途径和方式。因此,亲代的外貌、以及优良性状很有可能在子代重现,甚至酷似亲代。而亲代的缺陷和遗传病

研究构建藏族人群全基因组水平的适应性遗传变异图谱

  8月7日,《国家科学评论》(National Science Review)在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所——马普计算生物学研究所徐书华团队的研究成果“Prioritizing natural selection signals from the deep-sequencing gen

遗传变异的基本概念

生物的亲代能产生与自己相似的后代的现象叫做遗传。遗传物质的基础是脱氧核糖核酸(DNA),亲代将自己的遗传物质DNA传递给子代,而且遗传的性状和物种保持相对的稳定性。生命之所以能够一代一代地延续的原因,主要是由于遗传物质在生物进程之中得以代代相承,从而使后代具有与前代相近的性状。只是,亲代与子代之间、

科学家构建藏族人群全基因组水平的适应性遗传变异图谱

  8月7日,《国家科学评论》(National Science Review)在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所——马普计算生物学研究所徐书华团队的研究成果“Prioritizing natural selection signals from the deep-sequencing gen

遗传变异影响受教育程度

  通过一个全新的近30万人的全基因组关联分析(GWAS),研究人员发现了与一个人完成的正式教育年数相关的遗传变异。这一研究成果11日在线发表于英国《自然》杂志的一篇遗传学论文上。  虽然由完成的教育年数定义的受教育程度,在很大程度上会受到社会和环境因素的影响,但以前的研究仍然表明,遗传变异也会对不

分子生态学词汇遗传变异

中文名称:遗传变异外文名称:genetic variation定      义:遗传变异是指生命是在遗传的基础上,同一基因库中不同个体之间在DNA水平上的差异,也称“分子变异(molecular variation)”,也是对同一物种个体之间遗传差别的定性或定量描述。遗传与变异,是生物界不断地普遍发

JBC:揭秘“吃不胖”人群表观遗传变异

  有没有想过为什么有些人可以想吃多少就吃多少,并且从来不会因此而变胖?仅仅是因为遗传变异?最近一个研究小组指出了另一个重要的因素。相关研究结果发表在最近的《Journal of Biological Chemistry》杂志。  我们都知道:有些人不用为减肥苦恼,而其他一些人似乎一直都在跟赘肉做斗

中美大豆品种存在大量遗传变异

美国种植的大豆品种同中国种植的大豆品种有何不同?依据新近完成的中国大豆基因组测序,科学家发现,中美大豆品种在基因组上存在着大量的遗传变异。中国大豆基因组测序的完成,为优良大豆品种的培育奠定了基础。相关研究以封面文章形式在线发表于最新一期的《中国科学—生命科学》(英文版)上。作为重要的经济作物,大豆起

遗传变异如何影响蛋白表达变化

蛋白质是生命活动的主要承担者,其表达调控对于正常发育和疾病的发生发展至关重要。根据中心法则,我们知道信息的传递过程:DNA→RNA→蛋白。然而研究表明mRNA水平和蛋白水平并不完全一致,表明其中存在某种未知机制,介导mRNA水平的遗传变异对蛋白水平的影响。来自哈佛医学院和Jackson实验室的研究人

遗传变异让安第斯人适应高地生活

  稀缺的氧气、寒冷的气候和强烈的紫外线辐射使得安第斯山脉成为一个生命难以存在的地方。那么人类是如何适应这种高地生活的呢?一项关于古代和现代脱氧核糖核酸(DNA)的新研究表明,其中的答案可能是一些南美高地人的心肌发生了变化。  该研究同时发现,随着古代南美高地人逐渐以马铃薯作为主要食物,他们变得更容

遗传变异让狐狸适应撒哈拉沙漠

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502782.shtm美国科学家研究发现,近缘物种的DNA转移到北非狐狸基因组(该过程也称基因渗入)促进了北非狐狸适应在撒哈拉沙漠的生存。研究揭示了生命得以在炎热干旱环境下维持的遗传和生理机制。相关研究6月

Science解析免疫性的遗传变异

  莱根妇女医院(Brigham and Women's Hospital,BWH)、哈佛医学院、Broad研究所、麻省总医院MGH和芝加哥大学的一项研究显示,健康青年之间的遗传多样性会影响他们的免疫细胞功能。这些免疫性的遗传变异(Immunogenetic Variation)大多也是常见

这个遗传变异与严重儿童肥胖相关

科学家报道了与严重儿童肥胖有关的一种新的遗传机制。这是一个与饥饿控制有关的基因异常表达导致的基因重排,而大多数肥胖的常规基因检测无法检测到。相关研究近日发表于《自然—代谢》。 黑素皮质素受体4(MC4R)激活基因位于称为下丘脑的脑区,激发饱足或不饿的感受。干扰MC4R激活或发挥功能的变异,与饥饿

Nature:遗传变异如何影响蛋白表达变化

  蛋白质是生命活动的主要承担者,其表达调控对于正常发育和疾病的发生发展至关重要。根据中心法则,我们知道信息的传递过程:DNA→RNA→蛋白。然而研究表明mRNA水平和蛋白水平并不完全一致,表明其中存在某种未知机制,介导mRNA水平的遗传变异对蛋白水平的影响。来自哈佛医学院和Jackson实验室的研

Nature:遗传变异如何影响蛋白表达变化

  蛋白质是生命活动的主要承担者,其表达调控对于正常发育和疾病的发生发展至关重要。根据中心法则,我们知道信息的传递过程:DNA→RNA→蛋白。然而研究表明mRNA水平和蛋白水平并不完全一致,表明其中存在某种未知机制,介导mRNA水平的遗传变异对蛋白水平的影响。来自哈佛医学院和Jackson实验室的研

大规模测序研究:从遗传变异到功能

  随着测序研究的深入,人们已不再满足于了解遗传变异,而是期待探究功能。在最近几个星期,三个以“从遗传变异到功能”为主题的大规模测序项目都发表了很有意思的论文。   Transcriptome and genome sequencing uncovers functional variation

遗传变异从生命早期就开始影响血压

某些与高血压相关的基因从生命早期就会影响血压,并且随着年龄的增长,它们会增加患心血管疾病的风险。研究表明,高血压发生在所有年龄组,并且与遗传因素有关。“我们发现遗传因素从儿童时期的头几年到你的一生都会影响血压,”Øvretveit说。来自大型人群研究的遗传数据高血压是心脏病发作和中风的主要原因,心血

llumina向ClinVar数据库贡献人类遗传变异

  近日,来自圣地亚哥的消息– Illumina公司(纳斯达克股票代码:ILMN)宣布,它已向美国国家生物技术信息中心(NCBI)主办的公共数据库ClinVar贡献了超过95,000个人类遗传变异(信息)。Illumina所贡献的信息包括从致病变异到良性变异在内的各种类别的变异,这些变异是在Ill

科学家绘制鹰嘴豆遗传变异的完整图谱

  鹰嘴豆是世界上产量第三的豆类作物,全球范围内有50多个国家将鹰嘴豆作为重要口粮。但是鹰嘴豆相关的基础研究和育种实践还相对滞后。近期,包括中国在内的来自11个国家的科学家通过基因组测序技术,绘制了包含3366份样本信息的鹰嘴豆遗传变异完整图谱。研究成果发表在《Nature》期刊,标题为“A chi

首次报道线粒体一重要遗传变异

来自捷克共和国(Czech Republic)科学院生理学院,日本札晃医科大学(Sapporo Medical University),美国加州大学旧金山分校,密歇根大学等处的研究人员首次报道了线粒体中的一个与II型糖尿病代谢标记物直接相关的遗传变异,这一研究强调了常见疾病发病机理中线粒体基因组变异

科学家绘制鹰嘴豆遗传变异的完整图谱

  鹰嘴豆是世界上产量第三的豆类作物,全球范围内有50多个国家将鹰嘴豆作为重要口粮。但是鹰嘴豆相关的基础研究和育种实践还相对滞后。近期,包括中国在内的来自11个国家的科学家通过基因组测序技术,绘制了包含3366份样本信息的鹰嘴豆遗传变异完整图谱。研究成果发表在《Nature》期刊,标题为“A chi

人体存在四千多个与大脑结构相关遗传变异

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/506792.shtm

Nature:身高谁做主,这83个罕见基因变异影响显著?

  我们都知道,身高是受遗传因素高度影响的一种性状。过去的研究已经发现,近700个常见的遗传变异影响着我们的身高。但是每一个基因突变的影响都很细小,通常仅为1毫米或者更少。即便携带其中一些常见变异,身高最多也只会高或者矮1英寸。  现在,国际人类性状遗传研究协会(GIANT)招募了711,428名成

为国产优异大豆品种培育奠定基础-中黄13基因组发布

  中科院遗传与发育生物学研究所联合中国科技大学、江苏省农业科学院种质资源与生物技术所、北京贝瑞和康生物技术有限公司等,对中国国审大豆品种“中黄13”(Gmax_ZH13)的基因组进行从头组装,最终得到1.025 Gb的基因组序列,包含20条染色体和1条叶绿体。相关成果近日以封面文章形式在线发表于《

大豆“中黄13”基因组发布-为国产优异大豆品种培育定基础

中科院遗传与发育生物学研究所联合中国科技大学、江苏省农业科学院种质资源与生物技术所、北京贝瑞和康生物技术有限公司等,对中国国审大豆品种“中黄13”(Gmax_ZH13)的基因组进行从头组装,最终得到1.025 Gb的基因组序列,包含20条染色体和1条叶绿体。相关成果近日以封面文章形式在线发表于《中国