如何利用TCGA数据库进行深度癌症研究及发大牛文章？
玩转数据库，助你发牛文！癌症研究究竟有多难？让我们来捋一下基本思路：首先，要有一定数量的高质量肿瘤临床样本；其次……等一下，是不是在“首先”这一步就卡住了？癌症研究中的高质量的肿瘤样本不但要有切除适当的肿瘤瘤体和癌旁组织，还需要每个病人的各项病理指征、家族病史、治疗手段、疗效以及对病人不间断的随访信息。要满足这些苛刻的要求，无论对于战斗在一线的临床医生，还是各大高校的科研人员都是十分困难的。难道真的没有解决办法吗？当然有！TCGA数据库，质量高、样本多，而且还是免费的！【欢脱的传送门：https://cancergenome.nih.gov/】TCGA（The Cancer Genome Atlas）,即癌症和肿瘤基因图谱计划，是由美国国家癌症和肿瘤研究所（NCI）和国家人类基因组研究所(NHGRI）联合进行的。该计划通过应用基因组分析技术，特别是采用大规模的基因组测序，将人类全部癌症(近期目标为50种包括亚型在内的肿瘤）的......阅读全文
如何利用TCGA数据库进行深度癌症研究及发大牛文章？
玩转数据库，助你发牛文！ 癌症研究究竟有多难？让我们来捋一下基本思路：首先，要有一定数量的高质量肿瘤临床样本；其次……等一下，是不是在“首先”这一步就卡住了？癌症研究中的高质量的肿瘤样本不但要有切除适当的肿瘤瘤体和癌旁组织，还需要每个病人的各项病理指征、家族病史、治疗手段、疗效以及对病人不
如何利用TCGA数据库进行深度癌症研究及发大牛文章？
玩转数据库，助你发牛文！癌症研究究竟有多难？让我们来捋一下基本思路：首先，要有一定数量的高质量肿瘤临床样本；其次……等一下，是不是在“首先”这一步就卡住了？癌症研究中的高质量的肿瘤样本不但要有切除适当的肿瘤瘤体和癌旁组织，还需要每个病人的各项病理指征、家族病史、治疗手段、疗效以及对病人不间断的随访信
Nature癌症综述：如何用CRISPR进行癌症研究
CRISPR/Cas9系统可以很容易地改写多种生物的基因组，这一技术很快如风暴一般席卷了整个基因组工程领域。可想而知，以CRISPR/Cas9为基础的各种应用也将为癌症遗传学领域带来一场变革。麻省理工霍华德・休斯医学研究所的Tyler Jacks就是这方面的先行者，他去年连发两篇Nature文
Nature综述：如何用CRISPR进行癌症研究
CRISPR–Cas9系统可以很容易地改写多种生物的基因组，这一技术很快如风暴一般席卷了整个基因组工程领域。可想而知，以CRISPR–Cas9为基础的各种应用也将为癌症遗传学领域带来一场变革。麻省理工霍华德•休斯医学研究所的Tyler Jacks就是这方面的先行者，他去年连发两篇Nature文章
癌症基因组项目(TCGA)完成之反思
经过美国不懈的努力，涉及上万个癌基因的癌基因组项目正式告一段落。该项目在2006年开始，预计花费1亿美元进行研究，并且癌症基因组图谱（TCGA）现在已经成为国际癌症基因组协会最大的组成部分，该项目汇聚了来自16个国家的科学家，并发现了接近10万个与癌症相关的基因突变。 现在的问题是，下一步怎么
肿瘤免疫火得飞起，更新后的TIMER－2.0数据库真心好用！
肿瘤微环境中免疫细胞的组成和丰度是影响肿瘤进展和免疫治疗效果的重要因素。由于直接测量方法的局限性，计算算法通常用于从肿瘤转录组图谱推断免疫细胞组成。这些估计的肿瘤免疫浸润人群与肿瘤的基因组和转录组学变化相关，提供了对肿瘤免疫相互作用的见解。今天我们就一起来看这个肿瘤免疫分析的又一神器——TIME
深度解析癌症免疫疗法—如何训练机体来抵御癌症？
人类机体的免疫系统非常强大而且复杂，其能够有效鉴别并且破坏几乎具有无限多样性的外来入侵者，但不幸的是，被破坏的癌细胞还会继续保持在机体中，并且不断发展，损伤细胞这种“识别和自我忽略”的信号就会让其躲避免疫系统的检测，因此这些损伤细胞的生长就不会受到“烦扰”，从而就会破坏机体组织和器官中的正常生理
2019年，大牛们都在研究什么？—m6A文章盘点
19年悄悄的已经将近过半，但RNA甲基化研究马不停歇。单单过去一个半月的时间里高分文章就有十多篇，Nature，Cell子刊均有相关文章发表；造血干细胞分化，癌细胞上皮间质转化，树突细胞活化，心肌细胞肥厚，内源性免疫应答调控都有它的身影。这里小编给大家列举展示几篇最新的m6A RNA甲基化研究成
2019年，大牛们都在研究什么？—m6A文章盘点
19年悄悄的已经将近过半，但RNA甲基化研究马不停歇。单单过去一个半月的时间里高分文章就有十多篇，Nature，Cell子刊均有相关文章发表；造血干细胞分化，癌细胞上皮间质转化，树突细胞活化，心肌细胞肥厚，内源性免疫应答调控都有它的身影。这里小编给大家列举展示几篇最新的m6A RNA甲基化研究成
如何利用－Immune－Cell－Atlas－基准数据集进行研究？
利用 Immune Cell Atlas 基准数据集进行研究可以采取以下步骤： 1. 明确研究问题 - 确定您想要探索的具体免疫学问题，例如特定疾病中免疫细胞的变化、免疫细胞发育的轨迹、免疫治疗反应的机制等。 2. 数据获取和预处理 - 从相关数据库或研究团队获取数据集。
如何利用多种成像技术加速癌症等疾病的研究！
近年来，科学家们通过研究开发出了多种成像技术来加速人类癌症、肥胖等疾病的研究，本文中，将相关重要研究成果进行整理，分享给大家！与大家一起学习！ 【1】Cell Rep：利用组合性成像技术成功追踪阿尔兹海默病患者大脑的退化过程 近日，一项刊登在国际杂志Cell Reports上的研究报告中，来
大牛！不到半年，发两篇Nature！
今年3月，彭慧胜团队成功将显示器件的制备与织物编织过程实现融合，在高分子复合纤维交织点集成多功能微型发光器件，揭示了纤维电极之间电场分布的独特规律，实现了大面积柔性显示织物和智能集成系统。相关研究成果以《大面积显示织物及其功能集成系统》（“Large-area display textiles in
捏造了一个年发180篇论文假“大牛”，后续文章将面临处理
为了表达对论文数、被引数等量化评价指标的不满，Camille Noûs1年前首次出现在研究领域。从那以后，Noûs成为180篇期刊论文的作者，涉及的领域包括天体物理学，分子生物学和生态学，并且正在被引用。Camille Noûs 由 RogueESR 凭空创造，这是一个由法国高等教育和研究（简称
如何利用XRF技术进行检测？
分析仪发出X射线。X射线撞击到被测样品，使样品中的元素发出荧光，然后再返回到分析仪中的X射线探测器。分析仪对返回的X射线进行计数，并通过数学运算，得出分析结果。
肿瘤研究大牛PNAS解析与癌症生长有关微量元素
铜是人体所必需的微量元素，如果出现不平衡，就会导致各种病理状况，比如癌症的发生。然而目前关于这种微量元素与癌症之间的分子和细胞作用机制，科学家们了解的还并不多。 来自瑞士洛桑联邦理工学院的一组研究人员发表了题为“Bioavailable copper modulates oxidative
全球首例利用细胞移植治疗癌症手术成功进行
全球首宗利用细胞移植治癌手术日前成功进行。英国53岁的血癌患者斯科特(Joanne Scott)在化疗无效后接受女儿捐赠的细胞，成功抑制了癌细胞扩散。 据香港《明报》报道，此前医生称斯科特只有8个月的生命。伦敦皇家自由医院(Royal Free Hospital)的医生从其女儿身上取走细胞，经实验室
6篇Nature齐发！癌症基因组计划成果成井喷之势
除了Nature一次性发表6篇论文外，Nature Genetics杂志发表了3篇，Nature Communications发表9篇，Nature Biotechnology一篇，详细报道BioArt后续会陆续发布。文章合集网址：https://www.nature.com/collectio
癌症基因组——癌症研究和云计算的里程碑
图片来源：https://www.nature.com/articles/d41586-020-00308-w 2001年，人类基因组计划完成，整个计划花费约30亿美元，1985年提出，1990年正式启动，历经十余年。肿瘤是最热门的研究领域之一，该领域的研究者们一直希望可以借助测序手段去表征肿瘤的
多篇亮点文章共同解读癌症“帮凶”如何助纣为虐！
我们都知道，癌症的发生很复杂，而且往往是由于多种因素互相作用而引起的，然而有时候癌症的发生或扩散往往需要帮手来帮忙，那么到底有那些因素会成为癌症的“帮凶”来帮助癌症发展呢？本文中小编整理了近年来相关的研究报告，分享给各位！让我们一起来认识一下癌症都有哪些“帮凶”！ 【1】两项研究揭示骨髓源性免
如何利用土壤取样器具进行土壤取样？
近几年，随着农业科技的发展，在农业生产中对于作物生长环境我们需要通过各种样本检测是非常重要的一项工作，其中项目zui多的就是土壤检测，，我们必须在检测之前采集足够具有代表性的土壤样本，过去我们都通过工具随机选择获得，但是那样会影响我们需要测试的土壤样品。自从我们了解这一情况以来，而市面上就出现了各种
如何利用历史监测数据进行苔藓物种监测？
利用历史监测数据进行苔藓物种监测可以采取以下步骤：数据整合与清理收集所有相关的历史监测数据，将其整理为统一的格式。检查数据的完整性和一致性，清理错误或缺失的数据。时空分析按时间顺序分析苔藓物种的分布和数量变化，了解其动态趋势。对比不同地理位置的监测数据，发现区域差异和共性。物种多样性评估计算不同时期
如何利用酶标仪进行细胞增殖与活力测定
酶标仪在细胞生物学与药物筛选方面有着非常高的使用频率，而在各种细胞检测实验中，细胞增殖能力的检测是最为常见也是最基础的检测之一。 ●为什么要检测细胞状态呢？ 细胞状态是直接反应细胞生理状态的重要指标，通过监测细胞在各种化合物刺激作用下的反应状态，从而确定测试分子是否对细胞增殖有影
如何利用透析法进行脱盐浓缩蛋白
二、蛋白质的分离纯化蛋白质的分离纯化方法很多，主要有：（一）根据蛋白质溶解度不同的分离方法1、蛋白质的盐析中性盐对蛋白质的溶解度有显著影响，一般在低盐浓度下随着盐浓度升高，蛋白质的溶解度增加，此称盐溶；当盐浓度继续升高时，蛋白质的溶解度不同程度下降并先后析出，这种现象称盐析，将大量盐加到蛋白质溶液中
如何利用历史监测数据进行苔藓物种监测？
利用历史监测数据进行苔藓物种监测可以通过以下步骤：数据整理与分析对历史监测数据进行系统的整理，包括苔藓物种的种类、数量、分布地点、监测时间等信息。运用统计学方法和数据分析工具，分析数据的趋势、变异性和相关性。确定基线根据整理和分析的结果，确定苔藓物种的基线状态，例如常见物种的正常分布范围、数量水平等
如何利用土壤取样器具进行土壤取样？
近几年，随着农业科技的发展，在农业生产中对于作物生长环境我们需要通过各种样本检测是非常重要的一项工作，其中项目zui多的就是土壤检测，，我们必须在检测之前采集足够具有代表性的土壤样本，过去我们都通过工具随机选择获得，但是那样会影响我们需要测试的土壤样品。自从我们了解这一情况以来，而市面上就出现了各
利用生物炭技术进行边际土地生态利用研究获进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498603.shtm
利用生物炭技术进行边际土地生态利用研究获进展
近日，广东省农业科学院农业资源与环境研究所特聘教授林启美联合中国农业大学教授商建英等科研人员，在利用生物炭技术进行边际土地生态利用研究方面取得新进展。相关研究发表于Biochar。 保护耕地红线是我国基本国策，我国边际土地面积是耕地的2倍以上，由于土壤条件恶劣，其粮食生产价值很低，科学地利用边
－“10,000个癌症基因组计划”宣告完成
旨在绘制出1万个肿瘤基因组景观图谱的美国重大科研项目——“癌症基因组图集”（The Cancer Genome Atlas，TCGA）计划已正式宣告结束。这一于2006年启动，耗资1亿美元的研究项目现在是国际肿瘤基因组协作组(International Cancer Genome Consort
又一国产高分数据库，堪称lncRNA神器
之前我们介绍了好用的CRN数据库，可以在线分析差异表达lncRNA并绘制与差异mRNA联系的网络图。那么有没有能直接出lncRNA与预后相关的生存曲线图的工具呢？答案当然是有的！这次我们就一起来看一下这个数据库！ lnCAR数据库（https://lncar.renlab.org/）是由中山大
Nature重要成果：绘制癌症的全面分子图谱
根据一项获得美国国立卫生研究院（NIH）支持的新研究发现一种乳腺癌亚型与难治性高分级浆液性卵巢癌具有许多共同的遗传特征。研究结果表明两种癌症具有相似的分子起源，这可能推动比较乳腺癌和卵巢癌亚型的治疗学数据。 研究人员利用癌症基因组图谱（TCGA）生成的部分数据，根据来自825名乳腺癌患者样本的综合