揭示麂属动物染色体融合的分子机制及基因组三维构象
麂属动物是鲸偶蹄目、反刍亚目、鹿科、麂亚科下的一类哺乳动物，属内各物种间差异巨大的染色体数目而受到生物学家关注，是研究哺乳动物成种机制和染色体演化的优异模型。小麂、黑麂是我国特有的物种，黑麂和贡山麂是我国重点保护野生动物。黑麂和贡山麂都有8条（雌性）和9条（雄性）染色体，它们的核型却不相同，而小麂有46条染色体。自20世纪80年代，我国学者对多种麂属动物染色体开展了长期研究，发现其多变的染色体数目和核型是由鹿科祖先染色体（2n=70）反复串联融合而来，但反复串联融合的分子机制尚不清楚。此外，由于常染色体和性染色体发生融合，伴随倒位等染色体变异事件，黑麂演化出一对新性染色体（neo-sex chromosomes），这是哺乳动物中迄今发现的最年轻的新性染色体，使其成为研究哺乳动物性染色体演化的重要模型。 中国科学院院士、动物研究所研究员魏辅文团队联合西北工业大学教授王文团队、浙江大学教授周琦团队，以及国内的科研与保护机构，测......阅读全文
研究从基因组水平揭示食肉目染色体进化规律
染色体进化是物种形成和演化的重要驱动因素。具有显著核型差异的食肉目动物为染色体进化研究提供了很好的研究素材。虽然前人通过比较染色体涂色法建立了食肉目内许多物种的染色体比较图谱，但这些研究的分辨率比较低，尚没有深入到精细的核苷酸水平，也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物种间的共线性区块、染色体重排以
象腿蕉染色体级别基因组组装研究获进展
中国科学院华南植物园海外知名学者John Seymour Heslop Harrison教授领导的研究团队，在象腿蕉染色体级别基因组组装研究方面取得新进展。相关研究发表于Gigascience。王梓维为该文第一作者，John Seymour Heslop Harrison和刘青副研究员为通讯作者，华
象腿蕉染色体级别基因组组装研究获进展
象腿蕉（Ensete glaucum）是芭蕉科中耐寒的蕉类植物，原产于中国云南和东南亚地区，具有观赏、饲用和药用价值。中国科学院华南植物园教授John Seymour Heslop Harrison带领的研究团队，采用单分子纳米孔、Illumina测序策略，结合染色体构像捕获技术，发表了首个象腿蕉染
用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验（二）
二、正常男性中期染色体标本的制备1.准备一个封闭环境，其相对湿度约55%(可在50%〜60%变化），温度24〜26.5℃。2.将巴斯德吸管置于玻璃载片上方2〜4in处，让一滴细胞悬液滴在玻片的左侧。然后迅速将第二滴细胞悬液滴在玻片右侧（见注释7)3.在固定液全部蒸发前，将玻片浸入盛有新鲜固定液的染色
“六谷”丰登？——首个染色体水平基因组组装完成
中国菰 中国农科院供图 中国菰 （Zizania latifolia） 原产于中国，属于禾本科稻族菰属，主要分布于中国、韩国、日本和印度等国家。中国菰的颖果为菰米，在我国古代是重要的“六谷”之一。 近日，中国农业科学院烟草研究所烟草功能成分与综合利用创新团队与中国水稻研
用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验（三）
六、中期染色体标本的变性1.在染色缸中加入大约50mL变性液，将染色缸放于75〜76℃水浴中。预热变性液使其温度达到（73±2)℃。2.从-20℃冰箱中取出实验所需的标本，室温下系列乙醇脱水，各2min。3.室温干燥片子（5min)，或在实验室抽风橱中微风吹过标本使标本干燥。4.在37〜40℃电热板
鸭嘴兽基因组图谱揭秘独特的性染色体
鸭嘴兽可能是世界上长得最奇怪的动物。据说，当欧洲学者第一次见到这种鸭子嘴、海狸尾、水獭足的动物时，他们认为这是一场精心设计的骗局。它看上去既像爬行动物又像哺乳动物，还像鸟类。实际上，它属于稀有的单孔类动物。 鸭嘴兽不仅有一些奇特的身体特征，其新的基因组版本也强调了它一些不寻常的遗传特性。在上周
用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验（一）
实验方法原理 比较基因组杂交（CGH)是一种能够在一步全基因组筛查程序，描述G带不能发现的细胞遗传物质增加或减少的分子细胞遗传学技术。CGH优于进行全染色体涂染（wcp)的常规荧光原位杂交（FISH)和多色FISH之处，是它不仅能够识别增加的未知片段的染色体来源，而且还可将该片段定位于特定的染色体区
Y染色体的起源与进化
许多属于变温动物的脊椎动物是没有性染色体的。它们的性别由外界环境因素而不是个体基因型决定。这种动物中的一部分（例如爬行动物）的性别可能取决于孵化时的温度；其他则是雌雄同体的（亦即它们每个个体中同时能产生雄性和雌性的配子）。 某个远古哺乳动物的祖先发生了等位基因的变异（即所谓的“性别基因座”）—
华南植物园揭示锥属物种基因组变异的驱动机制
遗传变异的形成与维持机制是进化生物学研究的重要议题。已有研究表明，不同物种间的基因组变异模式存在一定的相似性，并受到多种进化力量的影响。然而，关于不同进化机制对相似基因组变异景观形成的贡献以及不同机制间复杂的互作模式尚不清楚。此外，已有研究多是基于近期快速辐射产生的物种或者少量分化时间较长的物种对，
酸浆属果实进化发育基因组变异机制取得的研究进展
茄科酸浆属（Physalis）宿存花萼在受精后随浆果发育迅速膨大，形成“中国灯笼”或膨大花萼综合征（ICS）这一创新形态，包裹浆果。然而，酸浆属果实形态、生化特性及其起源背后的遗传基础有待探究。 中国科学院植物研究所研究员贺超英研究组等合作完成了毛酸浆（Physalis pubescens s
十字花科蔊菜属质体基因组研究获进展
近日，陕西省西安植物园植物多样性监测与保护团队研究发现蔊菜属质体基因组在基因数量和顺序、总长度、基因组结构、密码子使用、长重复序列和SSR方面是保守的；14个突变热点区可作为区分该属植物的候选DNA条形码；基于质体基因组和nrDNA ITS序列的系统发育树也清晰地表明，10个蔊菜属物种在碎米荠族（C
华南植物园在报春苣苔属叶绿体基因组装研究取得进展
报春苣苔属是典型的喀斯特岩溶洞穴植物，具有非常丰富的物种多样性和特有性，是研究喀斯特植物适应性进化和物种形成的理想模式。图1. 报春苣苔属叶绿体基因组一致性圈图 中科院华南植物园植物科学研究中心冯超博士等人在康明研究员的指导下，以报春苣苔属植物为材料，率先搭建了该属三个完整的叶绿体基因组并进行
首个豆科绿肥作物染色体水平基因组组装完成
紫云英 中国农科院供图近日，中国农业科学院农业资源与农业区划研究所肥料及施肥技术团队完成了首个豆科绿肥作物——紫云英的染色体水平参考基因组组装，并利用比较基因组学解析了紫云英共生结瘤的遗传基础。该研究填补了豆科绿肥作物基因组学研究的空白，为豆科植物与根瘤菌共生提供了新的见解。相关研究成
北京基因组所等揭示Y染色体表观信息遗传机制
表观遗传学是与传统遗传学相对应的概念。遗传学以基于DNA序列的中心法则来传递遗传信息，在人群中，遗传信息在世代之间稳定遗传，那么表观遗传信息是否像遗传信息一样可被子代继承，尚缺少相关有力证据。DNA甲基化是非常重要的表观遗传信息，是表观遗传学研究的重要内容。目前，鲜少有DNA甲基化在人群中的继承
破解染色体级别基因组密码解析栽培菠菜的“前世今生”
上海师范大学16日发布消息称，该校王全华研究团队在菠菜基因组研究领域又取得一项重大标志性研究成果。团队联合康奈尔大学Boyce Thompson研究所(BTI)费章君教授课题组等多家科研机构完成了新一代菠菜基因组精细图谱绘制、重要农艺性状遗传基础和菠菜驯化历史的解析。 该研究成果以“基因组解析
人类种了6000年的作物有了染色体级别基因组
大麻又名火麻、汉麻、线麻等，籽用大麻在食品、医药、纺织、造纸等多个领域被广泛使用，是一种重要的工业原料。 9月15日，福建农林大学麻类研究室联合该校基因组与生物技术中心在《植物通讯》（Plant Communications）上发表了首个染色体级别的籽用大麻参考基因组图谱。他们在此基础上解析了
科学家首次明确白菜等蔬菜祖先基因
很少有人知道，百姓餐桌上经常“露面”的白菜、甘蓝、芥菜和油菜等，在蔬菜专业研究领域都属于芸薹属。长期以来，这些蔬菜的“祖先”到底是谁?对于研究芸薹属植物起源与进化的科学家来说一直是个难解之谜。日前从中国农业科学院获悉，该院王晓武研究员带领的科研团队多年从事芸薹属物种的研究，主导了白菜基因组的测序
昆明植物所山茶属代表植物比较叶绿体基因组学研究获进展
山茶属是山茶科中包含许多举世闻名经济植物的一个重要类群，包括为人类提供天然保健饮料的茶（Camellia sinensis var. assamica 和C. sinensis var. sinensis），健康型高级食用植物油的油茶（C. oleifera）以及观赏花卉云南山茶（C. reti
学者发表紫苞芭蕉和朝天蕉首个染色体水平基因组
近日，中国科学院华南植物园副研究员黄慧润、研究员王峥峰团队在国家自然科学基金项目的资助下，研究结合Oxford Nanopore和Hi-C测序技术成功组装并发表了紫苞芭蕉和朝天蕉的首个染色体水平基因组。相关成果在线发表于《园艺研究》（Horticulture Research）。紫苞芭蕉和朝天蕉的花
我国科学家发现黄花蒿首个染色体级别基因组图谱
疟疾至今仍威胁着人类的健康。黄花蒿是全球普遍使用的抗疟疾药物——青蒿素的主要天然资源，保障全球优质廉价的青蒿素原料供应对于全球疟疾防控有重要价值。但黄花蒿基因组杂合度和重复度很高，致使高质量的黄花蒿基因组组装成为该领域难题。 在重大新药创制科技重大专项、国家重点研发计划“中医药现代化研究”重点
微阵列中期分裂相染色体的比较基因组杂交（CGH）－实验
染色体 CGH 的独特优点在于它的全基因筛查功能，与检测单一靶 DNA 剂量改变的低通量方法，如 Southern 分析、PCR 和荧光原位杂交（FISH) 相比，速度显著提高且省力。目前染色体 CGH 是一种比较完善的分子细胞遗传学方法，但是它的两个缺陷限制其作为一种综合性筛查工具的应用。来源：《
基因组研究揭示复杂染色体重排或为子宫平滑肌瘤主因
子宫平滑肌瘤是一种良性肿瘤，但影响着数百万女性的健康。对其分子机理的深入理解可为这种肿瘤的预防和治疗提供线索。芬兰肿瘤学会的Miika Mehine等人对此进行了研究，他们发现，一种与染色体破碎重组(Chromothripsis)很类似的复杂染色体重排是许多子宫平滑肌瘤染色体异常的主要原因。
微阵列中期分裂相染色体的比较基因组杂交（CGH）－实验
实验方法原理 实验材料 高分子质量基因组DNA EcoR I 或 Dpn II试剂、试剂盒 SSCcDNA阵列dNTP 混合液 dCTP 酵母 tRNADNA 聚合酶 I仪器、耗材 Qiaquick PCR 纯化试剂盒 BioPrime 标记试剂盒Micrcon 30 滤器杂交炉Maxiprep D
首个合成酵母基因组中最后一条染色体创建完成
据最新一期《自然·通讯》杂志报道，包括澳大利亚麦考瑞大学在内的国际科学家团队，在合成生物学领域取得了重大成就，成功完成了世界上首个合成酵母基因组中最后一条染色体的创建，拼上了最后一块“拼图”。酿酒酵母的彩色扫描电子显微照片。科学家从酿酒酵母中创建了世界上第一个合成真核基因组和一个新发现的tRNA新染
利用单拷贝基因组探针及染色体彩绘方法进行荧光原位...
利用单拷贝基因组探针及染色体彩绘方法进行荧光原位杂交（FISH）实验材料 SSCD-PBSA糖原RNase多聚甲醛甲酰胺试剂、试剂盒 固定液乙醇杂交缓冲液标记探针橡胶乳黏剂封固剂实验步骤 含有重复序列探针的沉淀：大分子量黏粒探针往往含有重复序列，如果在杂交前不能封闭这些序列，将导致严重的非特异性杂交
“六谷”之一菰米首个染色体水平基因组组装完成
中国菰 中国农科院供图 中国菰 （Zizania latifolia） 原产于中国，属于禾本科稻族菰属，主要分布于中国、韩国、日本和印度等国家。中国菰的颖果为菰米，在我国古代是重要的“六谷”之一。 近日，中国农业科学院烟草研究所烟草功能成分与综合利用创新团队与中国水
小叶茶染色体级别基因组图谱联合研究成果首次完成
近日，生物学预印本服务器（www.biorxiv.org）在线发表了中美科学家联合研究团队的最新成果，该团队采用单分子实时测序（SMRT）和 Hi-C技术，在20多个代表性小叶茶品种中选用杂合度较低的小叶茶良种“碧云”，将组装获得的约2.85Gb 的基因组序列挂载到了15 条假染色体上，在国际上
研究人员首次明确白菜等蔬菜祖先基因
很少人知道，百姓餐桌上经常“露面”的白菜、甘蓝、芥菜和油菜等，在蔬菜专业研究领域都属于芸薹属。长期以来，这些蔬菜的“祖先”到底是谁?对于研究芸薹属植物起源与进化的研究人员来说一直是个难解之谜。记者日前从中国农业科学院获悉，该院蔬菜花卉研究所王晓武研究员带领的科研团队对芸薹属物种基因组进化的研究获
科学家首次发布银鲳高质量染色体水平参考基因组
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519516.shtm近日，中国科学院海洋研究所在银鲳基因组学研究方面取得新进展，首次发布了我国重要名贵经济鱼类——银鲳的高质量染色体水平参考基因组，相关研究成果在《自然》子刊《科学数据》在线发表。银鲳隶属