揭示麂属动物染色体融合的分子机制及基因组三维构象

麂属动物是鲸偶蹄目、反刍亚目、鹿科、麂亚科下的一类哺乳动物,属内各物种间差异巨大的染色体数目而受到生物学家关注,是研究哺乳动物成种机制和染色体演化的优异模型。小麂、黑麂是我国特有的物种,黑麂和贡山麂是我国重点保护野生动物。黑麂和贡山麂都有8条(雌性)和9条(雄性)染色体,它们的核型却不相同,而小麂有46条染色体。自20世纪80年代,我国学者对多种麂属动物染色体开展了长期研究,发现其多变的染色体数目和核型是由鹿科祖先染色体(2n=70)反复串联融合而来,但反复串联融合的分子机制尚不清楚。此外,由于常染色体和性染色体发生融合,伴随倒位等染色体变异事件,黑麂演化出一对新性染色体(neo-sex chromosomes),这是哺乳动物中迄今发现的最年轻的新性染色体,使其成为研究哺乳动物性染色体演化的重要模型。 中国科学院院士、动物研究所研究员魏辅文团队联合西北工业大学教授王文团队、浙江大学教授周琦团队,以及国内的科研与保护机构,测......阅读全文

科学家首次发布银鲳高质量染色体水平参考基因组

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519516.shtm近日,中国科学院海洋研究所在银鲳基因组学研究方面取得新进展,首次发布了我国重要名贵经济鱼类——银鲳的高质量染色体水平参考基因组,相关研究成果在《自然》子刊《科学数据》在线发表。银鲳隶属

中医科学院中药所等完成菊花基因组测序

  近日,中国中医科学院中药研究所和安利植物研发中心宣布,利用纳米孔测序技术突破复杂基因组测序,该团队在世界首次完成了菊属植物菊花的全基因组测序,并完成了重要的药用菊花品种——杭白菊的全长转录组遗传信息发掘。相关研究成果和基因组数据已在中国中医科学院中药研究所官网及安利植物研发中心学术研究网站公布,

叶下珠科药用植物基因组研究获新进展

近日,我国科学家在叶下珠科药用植物基因组研究方面取得新进展,研究揭示了多次杂交与多倍化事件共同塑造了叶下珠科复杂的物种形成历史。相关成果发表于《植物学杂志》(The Plant Journal)。叶下珠科包含超过2000个物种,大部分具有药用功能。叶下珠科的物种具有多种不同的染色体倍性和复杂的演化历

叶下珠科药用植物基因组研究获新进展

近日,我国科学家在叶下珠科药用植物基因组研究方面取得新进展,研究揭示了多次杂交与多倍化事件共同塑造了叶下珠科复杂的物种形成历史。相关成果发表于《植物学杂志》(The Plant Journal)。叶下珠科包含超过2000个物种,大部分具有药用功能。叶下珠科的物种具有多种不同的染色体倍性和复杂的演化历

版纳植物园揭示壳斗科植物的基因组大小进化

  物种的基因组大小是物种形成和多样化中最近处的性状。通过测定物种的基因组大小,有助于了解物种的染色体倍性和基因组进化,为全基因组测序提供基础数据,提高基因组多样性的生物信息学研究的效率。前人对植物基因组大小进化的研究多集中于温带草本类群,并且未与系统发育和地理分布相关联,对热带木本植物的基因组大小

我国学者利用32种樟科植物的叶绿体基因组确定山胡椒属

  樟科山胡椒属树种经济用途广泛。山胡椒属多数种类的种子富含脂肪,可供制皂及工业油用,如油料植物山胡椒(Lindera glauca);不少种类富含芳香油,可制香料及药用,如中草药三桠乌药(Lindera obtusiloba);一些种类的木材有香气,可供家具及文体用品等用,如缅甸著名木材黄金樟的树

武汉植物园在菱属泛基因组和结构变异研究中获进展

  水稻、玉米和小麦是三大主粮作物,但主粮来源单一成为粮食安全和营养安全的隐患,因此对“孤儿作物”(orphan crop)的重视利用是应对粮食安全危机的有效手段之一。然而,随着城乡现代化进程的持续推进和现代集约化农业的快速发展,“孤儿作物”野生种和地方品种资源正日趋减少,与主粮作物相比,其种质资源

我国率先完成菊花全基因组测序

  中国中医科学院中药研究所和安利植物研发中心对外发布消息称,由他们共同发起的科研团队,在菊花全基因组计划获重大进展的同时,还完成了重要的药用菊花品种——杭白菊的全长转录组遗传信息发掘。此举使我国成为世界上首次完成菊属植物菊花全基因组测序的国家。  据了解,菊属植物染色体结构复杂,包含从2n=18到

大豆“走失”的基因“回家”了

左上为栽培大豆种子,其余为多年生野生大豆种子。山东农大供图 多年生野生大豆植株           山东农大供图从又黑又小的野生大豆,到又黄又大的栽培大豆,3月15日《自然—植物》在线发表的论文证实,在这个过程中丢失了约70%的基因位点。现在,科学家让这些丰富的遗传资源“回家”了。论文通讯作者、山东

基因组所阿尔兹海默症染色体区域研究获进展

  近日,中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”研究员雷红星,开展的阿尔兹海默症染色体区域研究取得阶段性进展,其研究论文Chromosome 19p in Alzheimer’s disease: when genome meets transcriptome于8月在J

科学团队研究组装无患子染色体级别高质量基因组

近日,中国林业科学研究院亚热带林业研究所林木种质资源研究团队在《经济作物和产品》(Industrial Crops & Products)上发表了研究论文。该研究组装了无患子的染色体级别高质量基因组,分析挖掘了油脂合成候选基因,开发验证了一套特异分子标记,为无患子基因组学研究和种质遗传改良及鉴定评价

单拷贝基因组探针及染色体彩绘方法进行荧光原位杂交

            实验材料 SSC D-PBSA 糖原 RNase 多聚甲醛 甲酰胺 试剂、试剂

破解了香气之谜-蜡梅的染色体水平精细基因组图谱公布

  “一花香十里,更值满枝开。”凌寒怒放的蜡梅,是万花凋零的寒冬里一道亮丽的风景,其香味浓郁而独特,成为历代文人墨客挥笔高歌的对象。蜡梅为何冬季开花?其独特香味由何而来?蜡梅 华中农大供图  近日,华中农业大学刘秀群、赵凯歌研究组和金双侠研究组联合西南林业大学陈龙清研究组,在《基因组生物学》在线发表

利用单拷贝基因组探针及染色体彩绘进行荧光原位杂交

            实验材料 SSC D-PBSA 糖原 RNase 多聚甲醛 甲酰胺 试剂、试剂

我国科学家发布海带高质量染色体水平参考基因组

  近日,中国科学院海洋研究所海藻种质库团队在大型海藻基因组学研究方面取得重要突破,成功构建了海带的高质量染色体水平参考基因组。该成果发表在国际期刊《科学数据》。这是该团队在海洋经济藻类基因组研究领域取得的又一重要成果,为海带的遗传改良和基因组学研究提供了关键资源。海带孤雌生殖孢子体基因组组装 海洋

利用单拷贝基因组探针及染色体彩绘方法荧光原位杂交

            实验材料 SSC D-PBSA 糖原 RNase 多聚甲醛 甲酰胺 试剂、试剂

Cell:染色体水平油松基因组组装和甲基化研究取得进展

  近期,北京林业大学生物科学与技术学院联合安诺优达在国际知名期刊Cell(IF:41.582)在线发表了题为“The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution”的研究文章,研究者对油松进行了

利用单拷贝基因组探针及染色体彩绘进行荧光原位杂交

实验材料SSCD-PBSA糖原RNase多聚甲醛甲酰胺试剂、试剂盒固定液乙醇杂交缓冲液标记探针橡胶乳黏剂封固剂实验步骤含有重复序列探针的沉淀:大分子量黏粒探针往往含有重复序列,如果在杂交前不能封闭这些序列,将导致严重的非特异性杂交背景。人 Cot1 DNA 富含重复序列,可对黏粒的重复序列产生竞争性

研究人员从从基因组水平揭示食肉目染色体进化规律

  染色体进化是物种形成和演化的重要驱动因素。具有显着核型差异的食肉目动物为染色体进化研究提供了很好的研究素材。虽然前人通过比较染色体涂色法建立了食肉目内许多物种的染色体比较图谱,但这些研究的分辨率比较低,尚没有深入到精细的核苷酸水平,也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物种间的共线性区块、染色体重排以

中国获首个染色体级别橡胶树参考基因组图谱-利于育种

  从中国科学院昆明植物研究所获悉,由该所及云南省热带作物科学研究所、华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心组成的联合研究团队,历经6年,利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术,在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列,并揭示大戟植物基因组的染色体进化

首个对叶榕完整基因组发布

本报北京4月9日电(记者杨舒)对叶榕是一种广泛分布于我国南方的植物。近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所农业基因组学技术研发与应用创新团队发布首个对叶榕的完整基因组,修正了此前学界对其基因组测序绘制中存在的大量间隙和组装错误,大幅提升了对叶榕基因组的连续性、完整性和准确性,为榕属植物性别演化提供

变形杆菌属、普罗威登斯菌属及摩根菌属简介

 变形杆菌属包括四个种,即普通变形杆菌、奇异变形杆菌、产粘变形杆菌和潘氏变性杆菌。普罗威登斯菌属有四个种:即产碱普罗威登斯菌、斯氏普罗威登斯菌、雷极普罗威登斯菌和P.rustigianii.摩根菌属只有一个种,即摩根摩根菌。  这三个属的细菌为肠道寄居的正常菌群,在一定条件下能引起各种感染,也是医源

基因组所种属特异性小蛋白功能和进化研究取得新进展

  近日,由中国科学院北京基因组研究所(以下简称基因组所)于军研究员和肖景发副研究员及其团队参与完成的国家自然基金和国家重点基础研究发展计划项目——种属特异性小蛋白的功能和进化研究取得新进展,相关研究论文被《生物化学与生物物理进展》网络版接收。  小蛋白(小于个100氨基酸长度的蛋白

石松类和蕨类植物的基因组大小与进化研究中取得新进展

  基因组的大小与物种进化之间的关系一直以来都受到学者广泛关注。作为遗传信息的载体,基因组大小不可避免地逐步增加。已有研究显示,基因组的大小同物种的进化程度之间存在一定的正相关关系。从大尺度的分类水平来看,基因组大小和物种复杂程度在总的趋势上呈正相关性。然而随着研究的深入,人们发现基因组的大小和物种

中国农科院蔬菜花卉所解析野生和栽培辣椒基因组与重要性状形成机制

近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所蔬菜分子设计育种创新团队和茄科蔬菜育种创新团队,构建了野生和栽培辣椒高质量基因组,解析了辣椒的染色体核型、基因组三维结构与基因表达调控元件的演化特征,发现了转座子驱动的结构变异和高频渐渗事件对辣椒重要性状形成的重要贡献。相关成果以“Transposon prolif

太平洋潜泥蛤染色体水平基因组研究获新进展

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516537.shtm

历时6年-获首个染色体级别的橡胶树参考基因组图谱

  记者16日从中国科学院昆明植物研究所获悉,由该所及云南省热带作物科学研究所、华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心组成的联合研究团队,历经6年,利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术,在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列,并揭示大戟植物基因组的

昆明植物所解析九倍体木本竹基因组

竹子即竹亚科是禾本科的重要分支,广泛分布于亚洲、非洲和拉丁美洲,约有1,700种。作为一类生长快、多年生、可再生的森林资源,木本竹子越来越多被用作木材的替代品,具有重要的经济价值和生态价值。有研究发现,木本竹子均为异源多倍体,具有长时间营养生长、一次性开花等独特的生物学习性。多倍体是植物尤其是竹子进

放线菌的代表属链霉菌属的介绍

  链霉菌属(Streptomyces)共约1000多种,其中包括和很多不同的种别和变种。它们具有发育良好的菌丝体,菌丝体分枝,无隔膜,直径约0.4~1微米,长短不一,多核。菌丝体有营养菌丝、气生菌丝和孢子丝之分,孢子丝再形成分生孢子。孢子丝和孢子的形态因种而异,这是链霉菌属分种的主要识别性状之一。

气单胞菌属与邻单胞菌属

  (一)气单胞菌属  气单胞菌属广泛分布于自然界,可从水源、土壤以及人的粪便中分离。本属细菌有的种可引起人类腹泻等多种感染。  1.生物学特性  (1)形态染色:革兰阴性短杆菌,大小为(1~4)μm×(0.1~1)/μm,菌体两端钝圆,单极鞭毛,运动极为活泼(除杀鲑气单胞菌外)。无芽胞,有窄的荚膜