Cell：绘制人类单细胞染色质可及性图谱
在人类细胞中，总长约2米的基因组DNA通过与组蛋白缠绕形成核小体，并经过螺旋折叠等方式盘绕形成染色体进而团聚于直径10微米的细胞核中。在细胞内的DNA需要进行转录等活动的时候，DNA才会从组蛋白中释放出来，裸露出需要与转录因子结合的位点从而便于转录，染色质的这种特性叫做染色质可及性，暴露的区域被称为“开放染色质”。作为转录调控的核心区域，顺式作用元件附近的染色质通常具有较高的可及性，利用全基因组染色质可及性检测技术可鉴定出潜在的顺式作用元件。 近日，发表在《Cell》上的一项题为“A single-cell atlas of chromatin accessibility in the human genome”的研究中，来自美国加州大学圣地亚哥分校的研究团队利用单细胞测序技术在30个人类组织中分析了约60万个细胞，并通过与之前数据的集成分析识别了222个细胞亚型并注释了近120万个顺式作用元件，绘制了目前最大规模的人类单......阅读全文
韩国人绘制出最连续人类基因图谱，解读基因的奥秘
韩国首尔国立大学和韩国基因测序公司Macrogen近日合作发表研究，完成了目前最连续的韩国人基因图谱绘制。Jeong-Sun Seo教授的团队综合运用PacBio单分子测序技术、Bionano单分子光学图谱等方法，填补了大量传统测序中存在的基因序列缺口，成功绘制迄今最连续的人类基因组图谱。201
中科院绘制246个精细亚区的全新人类脑图谱
中国科学院日前发布消息，该院自动化研究所脑网络组研究中心蒋田仔团队联合国内外其他团队经过6年的努力，成功绘制出全新的人类脑图谱，即脑网络组图谱。 该项研究的最新成果——全脑精细分区图谱及其全脑连接图谱在国际学术期刊《大脑皮层》上在线发表。 中科院自动化所团队突破了100多年来传统脑图谱绘制的
科学家建立首个人类肢体发育的单细胞时空图谱
中山大学中山医学院教授张宏波团队与英国Sanger 研究所教授Sarah Teichmann团队合作，研究建立了首个人类肢体发育的单细胞时空图谱并解析关键调控机制。12月6日，相关成果在线发表于Nature。 “我们基于单细胞转录组学和空间转录组学技术建立的首个人类肢体发育单细胞图谱，解析了从
英绘制致癌蛋白“社交网络”图谱
一种致癌蛋白的显微图像 英国癌症研究所近日发布新闻公报称，该所研究人员设计了一个新的计算模型，通过分析致癌蛋白不同于非致癌蛋白的独特行为，绘制出这些蛋白的“社交网络”图谱，为开发抗癌新药提供了新的助力。相关研究成果刊登在最近一期《科学公共图书馆·计算生物学卷》上。 研究人员发现，有许多交互的
多学科交互，深度绘制细胞图谱
大多数人类疾病实质上是细胞故障的产物。但要了解细胞的哪些部分出错会导致疾病，科学家首先需要对细胞有完整的了解。美国加州大学圣地亚哥分校医学院的研究人员及其合作者在24日发表于《自然》杂志上的论文中，介绍了尺度集成细胞（MuSIC）技术，这是一种结合了显微镜、生物化学和人工智能的技术，揭示了以前未
果蝇幼虫完整“脑图谱”绘制完成
3月20日电 一个国际科研团队日前在美国《科学》杂志上发表论文说，他们绘制出了果蝇幼虫脑部的完整连接组，即包含所有神经元及其连接状况的线路图。这是第一份完整的昆虫“脑图谱”，将成为神经科学研究的重要工具，并可能为人工智能发展提供参考。 英国剑桥大学、美国约翰斯·霍普金斯大学等机构的研究人员经过12
基因组学大牛Science发布癌症重大成果
Whitehead研究所的科学家们发现，称作为“隔绝邻域”的环状染色质结构遭到破坏可以激活能够推动侵袭性肿瘤生长的癌基因。这一研究发现对于癌症诊断及治疗均具有重大的意义。相关论文发布在《科学》(science)杂志上。 领导这一研究的是Whitehead生物医学研究所的Richard A Yo
Cell：基因组三维结构存在细胞异质性
美国国家癌症研究所、哈佛大学、马萨诸塞大学和麻省理工学院联合开展的一项研究发现，不同细胞和不同等位基因之间的基因组组织结构存在很大差异。这项研究成果于本周发表在《Cell》杂志上。 研究人员利用高通量的染色质构象捕获（Hi-C）和高通量的荧光原位杂交（hiFISH）光学图谱绘制来分析人包皮成纤
用单细胞质谱流式技术“绘制”乳腺癌微生态系统图谱
乳腺癌是妇女最常见的恶性肿瘤之一，也是女性癌症死亡的主要原因【1】。目前临床工作中尚未实现乳腺癌完全意义上的精准治疗，很大程度是因为对肿瘤微生态系统的了解不够充分。肿瘤微生态系统是由癌细胞，浸润性免疫细胞，基质细胞和其他细胞类型以及非细胞组织成分所构成【2】。由于各种遗传或者非遗传的因素，癌细胞
Protein－－Cell:揭示延缓人类骨骼肌衰老的新靶标
骨骼肌是执行机体运动功能的主要组织器官之一。与衰老相关的骨骼肌质量和功能减退被称为肌肉减少症（Sarcopenia，肌少症），这种疾病将导致老年人运动能力、平衡能力等身体机能的显著下降骨骼肌是执行机体运动功能的主要组织器官之一。与衰老相关的骨骼肌质量和功能减退被称为肌肉减少症（Sarcopenia，
新型CUT＆RUN技术实现单细胞全基因组定位
在一项新的突破性研究中，来自美国匹兹堡大学和马萨诸塞大学医学院的研究人员对一种称为CUT&RUN（cleavage under targets and release using nuclease）的方法进行改进，使得在使用少量细胞（包括单细胞和单个植入前胚胎）的情形下，它适合用来研究转录因子和
Nature子刊：突破性测序技术绘制甲基化图谱
通过一种新的DNA测序技术，研究人员首次绘制了致病菌全基因组甲基化标记图谱。通过比较相关菌株之间的甲基化模式，他们发现了称作噬菌体的病毒感染细菌显著改变宿主的一种方式。 布莱根妇女医院(Brigham and Women"s Hospital)、霍华德休斯医学研究所研究员Matthew K
首个东亚人群炎症性肠病基因图谱绘制完成
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500867.shtm近日，同济大学附属第十人民医院教授刘占举团队联合美国学者黄海亮、广州医科大学附属三院教授李明松在《自然-遗传学》发表论文，阐述了东亚人群与欧洲人群在炎症性肠病（IBD）相关基因位点上的
科学家系统性绘制神经胶质细胞分子图谱
神经胶质细胞不仅可以支持和连接不同神经元，还起着分配营养物质、参与修复和吞噬过程等重要作用，但神经胶质细胞的亚群类型和分子特性仍有待深入了解。美国宾夕法尼亚大学的研究团队绘制了人类多种神经胶质细胞各阶段分子图谱，相关成果在《Cell Stem Cell》发表，论文的标题为：A single-ce
华人学者Cancer－Cell：首张人类癌症非编码RNA综合图谱
随着对重要但知之甚少的基因组部分——“DNA暗物质”的认识日渐增加，从根本上改变了科学家们研究疾病的方式。人类基因组中包含有大约2万个蛋白质编码基因（占总数的不到2%），而70%的基因组被转录为非编码RNA。但当前仍尚未系统地调查过这些称作为长链非编码RNAs (lncRNAs)的片段以及它们发
2016值得关注的技术：综合单细胞图谱
《Nature Methods》盘点2015年度技术，选出了最受关注的技术成果：单粒子低温电子显微镜（cryo-EM）技术。 除此之外，也整理出了2016年最值得关注的几项技术，分别为：细胞内蛋白标记（Protein labeling in cells）、细胞核结构（Unraveling nuc
中国科学家经过6努力领衔绘制完成全新人类脑图谱
一张全新人类脑图谱日前由中国科学家领衔绘制完成。它比目前最常用的由德国神经科学家布罗德曼在100多年前绘制的脑图谱精细4—5倍，第一次建立了宏观尺度上的活体全脑连接图谱。近日，全脑精细分区图谱及全脑连接图谱在国际期刊《大脑皮层》上在线发表。 记者20日从中科院获悉，中科院自动化所脑网络组研究
一次“看清”百万细胞！科学家突破单细胞测序局限
在生命科学领域，单细胞测序技术就像一把“精密手术刀”，让科学家得以剖析每个细胞的分子特征，为深入理解生命的复杂性提供独特视角。然而，现有的单细胞测序技术的局限性往往需要科学家做出取舍：要么漏掉某些细胞，要么抓不住细胞形态。这便导致在应对一些复杂研究场景时，现有技术就如同“盲人摸象”般看不到细胞所
一次“看清”百万细胞！科学家突破单细胞测序局限
在生命科学领域，单细胞测序技术就像一把“精密手术刀”，让科学家得以剖析每个细胞的分子特征，为深入理解生命的复杂性提供独特视角。然而，现有的单细胞测序技术的局限性往往需要科学家做出取舍：要么漏掉某些细胞，要么抓不住细胞形态。这便导致在应对一些复杂研究场景时，现有技术就如同“盲人摸象”般看不到细胞所处环
单细胞测序技术应用于发育生物学研究登顶三大学术杂志
2019年即将结束，在这一年中，单细胞测序的火热充分展示了该技术在科学研究领域的重要。发育生物学作为生命基本过程研究的基础学科，单细胞测序技术是该领域研究突飞猛进的助推器。在这300多个日夜里，科学研究成果殿堂《Cell》、《Nature》、《Science》上有哪些发育生物学的成果跟单细胞技术
科学家开发出基因挖掘新策略
得益于双子叶模式植物拟南芥和单子叶模式植物水稻的遗传学研究，植物发育生物学在过去40年取得了长足发展。植物分生组织（干细胞）的建立与维持机制、重要组织和器官的分化轨迹及其核心调控网络已初步建立。这些基础知识为作物农艺性状的分子调控解析与设计改造奠定了基础。然而，随着正向遗传学筛选的日趋饱和，基因
单细胞测序技术(single－cell－sequencing)－综述（一）
单细胞生物学最近几年是非常热门的研究方向。在这一领域中，最前沿的则是单细胞测序技术。传统测序方法一次处理成千上万个细胞，得到的变异水平也是成千上万个细胞的平均后水平。但是，就如同世界上没有完全相同的两片树叶一样，没有两个细胞是完全相同的。所以，单细胞测序对于研究单个细胞就显得至关重要。单细胞测序可以
张锋最新Cell论文：细胞命运调控可预测
全面了解基因调控网络（GRN）控制细胞状态是分子生物学的基本目标。转录因子（Transcription factors，TF）结合到基因组中的特定序列，以改变基因表达和特定细胞的状态。单个转录因子的过表达就足以导致细胞命运的深刻变化，例如，改变转录因子的表达可以诱导多能干细胞向特定类型细胞的再分
重庆大学学者在Nature发文：绘制单细胞分辨率的肿瘤脉管图谱
2024年7月10日23:00，重庆大学附属三峡医院作为第一完成单位和第一通讯作者单位联合清华大学、北京协和医院以及中南大学湘雅医院，在国际顶级学术期刊《Nature》（自然）发表最新研究成果。 论文题目为《Tumor vasculature at single-cell resolution
人类X染色质的观察
实验概要掌握观察与鉴别X染色质的简易方法，识别其形态特征及所在部位，为进一步研究人体染色体的畸变与疾病提供参考条件。实验原理1、X染色质的发现1949年，加拿大学者Barr等人在猫的神经元细胞核中首次在雌猫体内发现一种染色较深的浓缩小体，而在雄猫中则没有这种结构。进一步研究发现，除猫外，其他雌性哺乳
人类X染色质的观察
一、 实验目的 掌握观察与鉴别X染色质的简易方法，识别其形态特征及所在部位，为进一步研究人体染色体的畸变与疾病提供参考条件。 二、 实验原理 1、发现 1949年，加拿大学者Barr等人在雌猫的神经元细胞核中首次发现一种染色较深的浓缩小体，而在雄猫则没有这种结构。进一步研究发现，除猫外，其他雌性哺乳
庄小威院士：新成像方法测量染色质的表观遗传修饰
空间组学方法的最新发展使得单细胞转录组分析和三维基因组组织具有较高的空间分辨率。空间分辨单细胞表观基因组学方法将扩展空间组学工具的知识库，加速对细胞和组织功能的空间调节的理解。 2022年10月21日，哈佛大学庄小威团队在Cell 在线发表题为“Spatially resolved epige
我国学者发表基于单细胞转录组测序数据的小鼠细胞图谱
在国家自然科学基金项目（项目编号：31722027）等资助下，浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队在单细胞组学技术及哺乳动物全细胞表达谱系分析研究中取得突破性进展。相关成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”（利用微孔板测序
我国学者发表基于单细胞转录组测序数据的小鼠细胞图谱
在国家自然科学基金项目（项目编号：31722027）等资助下，浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队在单细胞组学技术及哺乳动物全细胞表达谱系分析研究中取得突破性进展。相关成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”（利用微孔板测序
Cell：科学家成功绘制出人类癌细胞的全局基因互作网络
癌症是一种异质性疾病(heterogeneous disease)，而且不同的癌症亚型之间也有着不同的遗传根源，因此多种类型的癌症往往会依赖于多种途径得以发展，而且其对抗癌制剂的反应也并不相同，目前对于研究人员最大的挑战就是如何精确地定义癌症利用的多种途径，以及寻找癌症易感性来帮助开发新型抗癌疗