我国科学家解析小RNA的生物合成机制

小RNA是真核生物中重要的基因调控分子,在生长发育、基因沉默、抵御病毒等动植物的各类生理过程中起着至关重要的作用。小RNA的生物合成中,Dicer家族核酸内切酶选择性识别小RNA前体,切割RNA至特定长度,并选择性地将一条链递呈给下游AGO蛋白从而介导下游基因沉默。Dicer如何起到“分子尺”和“分子刀”的功能,切割小RNA前体生成特定长度的小RNA这一机制尚不清晰。 国家“十三五”科技计划“蛋白质机器与生命过程调控”重点专项“植物非编码RNA介导基因沉默过程中重要蛋白质机器的结构功能研究(2016YFA0503200)”项目取得重要进展。项目团队以植物中特异性生成24-nt小RNA的Dicer Like 3 (DCL3)为对象开展了研究,利用合成的DCL3天然底物模拟物和冷冻电镜技术,解析了DCL3和天然底物模拟物的复合物结构,并从中观测到Dicer家族蛋白同时对前体小RNA的5’和3’端同时产生特异性识别的机制。项目团......阅读全文

关于小干扰RNA的结构介绍

  siRNA具有明确定义的结构:具有磷酸化5'末端的短(通常20至24bp)双链RNA(dsRNA)和具有两个突出核苷酸的羟基化3'末端。该切酶酶催化生产的siRNA由长的dsRNA和小发夹RNA。siRNA也可以通过转染引入细胞。由于原则上任何基因都可以被具有互补序列的合成siR

Science:小RNA分子的大作用

  如果我们的神经系统发育被扰乱,我们便会有罹患上严重神经系统疾病,造成感觉系统、运动控制和认知功能受损的风险。从人类到线虫,对于所有具有发达神经系统的生物都是这种情况。   现在来自哥本哈根大学的一项新研究,揭示了线虫中一个叫做mir-79的小分子调控神经发育的机制。这一分子是发育过程中特异神经

关于小干扰RNA的发现介绍

  siRNA最早是由英国的大卫·包孔博(David Baulcombe)团队发现,是植物中的转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing;PTGS)现象的一部分,其研究结果发表于《科学》。2001年,汤玛士·涂许尔(Thomas Tuschl)团队发现合成

核小RNA的基本信息

细胞内有核小RNA(small nuclearRNA,snRNA)。它是真核生物转录后加工过程中RNA剪接体(spliceosome)的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。其长度在哺乳动物中约为100-215个核苷酸,共分为7类,由于含U丰富,故编号为U1~U7。snRNA只存在于细胞核中,其中U

细胞化学词汇非编码小RNA

中文名称:非编码小RNA英文名称:small non-messenger RNA;snmRNA定  义:细胞中一大类由几十核苷酸到几百核苷酸组成的、不编码蛋白质的RNA。本身或与蛋白质结合形成的复合体有生物学功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干扰小RNA、时序小RNA等。应用学科:生物化学

小干扰RNA的概念和作用

在后生生物中,由Dicer产生的小干扰RNA(siRNA)被整合到称为RNA诱导沉默复合物(RISC)。该复合物含有内切核酸酶,切割与siRNA结合的完全互补的mRNA,产生的片段然后被核酸外切酶降解。 siRNA通常用于实验室细胞培养中阻断基因的功能。SiRNA被认为是病毒先天免疫系统的一部分,可

关于小干扰RNA的基本介绍

  小干扰RNA(Small interfering RNA;siRNA)有时称为短干扰RNA(short interfering RNA)或沉默RNA(silencing RNA),是一个长20到25个核苷酸的双股RNA,在生物学上有许多不同的用途。已知siRNA主要参与RNA干扰(RNAi)现象

特定小RNA半衰期可迅速转换

神经细胞小RNA半衰期可迅速转换  小核糖核酸(miRNAs,又称小RNA)通常被认为具有很长的半衰期。然而,瑞士科学家日前发现,在小鼠的视网膜中,为了响应黑暗与光亮的影响,特定miRNA的水平能够迅速作出改变——这应该归因于高速的衰减与转录。此外,他们指出,高转变率可能是许多神经细

多功能植物小RNA分析工具|一站式小RNA分析及可视化

  日,《科学通报》在线发表了华南农业大学园艺学院教授夏瑞团队最新研究成果,他们研究开发出一款多功能植物小RNA分析工具——sRNAminer,可便于研究人员进行一站式小RNA分析及可视化。   据介绍,植物小RNA是植物生长发育和营养繁殖过程的重要调控分子。目前已有的分析工具多数依赖于命令行环境,

细胞内核小RNA的基本特点

①稳定,半寿期常与核糖体相近;②含量丰富,如U1分子在每个核中的含量可有10^6个;③普遍性,在动、植物细胞中均含有snRNA;④高度保守,如人和爪蟾的U1snRNA有90%的序列相同。通常snRNA不是游离存在,而是与蛋白质结合成复合物,成为小核核糖核蛋白颗粒(small nuclear ribo

PNAS:小分子RNA引发肥胖代谢问题

科学家发现了机体生物事件链中的一种关键分子,这些事件会导致脂肪肝疾病,2型糖尿病和其他与肥胖有关的代谢异常疾病。通过阻挡这种分子,研究人员就能够扭转肥胖小鼠中其引发一些病理发展。这项研究结果刊登在《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上。MIR-34A是一种小分子RNA,在肥胖小鼠和患有脂肪肝的患者

细胞化学词汇核糖体小RNA

中文名称:核糖体小RNA英文名称:small ribosomal RNA定  义:(1)核糖体小亚基的RNA。如真核生物的18S rRNA和原核的16S rRNA。(2)核糖体中的小分子RNA,除18S和16S rRNA,还包括5S和5.8S rRNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核

PNAS:病毒小RNA抑制登革病毒复制

  每年有超过100个国家报道了近100百万例登革病毒(Dengue virus,DENV)感染性疾病,包括50万例登革出血热。伊蚊属的埃及伊蚊(Aedes aegypti)和白纹伊蚊(Aedes albopictus)是DENV的主要传播者。MicroRNA(miRNA)是一类具有调控功能

非编码小RNA的结构和功能

中文名称非编码小RNA英文名称small non-messenger RNA;snmRNA定  义细胞中一大类由几十核苷酸到几百核苷酸组成的、不编码蛋白质的RNA。本身或与蛋白质结合形成的复合体有生物学功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干扰小RNA、时序小RNA等。应用学科生物化学与分子生

核仁小分子RNA的定义和分布

核仁小RNA与其它RNA的处理和修饰有关,如核糖体和剪接体核小RNA、gRNA等。核仁小RNA是一个与特性化的非编码RNA相关的大家族。核仁小分子RNA调节细胞死亡,即便是血糖得到合适地调控,糖尿病病人经常会遭受并发症带来的痛苦,如心力衰竭(heart failure)、肾功能不全和免疫系统中B细胞

细胞化学词汇核糖体小RNA

中文名称:核糖体小RNA英文名称:small ribosomal RNA定  义:(1)核糖体小亚基的RNA。如真核生物的18S rRNA和原核的16S rRNA。(2)核糖体中的小分子RNA,除18S和16S rRNA,还包括5S和5.8S rRNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核

细胞化学词汇核糖体小RNA

中文名称:核糖体小RNA英文名称:small ribosomal RNA定  义:(1)核糖体小亚基的RNA。如真核生物的18S rRNA和原核的16S rRNA。(2)核糖体中的小分子RNA,除18S和16S rRNA,还包括5S和5.8S rRNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核

Nature新文章解析小RNA调控机制

  来自波士顿儿童医院和哈佛大学医学院的研究人员,在新研究中揭示了在Lin28介导的let-7选择性调控中起关键作用的一种核酸酶,相关论文“A role for the Perlman syndrome exonuclease Dis3l2 in the Lin28–let-7 pathwa

细胞内核小RNA的基本结构

细胞内有核小RNA(small nuclearRNA,snRNA)。它是真核生物转录后加工过程中RNA剪接体(spliceosome)的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。其长度在哺乳动物中约为100-215个核苷酸,共分为7类,由于含U丰富,故编号为U1~U7。snRNA只存在于细胞核中,其中U

关于小干扰RNA的siRNA设计介绍

  最初,siRNA序列的选择是基于实验经验而获得的(Elbashir et al. 2001,2002)。最近,生物信息学工具被用来设计siRNA(表18-1),目前多个数据库收录了经过实验确证的siRNA和shRNA。值得推荐的是,在设计新的siRNA之前可以通过搜索已有的siRNA数据库和科研

胞质小RNA的基本信息

中文名称胞质小RNA英文名称small cytoplasmic RNA;scRNA定  义细胞质中的小分子RNA。通常指转移核糖核酸(tRNA)和小的核糖体RNA(rRNA),如5S rRNA、5.8S rRNA等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

非编码小RNA的基本信息

中文名称非编码小RNA英文名称small non-messenger RNA;snmRNA定  义细胞中一大类由几十核苷酸到几百核苷酸组成的、不编码蛋白质的RNA。本身或与蛋白质结合形成的复合体有生物学功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干扰小RNA、时序小RNA等。应用学科生物化学与分子生

关于核仁小分子RNA的基本介绍

  核仁小RNA(small nucleolar RNA),是近来生物学研究的热点,由内含子编码,分布于真核生物细胞核仁的小分子非编码RNA,具有保守的结构元件。已证明有多种功能,主要参与rRNA的加工;反义snoRNA指导rRNA核糖甲基化。   核仁小RNA与其它RNA的处理和修饰有关,如核糖

关于小分子RNA的作用方式介绍

  microRNA-RISC对靶基因mRNA的作用主要取决于它与靶基因转录体序列互补的程度,有三种方式。  第一种是切断靶基因的mRNA分子——miRNA与靶基因完全互补结合,作用方式和功能与siRNA非常相似,最后切割靶mRNA。在植物中,大部分miRNA都以这种方式,靶基因mRNA断裂后,无p

小RNA(tsRNA)的发现与临床价值

转移 RNA (tRNA) 衍生的小RNA (tsRNA) 是一种新型的非编码小 RNA,可通过酶从 tRNA 上切割下来,在转录和翻译水平调节基因表达。tRNA的化学修饰可以直接影响 tsRNA 的产生和生物学功能。tsRNA参与多种疾病的发病机制,包括免疫紊乱、代谢紊乱和恶性肿瘤的发展,并且是各

核糖体小RNA的概念和结构

中文名称核糖体小RNA英文名称small ribosomal RNA定  义(1)核糖体小亚基的RNA。如真核生物的18S rRNA和原核的16S rRNA。(2)核糖体中的小分子RNA,除18S和16S rRNA,还包括5S和5.8S rRNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因

小分子RNA的识别方法的介绍

  多个研究小组采用生物化学结合以及生物信息学的方法开展对miRNAs的研究工作。由于据推测都是由Dicer酶降解RNA得到的,21—23个碱基大小、有5’端磷酸基和3’羟基的RNA片段,有的实验室采用改良的定向克隆方法来筛选具有相同特征的小分子——筛选一定大小的RNA分子,连接到3’和5’的适配子

关于核小RNA的基本信息介绍

  细胞内有核小RNA(small nuclearRNA,snRNA)。它是真核生物转录后加工过程中RNA剪接体(spliceosome)的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。其长度在哺乳动物中约为100-215个核苷酸,共分为7类,由于含U丰富,故编号为U1~U7。snRNA只存在于细胞核中,其

计算小RNA分子的单细胞测序新法

最近,卡罗林斯卡学院的研究人员开发出了一种单细胞程序,测量了单个胚胎干细胞中短的非编码RNA序列的绝对数量。这种新方法可以加深我们对于“基因是如何被调节、不同的细胞类型如何发展”的理解。相关研究结果发表在10月31日的《Nature Biotechnology》。当我们基因中的信息被使用时――例如构

小干扰RNA转录后基因沉默的介绍

  siRNA诱导的转录后基因沉默始于RNA诱导的沉默复合物(RISC)的组装。该复合物通过切割编码靶基因的mRNA分子来沉默某些基因表达。为了开始该过程,两条siRNA链中的一条(引导链)将被装载到RISC中,而另一条链即过客链被降解。某些Dicer酶可能负责将引导链加载到RISC中。然后,siR