多功能植物小RNA分析工具|一站式小RNA分析及可视化
日，《科学通报》在线发表了华南农业大学园艺学院教授夏瑞团队最新研究成果，他们研究开发出一款多功能植物小RNA分析工具——sRNAminer，可便于研究人员进行一站式小RNA分析及可视化。 据介绍，植物小RNA是植物生长发育和营养繁殖过程的重要调控分子。目前已有的分析工具多数依赖于命令行环境，且功能较单一，无法有效支持研究人员对植物小RNA生物功能的深度探索。 该团队开发的sRNAminer包含了常用的植物小RNA数据分析功能。其功能主要分为四大部分：一是数据预处理，包括接头去除，数据去冗余，去除目标外的非编码RNA和质体污染以及读段回帖；二是植物三种主要类型小RNA的鉴定与表达量计算；三是包括小RNA靶位点预测、介导PHAS位点产生的小RNA trigger预测、降解组测序数据分析等常用的功能；四是小RNA位点可视化。其中，sRNAminer的IGV-sRNA模块让用户能够针对相应类型的小RNA的特征对小RNA位点进行......阅读全文
多功能植物小RNA分析工具|一站式小RNA分析及可视化
日，《科学通报》在线发表了华南农业大学园艺学院教授夏瑞团队最新研究成果，他们研究开发出一款多功能植物小RNA分析工具——sRNAminer，可便于研究人员进行一站式小RNA分析及可视化。 据介绍，植物小RNA是植物生长发育和营养繁殖过程的重要调控分子。目前已有的分析工具多数依赖于命令行环境，
科学家开发一款多功能植物小RNA分析工具
近日，《科学通报》在线发表了华南农业大学园艺学院教授夏瑞团队最新研究成果，他们研究开发出一款多功能植物小RNA分析工具——sRNAminer，可便于研究人员进行一站式小RNA分析及可视化。 sRNAminer软件整体功能概览。课题组供图 据介绍，植物小RNA是植物生长发育和营养繁殖过程的重要
新型植物RNA甲基化编辑工具研发成功
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519898.shtm近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所联合国内多家单位成功开发出新型植物RNA甲基化编辑工具。该研究对作物基因编辑育种有重要的潜在应用价值。相关研究成果发表在《植物生物技术》（Pla
新型植物RNA甲基化编辑工具研发成功
记者10月6日从华中农业大学获悉，该校棉花遗传改良团队开发出基于CRISPR/dCas13（Rx）的新型植物RNA甲基化编辑工具。研究成果日前发表于《先进科学》杂志。N6-甲基腺苷（m6A）是真核生物mRNA最普遍的内部修饰，可能引起mRNA配对、热动力和折叠性能的改变，从而影响RNA的可变剪接、翻
华中农大科研团队开发出新型植物RNA甲基化编辑工具
9月4日，华中农业大学棉花遗传改良团队在《先进科学》杂志在线发表了其最新研究成果，该团队开发出基于CRISPR/dCas13(Rx)的新型植物RNA甲基化编辑工具。 以往对植物中m6A功能分析研究，多数是利用遗传扰动如敲除、超表达方式进行。然而，直接增加或删除m6A系统的任何关键组分会导致植物
华中农大科研团队开发出新型植物RNA甲基化编辑工具
9月4日，华中农业大学棉花遗传改良团队在《先进科学》杂志在线发表了其最新研究成果，该团队开发出基于CRISPR/dCas13(Rx)的新型植物RNA甲基化编辑工具。以往对植物中m6A功能分析研究，多数是利用遗传扰动如敲除、超表达方式进行。然而，直接增加或删除m6A系统的任何关键组分会导致植物中m6A
华中农大科研团队开发出新型植物RNA甲基化编辑工具
9月4日，华中农业大学棉花遗传改良团队在《先进科学》杂志在线发表了其最新研究成果，该团队开发出基于CRISPR/dCas13(Rx)的新型植物RNA甲基化编辑工具。以往对植物中m6A功能分析研究，多数是利用遗传扰动如敲除、超表达方式进行。然而，直接增加或删除m6A系统的任何关键组分会导致植物中m6A
植物病毒RNA提取
大多植物病毒RNA为单链RNA，并且其极性与mRNA极性相同，植物病毒RNA提取较为简单，一般使用酚氯仿即可获得满意结果。 一、材料 提纯TMV病毒液（10mg/ml）。 二、设备 冷冻台式离心机，低温真空干燥仪，电泳仪，电泳槽。 三、试剂 TE-饱和酚:氯仿（1:1），氯仿
分离植物总RNA
实验概要认识真核生物RNA的组成及分离的原理；学习RNA提取过程中抑制RNA酶活性的方法。实验原理真核生物的RNA包括rRNA、tRNA和mRNA。一个典型的真核细胞约含有10-5~10-6mg的RNA，其中80-85%为rRNA，其余15-20%主要由各种低分子量RNA组成（如tRNA、核内小分子
提取植物rna方法
提到RNA的提取，是不是充满了心酸和无奈呀，抽提过程中已十分小心谨慎了，但是有时候还是会出现RNA污染、降解的悲剧。别怕，今天小编给您介绍一种新的RNA提取方法，比以前的方法更快、更有效和更可靠，让您从此不用再担心的RNA的抽提了。 众所周知：获得纯净、完整的RNA样品，是对一种植物的活性基因
植物RNA提取实验
直接研磨法 液氮研磨法 实验方法原理 通过裂解液β-巯基乙醇迅速裂解细胞和灭活细胞RNA酶，植物RNA助提剂PLANTaid帮助结合多糖多酚并通过离
植物RNA提取实验
实验方法原理 独特的裂解液/β-巯基乙醇迅速裂解细胞和灭活细胞RNA酶，植物RNA助提剂PLANTaid帮助结合多糖多酚并通过离心去除，然后用乙醇调节结合条件后，RNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜，再通过一系列快速的漂洗－离心的步骤，去蛋白液和漂洗液将细胞代谢物，蛋白等杂质去除，
科学家研发新RNA成像工具
发表在《自然―方法学》上的一项报告介绍了一种用于人体活细胞内目标RNA成像的工具。这种针对RNA探针的被命名为Spinach2的工具，拓宽了可标记RNA的范围，从而更有利于动态定位那些与疾病有关的“有毒RNA”。 Spinach是一种经过设计的RNA复合物，其可以与小型合成分子结
植物RNA的制备实验
实验材料 RNA试剂、试剂盒 TELiCl无水乙醇乙酸钠氯仿仪器、耗材 匀浆器离心管离心机水浴锅实验步骤 1. 研钵和研棒先用液氮冷却，称出15 g 冻结植物组织于研钵中（加液氮保持冻结）。2. 用研棒磨成粉末，立即转移到一个盛有150 ml，研磨缓冲液和50 ml TLE缓冲液平衡酚的500
植物RNA的制备实验
酚/SDS法 实验材料 RNA 试剂、试剂盒
植物总RNA的分离
实验概要认识真核生物RNA的组成及分离的原理；学习RNA提取过程中抑制RNA酶活性的方法。实验原理真核生物的RNA包括rRNA、tRNA和mRNA。一个典型的真核细胞约含有10-5~10-6mg的RNA，其中80-85%为rRNA，其余15-20%主要由各种低分子量RNA组成（如tRNA、核内小分子
深入研究非编码RNA的新工具
最近，加拿大多伦多大学Donnelly中心的一个研究小组，开发出了一种方法，可使科学家们能够深入探索“ncRNAs在人类细胞内做了什么”。 这项研究发表在5月19日的《Molecular Cell》杂志，同一天，来自新加坡基因组研究所的Yue Wan研究组与斯坦福大学的Howard Chang
植物总RNA的提取实验
研磨法 实验方法原理 在液氮中研磨植物材料, 使部分细胞破碎, 进一步使植物细胞在裂解液中裂解, 用醋酸钠和氯仿沉淀蛋白质, 异丙醇沉淀核酸, 溶解后经氯化锂
酚/SDS法制备植物RNA
试剂、试剂盒 液氮 研磨缓冲液 TLE 缓冲液平衡酚) 氯仿 IiCl 溶液 (DEPC 处理） 乙酸钠 (DEPC 处理）
植物总RNA的提取实验
实验方法原理 在液氮中研磨植物材料, 使部分细胞破碎, 进一步使植物细胞在裂解液中裂解, 用醋酸钠和氯仿沉淀蛋白质, 异丙醇沉淀核酸, 溶解后经氯化锂沉淀总RNA, 洗涤后得到高质量的RNA。本实验旨在了解和掌握植物总RNA 的分离和纯化方法。实验材料 植物RNA试剂、试剂盒 尿素Tris-HClN
酚/SDS法制备植物RNA
试剂、试剂盒 液氮 研磨缓冲液TLE 缓冲液平衡酚)氯仿IiCl 溶液 (DEPC 处理）乙酸钠 (DEPC 处理） 无水乙醇DEPC 处理水仪器、耗材 Folytron 匀浆器（BrinkmarmPT10 35)实验步骤 一 材料与设备1) 液氮2) 研磨缓冲液 18mol/LTris，0.09m
植物病毒(plant－viruses)RNA提取
大多植物病毒RNA为单链RNA，并且其极性与mRNA极性相同，植物病毒RNA提取较为简单，一般使用酚氯仿即可获得满意结果。 一、材料 提纯TMV病毒液（10mg/ml）。 二、设备 冷冻台式离心机，低温真空干燥仪，电泳仪，电泳槽。 三、试剂 TE
植物组织总RNA的提取
实验概要由于RNA分子的结构特点，容易受RNA酶的攻击反应而降解，加上RNA酶极为稳定且广泛存在，因而在提取过程中要严格防止RNA酶的污染，并设法抑制其活性，这是本实验成败的关键。所有的组织中均存在RNA酶，人的皮肤、手指、试剂、容器等均可能被污染，因此全部实验过程中均需戴手套操作并经常更换（使用一
植物总RNA的提取规程
一、实验目的掌握植物总RNA提取的原理和方法二、实验原理RNA的提取：破坏细胞膜—除去蛋白—除去DNA—除去盐离子。RNase是一类生物活性极其稳定的酶类，能耐高温、耐酸、耐碱，高压灭菌处理也不能使其完全失活。在提取RNA实验中，要尽量抑制RNase的活性。•DEPC（焦磷酸二乙酯）是很强的RNas
MIT牛人发布可编程的RNA控制工具
MIT研究团队开发了可以追踪和操纵基因表达的模块化可编程蛋白，并将这一强大的研究工具发表在四月二十六日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 这些蛋白能够自定义结合任意RNA序列，“在生物和生物工程领域有广泛的应用，”这篇文章的通讯作者，MIT副教授Edward Boyden说。举例来说，人们可
中山大学等开发RNA编辑新工具
CRISPR-Cas9系统使用一段引导RNA（其与Cas9蛋白结合起来才能发挥作用）来靶定一段DNA，并裂解双链DNA。这一现象提出了一个问题：由一个Dicer结合RNA元件和一段反义RNA组成的一种人造小RNA（asRNA，是否也能用来诱导Dicer处理和降解一段特定的RNA呢？ 为此，5月
改良植物或成新的碳捕获工具
据美国物理学家组织网近日报道，美国一个研究小组正在研究改良植物的技术，以期在未来几十年中，将植物光合作用捕获碳的能力提高一倍。当前植物光合作用每年从大气中捕获的碳只有30亿吨，而为遏制气候恶化，每年需要从大气中减少约90亿吨碳。该研究发表在10月出版的《生物科学》上。 研究由美国劳伦斯·
植物中的RNA沉默的分类
植物中的RNA沉默根据作用靶标可以分为两类: 以RNA为靶标, 使其降解或抑制蛋白翻译, 称为转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing, PTGS); 以染色质为靶标, 使其基因启动子或组蛋白甲基化从而抑制 RNA 转录的起始, 称为转录基因沉默(tra
植物中的RNA沉默额定分类
植物中的RNA沉默根据作用靶标可以分为两类: 以RNA为靶标, 使其降解或抑制蛋白翻译, 称为转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing, PTGS); 以染色质为靶标, 使其基因启动子或组蛋白甲基化从而抑制 RNA 转录的起始, 称为转录基因沉默(tra
2.2.1－酚/SDS法制备植物RNA
酚/SDS法比较适合于从RNA含量较丰富.易提取的植物材料中制备RNA试剂、试剂盒液氮研磨缓冲液TLE 缓冲液平衡酚)氯仿IiCl 溶液 (DEPC 处理）乙酸钠 (DEPC 处理）无水乙醇DEPC 处理水仪器、耗材Folytron 匀浆器（BrinkmarmPT10 35)实验步骤一 材料与设备1