切口平移法标记探针的步骤
(1)模板 DNA 的制备用限制性内切酶将载体上的外源 DNA 酶切并进行琼脂糖凝胶电泳回收纯化,琼脂糖残留可抑制切口平移反应,因此彻底清除琼脂糖至关重要。也可以用带有外源 DNA 克隆片段的重组载体为模板来切口平移制备探针。(2)切口平移标记将模板 DNA 水溶液、DNase Ⅰ、未标记的三磷酸单核苷酸混合物、切口平移标记缓冲液、DNA 聚合酶Ⅰ、32P 标记的核苷酸依次加入反应管,14℃保温20min。(3)纯化标记探针,测定活性,-20℃保存,1~2周内可用。......阅读全文
切口平移法标记探针的步骤
(1)模板 DNA 的制备用限制性内切酶将载体上的外源 DNA 酶切并进行琼脂糖凝胶电泳回收纯化,琼脂糖残留可抑制切口平移反应,因此彻底清除琼脂糖至关重要。也可以用带有外源 DNA 克隆片段的重组载体为模板来切口平移制备探针。(2)切口平移标记将模板 DNA 水溶液、DNase Ⅰ、未标记的三磷酸单
切口平移法双链DNA探针标记法
切口平移法(nick translation) 当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的3'羟基末端。同时该酶具有从5'→3'的核酸外切酶活性,能从切口的5'端除去核苷酸。由于在切去核苷酸的同时又在切口的3'
切口平移法的操作步骤
1、用DNase I处理双链DNA,使之随机产生单链断裂。2、DNA聚合酶I的5‘-3’外切酶活性从断裂处5‘除去一个核苷酸,同时5‘-3'聚合酶活性将一个放射性核素标记的单核苷酸引入到断裂的3'端。3、反应重复进行,结果标记的核苷酸代替了原来的核苷酸残基,形成了放射性的DNA分子。
切口平移法的操作步骤
1、用DNase I处理双链DNA,使之随机产生单链断裂。2、DNA聚合酶I的5‘-3’外切酶活性从断裂处5‘除去一个核苷酸,同时5‘-3'聚合酶活性将一个放射性核素标记的单核苷酸引入到断裂的3'端。3、反应重复进行,结果标记的核苷酸代替了原来的核苷酸残基,形成了放射性的DNA分子。
双链DNA探针切口平移法
当双链DNA 分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA 聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的3'羟基末端。同时该酶具有从5'→3'的核酸外切酶活性,能从切口的5'端除去核苷酸。由于在切去核苷酸的同时又在切口的3'端补上核苷酸,从而使切口沿着DNA
双链DNA探针切口平移法
当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的3'羟基末端。同时该酶具有从5'→3'的核酸外切酶活性,能从切口的5'端除去核苷酸。由于在切去核苷酸的同时又在切口的3'端补上核苷酸,从而使切口沿着DNA链移动,用
双链DNA探针切口平移法
当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的3'羟基末端。同时该酶具有从5'→3'的核酸外切酶活性,能从切口的5'端除去核苷酸。由于在切去核苷酸的同时又在切口的3'端补上核苷酸,从而使切口沿着DNA链移动,
切口平移的操作步骤
1、用DNase I处理双链DNA,使之随机产生单链断裂。2、DNA聚合酶I的5‘-3’外切酶活性从断裂处5‘除去一个核苷酸,同时5‘-3'聚合酶活性将一个放射性核素标记的单核苷酸引入到断裂的3'端。3、反应重复进行,结果标记的核苷酸代替了原来的核苷酸残基,形成了放射性的DNA分子。
切口平移法的缺点
切口平移法的缺点:1.放射物质摄入率较低;2.长时间反应后在DNA Pol I的外切酶活性的作用下,将已经掺入的放射性物质游离下来,降低了摄入率;3.必须有高纯度的模板DNA;4.反应后必须除去未反应的放射性dNTP。
生物素酰化探针的制备实验——切口平移法
在标准的切口平移实验体系中,生物素-11-dNTP取代了dNTP,DNA酶I 的浓度调整到可生成长100~500个核苷酸的范围,其他生物素酰化的核苷酸也可代替生生物素-11-dNTP。实验材料DNA试剂、试剂盒DNA聚合酶dNTP2-疏基乙醇生物素甘油NaClEDTASDS无水乙醇仪器、耗材注射器电
什么是切口平移法?
双链DNA探针的合成方法主要有下列两种:切口平移法和随机引物合成法。切口平移法(nick translation) 利用微量的DNA酶Ⅰ使待标记的双链DNA分子产生若干切口,然后利用DNA聚合酶Ⅰ的5'→3'外切酶活性从从切口的5'端除去核苷酸;同时DNA聚合酶Ⅰ还有5
常用DAN探针制备的方法介绍切口平移
切口平移(nick translation)是制备核酸探针的常用方法之一。该方法用 DNase Ⅰ在双链 DNA 内部切开若干个单链切口形成3'-OH 末端,而不打断 DNA 的双链结构;用大肠杆菌 DNA 聚合酶Ⅰ的5'→3'核酸外切酶活性,从游离5'端降解双链 D
缺口平移法为例介绍DNA探针的标记方法
缺口平移法是最常用的探针标记法,反应体系的主要成分有DNA酶I(DNase I)、大肠杆菌DNA聚合酶I(DNA polymerase I)、三种三磷酸脱氧核糖核苷酸、一种同位素标记的核苷酸(如dATP、dTTP、dCTP,”P—dGTP)。首先用适当浓度的DNA酶I在探针DNA双链分子上随机切开若
DNA切口平移的定义
切口平移(nick translation)是切口产生3‘羟基和5’磷酸基团,DNA延伸合成3‘端,5’端被小片段降解,缺口位点沿着双链向3‘端移动,是在体外向DNA分子引入放射性标记核苷酸的技术。
切口平移的技术特点
切口平移(nick translation)是切口产生3‘羟基和5’磷酸基团,DNA延伸合成3‘端,5’端被小片段降解,缺口位点沿着双链向3‘端移动,是在体外向DNA分子引入放射性标记核苷酸的技术。
随机引物法标记探针
实验概要本实验探针标记采用TAKARA公司的随机引物标记试剂盒Ver.2。实验步骤1.于1.5ml离心管中加入5μl H2O,2μl引物(N6),5μl DNA(0.1μg-1μg)。2.充分混匀,98°C 3分钟。3.离心1秒钟,将离心管盖上的汽化水甩下。4.加入2.5μl dNTPs(各2.5m
核酸探针标记的实验过程
实验原理分子生物研究中,zui常用的探针即为双链DNA探针,它广泛应用于转基因植物拷贝数的鉴定、临床诊断等方面。双链DNA探针的合成方法主要有下列两种:切口平移法和随机引物合成法。切口平移法(nick translation) 当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可
核酸探针标记的实验过程
实验原理分子生物研究中,zui常用的探针即为双链DNA探针,它广泛应用于转基因植物拷贝数的鉴定、临床诊断等方面。双链DNA探针的合成方法主要有下列两种:切口平移法和随机引物合成法。切口平移法(nick translation) 当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将
核酸探针标记的实验过程
实验原理分子生物研究中,最常用的探针即为双链DNA探针,它广泛应用于转基因植物拷贝数的鉴定、临床诊断等方面。双链DNA探针的合成方法主要有下列两种:切口平移法和随机引物合成法。切口平移法(nick translation) 当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将
核酸探针标记
实验概要核酸探针根据核酸的性质,可分为DNA和RNA探针;根据是否使用放射性标记物与否,可分为放射性标记探针和非放射性标记探针;根据是否存在互补链,可分为单链和双链探针;根据放射性标记物掺入情况,可分为均匀标记和末端标记探针。实验原理分子生物研究中,最常用的探针即为双链DNA探针,它广泛应用于转基因
双链DNA探针标记法介绍
分子生物研究中,最常用的探针即为双链DNA探针,它广泛应用于基因的鉴定、临床诊断等方面。双链DNA探针的合成方法主要有下列两种:切口平移法和随机引物合成法。1. 切口平移法(nick translation) 当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的
分子杂交技术
分子杂交技术 互补的核苷酸序列通过Walson-Crick碱基配对形成稳定的杂合双链分子DNA分子的过程称为杂交。杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测。 杂交的双方是所使用探针和要检测的核酸。该检测对象可以是克隆化的基因组DNA,也可以是细胞总DNA或总R
简述探针标记方法
①缺口平移标记法。利用的是DNA聚合酶I能修复DNA链的功能。该法先由DNaseI在DNA双链上随机切出切口,然后DNA聚合酶I沿缺口水解5´;端核苷酸,同时在3´;端修复加入被标记核苷酸,切口平行推移。缺口平移法快速、简便、成本相对较低、比活性相对较高、标记均匀,多用于大分
基因探针的标记方法介绍
①缺口平移标记法。利用的是DNA聚合酶I能修复DNA链的功能。该法先由DNaseI在DNA双链上随机切出切口,然后DNA聚合酶I沿缺口水解5´端核苷酸,同时在3´端修复加入被标记核苷酸,切口平行推移。缺口平移法快速、简便、成本相对较低、比活性相对较高、标记均匀,多用于大分子DNA标记,(>100
探针标记方法的主要类型介绍
①缺口平移标记法。利用的是DNA聚合酶I能修复DNA链的功能。该法先由DNaseI在DNA双链上随机切出切口,然后DNA聚合酶I沿缺口水解5´端核苷酸,同时在3´端修复加入被标记核苷酸,切口平行推移。缺口平移法快速、简便、成本相对较低、比活性相对较高、标记均匀,多用于大分子DNA标记,(>1000b
核酸探针标记及原位杂交1
一、核酸探针标记核酸探针分子杂交是指具有一定同源性的两条核酸单链在一定条件下(适宜的温度及离子强度等)可按碱基互补原则形成双链,此杂交过程是高度特异的。杂交的双方是待测核酸及探针。核酸探针根据核酸的性质,可分为DNA和RNA探针;根据标记物不同,可分为放射性标记探针和非放射性标记探针两大类;根据是否
随机引物法介绍DNA探针的标记方法
变性的探针溶液加入6个核苷酸的随机DNA小片段,作为引物,当后者与单链DNA多个部位互补结合后,按碱基互补原则不断在其3'-OH端添加同位素标记的单核苷酸,这样也可以获得放射性比活性很高的DNA探针。
分子生物学常用实验技术(十二)
第九章分子杂交技术 互补的核苷酸序列通过Walson-Crick 碱基配对形成稳定的杂合双链分子DNA 分子的过程称为杂交。杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测。杂交的双方是所使用探针和要检测的核酸。该检测对象可以是克隆化的基因组DNA,也可以是细胞总D
双链DNA探针标记法的介绍
分子生物研究中,最常用的探针即为双链DNA探针,它广泛应用于基因的鉴定、临床诊断等方面。 双链DNA探针的合成方法主要有下列两种:切口平移法和随机引物合成法。 切口平移法(nick translation) 当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到
探针有哪些类型
探针有DNA探针和寡核苷酸探针。探针标记方法有:随机引物标记、切口平移法、末端标记法。切口平移是切口产生3'羟基和5'磷酸基团,DNA延伸合成3'端,5'端被小片段降解,缺口位点沿着双链向3'端移动,是在体外向DNA分子引入放射性标记核苷酸的技术。随机引物合成