《Cell》探讨“垃圾”DNA的新功能
美国国立卫生研究院下属国家关节肌肉骨骼及皮肤病研究所(NIAMS)的科学家们在新研究中证实，过去被认为是“垃圾”的DNA在免疫系统反应中发挥了关键性的作用。研究结果发表在近期的《细胞》(Cell)杂志上，有可能促成发现治疗免疫相关疾病的新靶点。 人类基因组中有32亿DNA碱基对，但只有2%的区域能够编码蛋白质。其他的大量冗余DNA，和基因一样都是遗传材料，但却不能编码用于建造动物身体、加速细胞内化学反应的蛋白质。到目前为止，这些基因组DNA的功能大多未知且遭到忽视。 采用全基因组DNA测序技术，美国国立卫生研究院的研究人员对基因组DNA进行了检测，以确定哪部分积极参与支持了各种细胞功能。研究人员发现信号传导及转录激活因子(STAT)蛋白家族成员在形成免疫系统辅助性T细胞(T helper cell)特性中发挥主要作用。重要的是，当研究“垃圾”DNA的影响时，他们看到STAT蛋白对于增强子活性的调控有可能导......阅读全文
《基因组蛋白质组与生物信息学报》：蛋白质组学技术面临
《基因组蛋白质组与生物信息学报》：蛋白质组学技术面临挑战 2003年4月人类基因组图谱基本绘制完成，但对基因的调节与功能问题仍未能解读。由于基因的功能主要是通过其编码的蛋白质来实现，蛋白质才是生命活动真正的执行者，所以越来越多的科学家致力于蛋白质的研究，试图找出人类疾病的致病机理，最终解决人类
美研究人员发布报告称发现埃博拉感染的关键蛋白质
美国研究人员26日发布报告说，他们发现埃博拉病毒必须与一种蛋白质相结合，才能感染宿主，这一发现将有助于预防埃博拉病毒传播并治疗其导致的埃博拉出血热。 研究人员在最新一期美国《微生物学》杂志上指出，老鼠实验显示，埃博拉病毒必须通过一种代号为NPC1的蛋白质才能进入体细胞，一旦阻止埃博拉病毒与该蛋
美研究人员发布报告称发现埃博拉感染的关键蛋白质
美国研究人员26日发布报告说，他们发现埃博拉病毒必须与一种蛋白质相结合，才能感染宿主，这一发现将有助于预防埃博拉病毒传播并治疗其导致的埃博拉出血热。 研究人员在最新一期美国《微生物学》杂志上指出，老鼠实验显示，埃博拉病毒必须通过一种代号为NPC1的蛋白质才能进入体细胞，一旦阻止埃博拉病毒与该蛋
北京蛋白质组研究中心招聘博士后和研究人员
北京蛋白质组研究中心蛋白质翻译后修饰研究室招聘博士后和研究人员 实验室概况： 北京蛋白质组学研究中心是由军事医学科学院与北京大学、清华大学等单位于2005年成立的综合性研究机构，是人类肝脏蛋白质组计划(HLPP)的国际总部和蛋白质组学国家重点实验室的主体。在国家相关部门的大力支持和
蛋白质组学不能被基因组和转录组取代
基因和蛋白并不存在严格的线性关系ORF并不预示一定存在相应的功能性基因mRNA水平并非与蛋白质的表达水平对应翻译后修饰及同工蛋白质（isforms)等现象在基因水平无从表现
蛋白质组学之逆袭：深度注释基因组（三）
人类尚未充分认识复杂的癌症基因组是如何转化为导致复发和死亡的驱动生物学的，将蛋白质组学与基因组学结合在一起能够让我们获得对癌症的新认识，同时提供一种有价值的资源以便科学界能够用来提出关于这些疾病的新假设，以及治疗它的手段。蛋白质基因组学终有一天会被证明是一种强大的临床工具，使得人类能够横跨癌症基因组
蛋白质组学之逆袭：深度注释基因组（一）
申请课题缺创新点？撰写论文没思路？急着毕业时间紧？别怕，对于吉凯，一切都是套路！更有甚者，对于宇宙终极难题：“屌丝如何逆袭白富美？”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。从前，在生物学研究领域，有一个白富美叫基因组学（Genomics），她有一项强大的技能：DNA测序，凭借这项技能，她完成了对多种物
蛋白质组学之逆袭：深度注释基因组（二）
针对一些乳腺癌亚型和携带常见突变如PIK3CA和TP53突变的肿瘤，分析结果揭示出了一些新的蛋白质标记物和信号通路。另外将一些基因中的拷贝数改变与蛋白质水平联系一起，从而鉴别出了10个新的候选调控因子。其中两个候选基因SKP1和 CETN3可能与癌基因EGFR有关联。EGFR是一种特别具有侵
KTH研究人员确定了300种调节细胞分裂过程的蛋白质
希望为抗击癌症做出贡献，瑞典的研究人员发布了一种新的分子图谱，用于调节细胞分裂过程的蛋白质-鉴定出300种此类蛋白质 今天发布在科学杂志《自然》上的数据的发布意义重大，因为它有助于使医学研究更接近能够靶向特定蛋白质来治疗癌症的地步。共同作者，KTH huang家理工学院教授艾玛·伦德伯格(Emma
Science：日本研究人员发现决定性别的蛋白质SryT
据日本《共同网》报道，日本大阪大学分子生物学教员宫胁慎吾研究团队10月1日在美国《科学》杂志网络版发表的研究成果称其发现了决定老鼠性别的蛋白质，该团队认为“有望弄清决定哺乳动物性别的机制，今后还将以人类为对象进行验证”。 哺乳动物在性别方面具有共同的特征，即拥有“XX”染色体的为雌性，拥有“X
仅采用NgAgo蛋白质，研究人员称跟韩春雨实验没有关联
这是自韩春雨之后，中国研究人员发表的有关NgAgo基因技术的第二篇学术论文。刘东在接受科技日报记者独家专访时表示，从学术角度确实无法评价，“我们用不同的系统，也没有重复他（韩春雨）的实验，仅仅是都用了NgAgo这样一个蛋白质而已，无法做任何关联和讨论。” ▲刘东，2011年获德国马克斯-德尔布
日科学家发现可抑制基因组损伤的蛋白质
日本科学家发表于最新一期《自然》杂志网络版的论文说，他们经动物实验发现，人类以及许多动物体内都有的Zuc蛋白质在抑制转位子造成的基因组损伤过程中发挥着重要作用，这项研究成果将有助于解开不孕症发病的机制。 日本科学技术振兴机构和东京大学15日联合发表新闻公报介绍了上述成果。公报说，动物基因组
蛋白质结构在结构基因组学中的应用介绍
已经测定了酿酒酵母（Saccharomyces cereuisiae）、线虫（Caenorhabditis elegans）、果蝇（Drosophilamelanogaster）、拟南芥（Arabidopsis thaliana）等模式生物的基因组序列.。特别值得一提的是，随着人类基因310福建
研究人员识别新的C9orf72相关ALS蛋白质靶点
在最新发表于《Science》的研究中，科学家们发现：以被称为SUPT4H1的单个蛋白质为靶点，能够减少C9orf72基因扩张所创造的三种毒性实体的水平。这一发现暗示，SUPT4H1可能作为有前途的候选者，为C9orf72基因导致的肌萎缩侧索硬化症（ALS）患者开发疗法。这项研究由美国ALS协会
Nature发布大规模癌症蛋白质基因组学研究重要成果
基于来自癌症基因组图谱(TCGA)计划的数据，一个多机构科学家小组完成了首个大规模的乳腺癌“蛋白质基因组学”（ proteogenomic）研究，将一些DNA突变与蛋白质信号联系到一起，并帮助确定了一些驱动癌症的基因。 这项研究旨在通过蛋白质和它们的修饰来更好地认识癌症。发表在5月25日《自然
逐次修正基因组法：有效提高非模式生物蛋白质组鉴定...
逐次修正基因组法：有效提高非模式生物蛋白质组鉴定的新策略随着高通量测序技术的不断崛起，全基因组测序也逐步普及。越来越多的物种基因组予以公布。目前，主要有两种获得研究物种参考基因组的策略：de novo 基因组拼接和基于mapping算法的基因组序列修正，mapping是指将所有测序读段通过序列比对定
基因组所开发出编码蛋白质DNA序列并行比对工具ParaAT
中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”章张研究员，带领其团队成功开发出“编码蛋白质DNA序列并行比对工具—ParaAT（Parallel Alignment and back-Translation）”。该研究成果发表在Biochemical and Biop
《基因组蛋白质组与生物信息学报》影响因子显著提高
在日前举行的第四届中国英文版科技期刊研讨会上，中国科学技术信息研究所发布了《2007年版中国英文版科技期刊引证报告》。根据这一报告提供的数据，中科院北京基因组研究所主办的《基因组蛋白质组与生物信息学报》（Genomics, Proteomics & Bioinformatics，简称GPB）的
对人结肠癌组织开展了基因组和蛋白质组分析
贝勒医学院的研究人员近日对人结肠癌组织开展了基因组和蛋白质组分析，并将结果发表在《Cell》杂志上。这种全面的研究策略有助于深入了解结肠癌，并有望推动早期诊断和新型疗法的开发。Bing Zhang博士 在贝勒医学院分子和人类遗传学教授Bing Zhang的领导下，研究团队生成了基因组和蛋白质组
基因组学与蛋白质组学两大巨头建立合作
AB Sciex和Illumina公司近日联手推出OneOmics™ 计划，其目的是在云计算环境中结合新一代蛋白质组学（NGP）和新一代测序（NGS）的工具。作为此计划的一部分，Illumina的应用商店BaseSpace将托管AB Sciex的SWATH™ 蛋白质组学云工具，这使得BaseSp
修正基因组法有效提高非模式生物蛋白质组鉴定的新策略
随着高通量测序技术的不断崛起，全基因组测序也逐步普及。越来越多的物种基因组予以公布。目前，主要有两种获得研究物种参考基因组的策略：de novo 基因组拼接和基于mapping算法的基因组序列修正，mapping是指将所有测序读段通过序列比对定位到参考基因组上。De novo 基因组拼接是利用短
基因组学做不了的事－蛋白质组学更精准打击癌症
近日，国际人类蛋白质组组织公布了2020年度权威奖励获奖名单，中国科学院院士、军事科学院军事医学研究院研究员贺福初荣获蛋白质组学杰出成就奖。 贺福初院士率先提出人类蛋白质组计划的科学目标与技术路线，倡导并领衔了人类第一个关于组织、器官的蛋白质组计划，揭示了人体首个器官（肝脏）蛋白质组。2014年
人类结肠癌蛋白质基因组学分析揭示出新的治疗策略
在一项新的研究中，来自美国国家癌症研究所、贝勒医学院、太平洋西北国家实验室、华盛顿大学、范德堡大学和得克萨斯大学卫生科学中心等研究机构的研究人员通过对来自患者的结肠癌组织产生的全部基因和蛋白的分析，对这种肿瘤有了更全面的认识，并指出新的癌症生物学机制和可能的新治疗策略。这项研究强烈支持对肿瘤组织
组学期刊三巨头：《基因组、蛋白质组与生物信息学报》
近年来GPB的中国风封面 冯丽妃摄 从编委到现任执行副主编，美国费城儿童医院和宾夕法尼亚大学教授邢毅与《基因组蛋白质组与生物信息学报》（Genomics, Proteomics & Bioinformatics，以下简称GPB）期刊结缘已近10年。前些年，该刊编辑部不时找他约稿子，以解“缺米之炊”
“十二五”基因组和蛋白质组技术发展战略研究启动
6月9日至10日，科技部中国生物技术发展中心在深圳组织召开了“基因组和蛋白质组技术发展战略研讨会”，标志着该领域的“十二五”发展战略规划研究正式启动。国内从事基因组学和蛋白质组学研究的院士、专家、学者共40多人参加了会议。科技部基础司张先恩司长应邀出席会议，生物中心马宏建副主任、深圳市委常委、常
Cell：人类结肠癌蛋白质基因组学分析揭示新的治疗策略
近日，美国贝勒医学院及太平洋西北国家实验室的科学家们利用基因组蛋白组学相结合的分析技术首次对人类结肠癌的蛋白基因组进行了详尽的分析，全面剖析了结直肠癌相关生物标志物、药物靶点和肿瘤抗原，并在Cell杂志上发表题为“Proteogenomic Analysis of Human Colon Can
十二五基因组和蛋白质组技术发展战略研究启动
6月9日至10日，科技部中国生物技术发展中心在深圳组织召开了“基因组和蛋白质组技术发展战略研讨会”，标志着该领域的“十二五”发展战略规划研究正式启动。国内从事基因组学和蛋白质组学研究的院士、专家、学者共40多人参加了会议。科技部基础司张先恩司长应邀出席会议，生物中心马宏建副主任、深圳市委常委、常
利用LCMS/MS等方法－发现线粒体基因组编码蛋白质的新模式
图 线粒体编码基因CYTB的双重翻译模式 在国家自然科学基金项目（批准号：92254301、92357302、32025010）等资助下，中国科学院广州生物医药与健康研究院刘兴国研究员团队在线粒体基因组编码研究方面取得进展，研究成果以“线粒体基因CYTB编码的新蛋白质CYTB-187AA调控哺乳动
Autoimmunity：能研究细胞表观基因组学特性的新型工具
如今研究人员都知道，表观基因组在控制DNA表达上扮演着关键角色，而且表观基因组的一系列改变与多种健康问题直接相关，比如癌症、自身免疫性障碍等多种疾病，但目前科学家们关于表观基因组并不是知道地很多，甚至也并没有工具去研究表观基因组。图片来源：CC0 Public Domain 刊登在国际杂志Au
最新研究！马普所实验室”重建“基因组
合成生物学研究不仅包括观察和描述生命过程，而且试图模仿天然的生命过程。在最近的一项研究中。马丁斯里德马克斯·普朗克生物化学研究所的科学家们制作了一个系统，该系统能够再生其自身的DNA和蛋白质构件的一部分。 马克斯·普朗克生物化学研究所“仿生系统”研究小组的负责人Hannes Mutschler