PNAS：明星家族又添新作用机制
RUB和马普研究所的研究人员揭示了细胞转运调控蛋白的新作用机制，他们发现核心开关蛋白Rab的活性受到其互作蛋白两个指状结构的调解，文章发表在美国国家科学院院刊PNAS杂志上。调控细胞生长的Ras蛋白只受到一个指状结构的调解，而Rab则需要两个指状结构，研究人员由此解密了GTPases家族的新作用机制。 GTPases 是我们体内一类重要的小分子，Ras和Rab都是其中的一员。Rab蛋白控制不同细胞区域之间的多种运输过程，如果运输系统被破坏就会发生肥胖症等疾病。 Rab和Ras蛋白作用相似，都类似于一个开关。当开关开启时高能分子GTP结合，而开关关闭时结合的是低能分子GDP。RabGAP蛋白负责催化GTP 的水解，在这一过程中GTP分解为GDP和一个磷酸基团。现在，研究人员以最高原子分辨率观察并记录了上述过程。 动态机制 研究人员通过X射线结构分析，首次确定了Rab•RabGAP蛋白复合体的空间结......阅读全文
怎么确定小分子与蛋白的活性位点
1 A:对接的时候，小分子与蛋白的活性位点是怎么选呢?参照文献么?选择的时候，活性位点有很多，是选择什么样的位点对接呢? B:先分析你的化合物和已知底物的相似性关系，再选择合适位点。 A:我刚刚开始接触这些，不太懂，相似性关系是分析哪方面呢? B:拓扑结构相似性，电荷分
小核糖核酸分子可调控肿瘤血管新生
来自中国科学院昆明动物研究所的消息，国际学术期刊《致癌基因》最新发表了该所肿瘤生物学学科组陈策实课题组的成果，他们在小核糖核酸分子调控乳腺癌血管新生功能及机制的研究中取得了重要进展。 据陈策实研究员介绍，实体瘤生长，需依赖于血液提供充足的营养和氧气。因此，只要将肿瘤的发展阻断在血管新生阶段，就
细胞水平小分子结合相应靶向蛋白的验证
我们不再是我们，我们依然是我们——当Alpha®遇上CETSA®小分子药物研发中，筛选能有效结合目标蛋白的分子是非常耗时耗（财）力的一个环节，但又是必须进行的工作。高失败率源于结合情况的错综复杂，体外生化实验的结合效果，往往不能很好的在细胞水平进行重现。这其中可能是因为分子在穿越细胞膜时，出现了被修
Cancer－Cell:科学家发现新型抗癌小分子
约翰霍普金斯大学科学家在培养细胞体系中发现一种小分子具有破坏癌细胞分裂，防止癌细胞生长的功能。相关报道发表在近期的Cancer Cell杂志上。 该研究是由Marikki Laiho博士领导的研究团队完成的。科学家发现小分子BMH-21能够破坏RNA聚合酶POL I转录通路，阻断癌
Adv－Sci：发现天然小分子，诱导胃癌铁死亡
胃癌（GC），是全球健康领域的重要挑战，是全球第五大最常见癌症和第三大癌症相关死亡原因。胃癌患者的预后通常较差，五年生存率低于30%，作为标准治疗方案的传统化疗疗效有限，且存在显著副作用。尽管靶向治疗和免疫治疗等治疗方法取得了进展，但这些疗法在胃癌仍然面临挑战。靶向治疗往往面临耐药性且疗效有限，
如何处理对接时候的蛋白自带小分子？
1A：请教蛋白自带好多小分子，对接的时候怎么处理呢?答：对接时并不需要这些小分子，其用途只有一个——帮助定位口袋。因此，保存你需要的小分子，其他清除掉。但有一种情况例外，辅酶分子或类似作用的分子应当保留在受体中，因为它将作为受体的一部分与配体产生相互作用。A：有的还带有金属离子~ 是不是也应该保留。
类器官常用小分子及应用文献汇总
小分子(small molecules)是指分子量小于1000道尔顿(尤其小于400道尔顿)，并具有生物学功能的化合物。此类化合物与细胞因子和蛋白不同，其可直接穿过细胞膜进入细胞，进而发挥相应的功能，适用于各种属的细胞。小分子化合物的作用靶点众多，已广泛应用于干细胞，类器官，免疫学，神经生物
新型小分子开关可控制蛋白质活性
蛋白质分子（示意图） 据美国匹兹堡大学网站最近报道，该校研究团队开发出一种新技术，利用小分子磷化氢作为“开关”能控制蛋白质的活性。该技术为人们更好地研究生物过程中的分子行为提供了一种有力工具。 蛋白质是生物体内种类最多、最重要的成分之一，从牙齿、骨骼、皮肤，到器官的生长和酶与激素的产生，都离不开
罗三中：把大志向写进小分子
罗三中，青年化学家，中科院化学研究所研究员 中科院分子识别与功能重点实验室副主任、国家杰出青年科学基金奖获得者、万人计划青年拔尖人才德国Thieme化学期刊奖获得者……这一系列的头衔和荣誉，属于一位青年化学家——罗三中。 今年40岁的罗三中，来自中国科学院化学研究所，主要从事有机小分子催化研
小分子样品采用柱层析的分离纯化方法
在很多化学药品的原料药合成制备过程中，有可能遇到无法重结晶，只能靠过柱分离来纯化的样品。 目前，利穗科技纯化过以及涉及到的化学药品有数百种，使用到的填料种类和纯化方法也有几十种。目前比较有新意和比较常用的方法有：高效正相硅胶层析柱法、反相C18高效DAC柱层析法、大孔吸附树脂法、高效树脂纯化法、DE
怎么确定小分子与蛋白的活性位点？
1A:对接的时候，小分子与蛋白的活性位点是怎么选呢?参照文献么?选择的时候，活性位点有很多，是选择什么样的位点对接呢?B:先分析你的化合物和已知底物的相似性关系，再选择合适位点。A:我刚刚开始接触这些，不太懂，相似性关系是分析哪方面呢?B:拓扑结构相似性，电荷分部的相似性。一类化合物能结合多个口袋的
新型小分子药物促进肝脏肠道皮肤修复再生
近期，厦门大学两个科研团队联合攻关，研制出一种能促进受损的肝脏、肠道及皮肤等器官修复与再生的重要小分子药物，并在小鼠实验中取得了优异的治疗效果。也许未来的某一天，人们只需通过服药，便可实现受损肝脏、肠道和皮肤的修复与再生。这被认为为再生医学领域带来了新的“曙光”。 8月18日，这项研究成果发表
阻遏蛋白的活性受到小分子诱导的控制
细菌对环境的改变必需作出迅速的反应。营养供给随时都可能发生变化，反复反常。要能得以幸存必需具有可以变换不同代谢底物的能力。单细胞真核生物也同样生活在不断变化环境中；而更为复杂的多细胞生物都具有一套恒定的代谢途径，而无需对外部环境作出反应。在细菌中是很需要灵活性，也需要很经济，因为细菌遇到合适的环境就
辅助分子伴侣Cpn11/20/23调控叶绿体ClpP蛋白酶复合体
中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）丛尧研究组与中科院遗传与发育研究所刘翠敏研究组合作，在Nature Plants上，在线发表了研究论文The cryo-EM structure of the chloroplast ClpP complex。该研究首次解析了莱茵衣
研究揭示光合蓝细菌超分子复合体组装与能量传递的结构基础
光合作用的核心在于光能捕获与电子能量转移高效协同。在蓝细菌中，缺铁条件下表达的铁应激诱导蛋白A（IsiA）会围绕光系统I（PSI）形成多种不同类型的超复合体，以增强光能捕获和光调控能力。其中，多层IsiA-PSI复合体在蓝细菌适应环境胁迫中发挥重要作用，但学界对其精细的三维结构、组装机制及能量传递途
研究提出植物蓝光受体CRY复合体组装与信号传递的分子机制
近日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心等，揭示了植物蓝光受体隐花素（CRY）在感知蓝光信号后，与下游效应蛋白GLOSSY2（GL2）组装形成信号转导复合体，进而调控植物表皮蜡质合成的分子过程。植物通过光受体蛋白感知不同波段的光信号，其中隐花素CRY负责感知350nm至500nm波长的蓝光。CRY被
新型靶向性疗法有望治疗白血病
编码BAP1组蛋白H2A去泛素酶复合体的ASXL1的突变通常会发生在人类骨髓肿瘤中，而且与患者预后较差存在一致性的关联。然而ASXL1突变改变BAP1活性并驱动白血病发生的精确性分子机制，目前研究人员并不清楚。 近日，一篇发表在国际杂志Nature Cancer 上题为“Epigenetic
研究人员破译了一种基因缺陷补偿分子机制
许多疾病都是由基因缺陷引起的。然而，它们的严重程度可能因个体患者而异。如今，在一项新的研究中，来自德国马克斯普朗克心肺研究所的研究人员破译了一种导致这种现象的分子机制。因此，缺陷基因的mRNA确保相关基因被激活从而补偿这种基因缺陷。他们希望利用这种机制开发新的治疗方法。相关研究结果发表在2019
有机小分子分离膜和单分子层共价有机框架膜研究获进展
近日，中国科学院国家纳米科学中心研究员唐智勇和李连山团队，在有机小分子分离膜和用于有机体系盐差能转化的单分子层共价有机框架（COF）膜研究方面取得进展。有机小分子分离膜的相关工作以Regulating the Layered Stacking of a Covalent Triazine Frame
揭示粘土矿物影响有机小分子缩合形成大分子的机制
氨基酸等有机小分子向蛋白质等生物大分子的转化是早期地球生命化学演化的重要阶段之一。粘土矿物在早期地球环境中分布广泛，其表面反应活性高，易与有机质结合，被认为是影响有机大分子形成的重要潜在因素。多年来，许多研究组已对水溶液体系（模拟原始海洋环境）中粘土矿物对氨基酸等有机小分子聚合形成有机大分子的反
我国科学家揭示线粒体外膜转位酶复合体组装的分子机制
线粒体是真核细胞能量代谢的主要场所，与动植物的生长发育密切相关，99%的线粒体蛋白由细胞核基因编码，在细胞质中合成。线粒体外膜TOM转位酶复合体负责绝大部分前体蛋白运输进入线粒体，再通过其他转位酶复合体分选至线粒体的各个部位。TOM复合体是由7个亚基组成的膜蛋白复合体，其组装过程是多步骤且高度动
我国科学家揭示线粒体外膜转位酶复合体组装的分子机制
线粒体是真核细胞能量代谢的主要场所，与动植物的生长发育密切相关，99%的线粒体蛋白由细胞核基因编码，在细胞质中合成。线粒体外膜TOM转位酶复合体负责绝大部分前体蛋白运输进入线粒体，再通过其他转位酶复合体分选至线粒体的各个部位。TOM复合体是由7个亚基组成的膜蛋白复合体，其组装过程是多步骤且高度动
青岛能源所:小分子产物研究受到广泛关注
近年来，电催化还原CO2生成有经济价值的小分子产物研究受到广泛关注，但是如何实现在较负的催化电压下保持较高的催化效率，从而达到高催化产率的目标，一直是领域内的研究难点。日前，中科院青岛生物能源与过程研究所环境友好催化过程研究组设计了一种新型的二维/零维的氧化铋纳米片/氮掺杂石墨烯量子点（Bi2O
Cell：这个小分子或攻克RAS无成药性难题！
RAS基因是一个“臭名昭著”的致癌基因，在超过30％的肿瘤中，这个基因都会产生突变。但自从1982年发现它以来，三十多年过去了，一直没有药物能够成功攻克这个难题。RAS也成为了所谓“无成药性”（Undruggable）靶点。 这一情况有望在近期得到解决。在上周发表在著名科学期刊《Cell》上的
SpCas9，首个抗CRISPR小分子抑制剂
自2012年“魔剪”技术出道以来，该技术一直备受争议。一些专家指出，基因编辑在很多层面上难以实现控制。近年来，科学家一直致力于开发“抗CRISPR”系统，来干扰细胞中的Cas核酸酶功能，以此来给CRISPR基因编辑技术带上一定程度的“镣铐”，规范该技术的使用操作。 如今，在美国Broad研究所
新型抗流感小分子蒎烷胺修饰研究获进展
中科院广州生物医药与健康研究院胡文辉博士领衔的抗流感项目团队携手中山大学药学院教授王洪根团队，在研究中发现了对抗流感小分子蒎烷胺进行骨架修饰的高效方法。近日，相关研究成果在线发表于美国《有机化学快报》上。 蒎烷胺是一类具有良好抗流感活性、抗菌活性的天然胺类小分子，其骨架在不对称合成中有广泛的应
动物所揭示小分子piRNAs的发生和调控机制
小分子piRNAs(Piwi-interacting RNAs)在抑制转座子活性和维持基因组稳定性方面起重要作用，但其发生和调控的分子机制仍不清楚。果蝇生殖细胞为研究这一机制提供了良好的模型。果蝇生殖细胞中piRNAs 的发生包括初级加工和次级加工两个过程，其中piRNAs次级加工途径，又称乒乓
研究发现新Wnt信号通路小分子激动剂
近日，中科院上海生物化学与细胞生物学研究所李林团队与中科院昆明植物所郝小江研究组合作，发现一个新的Wnt信号通路的小分子激动剂(代号为HLY78)，阐明了其在Wnt信号通路激活过程中的作用机制，并初步揭示了其在造血干细胞移植中应用的潜力，这为HLY78作为一种潜在的药物先导化合物提供了方向。相关
实验室常用小仪器——生物大分子类
实验室常用小仪器——生物大分子类1.台式高/低速离心机离心机是利用离心力，分离液体与固体颗粒或液体与液体混合物的专用设备。离心机涉及范围非常广泛，血液的分离、病毒的研究、DNA的研究、药品的提纯，对溶液中密度不同的粒子进行分离，是生物化学、放射免疫、环境保护等生产和科研单位必备实验仪器。2.紫外分光
上海有机所在活性小分子高效创制方面取得进展
孕甾皂苷大量存在于夹竹桃科植物，具有多样的生理活性。它们由孕甾和糖链组成，糖链部分含有大量2,6-二脱氧糖。此前，中国科学院上海有机化学研究所俞飚团队完成了一系列结构复杂的孕甾皂苷化学全合成。中药酸叶胶藤具有消炎功效，其相关植物中含有大量孕甾皂苷，被分离鉴定的包括ecdysosides A、B、F及