Southern杂交电泳凝胶预处理的基本步骤

1. 如果靶序列>5kb,则需进行脱嘌呤处理。 (1) 把凝胶浸在0.25mol/L HCl中,室温轻轻晃动,直到溴酚蓝从蓝变黄。 注意:处理人类基因组DNA≤10分钟;处理植物基因组DNA≤20分钟。 (2) 把凝胶浸在灭菌双蒸水中 2. 如果靶序列<5kb,则直接进行下面的步骤 (1) 把凝胶浸在变性液(0.5mol/L NaOH,1.5mol/L NaCl)中,室温2×15分钟,轻轻晃动。 (2) 把凝胶浸在灭菌双蒸水中 (3) 把凝胶浸在中和液中(0.5mol/L Tris-HCl,pH7.5,1.5mol/L NaCl),室温2×15分钟。 (4) 在20×SSC中平衡凝胶至少10分钟。......阅读全文

PCR扩增产物的分析法

  PCR扩增DNA片段只是一个重要手段。扩增片段的检测和分析才是目的,根据研究对象和目的的不同而采用不同的分析法。琼脂糖凝胶电泳可帮助判断扩增产物的大小,有助于扩增产物的鉴定,点杂交除可鉴定扩增产物外,还有助于产物的分型;Southern杂交分析可从非特异扩增产物中鉴定出特异产物的大小,增加检测的

关于Southern杂交的转膜的介绍

  即将凝胶中的单链DNA片段转移到固相支持物上。而此过程最重要的是保持各DNA片段的相对位置不变。DNA是沿与凝胶平面垂直的方向移出并转移到膜上,因此,凝胶中的DNA片段虽然在碱变性过程已经变性成单链并已断裂,转移后各个DNA片段在膜上的相对位置与在凝胶中的相对位置仍然一样,故而称为印迹(blot

关于Southern杂交的洗膜的介绍

  取出NC膜,在2×SSC溶液中漂洗5min,然后按照下列条件洗膜:  2×SSC/0.1% SDS,42℃,10min;  1×SSC/0.1% SDS,42℃,10min;  0.5×SSC/0.1% SDS,42℃,10min;  0.2×SSC/0.1% SDS,56℃,10min;  0

Northern-blot实验

实验方法原理 Northern blot的基本概述是将RNA样品通过变性琼脂糖凝胶电泳进行分离,再转移至尼龙膜等固相膜载体上,用放射性或非放射性标记DNA或RNA特异性探针对固定于固相膜上的mRNA进行杂交,洗膜去除非特异性结合杂交信号,经放射自显影或现色反应,对杂交信号进行分析。将杂交的m

Southern杂交待测核酸样品的制备

  (一)制备待测DNA  基因组DNA是从动物组织(或)细胞制备。1.采用适当的化学试剂裂解细胞,或者用组织匀浆器研磨破碎组织中的细胞;2.用蛋白酶和RNA酶消化大部分蛋白质和RNA;3.用有机试剂(酚/氯仿)抽提方法去除蛋白质。  (二) DNA限制酶消化  基因组DNA很长,需要将其切割成大小

DNA文库的构建及其筛选

实验材料 DNA试剂、试剂盒 升汞MS培养基琼脂糖EcoR IHind IIIBamH IBg lII Pst I仪器、耗材 电泳仪尼龙膜实验步骤 1.水稻 DNA 的提取水稻 DNA 的提取参照 Dellaporta, Wood 和 Hicks (1983) 法分离总基因组DNA并略有修改。 通过

双向凝胶电泳技术的操作步骤

样品要求1、建议使用的蛋白质溶解体系为8M尿素/4%CHAPS /40mMTris(Base)/65mM DTT;2、样品浓度大于2 μg/ μl;样品制备双向电泳成功的关键在于建立一套有效的、可重复的样品制备方法。样品制备的影响因素包括蛋白质的溶解性、分子量、电荷数及等电点等。对于不同的样品性质及

琼脂糖凝胶电泳的操作步骤

  琼脂糖凝胶电泳是用琼脂或琼脂糖作支持介质的一种电泳方法。对于分子量较大的样品,如大分子核酸、病毒等,一般可采用孔径较大的琼脂糖凝胶进行电泳分离。  琼脂糖凝胶约可区分相差100bp的DNA片段,其分辨率虽比聚丙烯酰胺凝胶低,但它制备容易,分离范围广,尤其适于分离大片段DNA。普通琼脂糖凝胶分离D

Northern-blot实验方法

Northern blot 是一种通过检测RNA的表达水平来检测基因表达的方法,通过northernblot的方法可以检测到细胞在生长发育特定阶段或者胁迫或病理环境下特定基因表达情况。Northern blot 首先通过电泳的方法将不同的RNA分子依据其分子量大小加以区分,然后通过与特定基因

痘苗DNA检测实验——Southern-杂交法

实验方法原理以前,用 HindIII 限制性内切核酸酶消化鉴定痕苗病毒 DNA。大部分的外源基因插入重组病毒的 TK 基因中,TK 基因位于 HindIII 5.1 kb 的 J 片段上。这样在重组病毒中,如果插入片段上没有 HindIII 内切酶位点,则J片段就会增大。如果缺乏 HindIII 5

琼脂糖凝胶电泳操作步骤

一. 为了制备凝胶,将琼脂糖粉与电泳缓冲液混合至所需浓度,并在微波炉中加热使其熔化。琼脂糖凝胶浓度1. 所用琼脂糖的百分比取决于要分离的片段的大小。2. 琼脂糖的浓度是指琼脂糖相对于缓冲液体积的百分比(w / v),琼脂糖凝胶通常在0.2%至3%的范围内。3. 琼脂糖浓度越低,DNA片段迁移越快。4

分子生物学常用实验技术(十三)

2. 从RNA 合成单链cDNA 探针cDNA 单链探针主要用来分离cDNA 文库中相应的基因。用RNA为模板合成cDNA 探针所用的引物有两种: (1)用寡聚dT 为引物合成cDNA 探针。本方法只能用于带Poly(A)的mRNA,并且产生的探针极大多数偏向于mRNA 3'末端序列

琼脂糖凝胶电泳分离待测DNA样品的基本步骤

  1. 制备琼脂糖凝胶,尽可能薄。DNA样品与上样缓冲液混匀,上样。推荐使用的靶基因的上样量见不同条件下上样本的使用指针比较表。一般而言,对地高辛杂交系统,所需DNA样品的浓度较低,每道加2.5-5μg人类基因组DNA;如果基因组比人类DNA更复杂(如植物DNA)则上样量可达10μg;每道上质粒D

RNA的电泳,转膜和杂交

实验原理:基本同 Southern Blotting,但因RNA 是单链分子,必须消除局部区域形成的二级结构,在电场中泳动的距离才能反映它本身的大小,因而需使用变性胶进行电泳;另应特别注意防止RNA 的降解。实验材料:经检测质量好的 RNA实验步骤:1.制胶:Agarose 1%-1.2% , 1×

分子杂交技术的几种常见的杂交

分子杂交是通过各种方法将核酸分子固定在固相支持物上,然后用放射性标记的探针与被固定的分子杂交,经显影后显示出目的DNA或RNA分子所处的位置。根据被测定的对象,分子杂交基本可分为以下几大类:(1) Southern杂交:DNA片段经电泳分离后,从凝胶中转移到硝酸纤维素滤膜或尼龙膜上,然后与探针杂交。

小鼠βactin基因的克隆表达(3)

(2)质粒的提取及酶切鉴定分析   质粒的提取按照质粒提取试剂盒的操作步骤进行,然后进行双酶切鉴定。   管号 ① ② 质粒DNA

分子杂交技术Northern杂交的简介

  Northern杂交与Southern杂交很相似。主要区别是被检测对象为RNA,其电泳在变性条件下进行,以去除RNA中的二级结构,保证RNA完全按分子大小分离。变性电泳主要有3种:乙二醛变性电泳、甲醛变性电泳和羟甲基汞变性电泳。电泳后的琼脂糖凝胶用与Southern转移相同的方法将RNA转移到硝

淀粉凝胶电泳的基本方法分类

(1)琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶电泳琼脂糖是一种线性多糖聚合物,是从红色海藻产物琼脂中提取而来的。当琼脂糖溶液加热到沸点后冷却凝固便会形成良好的电泳介质,其密度是由琼脂糖的浓度决定的。经过化学修饰的低熔点(LMP)的琼脂糖,在结构上比较脆弱,因此在较低的温度下便会熔化,可用于DNA片段的制备电泳。聚丙烯

凝胶电泳的基本原理

当一种分子被放置在电场当中时,它们就会以一定的速度移向适当的电极,这种电泳分子在电场作用下的迁移速度,叫做电泳的迁移率。它同电场的强度和电泳分子本身所携带的净电荷数成正比。也就是说,电场强度越大、电泳分子所携带的净电荷数量越多,其迁移的速度也就越快,反之则较慢。由于在电泳中使用了一种无反应活性的稳定

DNA印迹(Southern-Blot)实验

【实验原理】DNA印迹是1975年由英国Southern创建的。其基本原理是:DNA分子经限制性核酸内切酶酶切后,由琼脂糖凝胶电泳将所得 DNA片段按分子质量大小分离,然后将DNA片段变性,并使凝胶中的单链DNA片段转移到尼龙膜、硝酸纤维素膜(NC)或其他固相支持物上,此法中DNA 片段

单细胞凝胶电泳技术的试验步骤

试剂及材料:1)PBS2)0.8%正常熔点凝胶(PBS配制)3)0.6%低熔点凝胶(PBS配制)4)毛玻璃片5)盖玻片6)碱性裂解液(2.5mol/L NaCl;100mmol/L Na2EDTA;10mmol/L Tris;1%肌氨酸钠),临用前加10%DNMSO,1%Triton X-1007)

DIG试剂盒杂交实验

实验概要Southern技术是指以Southern名字命名的DNA转移杂交技术。它可用于基因组特定DNA序列的定位,可以测定相关片段的同源性、可以从c库、基因组文库中筛选完整基因等。用一种或多种限制性内切酶对基因组DNA加以切割,通过琼脂糖凝胶电泳分离酶切片段,随后,使DNA在原位变性,并从凝胶转移

双向电泳操作步骤——第二向凝胶

实验材料蛋白质试剂、试剂盒丙烯酰胺TEMED磷酸过硫酸铵溴酚蓝NaOH仪器、耗材电泳仪垫片凝胶板尼龙筛子实验步骤1.  用垫片组装凝胶平板。夹层每边的垫片之上用夹子固定,并置于凝胶支架上。注意玻璃平板和垫片的平齐,收紧夹子以保证密封圈不发生泄漏。调整平板的水平和垂直,在平板间将放上凝胶识别标签,使之

Southern杂交一般操作方法

一 基因组酶切和电泳在200 μl 微量离心管中加入:25 μl DNA样品(约10μg),3μl 限制性内切酶(MBI,10 U/ μl)5 μl 相应的10×buffer,补水到50μl。然后加一滴矿物油覆盖, 稍微离心后放于37℃水浴8-12小时。酶切完后,取5μl 酶切DNA样品于0.8%的

Westernblot法的起源和发展

生物大分子印迹法实际上是凝胶电泳技术、固定化技术及分子亲和技术三者融为一体的综合性技术,其核心在于把凝胶电泳已分离的区带转移并印迹于固定化纸上。生物大分子印迹法始创于1975年,内苏格兰爱丁堡大学E.M.Southern首先提出。他将限制酶切后的DNA片段先进行琼脂糖凝胶电泳,把一张硝酸纤维素纸放在

根据被测定的对象分子杂交基本分类介绍

(1) Southern杂交:DNA片段经电泳分离后,从凝胶中转移到硝酸纤维素滤膜或尼龙膜上,然后与探针杂交。被检对象为DNA,探针为DNA或RNA。(2) Northern杂交:RNA片段经电泳后,从凝胶中转移到硝酸纤维素滤膜上,然后用探针杂交。被检对象为RNA,探针为DNA或RNA。

分子杂交技术-2

 一、Southern杂交 Southern杂交可用来检测经限制性内切酶切割后的DNA片段中是否存在与探针同源的序列,它包括下列步骤:  (1) 酶切DNA, 凝胶电泳分离各酶切片段,然后使DNA原位变性。   (2) 将DNA片段转移到固体支持物(硝酸纤维素滤膜或尼龙膜)上。   (3) 预杂交滤

Northern-blot实验

Northern blot技术 Northern Blot             实验方法原理 将RNA样品通过变性琼脂糖凝胶电泳进行分离,再转移至尼龙膜等固相膜载体上,

脉冲场凝胶电泳实验

实验材料 DNA试剂、试剂盒 GTBETBE琼脂糖仪器、耗材 电泳仪实验步骤 1.  制备用于水平电泳的1%琼脂糖凝胶,放入电泳装置,其上覆盖以2~3 mm 的GTBE或TBE缓冲液。 2.  加入液体样品。装好蠕动泵用于电泳缓冲液循环。3.  对于微型凝胶调整循环速度至5~10 ml/min 对于

概述分子杂交技术常见的杂交分类

  分子杂交是通过各种方法将核酸分子固定在固相支持物上,然后用放射性标记的探针与被固定的分子杂交,经显影后显示出目的DNA或RNA分子所处的位置。根据被测定的对象,分子杂交基本可分为以下几大类:  (1) Southern杂交:DNA片段经电泳分离后,从凝胶中转移到硝酸纤维素滤膜或尼龙膜上,然后与探