基因芯片的原理
基因芯片（gene chip）的原型是80年代中期提出的。基因芯片的测序原理是杂交测序方法，即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法，可以用图11-5-1来说明。在一块基片表面固定了序列已知的八核苷酸的探针。当溶液中带有荧光标记的核酸序列TATGCAATCTAG，与基因芯片上对应位置的核酸探针产生互补匹配时，通过确定荧光强度最强的探针位置，获得一组序列完全互补的探针序列。据此可重组出靶核酸的序列。基因芯片又称为DNA微阵列（DNA microarray），可分为三种主要类型：1）固定在聚合物基片（尼龙膜，硝酸纤维膜等）表面上的核酸探针或cDNA片段，通常用同位素标记的靶基因与其杂交，通过放射显影技术进行检测。这种方法的优点是所需检测设备与目前分子生物学所用的放射显影技术相一致，相对比较成熟。但芯片上探针密度不高，样品和试剂的需求量大，定量检测存在较多问题。2）用点样法固定在玻璃板上的DNA探针阵列，通过与荧光标记......阅读全文
基因芯片与RNAseq的比较分析
基因芯片 vs RNA-seq哪个好 ？最近几年二代测序（又叫NGS）很火，而且价格越来越便宜，原来都用芯片检测mRNA、miRNA、LncRNA表达量的，好像不少都换用RNA-seq了。那么，到底选择哪种更好呢？今天就来回答下这个问题。一句话—— 看研究目的。常见误区一：测序的准确性高，获得的信息
染色体核型分析与基因芯片的区别
检测条件不同 核型分析需要新鲜的“活细胞”，需要细胞培养，若细胞培养失败，则检测失败，并且细胞生长周期比较长，因此核型分析的报告周期比较长。 基因芯片检测对象为DNA，不需要细胞培养，成功率高，报告周期短。 检测分辨率不同 芯片依赖其密布的探针，检测染色体上对应位点的信号，来判断同一染色
基因芯片合成后点样法的优缺点分析
主要优点是:保持探针长度均一,成本低用途广泛。缺点是:密度达不到原位合成法的水平,点之间重复性差。但经过改进,已可在6.5cm2 的范围内容纳100000个核酸位点已为从事基础研究的实验室广泛采用。
基因芯片研究方向及当前面临的困难
尽管基因芯片技术已经取得了长足的发展，得到世人的瞩目，但仍然存在着许多难以解决的问题，例如技术成本昂贵、复杂、检测灵敏度较低、重复性差、分析泛围较狭窄等问题。这些问题主要表现在样品的制备、探针合成与固定、分子的标记、数据的读取与分析等几个方面。样品制备上，当前多数公司在标记和测定前都要对样品进行一定
PCR基因芯片上荧光PCR反应的研究（四）
2.5 用SYBR Green荧光染料做常规实时定量PCR分析HLA 应用位点特异性PCR(SCP)方法从20例正常人中确定2位HLAA2（编号1、2）与2位HLA非A2（编号3、4）。 在GeneAmp ®SDS 5700检测SYBR荧光染料4步位点特异PCR反应（图4）SYBR荧光染料PCR反
基因芯片杂交结果中的常见问题
基因芯片杂交结果中的常见问题问题可能原因解决方案杂交点模糊、毛边DNA浓度过高降低DNA探针浓度进行芯片的打印紫外交联时未能有效固化DNA检测紫外灯，将其能量值调试至合适值；将打印好的芯片置80℃烤2~4h。杂交时盖片移动杂交时将盖片放正，杂交过程中避免其移动；预先用水和普通载玻片练习放置盖玻片。没
基因芯片技术的应用药物筛选和新药开发
由于所有药物(或兽药)都是直接或间接地通过修饰、改变人类(或相关动物)基因的表达及表达产物的功能而生效,而芯片技术具有高通量、大规模、平行性地分析基因表达或蛋白质状况(蛋白质芯片)的能力,在药物筛选方面具有巨大的优势。用芯片作大规模的筛选研究可以省略大量的动物试验甚至临床,缩短药物筛选所用时间,提高
基因芯片技术在疟原虫研究中的应用
基因芯片技术的出现有力地促进了人们对疟原虫生物学的认识。早在2000年,恶性疟原虫的基因组测序尚未完成, Hayward等根据恶性疟原虫绿豆核酸酶基因文库, 制成“鸟枪”DNA ( shotgunDNA)芯片,分析了疟原虫滋养体和配子体之间的基因表达差异,为疟原虫发育阻断剂和疫苗研究提供了有益线
PCR基因芯片上荧光PCR反应的研究（三）
2.2 PCR-SSCP并测序分析发现X连锁遗传性铁幼粒细胞贫血家系ALAS2基因第5外显子基因异常 分析两兄弟及其父母、外祖父母的ALAS2基因，两兄弟ALAS2基因第5外显子的PCR扩增产物有与正常脐血不同的单链电泳条带，他们的父亲和外祖父有与正常脐血相同的单链电泳条带，而他们的母亲和外祖母同时
基因芯片技术的应用生态环境保护
在环境保护上,基因芯片也广泛的用途,一方面可以快速检测污染微生物或有机化合物对环境、人体、动植物的污染和危害,同时也能够通过大规模的筛选寻找保护基因,制备防治危害的基因工程药品、或能够治理污染源的基因产品。
基因芯片技术在现代农业领域的应用
基因芯片技术可以用来筛选农作物的基因突变，并寻找高产量、抗病虫、抗干旱、抗冷冻的相关基因，也可以用于基因扫描及基因文库作图、商品检验检疫等领域。目前该类市场尚待开发。
PCR基因芯片上荧光PCR反应的研究（一）
郝麟1） 朱平1）＊ 于晓梅2） 张大成2） 赵新生3） 欧阳贱华3 （1）北京大学第一医院 北京 100034； 2）北京大学微电子学研究所 北京100871； 3）北京大学化学与分子工程学院 北京100871） 目的: 我们设计一种含有大量微反应池的PCR基因芯片，能对基因的重
基因芯片技术在环境保护领域的应用
在环境保护上，基因芯片也广泛的用途，一方面可以快速检测污染微生物或有机化合物对环境、人体、动植物的污染和危害，同时也能够通过大规模的筛选寻找保护基因，制备防治危害的基因工程药品、或能够治理污染源的基因产品。
基因芯片发现帕金森症相关的新基因
最近，科学家利用来自18,000多名患者的数据，发现了20多个帕金森病相关的遗传风险因子，包括6个以前没有报道过的。相关研究结果发表在2014年7月27日的《Nature Genetics》，该研究部分由美国国立卫生研究院（NIH）资助，在NIH实验室内完成。 本文资深作者、NIH国家老龄化研
PCR基因芯片上荧光PCR反应的研究（五）
3．讨论 随着近年基因芯片技术的发展，研究者逐渐认识到基于核酸杂交原理的传统基因芯片缺陷与应用的局限性。随着PCR技术的进展，特别是荧光定量PCR技术的出现PCR技术已成为生物医学领域中应用最广泛的技术。如果一种基因芯片能直接进行PCR反应,而且能够同时扩增大批可能发生变异的基因显然会有广泛
基因芯片杂交结果中的常见问题
基因芯片杂交结果中的常见问题问题可能原因解决方案杂交点模糊、毛边DNA浓度过高降低DNA探针浓度进行芯片的打印紫外交联时未能有效固化DNA检测紫外灯，将其能量值调试至合适值；将打印好的芯片置80℃烤2~4h。杂交时盖片移动杂交时将盖片放正，杂交过程中避免其移动；预先用水和普通载玻片练习放置盖玻片。没
PCR基因芯片上荧光PCR反应的研究（二）
1.3.2 PCR-SSCP方法分析按照我室常规进行。 1.3.3 Taqman荧光探针 以发现的ALAS2基因第五外显子点突变为中心设计，序列如下： 5’ （荧光集团）FAM-CAAGATCATAGAGAAGAAAC- TAMRA（淬灭集团） 3’，设计Taqman荧光PCR反应的上下
基因芯片技术在疾病诊断领域的应用
基因芯片作为一种先进的、大规模、高通量检测技术，应用于疾病的诊断，其优点有以下几个方面：一是高度的灵敏性和准确性；二是快速简便；三是可同时检测多种疾病。如应用于产前遗传性疾病检查，抽取少许羊水就可以检测出胎儿是否患有遗传性疾病，同时鉴别的疾病可以达到数十种甚至数百种，这是其他方法所无法替代的，非常有
染色体核型分析与基因芯片的区别
检测条件不同 核型分析需要新鲜的“活细胞”，需要细胞培养，若细胞培养失败，则检测失败，并且细胞生长周期比较长，因此核型分析的报告周期比较长。 基因芯片检测对象为DNA，不需要细胞培养，成功率高，报告周期短。 检测分辨率不同 芯片依赖其密布的探针，检测染色体上对应位点的信号，来判断同一染色
利用基因芯片检测尿液游离DNA样本
膀胱尿路上皮癌具有复杂多样的特征，其中一部分原因是基因组多样化所致。1,2Togneri等在《European Journal of Human Genetics》上发表的文章中称，尿液样本上清液中的游离DNA（cfDNA），与从制成颗粒的尿液细胞材料或传统肿瘤组织样本中获得的DNA相比，检测基
多重PCR基因芯片检测新研究
来自中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病诊断室的研究人员建立并初步评价了一种针对重要肠道病原菌的多重PCR基因芯片检测方法，这一方法具有较高的特异性，并且混合PCR可以分别按照种属内和种属间的引物组合方案用于多病原的筛检。 感染性腹泻在我国发病率居各类传染病之首，长期以来严重危害人民
基因芯片杂交仪,平台震荡器Grant
·Grant的ISO20芯片杂交仪是一个简单的但实用的芯片杂交箱，具有良好温控、保湿和稳定等性能，为芯片杂交的良好装置。 ·密封设计有效地保持了腔体的湿度，从而探针不会干，也无须加盖 ·使用强制气体循环，提高了温度均一性和可重复性 ·铝质玻片架传热均匀、快速 ·加一点杂交
多重PCR基因芯片检测新研究
来自疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病诊断室的研究人员建立并初步评价了一种针对重要肠道病原菌的多重PCR基因芯片方法，这一方法具有较高的特异性，并且混合PCR可以分别按照种属内和种属间的引物组合方案用于多病原的筛检。 感染性腹泻在我国发病率居各类传染病之首，长期以来严重危害人民健康。其中绝大
基因芯片技术简介和应用展望（一）
基因芯片（Gene Chip）通常指DNA芯片，其基本原理是将指大量寡核苷酸分子固定于支持物上，然后与标记的样品进行杂交，通过检测杂交信号的强弱进而判断样品中靶分子的数量。基因芯片的概念现已泛化到生物芯片（biochip）、微阵列（Microarray）、DNA芯片（DNA chip），
基因芯片距离临床应用仅咫尺之遥
１７世纪中叶，当显微镜最初得到应用的时候，荷兰自然学家安东尼·列文虎克用它观测到了细菌和血细胞。“我在大多数时候总是很惊奇地看到，”他描述着从牙齿刮下来的一点薄片，“那上面有许多非常小的活着的微生物，这是一幅悦人的动景。”三个半世纪后，凭借激光共聚焦显微镜，科学家看到了细胞最为复杂的三
基因芯片技术简介和应用展望（二）
四、其他技术 主要是美国NIH、Caliper公司和Orchidbio公司等，Orchidbio公司研制了一种毛细管微流泵芯片，在边长2英寸的芯片上集成了144个微室，分别由流入孔、反应室、循环管和废液流出孔组成，这种芯片不但可以用于基因诊断和分析，还可用于合成化学，利用芯片的微指结构，Calipe
基因芯片的研究方向及当前面临的困难
尽管基因芯片技术已经取得了长足的发展，得到世人的瞩目，但仍然存在着许多难以解决的问题，例如技术成本昂贵、复杂、检测灵敏度较低、重复性差、分析泛围较狭窄等问题。这些问题主要表现在样品的制备、探针合成与固定、分子的标记、数据的读取与分析等几个方面。样品制备上，当前多数公司在标记和测定前都要对样品进行一定
基因芯片技术助力鲑鱼的选择性育种计划
大西洋鲑鱼(Salmo salar)是一种具有较高经济、环境和科学价值的鱼类。在世界范围内，大西洋鲑鱼的产量每年约为140万吨。大西洋鲑鱼也被认为是研究鲑科其它鱼类成员的一个模式种，同样它也是正在进行的基因组测序和组装项目的目标。其基因组序列，对于理解鲑鱼复杂性状的遗传调节非常重要，可用于改
基因芯片在转基因产品检测中的应用
转基因产品检测芯片的目标为:要能确定是否是转基因产品、是哪一种转基因产品、是否是我国已批准的转基因产品,目前研制的芯片能检测国内外已批准商品化转基因作物物种:大豆、玉米、油菜、棉花、马铃薯、烟草、番茄、木瓜、西葫芦、甜椒等;含有启动子、终止子、筛选基因与报告基因等通用基因位点用作筛选是否是转基因产品
染色体核型分析和基因芯片检查的关系
色体核型分析常规染色体核型分析就是检测人类“生命的天书”中是否存在某些章节“漏印”、“多印”或“错印”，即染色体的数量或结构是否发生改变，从而排除染色体疾病。常见的染色体疾病包括：21三体综合征（即唐氏综合征），18三体综合征，13三体综合征，Turner综合征，Klifelter综合征，染色体易位