英国科学家找到检测癌症新突变特征
一个英国研究小组通过分析肿瘤和匹配的正常序列数据,检测到一系列新的突变特征,这些数据代表了通过基因组学英格兰 100,000 基因组计划 (100kGP) 分析的各种癌症类型。 正如他们周四在《科学》杂志上报道的那样,研究人员拥有超过 15,800 个匹配的 100kGP 肿瘤和正常样本的全基因组序列数据,这些样本来自通过英国国家卫生服务基因组医学中心登记的患者,重点关注来自 12,222 个前瞻性收集的基因组学的序列来自 11,585 名参与者的 19 种癌症类型的英格兰肿瘤。 他们还考虑了通过国际癌症基因组联盟分析的另外 3,001 个病例的基因组序列数据和由 Hartwig 医学基金会评估的 3,417 个转移性癌症病例的基因组序列数据。 在用于识别体细胞突变的生物信息学管道的帮助下,该团队追踪并分析了来自所考虑的每个受影响位点的肿瘤中数亿个 DNA 序列替换、小插入或缺失和重排,发现了 82 个单碱基替换突变标......阅读全文
基因突变检测指导癌症靶向治疗
肺癌和结直肠癌近年来已成为大多数国家癌症死亡的主要原因。由于个体遗传基因存在差异性,不同类型的癌症患者选择适合的靶向治疗药物或能取得预期的疗效,基因突变检测为医生提供了重要参考信息。中国国家食品药品监督管理局日前批准由瑞士罗氏诊断研发的cobas EGFR/KRAS基因突变检测技术用于临床基因突
NCCN增加女性癌症新基因突变检测
据医脉通报道,第21届美国国家综合癌症网络(National Comprehensive Cancer Network,NCCN)年会近日在好莱坞召开,会议增加了几个针对乳腺癌和卵巢癌遗传风险管理的新基因突变检测。 最近的研究发现PALB2基因突变与乳腺癌侵袭性相关,而RAD51C、RAD
罗氏NimbleGen综合性癌症基因捕获进行全面癌症突变检测
个人化癌症治疗是癌症治疗的发展方向与研究热点,相关的各种分子检测方案的发展迅猛。美国一个癌症中心开发了一个两步法方案用于指导药物选择、选择合适的患者参加药物临床实验。 这两步检测法包括:第一步,对少量癌症基因的突变热点进行测序,这些基因通常有较为明确的针对性治疗方案或者靶向药物,此作为快速的初步筛
英国科学家找到检测癌症新突变特征
一个英国研究小组通过分析肿瘤和匹配的正常序列数据,检测到一系列新的突变特征,这些数据代表了通过基因组学英格兰 100,000 基因组计划 (100kGP) 分析的各种癌症类型。 正如他们周四在《科学》杂志上报道的那样,研究人员拥有超过 15,800 个匹配的 100kGP 肿瘤和正常样本的全基
Nature子刊:检测癌症特异性突变的新探针
来自美国宾州大学,东南大学的研究人员发表了题为“Rapid magnetic isolation of extracellular vesicles via lipid-based nanoprobes”的文章,研发出了一种新颖的脂质纳米探针方法,可以快速、经济且高效地分离纳米级的胞外囊泡(nE
数字PCR在-癌症标志物稀有突变检测的应用
在一份给定的样本中,相比于野生型DNA,癌症相关的突变序列比例较低,经常无法检测。而凭借其超高灵敏度,dPCR系统可以很容易地定量分析低至0.001%-0.0001%的突变频率。之前用任何方法都无法实现准确稳定检测的样本,现在可以使用dPCR轻松进行定量分析。例如,已实现肺癌相关的表皮生长因子受体
Nature子刊:检测癌症特异性突变的新探针
来自美国宾州大学,东南大学的研究人员发表了题为“Rapid magnetic isolation of extracellular vesicles via lipid-based nanoprobes”的文章,研发出了一种新颖的脂质纳米探针方法,可以快速、经济且高效地分离纳米级的胞外囊泡(nE
最新研究可检测癌症组织中的基因融合和碱基突变
靶向治疗和免疫检查点抑制剂治疗目前已显著改善了肿瘤患者的生存率,而新型疗法的有效运用往往需要依赖于对基因变异的准确检测。当前的研究表明,诸如NTRK(神经营养因子受体酪氨酸激酶)等罕见的融合变异事件能有效地驱动肿瘤发生,并成为多种肿瘤中靶向治疗的靶标。基于DNA检测的大Panel可以覆盖几百个
新药或有助治疗KRAS突变癌症
一种靶向一个常见的特定遗传异常的新型抗癌药物在小鼠和人类肿瘤研究中表现出一定潜力。相关论文近日刊登于《自然》。这项研究还包含了已知的关于KRAS抑制剂疗法在人类临床试验中应用的首次报告。 在众多癌基因中,RAS基因家族在人类肿瘤中突变概率最高,其中KRAS作为RAS基因家族中的主要亚型,促发
突变“热点”揭示癌症诱发新因素
美国加州大学圣地亚哥分校的生物工程师们在最新研究中发现了癌症进化中一个此前未被认识到的关键角色:基因组某些区域发生的簇状突变。研究人员发现,“簇状体细胞突变”在大约10%的人身上诱发了癌症进展,了解它们可以预测患者的存活率。相关论文9日发表在《自然》网站上。簇状意味着它们在细胞基因组的特定区域聚集在
首张癌症驱动突变图谱绘成
新突变图谱揭示关键癌症基因的微小变化如何显著改变肿瘤生长模式。图片来源:美国《每日科学》网站癌症驱动突变是指某些基因突变能直接推动正常细胞向癌细胞转化。一个国际科研团队绘制出全球首张完整的癌症驱动突变图谱,揭示了癌症关键基因中数百种突变如何影响肿瘤生长。当与真实患者数据比对时,这张图谱能准确预测癌症
肿瘤免疫疗法——多突变癌症克星
临床试验中使用的新型免疫系统激活抗癌药物让许多看似无法治愈的黑素瘤或肺癌患者重获新生,但这些药物对结肠癌似乎无效。不过有一个例外——一位男性患者的结肠癌转移瘤在2007年接受药物治疗后消失了——引起了研究人员的兴趣。他们怀疑该患者之所以能够康复,可能与肿瘤中出现大量突变有关。如今,一个小型临床试
癌症检测
什么是肿瘤标志物 肿瘤标志物是由肿瘤细胞产生的,存在于细胞.组织或体液中,能用化学或免疫方法定量、证明癌肿存在(或在某一脏器存在)、可以监测肿瘤治疗和预后的物质。有的肿瘤标志物在正常人体内不存在,罹忠癌症后才会出现,有的则是罹患癌症后水平会显著高于正常人,因此,肿瘤标志物检查可以检测到早期癌症的踪
检测-DNA-突变,可以告诉我们谁可能有发展早期癌症
爱因斯坦研究人员已经开发并验证了一种准确识别单细胞基因组中突变的方法。这种新方法可以帮助预测癌症是否将在看似健康的组织中发展,在今天的自然方法的在线版本中发表的论文中被描述。相应的作者是 Lola 和 Saul Kramer 分子遗传学主席 Jan Vijg 博士。 在科学家可以分析单个细胞的
Nat-Commun:癌症——基因突变的起源
DNA的复制是细胞分裂的前提。但是,在存在某些破坏性成分的情况下,细胞将无法很好地执行相关操作,复制过程将变得更加缓慢且效率较低,这种现象称为“复制压力”。虽然已知“复制压力”与遗传突变的增加有关,但至今仍不清楚起作用的确切机制。 最近,日内瓦大学(UNIGE)的研究人员阐明了在“复制压力”下
《科学》重点文章:癌症与基因突变
生物通报道:来自霍德华休斯医学院,Ludwig癌症遗传与治疗中心(the Ludwig Center for Cancer Genetics and Therapeutics)以及约翰霍普金斯凯门综合癌症中心(Johns Hopkins Kimmel Comprehensive Cancer Cen
癌症干细胞大牛Science新发现:CRISPR发现癌症中突变信号
荷兰乌德勒支大学的研究人员发表了题为“Use of CRISPR-modified human stem cell organoids to study the origin of mutational signatures in cancer”的文章,利用CRISPR构建癌症类器官,从中发现了
癌症“坏运气”?Science:近2/3癌症突变源于DNA复制出错!
“近2/3的癌症突变源于DNA复制过程中随机发生的错误!” 这是来自于约翰•霍普金斯大学基默尔癌症中心(Johns Hopkins Kimmel Cancer Center)的科学家们在3月24日发表于《Science》期刊上的一篇最新学术论文的结论。它意味着,DNA复制出错是导致癌变的主要因
-PNAS:偶然突变的积累能减缓癌症发展
一个典型的癌细胞基因组中分散着成千上万的突变,有着数以百计的突变基因。然而,这些突变基因中只有一小部分被认为是癌症的驱动子,负责癌症特征的表现,例如不受控制的细胞生长。癌症生物学家们很大程度上忽略了其他突变,因为他们相信那些突变对癌症的进展发挥着微小的作用,甚至乎没有作用。 但是由麻省理工学院
基因突变让端粒失控 促发癌症
近日,来自威斯达研究所的研究人员揭示了保护端粒(我们染色体末端结构)的部分蛋白复合物的结构,相关研究成果发表在 Nature Communications 上,该研究解释了与这个蛋白复合物相关的一组基因突变如何促进一系列癌症。 端粒是染色体末端的保护性结构,对人体基因组的复制和保护至关重要。端
发现癌症耐药突变-液体活检优于组织活检?
癌症的耐药性是今天癌症治疗的一大难题。临床中经常可以遇到肿瘤组织在靶向疗法后明显变小,但不久又重新恶化。肿瘤学家一直希望能够快速对患者体内出现的癌症耐药性机制进行检测,从而可以确定其它种对肿瘤仍然有效的药物。 近日,来自于Broad研究所(Broad Institute of MIT and
核酸突变检测技术
基因突变是指由于DNA碱基对的置换、增添或缺失而引起的基因结构的变化,亦称点突变。它的分类方式包括1)根据基因结构的改变方式,基因突变可分为碱基置换突变和移码突变两种类型;2)根据遗传信息的改变方式,基因突变又可以分为同义突变、错义突变和无义突变三种类型。基因突变的检测方法:从基因突变的性质来看,检
定义癌症突变:破坏基因组3D相互作用的突变
在细胞中,DNA紧密地包裹在蛋白质周围,并以一种复杂的3D结构包装,我们称它们为“染色质”。染色质不仅可以保护我们的遗传物质不受损伤,而且通过调节基因组在3D空间的表达来组织整个基因组:展开呈现给细胞基因表达机器,然后再将它们卷回去。 在3D染色质结构中,一些区域被称为“拓扑关联域(TADs)
这种基因突变导致1/4的人罹患癌症,并且还助力癌症生长
癌症的发生与原癌基因的突变有关。研究表明,原癌基因例如Ras基因发生突变,会导致25%的人类癌症的发生。 近日弗兰西斯克里克研究所的Matthew Coelho博士做了相关实验后发现,Ras基因发生突变还可以抑制免疫系统的抗癌反应。相关研究成果以题为《Oncogenic RAS Signali
超过8%的儿童癌症患者携带癌症易感基因突变研究概要
《 New England Journal of Medicine》期刊公布的一项研究显示,超过8%的儿童癌症患者携带癌症易感基因突变。 研究者对1120例儿童癌症患者的肿瘤样本和正常组织进行了DNA测序,发现8.5%的患者的正常组织携带生殖细胞系致病或可能致病突变,这些突变会导致癌症风
识别每种肿瘤的癌症驱动突变,有助开发个性化癌症治疗
在一项新的研究中,来自西班牙巴塞罗那生物医学研究所的研究人员开发出一种计算工具,它可以识别每种肿瘤类型的癌症驱动突变。这一发现有助于加速癌症研究,并提供工具帮助肿瘤学家为每名患者选择最佳治疗方法。相关研究结果于2021年7月28日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“In silico sa
聚集癌症血液检测
虽然实体肿瘤的检测仍然是癌症诊断中的常规程序,但新一代测序等现代技术,已经使科学家们能够更详细地跟踪肿瘤的组织起源。许多肿瘤会脱落细胞,称为外泌体(exosome)的囊泡,也有DNA进入血液和其他体液的痕迹。最近的研究表明,这些碎片可以作为标记物,来监测疾病的进展,甚至有助于研究人员在症状出现之
癌症检测新手段
一项新的研究表明,一种针对不具有EGFR突变的非小细胞癌(NSCLC)患者,为他们提供预后信息的血液检测,能够降低癌症晚期的诊疗成本,并提高NSCLC患者的生存率,改善他们的生活质量。VeriStrat多肽组质谱检测(由美国Biodesix公司研发),用于帮助临床医生对不具有EGFR突变的晚期NSC
癌症基因检测标准
据世界癌症预防组织机构统计,现今社会每100人就有1人因患癌症而死亡, 每年死亡的人数中,1/5是死于癌症。未来20年里,癌症将继续位居人类死因首位。 癌症的新认识 癌症只是慢性病,一类与冠心病、糖尿病有所类似的慢性病 癌症是生活方式疾病,80%与不良生活方式有关。 遗传、疾病、环境与职
错过约90%BRCA突变携带者?23andMe癌症基因检测再遭质疑
一项最新研究发现,23andMe直接面对消费者(DTC)的BRCA基因检测可能会错过约90%的BRCA突变携带者,包括有癌症家族史和没有癌症家族史的个体。此外,由于未覆盖某些突变,该检测还有可能错过德系犹太人后裔中约20%的BRCA突变。近日,在美国医学遗传学与基因组学会(ACMG)年会上,美国