罗氏NimbleGen综合性癌症基因捕获进行全面癌症突变检测

个人化癌症治疗是癌症治疗的发展方向与研究热点,相关的各种分子检测方案的发展迅猛。美国一个癌症中心开发了一个两步法方案用于指导药物选择、选择合适的患者参加药物临床实验。 这两步检测法包括:第一步,对少量癌症基因的突变热点进行测序,这些基因通常有较为明确的针对性治疗方案或者靶向药物,此作为快速的初步筛选,使通过筛选的患者可以参与到新药的临床实验中。第二步,对超过200个的癌症基因进行测序,发现额外的相关突变,获得更全面的病人基因突变信息。 在对这200多个癌症基因的测序中,首先采用了NimbleGen SeqCap液相序列捕获产品,即通过探针杂交的方法在溶液中富集样本癌症基因序列,而然后进行测序。采用的NimbleGen产品正是罗氏最新推出的综合性癌症基因捕获试剂(Comprehensive Cancer Panel)。 这个产品包括了256个癌症基因,来自于Cancer Gene Census(Sanger)及NCBI Ge......阅读全文

罗氏NimbleGen综合性癌症基因捕获进行全面癌症突变检测

个人化癌症治疗是癌症治疗的发展方向与研究热点,相关的各种分子检测方案的发展迅猛。美国一个癌症中心开发了一个两步法方案用于指导药物选择、选择合适的患者参加药物临床实验。 这两步检测法包括:第一步,对少量癌症基因的突变热点进行测序,这些基因通常有较为明确的针对性治疗方案或者靶向药物,此作为快速的初步筛

万人药物基因组研究项目采用罗氏NimbleGen序列捕获技术

  来自美国的药物基因组研究专家将开展一个由一万人参加的药物基因组项目,将参加这个的医疗记录与他们的基因组信息进行关联,这些信息主要包括了84个与药物应答相关的基因情况。      为了获得与药物治疗相关的基因信息,研究人员将利用NimbleGen序列捕获产品,从全基因组DNA中富集这些

罗氏宣布推出目标基因组测序的新技术

罗氏应用科学部(Roche Applied Science)旗下的Roche NimbleGen公司的宣布推出商业化的NimbleGen序列捕获技术(NimbleGen Sequence Capture technology),以帮助那些希望对基因组选定目标区域进行高通量测序的科学家们。这项新技术使

序列捕获之新品荟萃

  2009年,基因组定向捕获工具的出现,让外显子组的捕获成为可能。科学家们普遍认为外显子组测序比全基因组测序更有优势,特别是对罕见的单基因疾病。不仅仅是费用更低,数据的阐释也更为简单。因此,外显子组测序也在2010年被《Science》杂志评为年度十大突破。   数百篇已发表的文章,也证实了外显

NimbleGen大麦外显子组捕获快速定位多节矮秆突变基因

在农业生产中,性状相关的基因定位对于科学育种十分重要,传统的遗传重组定位具有指导意义和实用价值,但传统方法周期长、耗费大。随着二代测序的发展,DNA测序速度大大加快、成本大大降低,使得通过测序法进行的基因定位(mapping-by-sequencing)成为越来越多动植物研究的主要手段。对合适的样本

靶向捕获让ctDNA无处遁形

循环肿瘤DNA(ctDNA)是一类具备广泛应用前景的肿瘤标志物,可用于肿瘤发展及预后状态的无创测定。现有的ctDNA检测方法要根据每位癌症患者的情况来制定繁琐的检测步骤,且敏感度低,难以适用于广泛的临床应用。近期在Nature Medicine上发表的一篇文章中1,研究人员介绍了一种全新的ctDNA

基因突变检测指导癌症靶向治疗

  肺癌和结直肠癌近年来已成为大多数国家癌症死亡的主要原因。由于个体遗传基因存在差异性,不同类型的癌症患者选择适合的靶向治疗药物或能取得预期的疗效,基因突变检测为医生提供了重要参考信息。中国国家食品药品监督管理局日前批准由瑞士罗氏诊断研发的cobas EGFR/KRAS基因突变检测技术用于临床基因突

罗氏推出序列捕获新产品

  罗氏公司近日宣布推出多款SeqCap EZ Library目标富集新产品。SeqCap EZ Library这种方法可在新一代测序之前实现整个外显子组或定制区域的富集。这些新产品旨在加强基础和临床研究中的遗传变异发现和检测,而出色的捕获效率也能将测序费用降至最低。它们经过优化,适用于各种新一

NimbleGenSeqCap用于加拿大一4000外显子组测序项目

  最近罗氏NimbleGen的SeqCap EZ Exome产品被加拿大多伦多一医院基因组服务中心选中,用于一个癌症生物标记物研究。该中心将开展一项4000个外显子组测序项目,用于发现癌症相关的生物标记物。   第一批购买的产品还包括一台Caliper Sciclone NGS Work

最全面的癌症基因普查

图片来源于网络  该“癌症基因普查”描述了所有与致命癌症密切相关的基因,以及这些基因在各种疾病中的功能,形成了超过700个基因的资源目录,帮助科学家了解癌症原因,找到药物靶点和设计治疗方案。为改善个体化医学铺平了道路,建立了针对特定遗传功能或突变的抗癌药物合集。  癌症是一种遗传性疾病,DNA突变会

NCCN增加女性癌症新基因突变检测

据医脉通报道,第21届美国国家综合癌症网络(National Comprehensive Cancer Network,NCCN)年会近日在好莱坞召开,会议增加了几个针对乳腺癌和卵巢癌遗传风险管理的新基因突变检测。 最近的研究发现PALB2基因突变与乳腺癌侵袭性相关,而RAD51C、RAD

罗氏协办中国癌症防治科普宣传计划

据中国医药报讯 为加强科普宣传,遏止我国居民癌症发病率上升势头,提高疾病的治愈率,降低死亡率,上海罗氏制药有限公司积极协办“对话希望-2008年中国癌症防治科普宣传促进计划”。 “对话希望-2008年中国癌症防治科普宣传促进计划”由卫生部和中国抗癌协会共同发起并主办,该项目将组织国内著名医学专家,

300多种肿瘤-晚期癌症患者测序突变数据库发表的启示

  5月8日,Nature Medicine杂志发表一篇重量级文章,纪念斯隆-凯特琳癌症研究中心(MSKCC) 的科学家采用MSK-IMPACT方法,开展了一个大规模、前瞻性的临床测序研究。他们对上万名晚期癌症患者,接近300多种肿瘤进行了基因测序,同时收集了这些肿瘤病人的临床注释、病理等方面的信息

癌症基因检测标准

  据世界癌症预防组织机构统计,现今社会每100人就有1人因患癌症而死亡, 每年死亡的人数中,1/5是死于癌症。未来20年里,癌症将继续位居人类死因首位。  癌症的新认识  癌症只是慢性病,一类与冠心病、糖尿病有所类似的慢性病  癌症是生活方式疾病,80%与不良生活方式有关。  遗传、疾病、环境与职

儿童癌症基因检测,任重而道远

  两项独立的先驱性临床研究同时发现了四成儿科癌症患者肿瘤或生殖系的共有突变,这些共有突变位点在癌症的诊断和治疗方面具有潜在的临床意义。  发现该成果的科研团队由得克萨斯儿童癌症中心和贝勒医学院领衔,两个团队共同致力于开发疾病确诊初期的癌症干预手段。另外,波士顿儿童医院达纳法博癌症中心与布莱根妇女医

癌症基因检测的现状

  目前,化疗总体有效率在30%到40%,而通过基因检测筛选出获益病人,有效率可以提高到80%。分子检测为癌症治疗模式带来了翻天覆地的变化,癌症治疗开始迈入个性化治疗的新天地。  目前,在国外,美国FDA(食品药品监督管理局)已经强制要求用药前进行EGFR、KRAS等基因检测。另一权威机构NCCN(

Nat-Commun:癌症——基因突变的起源

  DNA的复制是细胞分裂的前提。但是,在存在某些破坏性成分的情况下,细胞将无法很好地执行相关操作,复制过程将变得更加缓慢且效率较低,这种现象称为“复制压力”。虽然已知“复制压力”与遗传突变的增加有关,但至今仍不清楚起作用的确切机制。  最近,日内瓦大学(UNIGE)的研究人员阐明了在“复制压力”下

《科学》重点文章:癌症与基因突变

生物通报道:来自霍德华休斯医学院,Ludwig癌症遗传与治疗中心(the Ludwig Center for Cancer Genetics and Therapeutics)以及约翰霍普金斯凯门综合癌症中心(Johns Hopkins Kimmel Comprehensive Cancer Cen

精准医疗,全外显子组测序立功啦

  精准医疗计划(Precision Medicine Initiative)是美国奥巴马总统在2015年国情咨文演讲中宣布的一项新的国家项目,并称将为建立大量志愿者服用药物的生理和基因资料、建立个人基因组与癌症相关突变靶标、数据标准开发与保密等工作投资共计2.15亿美元。  精准医疗无疑是医疗技术

Nature:99个癌症基因组全面解析

  近日来自美国、澳大利亚、加拿大的研究人员组成的一个国际研究小组报告了一项大规模胰腺癌基因组分析研究的结果,揭示了导致这一癌症潜在突变的复杂性,发现了与之相关的两条新信号途径。这些信息将推动开发出胰腺癌的新早期诊断测试。相关论文在线发表在10月24日的《自然》(Nature)杂志上。   贝勒医

新方法准确检测Lynch综合征相关突变

  贝勒医学院等机构的研究人员近日开发出一种更准确的方法,检测PMS2基因中的突变。这个基因的突变与遗传性非息肉结肠直肠癌(Lynch综合征)和Turcot综合征相关。研究结果在线发表于《the Journal of Molecular Diagnostics》上。  为了提高PMS2基因突变检测的

NimbleDesign罗氏序列捕获定制设计软件上线

  NimbleDesign是罗氏NimbleGen推出的免费在线软件,用于NimbleGen SeqCap EZ Choice以及Choice XL人类基因组目标区域的定向捕获探针设计。现在您只需用一分钟注册您的账户,就可以享受到NimbleGen专有的探针算法所带来的高密度、高覆盖、高效率的

英国癌症研究所采用Illumina设备进行临床基因检测

  伦敦,5月20日(路透社报道)--继好莱坞影星安吉丽娜·朱莉因检测出携带BRCA1基因高危突变,为防乳腺癌和卵巢癌而切除乳腺之后,英国伦敦的癌症研究所(ICR)领导的研究中心联盟将与美国的基因测序公司Illumina合作推出一项基于测序的检测项目,以分析癌症患者中的基因突变,让更多的人从中获益。

罗氏欲将癌症药物成功复制到眼科药物领域

  罗氏旗下眼科试验药物获得阳性试验结果,这将使罗氏在年销售额达几十亿美元的视力减退药物市场的地位得到巩固,罗氏似乎要在其核心的癌症治疗药物领域之外拓展业务。在放弃糖尿病治疗药物和提升高密度胆固醇的药物之后,这家世界最大的癌症药物制造商正渴望证明其在眼科药物开发方面也有较强的实力。   罗氏旗下的

基因突变让端粒失控 促发癌症

  近日,来自威斯达研究所的研究人员揭示了保护端粒(我们染色体末端结构)的部分蛋白复合物的结构,相关研究成果发表在 Nature Communications 上,该研究解释了与这个蛋白复合物相关的一组基因突变如何促进一系列癌症。  端粒是染色体末端的保护性结构,对人体基因组的复制和保护至关重要。端

JBC:验血可检测癌症基因

  Texas大学MD Anderson癌症中心的科学家们发现,癌细胞释放到血液中的胞外体(Exosome),包含了癌细胞的整个遗传学蓝图。这一基因组数据可以用于检测癌症相关的突变,帮助医生尽早诊断癌症,以便对患者进行有效治疗。文章发表在本期的Journal of Biological Ch

癌症基因检测“揭示家族性”

   科学家们已经发现了为什么一些家族会患许多不同类型的癌症,这要得益于基因检测。在对1,100例罹患罕见癌症(也称为肉瘤)患者的检测中发现,半数以上患者具有增加癌症风险的先天性基因突变。这项发表在柳叶刀《》肿瘤学》杂志上的研究称,遗传性突变可能成为癌症治疗新靶点。可以为那些易患癌症家庭提供筛查和建

罗氏甲基化捕获试剂创新甲基化研究方法

  自2004年美国批准Vidaza (azacitidine)可用于血液疾病( 如MDS)的治疗以来,通过改变致病基因的表观遗传学特征进行疾病治疗的方法,为人们带来了疾病的新治疗策略。然而,由于表观遗传检测方法的局限,要确定基因的碱基在何处以何种程度被甲基化一直以来困扰着研究者,从而难以确定基

最新研究可检测癌症组织中的基因融合和碱基突变

   靶向治疗和免疫检查点抑制剂治疗目前已显著改善了肿瘤患者的生存率,而新型疗法的有效运用往往需要依赖于对基因变异的准确检测。当前的研究表明,诸如NTRK(神经营养因子受体酪氨酸激酶)等罕见的融合变异事件能有效地驱动肿瘤发生,并成为多种肿瘤中靶向治疗的靶标。基于DNA检测的大Panel可以覆盖几百个

这种基因突变导致1/4的人罹患癌症,并且还助力癌症生长

  癌症的发生与原癌基因的突变有关。研究表明,原癌基因例如Ras基因发生突变,会导致25%的人类癌症的发生。  近日弗兰西斯克里克研究所的Matthew Coelho博士做了相关实验后发现,Ras基因发生突变还可以抑制免疫系统的抗癌反应。相关研究成果以题为《Oncogenic RAS Signali