斑鳖的全基因组序列解析:其与中华鳖亲缘关系密切

记者12日从中国科学院昆明动物研究所获悉,该所和长沙生态动物园合作,成功组装出了全球最濒危龟鳖类物种斑鳖的高质量参考基因组序列,并解析其适应性进化基础。研究人员发现,斑鳖与中华鳖亲缘关系密切,然而在54.4百万年前开始分道扬镳。 斑鳖是目前地球上现存体型最大的鳖类物种,其背甲长度可达1.5米、体重可达115公斤。此外,斑鳖也是全球目前最濒危的龟鳖类物种。在2019年初,全球已经明确记录的斑鳖个体仅仅只有4只(中国1雌1雄;越南2只,性别不详)。然而,2019年4月13日,中国的雌性个体意外死亡(这是当时全球唯一确定性别的雌性斑鳖个体),令人十分惋惜。 为了避免雌性斑鳖基因组遗传信息的永远丢失,也为了推动斑鳖的调查和保护工作,在长沙生态动物园的支持下,研究人员在雌性死亡斑鳖的病理解剖检查过程中采集了该个体的组织样品。通过结合相关测序数据,研究人员成功组装出了该个体染色体水平的高质量参考基因组序列。 基于多种数据集和系统发......阅读全文

我国绘制完成世界首个鹅全基因组序列图谱

  6月3日,深圳华大基因研究院和浙江省农业科学院、象山县浙东白鹅研究所联合召开新闻发布会,宣布“鹅全基因组序列图谱绘制完成”。这是我国独立研究完成的全世界首个鹅全基因组序列图谱,这一研究成果对于揭示家鹅繁殖、抗逆、生长、肉质、羽色等性状的遗传基础,鹅的驯化、不同鹅种的生物学分类、中国家鹅

我国科学家绘制完成鲤鱼全基因组序列图谱

  鲤科鱼类是我国最重要的水产养殖种类,年产量占我国淡水养殖总产量的70%以上,其中鲤鱼不仅是我国也是世界性的重要养殖鱼类。5月6日,中国“鲤鱼基因组计划”学术报告会暨新闻发布会在京举行。由中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心、黑龙江水产研究所和中科院北京基因组研究所共同实施

甲鱼壳的介绍

  甲鱼壳的其他名称:鳖甲, 上甲, 鳖壳,团鱼壳, 团鱼盖, 团鱼甲, 鳖盖子, 别甲, 鳖盖, 制鳖甲, 烫鳖甲,主治劳热骨蒸,阴虚风动,劳疟疟母,症瘕痃癖,经闭经漏,小儿惊痫。  全年均可捕捉,以秋、冬二季为多,捕捉后杀死,置沸水中烫至背甲上的硬皮能剥落时,取出,剥取背甲,除去残肉,晒干。

绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图谱完成

  绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图谱已经由中国烟草完成。这是全球第一套烟草全基因组序列图谱,也是继马铃薯和番茄基因组之后全球完成的第三种茄科植物全基因组序列图谱。该绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图谱是目前已知植物基因组序列图谱中基因组最大、组装精度最高、组装结果最好的2个图谱。绒毛

马铃薯单倍型DM基因组全序列完成图组装成功

中国农业科学院蔬菜花卉研究所马铃薯遗传育种与栽培创新团队和蔬菜分子设计育种创新团队,对马铃薯单倍型DM的基因组进行了全序列组装,获得了包含24个端粒和12个着丝粒完整序列的马铃薯单倍型DM的端粒到端粒(T2T)的基因组完成图(DM8.1),并在之前马铃薯基因组未能完整组装的高度重复序列区域中,发现了

两栖爬行动物:它们也该被拯救

  多数两栖爬行类动物体型较小,长得又其貌不扬,因此,它们很少能够成为人们眼里的明星物种。但在进化学上,它们有着非常重要的地位。两栖爬行动物是脊椎动物从水体到陆地演化过程中的过渡类群。  什么是地球上最濒危的动物?你一定想不到,它来自一种爬行动物——斑鳖。斑鳖原产于太湖流域,从最开始命名到最终确认这

香蕉、椰子、水稻、玉米的祖先是如何演化的?

香蕉、芦笋、椰子这样的重要园艺作物亦或是水稻、小麦、玉米等大宗粮食作物,它们都属于单子叶植物。单子叶植物是被子植物重要的分支之一,约占被子植物物种多样性的五分之一。近日,中国科学院武汉植物园研究团队与法国合作者公布了单子叶植物最早期分支菖蒲目中的重要水生药用植物石菖蒲的基因组,研究揭示了单子叶植物祖

我国绘制完成世界首个蒙古族人全基因组序列图谱

  我国科学家绘制完成了全世界首个蒙古族人全基因组序列图谱。这是记者12月18日在内蒙古自治区呼和浩特市召开的“世界首例蒙古族人全基因组序列图谱绘制完成成果发布会”上获得的消息。   据项目总负责人、内蒙古农业大学生命科学学院动物生物技术重点实验室主任周欢敏介绍,这一研究成果是我国科学家首次独立完

海洋所科研人员绘制完成牡蛎全基因组序列图谱

  近日,牡蛎基因组计划(Oyster Genome Project,OGP)项目组宣布,历时两年的牡蛎基因组序列图谱终于绘制完成。这是世界上第一张养殖贝类的全基因组序列图谱,标志着基于短序列的高杂合度基因组拼接和组装技术获得了重大突破。据悉,目前的基因组图谱已达到国际领先的基因组图

从10个物种认识地球上的生命

如果外星访客想要收集地球上有纪念意义的10种生命形式,他们会选择哪些物种?长颈鹿是一种动物,还是四种甚至八种动物?一种大多数人都没听说过的鸟是什么鸟?8月18日下午,一场名为“鹦鹉螺与长颈鹿——‘天际线’科普图书分享会”的读书活动在上海书展举行,上海辰山植物园科普部部长王西敏以“从10个物种,认识地

国家一级重点保护野生动物长江鲟现身洞庭湖

11月2日上午,在湖南益阳南县茅草街“南洞庭湖草龟中华鳖国家级水产种质资源保护区”,省水产科学研究所科研人员监测到一尾国家一级重点保护野生动物长江鲟,这是科研人员首次在洞庭湖水域监测到该物种。 长江鲟又名达氏鲟,主要分布在长江中、上游的干支流,是长江特有鱼类。此前受水利工程建设等因素影响,长江鲟

改写教科书!云南大学最新Science

  软体动物包含了巨大的差异,包括我们熟悉的蛤蜊和蜗牛,以及我们不太熟悉的具有复杂多成分骨骼的针孔动物(石鳖和蚓类)。古生代的化石表明,冠类软体动物是由生物矿化的壳和硬膜结合而成的(如鳞片、棘和针状体)。  2024年8月1日,云南大学马晓娅及牛津大学Luke A. Parry共同通讯在Scienc

蒙古高原四个特色物种全基因组序列图谱绘制完成

  内蒙古农业大学和深圳华大基因研究院8月9日在呼和浩特市联合宣布,蒙古羊、蒙古牛、蒙古马和阿拉善双峰驼全基因组序列图谱绘制完成。这是我国科学家首次独立完成蒙古高原物种全基因组序列图谱,标志着我国地方畜种研究进入基因组水平。  蒙古羊、蒙古牛、蒙古马、阿拉善双峰驼是我国古老的原始品种和畜牧

中国农科院特产所首次破译鹿科动物全基因组序列

  近日,由中国农业科学院特产研究所研究员李光玉带领创新团队在国际上首次破译鹿科动物全基因组序列。驯鹿全基因组测序的完成,不仅为研究人员从基因组水平挖掘驯鹿生长、代谢和抗寒等重要性状的分子机制提供了科学指导,而且为驯鹿驯化历史、基因组演化、群体遗传及鹿类动物的进化等理论研究奠定了重要基础。相关研究成

我国科学家完成大黄鱼全基因组序列图谱绘制

  浙江省科技厅、上海市科委30日在浙江省舟山市共同宣布,来自浙江海洋学院、复旦大学、上海交通大学等院所的科学家已绘制完成大黄鱼的全基因组测序、组装和序列图谱。   据介绍,这是我国科学家完成的第二个鱼类基因组序列图谱,也是世界上首个石首鱼科鱼类基因组序列图谱。   大黄鱼属硬骨鱼

我国绘制并破译世界首例双峰驼全基因组序列图谱

  记者17日从内蒙古农业大学获悉,我国科研人员近日完成了世界首例双峰驼全基因组序列图谱绘制和破译工作。专家表示,这项成果将对野生骆驼保护和家养骆驼品种改良起到重要指导作用,并将进一步推动骆驼产业的健康发展。   据了解,这个研究项目由内蒙古农业大学、上海交通大学、中国科学院上海生命科学研究院、南

Illumina助力云南省CDC快速破译新型冠状病毒全基因组序列

  据云南广播电视台《都市条形码》微信公众号报道,1月21日,国家卫生健康委确认昆明市首例输入性新型冠状病毒感染的肺炎确诊病例。云南省疾控中心急性传染病防制所所长伏晓庆介绍,1月17日中午12点,实验室收到患者采样标本,下午3点就完成了核酸检测,结果呈阳性。  1月18日凌晨1点,实验室开始病毒全基

武汉植物园在水生单子叶植物的起源和演化研究中取得进展

  泽泻亚纲是水生单子叶植物中最为原始的类群之一,全球性广泛分布,在研究被子植物的系统发育、地理分布格局成因中起着重要作用。  中科院武汉植物园水生植物适应性进化学科组博士研究生陈凌云在王青锋研究员的指导下,通过细胞核、叶绿体和线粒体部分基因的测序,结合化石证据和系统进化分

解析现代月季基因组序列

科学家研究现代月季基因。图片来源:monticelloshop.org 近日,法国农业科学研究院、里昂大学、法国国家科学研究中心的研究人员解密了现代月季的基因组序列。现代月季拥有独特的颜色与香味,广受称赞,这项研究帮助人们从分子角度了解这背后的基因和代谢流程。4月30日,相关论文在线刊登于《自然

基因组序列草图的概念

中文名称基因组序列草图英文名称draft genome sequence定  义已测定序列占到90%以上、测序精度在1%的基因组序列图。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

肺含水量增加的鉴别诊断

  肺郁血:呼吸困难、两肺湿罗音、咳粉红色泡沫痰甚至咯血等。左心衰竭的临床特点主要是由于左心房和(或)右心室衰竭引起肺瘀血、肺水肿。而右心衰竭的临床特点是由于右心房和(或)右心室衰竭引起体循环静脉瘀血和水、钠潴留。  肺化脓:该病常与眼病伴行。患该病的鳖,眼球充血,水肿,下陷,有脓性分泌物,并有豆腐

马钱子

  种子极毒,主要含有马钱子碱和番木鳖碱等多种生物碱,用于健胃药。中医学上以种子炮制后入药,性寒,味苦,有通络散结,消肿止痛之效。西医学上用种子提取物,作中枢神经兴奋剂。  【别名】 马钱,车里马钱、云南马钱、马钱子  【来源】本品为马钱科植物马钱Strychnos nux-vomica L.的干燥

昆明植物所完成六种木本竹子叶绿体基因组全序列的测定

  竹亚科(Bambusoideae)隶属于禾本科(Poaceae),全世界共分布有一千余种。木本竹子因种类数目多,形态性状复杂多变及多年生一次性开花等原因而成为系统发育学研究难点。随着新一代测序技术的兴起,系统发育基因组学为解决这类困难类群的系统发育关系带来了曙光。  中国科学院昆明植物研究所李德

上海生科院合作完成世界首例双峰驼全基因组序列图谱

  11月13日,中国科学院上海生命科学研究院/中国科学院系统生物学重点实验室李亦学研究员课题组与内蒙古农业大学、上海交通大学、南开大学等研究机构的科研人员合作完成了世界首例双峰驼全基因组序列图谱绘制和破译工作,成果在Nature Communications(DOI: 10.103

OPGEN全基因组图谱应用系列——鞭虫全基因组测序

鞭虫是一种常见的土壤传播寄生虫,地理分布广,感染率高,寄生于人体盲肠,导致人体慢性感染,对人类危害巨大。鞭虫的全基因组测序研究由著名的桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)完成,发表在世界顶级期刊《Nature Genetics》上。该研究通过对2种不同

海洋光学30年-|-上天入海

每前进一小步,就是梦想的一大步。正如毛主席词里写的,“可上九天揽月,可下五洋捉鳖。谈笑凯歌还,世上无难事,只要肯登攀。”当神舟十四号航天员太空出舱“暴露”在外太空,他们面对的是极端恶劣的环境——200摄氏度左右的温差变化,空间辐射、真空环境等。而舱外航天服重达上百公斤,要在这个“人形飞行器”中控制好

首次测定玉米蛇基因组序列

  在现有的5000种哺乳动物中,有超过100种已经进行了基因组测序,但是,只有9种爬行动物(在10000个物种当中)的基因组对科学界来说是可用的。最近,瑞士日内瓦大学(UNIGE)的一个研究小组,构建了一个大的数据库,其中就包括一种爬行动物——玉米蛇的新基因组测序,这种蛇越来越多地被用来了解爬行动

概述酿酒酵母的基因组序列

  1996年6月,在国际互联网的公共数据库中公布了酿酒酵母的完整基因组顺序,它被称为遗传学上的里程碑。因为首先,这是人们第一次获得真核生物基因组的完整核苷酸序列;其次,这是人们第一次获得一种易于操作的实验生物系统的完整基因组。 [10]  在酿酒酵母测序计划开始之前,人们通过传统的遗传学方法已确定

胡萝卜基因组序列草图成功绘出

  来自美国的一个研究小组称,他们完成了对30余种胡萝卜样品的测序,绘制出了胡萝卜基因组序列草图。这很可能是迄今最完整的蔬菜基因组序列草图。研究人员称,这一研究阐明了胡萝卜的起源和演化过程,对改善胡萝卜和其他农作物的营养价值提供了可能。相关论文在线发表在《自然·遗传学》杂志网站上。   胡萝卜和生菜

-震惊!Genbank参考基因组序列多处错误!

 震惊!Genbank参考基因组序列多处错误!   随着基因组测序技术的飞速发展以及测序成本的快速降低,全基因组数据也在急速增加。尽管参考基因组数据是非常有价值的资源,但是由于测序过程中的外源污染或者研究者对数据组装方法的误用,使得基因组数据面临很多问题。  近日,约翰霍