蛋白质组学研究的研究意义和背景

随着人类基因组计划的实施和推进,生命科学研究已进入了后基因组时代。在这个时代,生命科学的主要研究对象是功能基因组学,包括结构基因组研究和蛋白质组研究等。尽管已有多个物种的基因组被测序,但在这些基因组中通常有一半以上基因的功能是未知的。功能基因组中所采用的策略,如基因芯片、基因表达序列分析(Serial analysis of gene expression,SAGE)等,都是从细胞中mRNA的角度来考虑的,其前提是细胞中mRNA的水平反映了蛋白质表达的水平。但事实并不完全如此,从DNA、mRNA、蛋白质,存在三个层次的调控,即转录水平调控(Transcriptional control ),翻译水平调控(Translational control),翻译后水平调控(Post-translational control )。从mRNA角度考虑,实际上仅包括了转录水平调控,并不能全面代表蛋白质表达水平。实验也证明,组织中mRNA丰度......阅读全文

新蛋白质组学方法引领蛋白功能研究革命

人类细胞是通过成千上万个蛋白质的协同作用来控制它们生长和分化的。但是,到目前为止,大多数人类蛋白质的特定功能还不清楚。 疾病的发生常常是由于冠军细胞蛋白质功能的失常。目前,世界各地已经启动了大量大规模的研究计划以了解所有人类蛋白质的功能。 现在,来自IRCM(Instiut de recherc

APAF选择TripleTOF-5600系统推进蛋白质组学研究

  全球生命科学分析技术的 领导者AB SCIEX公司,今天宣布,澳大利亚的蛋白质组分析中心(APAF)选择了AB SCIEX TripleTOF 5600系统,通过显著增加蛋白质组覆盖率来帮助推进蛋白质组学研究。TripleTOF 5600 系统是生命科学产业界最快、最灵敏的高分

我国在单细胞蛋白质组学研究获突破

  浙江大学化学系微分析系统研究所方群教授团队,联合北京大学医学部精准医疗多组学研究中心主任黄超兰教授团队,在单细胞蛋白质组学分析研究领域取得突破性进展。研究论文近日在线发表在美国《分析化学》杂志上。  黄超兰介绍,近年来,基于细胞群体内的蛋白质组学研究,已越来越难以满足对生命功能深入探究的需要。从

蛋白质组学牛人Cell发表病毒研究新工具

  科学家们在质谱分析的基础上,开发了一种全新的蛋白质组学技术——QTV(quantitative temporal viromics)。这一技术能够在病毒感染的过程中,对宿主和病毒蛋白的实时动态进行系统性定量分析,展现病毒与宿主的具体互作过程。这一技术发表在六月五日的Cell杂志上。  在QTV技

综述:基于质谱技术的糖蛋白质组学与糖组学研究进展

   糖是组成生命体的四大类重要分子之一,糖蛋白质是由糖链与肽链中的特定氨基酸残基以糖苷键共价连接而成的蛋白质。糖蛋白质普遍存在于生物体内,在很多生命过程中起着重要作用,如蛋白质的折叠、细胞之间的相互识别、炎症反应等。同时,糖基化修饰在疾病中,特别是肿瘤的发生、发展和转移过程中也起到重要作用,许多疾

蛋白质组研究系统

4700 TOF/TOF蛋白质组分析系统4700TOF/TOF蛋白质组分析系统是全球第一台TOF/TOF 串联飞行质谱仪,它作为目前的最新质谱技术,它一问世即被世界各大蛋白组研究中心和著名蛋白质实验室所争相采用。它由两级TOF和高能碰撞池组成,其工作原理是离子在MALDI源中产生并被加速和聚焦;对于

生物质谱——蛋白质组学研究的肱股之臣

  分析测试网讯 2017年11月29日,由北京大学,首都科技条件平台主办,安特百科(北京)技术发展有限公司(分析测试百科网)协办的题为“生物质谱在蛋白质组学研究中的应用”的讲座在北京大学化学与分子工程学院化学楼A201报告厅举办,来自蛋白质行业的专家学者参与了此次讲座。北京大学分析测试中心、美国密

“Q-Exactive-蛋白质组学研究的综合平台”网络讲座

  9月27日,赛默飞世尔科技借分析测试百科网这一平台成功举办了“Q Exactive 蛋白质组学研究的综合平台”网络讲座。赛默飞世尔科技李静工程师为大家介绍了Q Exactive高性能台式四极杆—轨道阱系统的基本组成及特点,着重讲解了Q Exactive 在蛋白质组学应用的优势。  赛默飞世尔科技

蛋白质组学在植物科学研究中的应用

1 植物群体遗传蛋白质组学 1.l 遗传多样性蛋白质研究基于基因组学的一些遗传标记,如RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)、RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)、SSR(Simple Sequen

蛋白质组的研究内容

主要有两方面,一是结构蛋白质组学,二是功能蛋白质组学。其研究前沿大致分为三个方面:① 针对有关基因组或转录组数据库的生物体或组织细胞,建立其蛋白质组或亚蛋白质组及其蛋白质组连锁群,即组成性蛋白质组学。② 以重要生命过程或人类重大疾病为对象,进行重要生理病理体系或过程的局部蛋白质组或比较蛋白质组学。③

蛋白质组的研究内容

主要有两方面,一是结构蛋白质组学,二是功能蛋白质组学。其研究前沿大致分为三个方面:① 针对有关基因组或转录组数据库的生物体或组织细胞,建立其蛋白质组或亚蛋白质组及其蛋白质组连锁群,即组成性蛋白质组学。② 以重要生命过程或人类重大疾病为对象,进行重要生理病理体系或过程的局部蛋白质组或比较蛋白质组学。③

布鲁克:利用CCS检测和深度学习研究4D蛋白质组学

  近日,Matthias Mann教授团队和Fabian Theis教授组*共同在《Nature Communication》上发表开创性成果,标题为“Deep learning the collisional cross sections of the peptide universe from

蛋白质组研究中的样品分离和分析

利用蛋白质的等电点和分子量通过双向凝胶电泳的方法将各种蛋白质区分开来是一种很有效的手段。它在蛋白质组分离技术中起到了关键作用。如何提高双向凝胶电泳的分离容量、灵敏度和分辨率以及对蛋白质差异表达的准确检测是双向凝胶电泳技术发展的关键问题。国外的主要趋势有第一维电泳采用窄pH梯度胶分离以及开发与双向凝胶

顽拗性植物组织的蛋白质组学研究(苯酚法提取蛋白质...

顽拗性植物组织的蛋白质组学研究(苯酚法提取蛋白质)实验实验材料 植物组织试剂、试剂盒 苯酚提取缓冲液沉淀液等电聚焦缓冲液仪器、耗材 低温粉碎机实验步骤 3.1 蛋白质提取( 1 ) 新鲜植物组织在液氮中冷冻,然后在自动低温粉碎机中预先冷却的钢杯中将材料研磨成细碎的粉末(见注释 4) 。( 2 ) 在

顽拗性植物组织的蛋白质组学研究(苯酚法提取蛋白质)

实验材料植物组织试剂、试剂盒苯酚提取缓冲液沉淀液等电聚焦缓冲液仪器、耗材低温粉碎机实验步骤3.1 蛋白质提取( 1 ) 新鲜植物组织在液氮中冷冻,然后在自动低温粉碎机中预先冷却的钢杯中将材料研磨成细碎的粉末(见注释 4) 。( 2 ) 在一个 15 ml 的离心管(falcon  tube) 中加入

顽拗性植物组织的蛋白质组学研究(苯酚法提取蛋白质)

1. 前言提取蛋白质是蛋白质组学研究的第一步。植物组织的蛋白质含量较低,并且存在多种非蛋白质成分,如细胞壁及贮藏多糖、脂质和酚类化合物,使蛋白质的提取难度增大 。植物蛋白质的可溶性与它们的细胞内定位关系密切,传统的蛋白质提取方法是用水合缓冲液、去垢剂或直接沉淀法 [1] 。除了普遍使用的 TCA

医用红外热像仪的背景研究和现状

  红外热像技术被发现应用医学领域已有 40 多年历史 , 自从 1956 年英国医生 Lawson 用红外热像技术诊断乳腺癌以来, 医用红外热像技术逐步受到人们的注意。特别是近 5 年来, 由于光电技术 、计算机多媒体技术的发展 ,使热像仪的分辨能力、清晰度进入可以满足临床需要的水平。美国 、英国

水生所蛋白质翻译后修饰组学研究获进展

  蛋白质的翻译后修饰,如磷酸化、乙酰化等,是调节蛋白质生物学功能的关键步骤,是蛋白质动态反应和相互作用的一个重要分子基础,也是细胞信号网络调控的重要靶点。由于翻译后修饰蛋白质在样本中含量低且动态范围广,其研究极具挑战性。近期,中国科学院水生生物研究所葛峰研究员学科组在蛋白质翻译后修饰组学及其功能方

花粉管钙通道抑制后蛋白质组学研究

实验概要本实验运用蛋白质组学技术手段对钙通道受抑制后花粉管中蛋白质表达模式进行研究,以期鉴定出与Ca2 调节花粉管生长相关的蛋白质,拓展对Ca2 在花粉管生长调节机制的认识。主要设备IPGphor II等电聚焦系统(Amersham Biosciences,Sweden)ZipTipC18 (Mil

蛋白质组学研究选材四大原则

中国饮食文化博大精深,《舌尖上的中国》向世界展示了我们这个完美的吃货民族。一道成功佳肴,食材挑选有着非常严格的标准。在医学基础研究领域,实验与做菜亦有共通之处,做饭时如果偷懒,用煮过面条的汤煮馄饨,馄饨的卖相口感观感都大为降低。实验也如此,一是一,二是二,必要精确审慎,更不可以偷懒,变通条件。偷工减

iTRAQ蛋白质组学研究原理、优势及实验流程(一)

大家好,我是黄博,吉凯一小兵,蛋白质组学实验狗。今天的故事是一个作文从没及格过的闷骚理科男(我一直是这么定位自己的)是如何被陈博内个大尾巴狼生生逼来写文章的故事,真的是有血、有泪、有shi!情节需要,中间可能会穿插一些技术方面的内容,请各位自动忽略。那是一个月黑风高的晚上,本人和大尾巴狼(我实在不想

iTRAQ蛋白质组学研究原理、优势及实验流程介绍

  大家好,我是黄博,吉凯一小兵,蛋白质组学实验狗。今天的故事是一个作文从没及格过的闷骚理科男(我一直是这么定位自己的)是如何被陈博内个大尾巴狼生生逼来写文章的故事,真的是有血、有泪、有shi!情节需要,中间可能会穿插一些技术方面的内容,请各位自动忽略。   那是一个月黑风高的晚上,本人和大尾巴狼

iTRAQ蛋白质组学研究原理、优势及实验流程(二)

“那iTRAQ的原理是什么,有哪些优势?”“iTRAQ(Isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation)技术由美国AB SCIEX公司研发,最早于2004年美国质谱年会上被提出,是一种基于体外等重同位素标记的相对定量技术。该技术利用同

临床皮肤病的蛋白质组学研究:牛皮癣

Proteomics of skin proteins in psoriasis: from discovery and verification in a mouse model to confirmation in humans.KC Lundberg,Y Fritz.Molecular & C

蛋白质组学在高端心血管研究中的应用

Dr Manuel Mayr,King’s College London and Dr Paul Humphrey,Thermo Fisher Scientific本文将讨论伦敦国王学院采用的蛋白质组学解决方案在先进的心血管研究中的重要性。引言蛋白质组学是对蛋白质的大范围分析,被认为是生物系统研究的

做好代谢组学研究的关键

首先明确代谢组学的核心任务。对小分子代谢物的定性、定量分析并发现差异代谢物:(1)对生物体系中的内源性代谢物及其变化规律进行表征;(2)以差异代谢物作为核心对生命奥秘进行解析。而基于色谱/质谱联用的分离分析技术具有灵敏度高、选择性好、动态范围宽、信息丰富等优点,已成为代谢组学研究的主流技术平台。其次

代谢组学——肿瘤研究的利器

  细胞内许多生命活动是发生在代谢物层面的,代谢物更多地反映了细胞所处的环境,比如细胞现在是不是健康?药物是否起效?环境污染物是不是正在伤害细胞?等等。由此,20世纪90年代,衍生出了一门新学科:代谢组学。它回答了基因组学和蛋白质组学不能回答的问题:细胞到底发生了什么?  1、肿瘤与代谢组学  肿瘤

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生