crisprcas9基因敲除原理

基本原理:CRISPR簇是一个广泛存在于细菌和古生菌基因组中的特殊DNA重复序列家族,其序列由一个前导区(Leader)、多个短而高度保守的重复序列区(Repeat)和多个间隔区(Spacer)组成。前导区一般位于CRISPR簇上游,是富含AT长度为300~500bp的区域,被认为可能是CRISPR簇的启动子序列。重复序列区长度为21~48bp,含有回文序列,可形成发卡结构。基因编辑技术形式有:1、同源重组同源重组(Homologous recombination)是最早用来编辑细胞基因组的技术方法。同源重组是在DNA的两条相似(同源)链之间遗传信息的交换(重组)。2、核酸酶基因编辑的关键是在基因组内特定位点创建DSB。常用的限制酶在切割DNA方面是有效的,但它们通常在多个位点进行识别和切割,特异性较差。为了克服这一问题并创建特定位点的DSB。......阅读全文

利用CRISPR/Cas9系统可拯救失明小鼠

  英国《自然·通讯》杂志发表一项遗传学重要研究成果,一种基因组编辑方法能够阻止小鼠视网膜退化,进而拯救失明小鼠。其所述方法利用了CRISPR/Cas9基因治疗系统,可适用于导致色素性视网膜炎(失明的主要原因)的各种潜在遗传缺陷。  色素性视网膜炎无法医治、不易觉察,对患者眼睛造成极大危害而且具有遗

顶级期刊:用光控制CRISPR/Cas9基因编辑

  一段时间以来,科学家们一直都在尝试操纵基因。最近,美国匹兹堡大学的Alexander Deiters就发现了一种方式,以更高的精度来控制这个过程。他采用的是光。Deiters及其研究团队首次实现了这一技术突破,他们将相关研究结果发表在最近的化学领域顶级期刊《美国化学学会杂志》(Journal o

CRISPR/Cas9技术,热度背后的冷思考

  俞晓峰博士现任赛业模式生物副总裁、高级科学家,负责基因修饰模式动物的研发与技术服务等工作。   俞博士在遗传基因模式动物领域有超过20年研发与管理等方面的丰富经验,在干细胞相关领域及哺乳动物细胞系基因改造研究也取得了巨大成就,其研究成果多次发表在Nature Immunology、Hum Mo

CRISPR/Cas9技术,热度背后的冷思考

近年来,CRISPR/Cas9基因编辑技术正在给整个科研界带来革命性变化,该技术使用CRISPR系统将Cas9蛋白和向导RNA注入小鼠受精卵,就能轻松实现基因敲除,同时,注入Donor DNA则可实现基因敲入,甚至国际著名学术期刊Genome Biology有文章指出这项新技术将很快取代使用胚胎

Nature发布CRISPR/Cas9系统应用新突破

  来自洛克菲勒大学的研究人员报告称,他们利用CRISPR/Cas9成功地有效引入了特异的纯合子和杂合子突变。这一突破性的成果发布在4月27日的《自然》(Nature)杂志上。  细菌CRISPR/Cas9系统使得人们能够在许多生物中实现序列特异性的基因编辑,有望成为在人类多能干细胞中建立人类疾病模

CRRSPR/Cas9基因敲除系统之sgRNA设计

sgRNA设计网站介绍sgRNA的在线设计网站有:1、http://crispr.mit.edu/ ;2、http://www.e-crisp.org/E-CRISP/;等网站。这些网站虽然一定程度上满足了部分研究 者的需要,但仍然存在很多不足和缺陷。例如:1、数据分析周期长;2、无具体的脱靶数据;

CRISPR/Cas9:基因编辑的历史与发展

CRISPR/Cas系统是细菌和古菌特有的一种天然防御系统,用于抵抗病毒或外源性质粒的侵害。当外源基因入侵时,该防御系统的 CRISPR 序列会表达与入侵基因组序列相识别的 RNA,然后 CRISPR 相关酶(Cas)在序列识别处切割外源基因组DNA,从而达到防御目的。根据Cas蛋白的特点,可将CR

crispr/cas9到底是什么东西

最近几年基因编辑技术异常火爆,CRISPR/Cas9技术面世以后,弥补了传统基因编辑技术的诸多不足,使得基因的“任意编辑”变得越来越容易。也因此,CRISPR/Cas9技术当仁不让的成为基因编辑技术的“王牌”,大有一副取而代之的势头。所以这里就给大家简单介绍一下CRISPR/Cas9的技术原理!一、

Nature-Biotechnology:见光起舞—当光学碰撞CRIPSR/Cas9

  日本的科学家们已经开发出一种光活化的Cas9核酸酶来控制CRISPR诱导的基因编辑,一个“开关”即可激活。这个光激活的Cas9核酸酶可以为研究者在RNA诱导的核酸酶研究上提供更大的空间和时间的控制。这篇研究在线发表在最新的Nature Biotechnology中。  来自加州大学的干细胞生物学

Nature解答Cas9基因组编辑核心谜题

  有一种蛋白在细菌免疫系统中起着至关重要的作用,并正快速成为一种很有用的遗传工程工具。现在有关这一蛋白的一个中心问题已经获得了解答。来自劳伦斯伯克利国家实验室和加州大学伯克利分校的研究人员,确定了这一叫做Cas9的细菌酶在病毒感染过程中是如何在RNA序列的引导下识别和降解外源DNA,以及在动物和植

全新CRISPR/Cas9基因编辑系统助力肝癌建模

  最近发表在开放获取期刊《Genome Medicine》上的一项研究,报道了一种建立肝癌小鼠模型的新方法,即利用CRISPR/Cas9系统快速将癌症相关基因敲入小鼠的DNA中。  研究的通讯作者、麻省大学医学院RNA疗法研究所的王文说:“为了更好地理解肿瘤生物学、开展临床前研究以及为病人找到潜在

改造型Cas9:RNA病毒的新杀器?

  Cas9是一种特殊的核酸内切酶,已经迅速成为了基因组编辑时代的革命性的新工具。通过小的RNA作为引导序列,Cas9能够特异性结合到DNA上我们感兴趣的区域,然后切割DNA双链。  《美国科学院院刊》近期发表了一篇关于改造Cas9系统的文章。来自一种革兰氏阴性细菌(Francisella novi

Cas9/guideRNA遏制“病媒”蚊子传播病毒

  每当夏日将至,人们就开始陷入到被蚊子支配的恐惧之中,小小的蚊子不仅让很多人饱受皮肉之苦,还会传播疟疾、登革热、丝虫病等危害性较强的传染病。因此,别看人类处在食物链的顶层,可几十年过去了,除了杀虫剂策略,我们仍然没有什么一劳永逸的办法对付蚊子。随着CRISPR 基因编辑革命的爆发,人们开始将目光聚

利用CRISPR/Cas9技术对抗艾滋病

  艾滋病病毒(HIV)是一种有效和狡猾的逆转录病毒。一旦HIV将其DNA导入宿主细胞基因组,它就有一段很长的潜伏期,并能保持休眠状态潜伏很多年。虽然医生可以调制相匹配的抗逆转录病毒药物鸡尾酒,来抑制病毒,但是如果停止治疗病毒又会再度复活。  为了使潜伏性HIV变得完全无害,美国麻省大学医学院的研究

Cas9也可以用来找药靶?(一)

去年10月份季博分享了一篇文章“Cas9与耐药基因研究是啥关系”,介绍的是张锋的两篇文章,2014年的Science,2015年的Nature。讲座中,季博给大家简单分析了这两篇文章,两篇文章用的思路都一样,连细胞和药物都一样。按道理,14年Science收了,15年同档次的Nature是不会再收了

CRISPR/Cas9和ES打靶选择的优劣比较

 近年随着生物医药技术快速迭代,靶向药物、免疫疗法、基因治疗等个性化治疗方式成为生物药创新的主要方向,这其中离不开基因编辑技术的发展。从一年前的ZL之争,到基因编辑公司Editas人类基因编辑的临床试验获FDA批准可知,基因编辑技术的发展备受期待。 目前动物模型基因编辑技术大抵分为两类:ES细胞打靶

检测CRISPR/Cas9基因编辑系统的副作用

  目前,弗吉尼亚大学医学院的研究人员设计出一种方法,检测风靡科学界的CRISPR/Cas9基因编辑系统中意想不到的副作用。相关研究结果发表在最近的《Nature Biotechnology》。  称为CRISPR的基因打靶系统,可让我们编辑基因组中特定靶位点的遗传信息。这种新方法揭示的系统,有可能

生物医药领域的黑马:CRISPR/Cas9-技术

  CRISPR/Cas9基因编辑技术深受研究人员的喜爱,那么它为什么如此优秀呢?   CRISPR(Clustered regularly interspaced short palindromicrepeats)规律成簇间隔短回文重复;Cas9(CRISPR associated nucle

设计cas9条件性基因敲除小鼠

其关键是构建带有两个Loxp位点的小鼠,即flox(flanked by loxP)小鼠。今天我们就来详细介绍一下如何设计。共分三步:第一步,选择外显子。第二步,设计sgRNA。第三步,设计SSODN。听起来蛮简单的哈?下面我们详细讲讲。第一步,选择外显子。1. 尽量选择敲除所有转录本共用的外显子。

天生一对:CRISPR/Cas9与AAV

   CRISPR/Cas9已经成为体外基因组编辑的最流行系统,但体内的基因编辑方法仍然受到Cas9导入问题的限制。腺相关病毒载体(AAV)因免疫原性低而常常用于基因的体内导入。不过,化脓链球菌(spCas9)和嵌合sgRNA(总共~4.2 kb)要包装到AAV载体中还蛮有挑战性的,因为AAV只能容

Genetics:电穿孔技术或提高CRISPR/Cas9系统效率

  发表于国际杂志Genetics上的一篇研究论文中,来自美国杰克逊实验室(Jackson Laboratory)的研究人员通过研究表明,利用一种电流来运输CRISPR/Cas9系统对实验室小鼠进行工程化的遗传改造,或许可以明显而且有效地改善CRISPR/Cas9系统的作用效率。  CRISPR/C

全新CRISPR/Cas9基因敲入系统助力肝癌建模

  最近发表在开放获取期刊《基因组医学》(Genome Medicine)上的一项研究,报道了一种建立肝癌小鼠模型的新方法,即利用CRISPR/Cas9系统快速将癌症相关基因敲入小鼠的DNA中。  研究的通讯作者、麻省大学医学院RNA疗法研究所的王文说:“为了更好地理解肿瘤生物学、开展临床前研究以及

吉林大学:利用CRISPR/Cas9构建转基因猪

  来自吉林大学的研究人员报告称,他们利用CRISPR/Cas9系统高效构建出了myostatin (MSTN)基因突变猪。这一研究成果发布在11月13日的《Scientific Reports》杂志上。吉林大学的逄大欣(Daxin Pang)教授及焦虎平(Huping Jiao)是这篇论

李劲松教授:当单倍体干细胞遇上CRISPR/Cas9

  6月17日,由生物谷主办的“2016(第三届)基因编辑研讨会”在沪隆重召开。中国科学院上海生物化学与细胞生物学研究所李劲松研究员为了我们带来了题为“当单倍体干细胞遇上CRISPR/Cas9”的精彩报告。  李劲松研究员2007结束在洛克菲勒大学的博士后研究,回国担任生化细胞所研究所研究员,研究组

强大的基因组编辑工具Crisp/cas9(三)

人类 sgRNA 文库相关产品  货号 文库 sgRNA 数目 基因数目 管数 载体 L01-LS03 Innate kinases & ubiquitin ligases 475 239

快速便宜的CRISPR/Cas9突变体筛选方法

  新的基因组编辑工具——如ZFNs、TALENs以及最近的CRISPR/Cas9系统,已经大大提高了在不同动物模型中敲除基因的能力,包括斑马鱼。然而,对数量庞大的动物进行筛选,所需的时间和成本,仍然是一个瓶颈。  最近,意大利多恩动物研究所(Stazione zoologica Anton Doh

Cell发布CRISPR/Cas9重要研究成果

  来自东京大学、麻省理工学院与哈佛大学Broad研究所的研究人员,在新研究中揭示出了新凶手弗朗西丝菌Cas9(FnCas9)的结构,并利用这一结构信息对FnCas9进行改造构建出了一个变异体。研究成果发布在2月25日的《细胞》(Cell)杂志上。  京东大学医学科学研究所基础医学系Osamu Nu

吉林大学:利用CRISPR/Cas9构建转基因猪

  来自吉林大学的研究人员报告称,他们利用CRISPR/Cas9系统高效构建出了myostatin (MSTN)基因突变猪。这一研究成果发布在11月13日的《Scientific Reports》杂志上。吉林大学的逄大欣(Daxin Pang)教授及焦虎平(Huping Jiao)是这篇论文的共同通

Nature:用新型高效Cas9实现基因组编辑

  来自哈佛-麻省理工Broad研究所、麻省理工学院和国立卫生研究院国家生物技术信息中心的研究人员,在一项合作研究中发现了一种高效的Cas9核酸酶,攻克了体内基因组编辑面临的一个主要挑战。发表在《自然》(Nature)杂志上的研究结果,预计将有助于CRISPR工具箱更容易地应用于体内实验和治疗用途。

强大的基因组编辑工具Crisp/cas9(一)

关于Crisp/cas9,这个是目前研究的一个大热门,相关的文章和技术解析层出不穷,大家对什么是Crisp/cas9应该也有了一定的了解,今天就跟大家简单的介绍一下相关的产品吧。不过首先,我们还是再过一遍Crisp/cas9的相关概念吧。  一、 相关概念 (1)CRISPR/Cas是什么?CRIS