Illumina与PacBio测序数据帮助质体基因组多样性演化机制
近日，中科院植物研究所研究员张宪春、副研究员向巧萍等揭示了自养维管植物中目前已知最特异的质体基因组。相关研究成果发表于《植物学报》。近年来质体基因组研究揭示了复杂多样的结构和序列变异，对教科书上经典的四分体结构提出了挑战。质体基因组多样性演化的机制常被笼统地诉诸于DNA修复系统可能存在缺陷。科研人员在前期工作中发现石松类卷柏科植物细胞器靶向的DNA修复系统中缺失RecA1和RecA3，卷柏质体基因组结构呈现出复杂多样的变异，是深入探讨质体基因组演化机制适用的自然突变体系。目前研究表明，卷柏科植物质体基因组具有标志性同向重复序列（DR）的环形结构，中短重复极少，GC含量高等特点。研究人员结合Illumina与PacBio测序数据，通过生物信息学分析揭示中华卷柏的质体基因组由总长为81,010 bp的15个contig组成。它们并不形成一个环形的分子，而是由三个重组热点区域介导形成动态复杂的网状结构，可以解析为许多不等比例的异构体，......阅读全文
基因多样性的概念
基因多样性(Gene diversity)代表生物种群之内和种群之间的遗传结构的变异。每一个物种包括由若干个体组成的若干种群。各个种群由于突变、自然选择或其他原因，往往在遗传上 不同。
基因多样性的功能
基因多样性(Gene diversity)代表生物种群之内和种群之间的遗传结构的变异。每一个物种包括由若干个体组成的若干种群。各个种群由于突变、自然选择或其他原因,往往在遗传上 不同。
玉米基因表达多样性令人吃惊
玉米植株的基因组比科学家之前想象的更令人兴奋，所以，领衔的科学家正在进行新尝试，分析和注释植物遗传资源的深度。 “我们的新研究确立了玉米的多样性，甚至超过了我们已经知道的程度。”美国农业部和冷泉港实验室的博士Doreen Ware说。“这种多样性本身很吸引人，同时，其对农业也非常重要。” 玉
“自私超基因”严重破坏遗传多样性
美国罗切斯特大学的生物学家首次使用群体基因组学来阐明一种被称为分离变相因子（SD）的“自私遗传元素”的进化和后果。发表在《eLife》杂志上的论文表明，SD已导致染色体组织和遗传多样性发生了巨大变化。 人类基因组中充斥着“自私”的遗传元素，这些元素似乎对宿主没有好处，而只是寻求自我繁殖。 研
分子生态学词汇基因多样性指数
中文名称：基因多样性指数英文名称：gene diversity index定 义：一个种群中每个位点上平均期望杂合度。一般用符号“H”表示。应用学科：生态学（一级学科），分子生态学（二级学科）
促进基因多样性可以拯救濒危生物么？
不断扩大的全球人类足迹正在将世界动植物划分为越来越小、越来越孤立的种群，这些种群可能会因为近亲繁殖、疾病或环境变化而灭绝。几十年来，环保人士一直在提议通过从更多的人口中引进新的血液来振兴这些顽固分子。但他们想知道这是否真的有效，以及如何在不破坏处于危险中的群体的基因特性和独特适应性的情况下做到这
Science:－促进基因多样性可以拯救濒危生物么？
不断扩大的全球人类足迹正在将世界动植物划分为越来越小、越来越孤立的种群，这些种群可能会因为近亲繁殖、疾病或环境变化而灭绝。几十年来，环保人士一直在提议通过从更多的人口中引进新的血液来振兴这些顽固分子。但他们想知道这是否真的有效，以及如何在不破坏处于危险中的群体的基因特性和独特适应性的情况下做到这
Nature：用单细胞基因组探索多样性
宏基因组研究极大地提高了我们对于细菌以及古细菌多样性的理解。然而，环境宏基因组数据往往不容许个别物种的基因组组装，因此，大多数完整的基因组序列来自于培养的微生物。如今，两个新的大规模研究利用单细胞基因组，直接从未培养的环境样本中恢复了细菌和古细菌基因组。 Rinke等人利用荧光活化性细胞分
人类多样性调查发现近3亿基因突变
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517755.shtm美国一项大规模人类多样性调查研究项目“All of Us”已取得实质性成果。2月19日，美国国立卫生研究院（NIH）等机构的研究人员对“All of Us”收集的多达24.5万个基因组
拟南芥基因研究显示：环境对遗传多样性影响巨大
一项针对多种拟南芥的基因研究表明，环境因素对物种遗传多样性和基因组的影响比之前人们预期的更大。相关论文发表在7月20日的《科学》杂志上。 除了实验室中科学家的“最爱”，世界各地还分布着多种野生拟南芥。它们的生长速度、叶子颜色以及发枝方式都是不同的。在最新的研究中，由德国马普发育生物学研究所（Max
免疫球蛋白基因的结构和抗体多样性
Ig分子是由三个不连锁的Igκ、Igλ和IgH基因所编码。Igκ、Igλ和IgH基因定位于不同的染色体上（表2-5)。编码一条Ig多肽链的基因是由在胚系中多个分隔的DNA片段（基因片段)经重排而形成的。1965年Dreyer和Bennet首先提出假说，认为Ig的V区和C区是由分隔存在的基因所编
植物多样性能预测昆虫多样性
日前，应用宏条形码技术，中科院昆明动物研究所研究员俞维理课题组对“植物多样性精确预测昆虫多样性”的重要结论进行了验证和扩展。 昆虫具有宿主特异性，因此植物多样性应该能够预测昆虫多样性，但是已有的研究并不支持该结论；直到Basset 等人在一个热带森林里进行前所未有的全面采样，并结合复杂的统计模
基因组多样性和祖源信息数据库
11月3日，中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）计算生物学研究所徐书华课题组的研究成果，以PGG.Population: a database for understanding genomic diversity and genetic ancestry of human popul
Cell：全基因组测序揭示人类遗传多样性
遗传的历史就书写在现代非洲人的DNA中，但还需要一些调查工作来对其进行注释。在即将出现在8月3号《细胞》(Cell)杂志封面上的一篇报道中，宾夕法尼亚大学的遗传学家们和他们的同事对分属三个不同狩猎者(hunter-gatherer)群体的15个非洲人的完全测序基因组进行了分析，并破解了一些必定涉
Cell：易碎基因虽促疾病－但增加脑细胞多样性
最近，一项刊登于国际杂志Cell上的研究论文中，来自霍华德休斯顿医学院（HHMI）的研究人员通过研究在大脑干细胞中鉴别出了27个基因更易于引发特定类型的DNA损伤，这些基因的易碎性或可帮助解释为何其会在癌症中经常发生突变或被剔除，以及引发神经精神疾病，但这些基因的易碎性或许也会通过产生多样化的神
多样性增加281％，人类肠道菌群基因组图谱公布！
近两年来，以免疫检查点为药物靶点的免疫检查点抑制剂治疗癌症受到越来越多科研工作者的青睐。但是临床研究结果表明，许多癌症患者因接受免疫药物治疗而出现不同程度的免疫相关不良反应，最终出现不得不提前终止治疗的情况。 而寄居在人体内的肠道菌群可以影响免疫检查点抑制剂治疗癌症，能够极大地改善患者对该疗法
分子生态学词汇根井正利基因多样性指数
中文名称：根井正利基因多样性指数英文名称：Nei's gene diversity index定 义：由根井正利(Masatoshi Nei)提出来的测度基因多样性的指数。H=1-(∑Pi2)/N, 这里，Pi是等位基因的频率，N是种群的基因座数。应用学科：生态学（一级学科），分子生态学
我国专家首绘蝎子基因组图谱－揭开多样性面纱
由武汉大学领衔，与上海生物信息技术研究中心合作，近日完成了对马氏正钳蝎(Mesobuthus martensii)的基因组测序，预测了32016个蛋白质编码基因，在国际上第一个揭示了蝎子(scorpion)这一种独特的节肢动物适应模式。 专家表示，马氏正钳蝎基因组的解析揭开了蝎毒素多样
质体基因组多样性演化，提供土壤碳动态新视角
近日，中科院植物研究所研究员杨元合团队以青藏高原高寒草原生态系统为研究对象，依托野外长期氮添加控制实验平台，结合18O-DNA标记、高通量测序等技术揭示了氮添加影响土壤微生物CUE的新机制。相关研究成果发表于《全球变化生物学》。工业革命以来，化石燃料燃烧和农业化肥使用等人类活动导致大气氮沉降增加。持
抗体多样性的缘由与衍生基因重组与体细胞高突变
这是一个缤纷多彩的世界，众生各得其时，恣意生长；又是一个危机四伏的世界，万物相生相克，终归尘土。世界因多变而精彩，又因未知而危险。各种各样的病毒、细菌、真菌和寄生虫让人防不胜防，是各类呼吸系统、循环系统、消化系统或皮肤黏膜疾病的元凶之一。导致中世纪欧洲人口骤减的鼠疫阴魂不散，疟疾、霍乱弧菌、流感
抗体多样性的缘由与衍生基因重组与体细胞高突变
这是一个缤纷多彩的世界，众生各得其时，恣意生长；又是一个危机四伏的世界，万物相生相克，终归尘土。世界因多变而精彩，又因未知而危险。各种各样的病毒、细菌、真菌和寄生虫让人防不胜防，是各类呼吸系统、循环系统、消化系统或皮肤黏膜疾病的元凶之一。导致中世纪欧洲人口骤减的鼠疫阴魂不散，疟疾、霍乱弧菌、流感病毒
大豆基因组重测序表明:野生大豆遗传多样性更高
“中原有菽，庶民采之。”五千年前，华夏始祖将野生大豆驯化，变成今天的“五谷”之一。而今，一项被称为“大豆回家”的基因组研究计划在其故乡中国取得突破。 11月15日，由香港中文大学、华大基因研究院、农业部基因组重点实验室、中国农业科学院等单位合作完成的《31个大豆基因组重测序揭示遗传多样性和
粤籼稻种质资源遗传多样性和育种选择基因获鉴定
近日，广东省农业科学院水稻研究所遗传资源研究团队利用广东籼稻核心种质开展基因组多样性和基因发掘工作，在鉴定广东籼稻种质资源遗传多样性和育种选择基因方面取得新进展。相关研究论文发表于Rice。该研究分析了广东籼稻农家品种和育成品种改良历程中的遗传多样性并鉴定了潜在受育种人工选择的产量、抽穗期、品质等性
蝴蝶基因组大小进化进展－发现表型多样性进化遗传基础
蝴蝶因其丰富的形态多样性，自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一，近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型，已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。 中国科学院昆明动物研究所科研团队在2015年完成所有蝴蝶模式种金凤蝶及其
氮肥对水稻土亚硝酸还原酶基因多样性影响研究
长期施用氮肥对水稻土亚硝酸还原酶基因多样性影响研究获新发现 中国科学院亚热带农业生态研究所桃源农业生态试验站通过对土壤样品进行长期定位观测、试验，采用PCR扩增、克隆测序等分子生物学技术，研究长期施氮肥对水稻土亚硝酸还原酶基因nirK、nirS多样性的影响，发现明显提高nirS基因群
如何通过计算多样性指数评估苔藓物种多样性
通过计算多样性指数来评估苔藓物种多样性，通常可以按照以下步骤进行：数据收集首先，需要通过实地调查、标本采集等方法，确定研究区域内苔藓的物种组成以及每个物种的个体数量。选择多样性指数常见的用于评估苔藓物种多样性的指数包括香农 - 威纳指数（Shannon-Wiener Index）、辛普森指数（Sim
抗体的多样性
人血清中的抗体多种多样，B淋巴细胞可产生的抗体种类在108以上，可与众多不同抗原发生特异性结合。抗体多样性的原因主要有两方面：1．外源性因素环境中抗原种类甚多，每种大分子抗原又有多种抗原表位，每种抗原表位均可选择激活体内一个B细胞克隆，产生一种特异性抗体。2．内源性因素抗体多样性的另一个原因是由基因
物种多样性指数
物种多样性指数类别名称计算公式物种多样性指数Simpson指数D=1-∑Ni2Shannon-Wiener指数H=-∑PilogPi备注：式中，N为群落中所有物种个体总数，Pi=ni/N，ni为物种i的重要值，Ni为物种i的个体数。
抗体的多样性
人血清中的抗体多种多样，B淋巴细胞可产生的抗体种类在108以上，可与众多不同抗原发生特异性结合。抗体多样性的原因主要有两方面： 1．外源性因素环境中抗原种类甚多，每种大分子抗原又有多种抗原表位，每种抗原表位均可选择激活体内一个B细胞克隆，产生一种特异性抗体。 2．内源性因素抗体多样性的另一个
Illumina与PacBio测序数据帮助质体基因组多样性演化机制
近日，中科院植物研究所研究员张宪春、副研究员向巧萍等揭示了自养维管植物中目前已知最特异的质体基因组。相关研究成果发表于《植物学报》。近年来质体基因组研究揭示了复杂多样的结构和序列变异，对教科书上经典的四分体结构提出了挑战。质体基因组多样性演化的机制常被笼统地诉诸于DNA修复系统可能存在缺陷。科研人员